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생물정보학 강의 경상대학교 생화학과 생물정보학연구실Bioinformatics Lab http://bio.gsnu.ac.kr
Bioinformatics Lecture By Prof. Keun Woo Lee
현대생물학과 생물정보학Modern Biology and Bioinformatics
생물정보학 강의 경상대학교 생화학과 생물정보학연구실Bioinformatics Lab http://bio.gsnu.ac.kr
DNA
Central Dogma of Molecular Biology(생화학의 중심원리)
RNA
Protein
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Ribose
Adenine
Nucleotide Structures
Tri-Phosphate
(cf. ATP)
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DNA to RNA (Transcription)
Cytoplasm
Nucleus
RNA polymerase
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Why TRANSLATION?(Central Dogma of Biochemistry)
DNA/RNAAlphabet:A/T/C/G
ProteinAlphabet:Ala/Thr/Cys/Gly….
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DNA
현대생물학의 Keyword “-OMICS”
mRNA
Protein
“Genomics”
“Proteomics”
“Functional Genomics”(“Transcriptomics”)
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Genomics to Proteiomics
Genomics (유전체학): 세포내 존재하는 유전정보물질(DNA, RNA)을 대상으로하는 연구의 총칭. 즉 유전정보의 수집및 체계적 분석, 혹은 발굴/발견등을 수행한다.
Functional Genomics (기능유전체학): 유전체학중에서 유전자의 기능 및 질병과연관된 상관관계를 연구하는 분야.
Structural Genomics (구조유전체학): 유전자 정보로 부터 그 기능을 예측하고구조와 기능간의 상관관계를 연구하는 분야.
Transcriptomics (전사체학): Exon-Intron 구조로 인하여 한개의 유전자가 한개의 mRNA를 만들지 않고 이과정에도 매우 복잡한 작용기작이 존재함이 발혀 졌다. 이처럼 DNA에서 RNA로 진행되는 과정을 연구하는 학문을 전사체학이라고한다.
Proteiomics (단백체학): 단백질의 발현 및 발현후 작용 (변형, 기능 및 조절작용, 다른 단백질과의 상호작용)을 연구하고 더나아가 이들 단백질간의 기능 및 상호연관 네트웍을 조사하는 연구분야.
(어원: 전체를 뜻하는 -ome 과 학문을 뜻하는 접미사 –ics 가 더해짐)
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OMICS 시대의 도래 와 생물정보학의 출현
“Huge Amount of Data”
DNA chip
Protein chip
Seq. Data…
“Genomics”
“Proteomics”“Functional Genomics”
“Structural Genomics”“Physiomics”
“Metabolomics”
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Bioinformatics생물정보학
“유전자나 단백질같은 생체물질의 구조 및 서열 같은 다양한 생물데이터를 수리과학적, 전산학적 방법론을 이용하여 조작 및 분석하는 새로운 학문 분야” -이근우-
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중심원리의중심원리의중심원리의중심원리의 위기와위기와위기와위기와단백체학의단백체학의단백체학의단백체학의 대두대두대두대두
Bioinformatics Lecture By Prof. Keun Woo Lee
생물정보학 강의 경상대학교 생화학과 생물정보학연구실Bioinformatics Lab http://bio.gsnu.ac.kr
고등생물의 유전자수 부족?
C. elegans (선충): 총 DNA수 100 M � 총 유전자수 19000개
Human (인간): 총 DNA수 3200 M � 총 유전자수 25000개
단백질수의 증가By Alternative splicting and Post-translational Modification