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1 Laboratorio de Microbiología

Cartera de Servicios Actualización (Julio 2015)

MACROPROCESO GENERAL Procedimiento general

GC DTL CSm ED01 CARTERA DE SERVICIO DE

MICROBIOLOGÍA

Nombre y Cargo Firma

U. Organizativas Afectadas: Hospital

Universitario Virgen de laVictoria

Fecha

Encarnación Clavijo Frutos y FEAs de Microbiologia

Revisado Encarnación Clavijo Frutos

Aprobado Juan de Dios Colmenero Castillo



Cartera de Servicios del Laboratorio de Microbiología H.U. Virgen de la Victoria

(Málaga)



Este documento ha sido elaborado por: Coordinadora de la Unidad Prfa. Titular FEA del Servicio de Microbiología (H.U. Virgen de la Victoria)

E. Clavijo Frutos

FEA Microbiología

M.V. García López M. Ortega Torres I. Viciana Ramos L. Mora Navas B. Perea López



Cartera de servicios del Laboratorio de Microbiología

La actividad asistencial del Servicio de Microbiología del HUVV se realizará de la siguiente manera:

Lunes a Viernes

8-22 h: Actividad normal, recepción, estudio e informe de muestras ordinarias y urgentes.

22-8h: Conservación de las muestras y realización de las pruebas urgentes

Sábado, Domingo y Festivos

8-15 h: Actividad normal, recepción, estudio e informe de muestras ordinarias y urgentes.

15-8h: Conservación de las muestras y realización de las pruebas urgentes

El teléfono de contacto para la actividad de urgencias es el 677904134 Los facultativos pertenecientes al Servicio de microbiología del HUVV realizan actividad de asistencia continuada (15:00 a 22:00) de lunes a viernes. Los sábados, domingos y festivos realizan jornada complementaria de 8:00 a 15:00 h y a partir de esta hora están de guardia localizada los residentes.



1- Determinaciones urgentes

DETERMINACIONES

MUESTRAS

SERVICIOS AUTORIZADOS

OTRAS CARACTERÍSTICAS

Detección de antígeno de S.pneumoniae

Orina

Todos los servicios

Previo contacto y acuerdo con Facultativo de guardia

Detección de antígeno de L.pneumophila

Orina


Tinción de Plasmodium spp

Sangre


Detección de hemocultivos positivos

Detección de antígeno de S. agalactiae

Vagino-rectal / orina (R.N.)


Rosa de Bengala (Brucella spp)

Suero

Siempre acompañado de frascos de hemocultivos. Previo contacto y acuerdo con Facultativo de guardia

Monosticón

Suero

Antígeno de superficie VHB

Suero Previo contacto y acuerdo con Facultativo de guardia

Detección de anticuerpos VIH

Suero Previo contacto y acuerdo con Facultativo de guardia



Tinción de Gram LCR

Líquidos biológicos estériles Muestras procedentes de quirófano y radiología intervencionista


Tinción de Ziehl (TBC)

Muestra respiratoria

Área de urgencias


Tinción de Tinta china

LCR


Procesamiento de las muestras debidamente justificadas con la realización de los cultivos pertinentes



2- Cartera de servicios por muestra

- T.Gram y Pneumocystis 2 3

Biopsia de tracto respiratorio (PPA,PBP,BP)

- Cultivo de bacterias aerobias, anaerobias y hongos - Cultivo de Nocardia2, - Cultivo e inmunofluorescencia de Legionella2

- Micobacterias1

7 días 7 días Contenedor de boca ancha estéril con suero fisiológico

Esputo - T. Gram y Pneumocystis (solo en esputo inducido) - Cultivo de bacterias aerobias y hongos3

- Cultivo de Nocardia 2

- Cultivo e inmunofluorescencia de Legionella 2

- Micobacterias 1

2 días 5 días Contenedor de boca ancha estéril 2-4 ml

1-Ver apartado correspondiente 2- El tiempo máximo de respuesta será de 7 días 3- El tiempo máximo de respuesta para hongos filamentosos será de 15 días 4- El tiempo de respuesta máximo será de 21 días 9- Solicitar en el laboratorio de Microbiología.

MUESTRA DETERMINACIÓN TIEMPO DE

RESPUESTA CONTENEDOR Min Max

VOLUMEN MÍNIMO

- T.Gram - Cultivo de bacterias aerobias, anaerobias2 y hongos3

- Micobacterias1

Jeringa con tapón 2días 7 días

Tubo cónico estéril de tapón de rosca 1-5ml - de Nocardia2…)

bacterias (Brucella4, Contenedor de boca ancha estéril

Biopsia

- T. Gram - Cultivo de bacterias aerobias y hongos - H. pylori (biopsia gástrica o duodenal)

3 7 días 7 días Contenedor de boca ancha estéril con suero fisiológico

- T.Gram

Biopsia de tejidos blandos

- Cultivo de bacterias aerobias, anaerobias y hongos 7 días - Micobacterias1

2 3 7 días Contenedor de boca ancha estéril con suero fisiológico

- T. Gram - Cultivo de bacterias aerobias y hongos 3 2 días 5 días - Cultivo de Nocardia 2, - Cultivo e inmunofluorescencia de Legionella 2

- Micobacterias 1

Contenedor de boca ancha estéril 2-10ml

Catéter

-Cultivo semicuantitativo (T. de Maki) -Cultivo cuantitativo

2 días 5 días Contenedor de boca ancha estéril 3-4 cm (porción más distal)



2

MUESTRA DETERMINACIÓN

TIEMPO DE

RESPUESTA Min Max

CONTENEDOR VOLUMEN MÍNIMO

E. Conjuntival - Cultivo de bacterias aerobias - Chlamydia

2 días 5 días Torunda con medio de transporte (cultivo)

Torunda sin medio (Chlamydia)9

E. Endocervical - Cultivo de bacterias aerobias (gonococo) y hongos - Detección de Mycoplasma - Detección de Chlamydia

2 días 5 días -Torunda con medio de transporte (cultivo) - 2 Torundas sin medio de transporte (Mycoplasma y Chlamydia)9

E. Endometrial - T. Gram - Cultivo bacteriano

2 días 5 días Torunda con medio de transporte

E. Faringo-amigdalar - Cultivo de bacterias aerobias 2 días 5 días Torunda con medio de transporte

E. Fistulas - T.Gram

- Cultivo de bacterias aerobias y hongos 2 días 5 días Tubo cónico estéril de tapón de rosca 1-5ml

Tubo cónico estéril de tapón de rosca

E. Herida - T.Gram - Cultivo de bacterias aerobias, anaerobias y hongos3

- Micobacterias1

2 días 5 días Torunda con medio de transporte (no para estudio de anaerobios)

Exudado Nasal -Estudio de portadores de MRSA 2 días 5 días Torunda con medio de transporte

Contenedor de boca ancha estéril

Aspirado sinusal - Cultivo de bacterias aerobias y anaerobias 2 días 5 días

1-Ver apartado correspondiente 2- El tiempo máximo de respuesta será de 7 días 3- El tiempo máximo de respuesta para hongos filamentosos será de 15 días 4- El tiempo de respuesta máximo será de 21 días 9- Solicitar en el laboratorio de Microbiología.

de catéter

- T.Gram - Cultivo de bacterias aerobias y hongos3


3 E. Oral - Cultivo de hongos 2 días 5 días Torunda con medio de transporte



E. vaginal -T. Gram -Cultivo bacterias aerobias y hongos -Embarazadas: Despistaje de S. agalactiae - Detección de Chlamydia (estudio de ITS)

2 días 5 días Torunda con medio de transporte (cultivo) Torunda sin medio de transporte (Chlamydia) 9

Heces

-Fresco -Cultivo de enteropatógenos -Toxina Clostridium difficile1

-Antígenos Rotavirus, Adenovirus, Helicobacter, Astrovirus.1

- E.coli EH 1

-Parásitos1

-Micobacterias1

2 días 5 días

- Contenedor de boca ancha estéril H. formadas/ pastosas: 4-6 gr H. diarreicas:5- 10ml

Adultos: 5-10 ml/ Hemocultivo -T. Gram

- Cultivo de bacterias aerobias, anaerobias2

y hongos3

- Micobacterias1

- Cultivo de bacterias especiales (Brucella4, Nocardia2…)

2 días 5 días

- botella hemocultivo aerobio

- botella hemocultivo anaerobia

- botella pediátrica

por botella 2 extracciones (cada extracción con una botella aerobia y otra anaerobia) Pediátricos: 0,5- 3ml en botella pediátrica

1-Ver apartado correspondiente 2- El Tiempo máximo de respuesta será de 7 días 3- El tiempo máximo de respuesta para hongos filamentosos será de 15 días 4- El tiempo de respuesta máximo será de 21 días 9- Solicitar en el laboratorio de Microbiología.

E. ótico

DETERMINACIÓN

Cultivo de bacterias aerobias y hongos3

TIEMPO DE RESPUESTA

MINIMO

Min 2 días

Max 5 días

CONTENEDOR

Torunda con medio de transporte

Torunda con medio de transporte (cultivo) E. uretral -T. Gram

-Cultivo bacterias aerobias -Detección de Mycoplasma - Detección de Chlamydia

2 días 5 días 2 Torundas sin medio de transporte (Mycoplasma y Chlamydia) 9



Lavado broncoalveolar

LCR

Líquidos orgánicos

- T Gram - Criptococo (tinta china/latex) - Cultivo de bacterias y hongos - PCR (CMV, VHS,VVZ, Enterovirus) - Micobacterias1

- Serología sífilis 1

- Ag Neumococo, Neisseria, Haemophilus, E.coli K1, S. agalactiae - Brucella -Amebas

-T.Gram -Cultivo de bacterias aerobias , anaerobias 2

y hongos -Micobacterias1

-PCR (CMV, VHS,VVZ, Enterovirus) -Ag neumococo (L. pleural)1

2 días 5 días -Tubo cónico estéril de tapón de rosca

2 días 7 días Tubo cónico estéril de tapón de rosca

- 1ml (estudio bacteriano rutinario) - Para otras determinaciones 0,5ml adicionales por cada uno de los estudios

- 10ml (estudio rutinario) - Anaerobios inyectar de 5-10ml en botella anaerobia de hemocultivos

Orina

-Cultivo de bacterias aerobias , anaerobias 2

(punción suprapúbica) y hongos -Micobacterias1

-Detección Ag neumococo, Legionella -Parásitos1

- Detección de Chlamydia (estudio de ITS en varón)

1 días 5 días


- 5-10ml -Micobacterias 100ml -Parásitos orina 24 h - Virus 1ml

Jugo gástrico -Micobacterias 1 -Contenedor de boca ancha estéril 5-10ml

Material protésico - Cultivo de bacterias aerobias, anaerobias 2 2 días 7 días Contenedor de boca ancha estéril

Raspado conjuntival y corneal Cultivo de bacterias aerobias y hongos 3 2 días 5 días Portaobjetos y medios de cultivo 5

- T. Gram y Pneumocystis - Cultivo de bacterias aerobias y hongos 3

- Cultivo de Nocardia 2

2 días 5 días -Contenedor de boca ancha estéril 2-10ml

- Cultivo e inmunofluorescencia Legionella 3

de

- Micobacterias



MUESTRA DETERMINACIÓN

- T.Gram

TIEMPO DE RESPUESTA

Min Max

CONTENEDOR

VOLUMEN MINIMO

Úlcera - Cultivo de bacterias aerobias, anaerobias2 y hongos - Micobacterias1

2 días 5 días Tubo cónico estéril de tapón de rosca Torunda con medio de transporte (no para anaerobios)

Sangre - Serología 1

- PCR - Parásitos 1

Secreción prostática (Técnica de Meares-Stamey) - Cultivo 2 días 5 días Contenedor de boca ancha estéril

- Orina 10ml - Fluido prostático toda la muestra que se obtenga

Semen - Cultivo aerobio y hongos - Cultivo de Mycoplasma y Ureaplasma

2 días 5 días Contenedor de boca ancha estéril

1-Ver apartado correspondiente 2- El tiempo máximo de respuesta será de 7 días 3- El tiempo máximo de respuesta para hongos filamentosos será de 15 días 4- El tiempo de respuesta máximo será de 21 días 5-Contactar previamente con el laboratorio de Microbiología



3-Micobacterias

DETERMINACIÓN MUESTRA

Cultivo - Absceso - Biopsias - Bronco-aspirado(BAS) - Exudados7

- Esputo - Esputo inducido (EI)

- Heces7

- Jugo gástrico - Lavado bronqueoalveolar (BAL)

- LCR - Líquidos orgánicos (pleural, abdominal…)

- Orina

TIEMPO DE RESPUESTA

MAXIMO

42dias (si cultivo negativo)

CONTENEDOR VOLUMEN

MINIMO

- Orina 100 ml ( tres días consecutivos)

Contenedor de boca ancha estéril - Esputo, EI, BAL, BAS (tres muestras 5-10 ml)

Hemocultivo

42dias (si cultivo negativo)

botella Myco/F-lytic (solicitar al laboratorio de microbiología)

1-5ml

IGRA-Quantiferon 7días Tubos específicos (solicitar al laboratorio de microbiología)

Tinción Auramina 6 Min 1día Max 3días Contenedor de boca ancha estéril

Tinción Ziehl Neelsen 6 Urgente1 Contenedor de boca ancha estéril

Detección mediante PCR 5 1 Contenedor de boca ancha estéril

1-Ver apartado correspondiente 5-Contactar previamente con el laboratorio de microbiología 6- mismas muestras que para el cultivo 7- Justificar petición



4- Serología

Entamoeba histolytica Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

TIEMPO DE

Aspergillus (Galactomanano) Suero BAL

2días 7días Tubo sin anticoagulante

MÍNIMO

7ml


Adenovirus Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Borrelia burgdorferi Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Brucella Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Chlamydophila pneumoniae Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Chlamydophila psittaci Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Chlamydia trachomatis Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Citomegalovirus Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Coxiella burneti Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Epstein-Barr Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml



Erythrovirus B19 Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

HSV 1+2 Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Hepatitis B AgHBs aHBs aHBc

aHBc IgM AgHBe aHBe

Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Hepatitis Delta IgM


Leishmania Suero 3días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

TIEMPO DE

MEDIO

E. granulosus Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Helicobacter pylori Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Hepatitis A IgM/G Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Hepatitis C aHVC Confirmatorio


Legionella pneumophila Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml



Mycoplasma pneumoniae Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Rickettsia conorii Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Rubéola Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Sífilis Suero LCR (VDRL)

3días 7días Tubo sin anticoagulante


7ml

Trypanosoma cruzi Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Leptospira Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Parotiditis Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Rickettsia typhi Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Sarampión Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Toxoplasma gondii Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Varicela-Zoster Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml



Virus VIH (ELISA, ELFA, test confirmatorio)


VRS


Virus influenza A,B Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Virus parainfluenza Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml

Yersinia enterocolítica Yersinia Pseudoyuberculosis Suero 2días 7días Tubo sin anticoagulante 7ml



5-Detección de antígenos

Cryptococcus LCR 1día 3 días Tubo cónico estéril de tapón de rosca

Antígenos solubles: - Neisseria meningitidis, -Streptococcus pneumoniae,

-Haemophilus influenzae, -Streptococcus agalactiae

LCR Urgente -Tubo cónico estéril de tapón de rosca 1mL

DETERMINACIÓN MUESTRA TIEMPO DE


Max

Adenovirus Heces diarreicas 1día 3 días Contenedor de boca ancha estéril

Astrovirus Heces diarreicas 1día 3 días Contenedor de boca ancha estéril

Clostridium difficile (Detección de toxina) Heces diarreicas 1día 4 días Contenedor de boca ancha estéril

E. coli O157:H7 Heces diarreicas 1día 3 días Contenedor de boca ancha estéril

Helicobacter pylori Heces 1día 3 días Contenedor de boca ancha estéril

Legionella pneumophila Orina 1día 3 días Contenedor de boca ancha estéril

Rotavirus Heces diarreicas 1día 3 días Contenedor de boca ancha estéril

S. pneumoniae Orina, L. pleural 1día 3 días Contenedor de boca ancha estéril

Virus VIH Suero, plasma Urgente 1 Tubo sin anticoagulante 7mL



6. Biología molecular

Micobacterias : Detección del complejo tuberculosis

Absceso, Biopsias, Bronco aspirado, Exudados7, Esputo, Esputo inducido, Heces7, Jugo gástrico, Lavado bronquioalveolar , LCR, Líquidos orgánicos (pleural, abdominal…), Orina

1día 7 días Contenedor de boca ancha estéril


1ml

BAL Biopsia LCR Orina Plasma

2 días 7 días Contenedor de boca ancha estéril Orina 1ml

CMV Tubo vacutainer con EDTA Plasma 2ml

Tubo cónico estéril de tapón de rosca LCR>0.5ml

Enterovirus LCR Plasma

2 días 7 días Contenedor de boca ancha estéril Orina 1ml

Tubo vacutainer con EDTA Plasma 2ml

Tubo cónico estéril de tapón de rosca LCR : 0.5 ml

Genotipo virus hepatitis C, Plasma Suero

2 día 15 dias 20iddi

Tubo vacutainer con EDTA

Tubo sin anticoagulante

2ml

7 ml

Carga viral C Plasma LCR Plasma Exudado úlcera

2 días 7 días




2 ml

VHS1,2

LCR>0,5ml Plasma 2ml

Torunda sin medio de transporte

VHS 6,7,8 LCR Plasma

2 días 7 días Tubo cónico estéril de tapón de rosca Tubo vacutainer con EDTA

LCR>0,5ml Plasma 2ml

2 días 10 días



Mycoplasma spp.

Sobrenadante de cultivo celular

2 días 7 días


VHB

Genotipo y estudio de resistencia) Carga viral

Suero ó Plasma Suero ó plasma

7días 21 días

Tubo sin anticoagulante o

Tubo vacutainer con EDTA Tubo vacutainer con EDTA

7ml

Virus influenzae A/B

Muestra respiratoria (Frotis faríngeo, frotis nasal, aspirado nasofaríngeo)

2días 3 días

Torunda con medio de transporte viral

Virus varicela-zoster

LCR Plasma Vesícula

2 días 7 días




LCR>0,5ml

Plasma 2ml

Virus del papiloma humano

Condilomas Endocervical

1día 15días


VIH Carga viral Resistencia VIH Resistencia integrasa

Tropismo viral

Plasma

2días 10 días 7 días 21 días 7 días 21 días 7 días 21 días


7ml

PCR Chlamydia trachomatis Neisseria gonorrhoeae

Exudado vaginal Exudado endocervical Orina (varón) Exudado rectal Exudado faríngeo

7días 14 días



7- Justificar petición 8-Es necesario contactar con microbiología para justificación y aceptación de la realización de la prueba

2 días 10 días



Parásitos intestinales Heces 2días 4días -Contenedor específico para parásitos con conservantes

-Si se sospecha Cryptosporidium spp , Giardia o Entamoeba enviar heces frescas sin conservantes (Contenedor de boca ancha estéril)

7-Parásitos/Hongos

DETERMINACIÓN MUESTRA TIEMPO DE

RESPUESTA Min Max


-Valorar la periodicidad de la filaria para la extracción diurna o

Microfilarias Sangre 2días 4días

Tubo vacutainer con EDTA nocturna de la muestra. -Si la filaria no presenta periodicidad extraer dos muestras(diurna/nocturna) La toma de muestras deberá

Oxiuros Test de Graham 2días 4días Porta-objetos con cinta adhesiva realizarse a primera hora de la mañana

Parásitos en orina

Orina de 24h

2días

4días

Contenedor específico para orina de 24 h

Orina: muestra de las 11 A.M. tras

Contenedor de boca ancha estéril 10 minutos de ejercicio

Parásitos sanguíneos Sangre 2días 4días Tubo vacutainer con EDTA

Toma de muestra para estudio de dermatofitos

Escamas uñas Escamas piel Pelos

2días 21días Contenedor estéril

Previa cita al número 951032080, la toma se puede realizar en la consulta del Servicio de Microbiología



8-Vigilancia epidemiológica/Vigilancia infección nosocomial

TIEMPO DE

RESPUESTA Min Max

MÍNIMO

E. Faringo-amigdalar - Estudio de portadores de MRSA - Estudio de bacterias multiresistentes


E. ótico - Estudio de portadores de MRSA - Estudio de bacterias multiresistentes


Exudado Nasal - Estudio de portadores de MRSA - Estudio de bacterias multiresistentes


E. pliegues cutaneos - Estudio de portadores de MRSA - Estudio de bacterias multiresistentes


E. Rectal - Estudio de bacterias multiresistentes 2 días 5 días Torunda con medio de transporte

Estudio de necropsias Contenedor estéril

L. pneumophila - Agua y muestras ambientales 2 días 14días Contenedor estéril

macroproceso procedimiento5general general … · 2017-11-03 · 5"...

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