Klinisk Mikrobiologisk Afdeling

Årsfortælling og Årsrapport 2009

KMA, RH, 2009 KMA, RH, 2009

Maj 2010

Idé og ansvarlig for indhold: Niels Høiby

Redaktion og layout: Mie Hørbo

Trykkeri: Rigshospitalets Kopicentral

Indledning 2

Bioanalytikere 3

Sekretariat 12

Hospitalsmedhjælpere og laboratoriebetjent 13

Forskning, udvikling og samarbejdspartnere 14

Årsstatistik 34

KMAs Brugervejledning 34

Rådgivning og Information 34

Ph.d. afhandlinger 2009 35

Doktordisputatser 2009 35

Artikler trykt i 2009 35

Kongresabstracts, foredrag, posters, korrespondencer o.l. 41

Diverse 48

Undervisning 52

Videreuddannelse og rejser 53

Ansatte på KMA 54

Indhold

Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på Rigshospitalet er et: European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases (ESCMID) Collabora-tive Center.

KMA, RH, 2009

2

KMA, RH, 2009

3

De følgende siders tekst og foto er først og fremmest til dig, som arbejder på Rigshospitalets Klinisk Mikrobio-logiske Afdeling (KMA), til dig der udvikler, undersøger, mikroskoperer, forsker, analyserer, tænker og i det hele taget er en del af afdelingens daglige liv. Også samar-bejdspartnere, komne nye kollegaer og andre der har interesse i et kig ind i afdelingens arbejde og forskning er velkomne til at læse med. Men hvad er formålet med denne samling fortællinger?

Formålet er først og fremmest at skabe en publikation, der præsenterer et samlet udtryk fra en afdeling, der fysisk er opdelt på flere afsnit. KMA er en afdeling med en meget bred faglig spændevidde og ansatte med forskellige fagligheder og interesser. I Årsfortællingen er der plads til at alle kan fortælle, så hele KMA, og andre, kan læse med. Emnerne er forskning, arbejdsmiljø, nyt apparatur i laboratoriet, forandrede arbejdsgange, gode ideer til det komne år, kurser, priser, afdelingens samar-bejdspartnere mm.

Årsfortællingen 2009, vil i denne 1. udgave, byde på ud-valgte historier, der fandt sted i løbet af 2009. Derudover indeholder publikationen også en fuldstændig opgørelse over diagnostiske undersøgelser, publiceringer, posters, foredrag mm. for 2009.

Årsfortællingen 2009 vil være tilgængelig i fysisk form og kan fås i sekretariatet på afsnit 9301 (tlf. 3545 6409). Den kan også downloades fra Rigshospitalets intra- og internet under Klinisk Mikrobiologisk Afdeling.

God læselyst!

Afsnit 9301, Juliane Mariesvej 22

Afsnit 7602, Tagensvej 20

Fortællinger fra Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, 2009

I hvert team er en teamleder, der fungerer som kontaktperson i en rotationsperiode. Tre gange om året er der rotation i de fire team. Vibeke Clausen er afdelingsbioanalytiker og står for det organisatoriske i team 1,2, og 3. Anna Marie Aastrup er afdelingsbioanalytikere og står for det faglige i team 1, 2 og 3. Jeanette Jakobsen er i 2009 blevet ansat som afdelingsbioanalytiker for team 4 og dækker såvel det organisatoriske som det faglige område.

Birgit Jørgensen, bioanalytiker (tv) og Marija Barbateskovic, projektbioanalytiker

Sarah Buur Bendixen, bioanalytiker

Elin Björklund Nielsen, bioanalytiker

Tine Glibstrup, bioana-lytiker (tillidsrepræsen-tant).

TEAM 1Prøvekategorier: Bloddyrkninger og spinalvæsker, våde podninger, herunder bl.a. væv og kateterspidser og øv-rige sterile væsker til bakteriologiske undersøgelser.

TEAM 2Prøvekategorier: Tørre podninger og ekspektorater til bakteriologiske undersøgelser og ekspektorater fra cy-stisk fibrose patienter.

TEAM 3Prøvekategorier: Urindyrkninger, patogene tarmbakterier, serumkoncentrationsbestemmelser og diverse prøvema-terialer fra afdeling M (Epidemiafdelingen).

TEAM 4Prøvekategorier: Primært blodprøver, urinprøver, spinal-væsker, podninger, luftvejssekreter og fæces.

Bioanalytikere

Laboratorier inddelt i team

KMA, RH, 2009

4

KMA, RH, 2009

5

Laboratorier ikke tilhørende team

Afdelingsbioanalytiker Vibeke Clausen i Prøvemodtagelsen

Oplæringen foregår således, at bioanalytikeren får en grundig oplæring i enten virologi eller bakteriologi. Desværre er mængden af arbejde for nuværende så stort, at tilbud om at komme til det andet område har været yderst begrænset, men der arbejdes på at gøre mulighederne herfor større. Dels for at den enkelte bioanalytiker kan dygtiggøre sig og dels for at afdelingen får større mulighed for at fordele arbejdsopgaverne. Den fremtidige opgave er derfor også at skabe mulighed for rotation mellem speciallaboratorierne.

- Vi blev mødt af et engageret personale på Skejby KMA, hvor samtlige persona-legrupper var repræsenteret. Alle havde forberedt sig til dagen. Der var en livlig debat, og der blev stillet mange relevante spørgsmål, så som: Hvordan sørger man for, at nyt personale bliver oplært? Hvordan foregår en rotation? Hvordan ledes et team og af hvem? Hvordan foregår kommunikationen fra ledelse til team? Hvordan hjælper man hinanden? Hvordan erhverver/vedligeholder man de kom-petencer, man besidder? Og hvem har ansvaret?

Mange andre spørgsmål meldte sig, som vi kunne nikke genkendende til. Vi un-derstregede, at det ikke er enkelt, hverken for ledelsen eller andet personale at implementere en ny arbejdsform. Det er en proces at omorganisere arbejdet og finde frem til en struktur, der fungerer bedst muligt på den pågældende afdeling, og denne proces er i en stadig udvikling.

Ledende bioanalytiker på Skejby KMA, inviterede i 2009 KMA på RH til at komme på visit for at fortælle om afdelin-gens erfaringer med at indføre teamstruktur. På Skejby KMA har man tidligere arbejdet på at indføre denne arbejds-form, og derfor var det oplagt at dele erfaringer. Et hold fra RH besøgte derfor kollegaerne på Skejby for at fortælle om den teamstruktur, der blev igangsat på vores afdeling i marts 2003. Afdelingsbioanalytiker Vibeke Clausen fortæl-ler:

Vores mål på KMA, RH med teamstrukturen er bl.a. at opnå: • Større kontinuitet i det daglige arbejde• Ejerskab for beslutninger i sit eget team• Det skal være nemt at lave ændringer, da man ikke skal blive enig med 21

andre kollegaer, men kun med sit team, som typisk består af 6-7 medarbejdere

• Det skal være overskueligt at planlægge oplæring

v/Vibeke Clausen, afdelingsbioanalytiker, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH.

Teamstruktur

Grethe Gomme,bioanalytiker

Lars Christopher-sen, bioanalytiker (sikkerhedsrepræ-sentant)

Marjan Yousefi, bioanalytiker

Annette Gregersen,bioanalytiker

Marlene Høg,laborant

Charlotte Foged, bioanalytiker

Bodil Rubenhagen,bioanalytiker

Lena Nørregaard, bioanalytiker

Katja Bloksted, bioanalytiker

Ulla Johansen, bioanalytiker

Elektroforese-, typnings- og forskningslaboratorium

Fagocyt- og monocytlaborato-rium

Parasitologisk laboratorium

Anaerob laboratorium

Hygiejne laboratorium

KMA, RH, 2009

6

KMA, RH, 2009

7

Miljøet som vi arbejder i

- Det står mig meget nært, at der er fokus på arbejdsmiljøet for bioanalyti-kerne. Et godt arbejdsmiljø med fokus på hensigtsmæssige arbejdsgange og arbejdsstillinger er vigtigt for at kunne skabe et miljø, hvor fagligheden kan blive udfoldet, og hvor der er rart at være. Mængden af arbejde på afdelingen er ofte meget stort, og der arbejdes til stadighed på løsninger, der forhåbentligt kan lette dette på forskellige områder. Som tiltag for et bedre arbejdsmiljø og et mindre arbejdspres kan nævnes;

• Fleksible arbejdstider for alle bioanalytikere inden for rammerne imel-lem 07.30 – 16.00 under hensyntagen til de givne funktioner.

• Som noget nyt afprøves mødetider imellem kl. 07.00- 09.00 i virus-funktionen over 3. mdr.

• I 2009 blev endnu en bioanalytiker færdig med en diplomuddannelse, som et led i at give bioanalytikerne en bredere faglig viden. Uddannel-sen blev sammensat af traditionelle moduler inden for bioanalytiker-diplomuddannelsen suppleret med moduler fra Danmarks Tekniske Universitet. Denne viden kan b.la. bruges til at finde mere hensigts-mæssige faglige og organisatoriske løsninger til glæde for alle.

• I alle faggrupper er der fokus på at indføre nye teknikker, der kan lette arbejdsopgaverne. Af større udstyr kan nævnes bloddyrkningssystem, identifikationssystem og PCR- apparatur.

• Etablering af IT løsninger, der aflaster bevægeapparatet. I 2010 arbejder vi på at indføre en mere simpel oprettelse af rekvisitioner til prøver.

Sygefravær og personaleomsætning Der er et sygefravær for bioanalytikergruppen på 3,7 % i forhold til 4,8 % på Rigshospitalet og en lav personaleomsætning inden for de fleste funktio-ner, hvilket er en kæmpe fordel for alle i en travl hverdag. Denne udvikling skulle gerne fortsætte, hvorfor det pågående arbejde med arbejdsmiljø og udvikling er så vigtigt.

Personalegoder til alle• Rygtræning ugentlig ledet af RH fysioterapeuter.• Fysioterapi tilbydes ugentligt for alle personalegrupper mod en mindre

brugerbetaling.• Daglig skulder/rygtræning i 5 min. ledet af den bakteriologiske afde-

lingsbioanalytiker.• Mindre motionsrum kan benyttes uden for arbejdstid. Der tilbydes

træningsprogram lagt i samarbejde med fysioterapeut tilknyttet afde-lingen.

• I 2009 har vi fået frugtordning.

Annette Dreyer, ledende bioanalytiker

Thomas N. Thomsen, bioanalytiker

For at styrke fagligheden blandt bioanalytikerne, er der mulighed for deltagelse i interne og eksterne kurser, hvis personaleressourcerne tillader dette.Ved opbygningen af delvis selvstyrende team og med en struktureret og grundig oplæring, er det lykkedes afdelingen at tiltrække og fastholde unge nyuddannede bioanalytikere. Den erfaring den bioanalytikerstuderende får gennem professionsud-dannelsen, giver en god overordnet forståelse for ansvarsområderne i klinisk mikrobiologi. Men der stilles imidlertid yderligere store krav til bioanalyti-kerens viden. Hun/han skal kunne håndtere eksi-sterende og nye metoder til påvisning af mikroorga-nismerne og mulighederne for behandling af disse, hvor bestemmelse af bakteriers resistens over for antibiotika er det største arbejdsområde.

Hertil kommer, at bioanalytikeren skal have kend-skab til de efterhånden mangeartede systemers styrker og faldgruber. Derfor er en målrettet indsats med oplæring nødvendig efter endt professionsud-dannelse.

Desuden er analysemetoderne og de forskellige mi-kroorganismer så mangeartede, at et dybtgående kendskab til faget tager flere år, og det er nødven-digt, at nogle bioanalytikere specialiserer sig inden for bestemte områder.

Anna Marie Aastrup, afdelings- og kvalitets-bioanalytiker

Uddannelsev/Annette Dreyer, ledende bioanalytiker, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH v/Anna Marie Aastrup, afdelings- og kvalitetsbioanalytiker, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

8

KMA, RH, 2009

9

Status fra bioanalytikerunderviserne

Bioanalytikerunder-viser, Lisbeth Kanstrup

Studerende i øvelab.

BiokemiNeuro-fysiologi

Nuclearmedicin

Immunologi

Patologiskanatomi

Mikrobiologi

Fysiologi

Et strategisk og praktisk puslespil Der er meget planlægning i jobbet som bioanalytikerunderviser. Modulbeskrivel-serne i den nye uddannelse bliver både lavet løbende på skolen, samtidig med at en del laves i samarbejde med de kliniske undervisere. Mange specialer er involveret, og der er mange hensyn af tage i planlægningen af de studerendes uddannelsesforløb. Der er både praktiske og strategiske spørgsmål, der melder sig:

Hvad er målene for de enkelte moduler? Hvor og hvordan kan modulerne opfyl-des bedst muligt? Er der plads til studerende i laboratoriet samtidig med oplæ-ring af fast personale? Hvad gør vi, når der er overlapning af hold? Hvad er der sket af nye ting i rutinen, som vi skal følge med i og videreformidle? Og hvordan håndterer vi ’Fronter’, som er læringsmanagementsystemet som skolen har ind-ført til kommunikation mellem skolen, studerende og de kliniske undervisere? Spørgsmål, vi hele tiden må forholde os til.

Den nye uddannelse er modulopbygget med i alt 14 moduler, mens den ”gamle” uddannelse bestod af 7 semestre. Uddannelsen giver mulighed for fortsat ud-dannelse på master- og kandidatniveau. 2009 bød derfor på et spændende uddannelsesforløb med studerende fra både den nye og gamle uddannelse.

Uddannelsens opbygningUddannelsen til bioanalytiker, professionsbachelor i biomedicinsk laboratorieana-lyse eller Bachelor Degree in Medical Laboratory Technology, foregår i København dels på Bioanalytikeruddannelsen på Professionshøjskolen Metropol (skolen), dels på de kliniske afdelinger i Region Hovedstaden samt på Københavns Praktise-rende Lægers Laboratorium (KPLL). Rigshospitalet (RH) og KPLL samarbejder om et vist antal studerende. Fordeling af de studerende administreres af en uddannel-seskoordinator. KMA, RH har p.t. en kvote på fire studerende pr. modul.

En ny uddannelse startede i efteråret 2008, men studieordningen blev først god-kendt i juli 2009. Flg. kliniske specialer er med i uddannelsen: (som noget nyt er neurofysiologi kommet med).

Studerende på KMAI 2009 har vi haft studerende fra både Modul 1 (Bioanalytikerpraksis), Modul 4 (Bioanalytisk kvalitetssikring) og Modul 5 (Tværprofessionel virksomhed). Vi har også haft studerende på 6. semester og 7. seme-ster fra den ”gamle” uddannelse. Fire studerende blev færdige på KMA i slutningen af januar 2009. Professionsbachelorprojekterne (skriftlig rapport på baggrund af et selvvalgt, praktisk arbejde udført på KMA) og efterfølgende eksamen, som foregår på skolen, endte med et fint resultat for alle.

1. februar 2009 startede fire nye studerende på 6. semester. Dette afsluttes med en individuel eksamination på baggrund af en skriftlig rapport over en selvvalgt praktisk, mikrobiologisk problemstilling. Eksamen blev afholdt på KMA med bioanalytikerunderviseren som eksaminator og en kollega fra en anden KMA-afdeling som censor. Disse studerende, suppleret med endnu én studerende, fortsatte i efteråret på KMA på 7. semester, først i en 6 uger valgfri periode, og i slutningen af 2009 var de godt i gang med deres afsluttende projekt. Efter ca. tre ugers praktiske undersøgelser skrev de flittigt på rappor-ten, som blev afleveret først i 2010.

Fra midten af april var her fire Modul 4-studerende for første gang. Modulet starter på skolen med fællesundervisning, og derefter er de studerende i de forskellige specialer i klinikken i ca. 10 uger. Her skal de have opfyldt målene for modulet på bedst mulig vis. Dette modul var nok mere styret af obligatoriske opgaver, end vi er vant til. Det blev afsluttet med eksamen, som bestod af en praktisk opgave på KMA, en skriftlig beskrivelse af en mikrobiologisk analyse/procedure inkl. kvalitetssikring og en beskrivelse af forskelle og ligheder på kva-litetssikring i KMA og et andet speciale.

Otte studerende fra Modul 1 har været på KMA i to uger. Det er 2. gang det afholdes hos os, men i forhold til første gang er der ændret i studieplanen, så vi kan ikke automatisk overføre undervisningsplanen fra det ene år til det næste. Modulet starter på skolen med fællesun-dervisning. Der er også fællesundervisning sammen med de andre specialer i klinikken. Eksamen er skriftlig og foregår på skolen. Det er dels multiple choice spørgsmål indenfor Basal laboratoriepraksis, dels essay-spørgsmål (emner indenfor de to specialer den studerende har været i). Disse spørgsmål/emner laves i samarbejde med skole og bioanalytiker-undervisere i klinikken. Andre 25 studerende har været forbi KMA til rundvisning (20 fra Modul 1 og fem fra Modul 5).

Ros til laboratorierneSom det kan ses, er der en massiv gennemstrømning af studerende på afdelingen, og vores intention er, at de studerende der kommer til vores KMA skal brænde for vores fag! Og det takker vi hermed alle i de enkelte laboratorier for at medvirke til, når de studerende har deres gang rundt i laboratorierne! Vi hører ofte ros fra de studerende mht. deres oplevelser, når de er med ved de enkelte arbejdspladser. Tak for det!

Studerende i øvelab.

Studerende i øvelab.

v/Lisbeth Kanstrup og Imran Ahmad Khan, bioanalytikerundervisere, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

- Vi vil rigtig gerne, at de nye bioanalytikere skal brænde for vores fag

KMA, RH, 2009

10

KMA, RH, 2009

11

Færdiguddannet

Lasse tilbragte 6. og 7. semester på KMA, RH, og i be-gyndelsen af 2010 kom han tilbage, men denne gang i en fast ansættelse. Lasse er 23 år og startede på bioanalyti-keruddannelsen i efteråret 2006.

Dygtige undervisereSom studerende på KMA kom han godt rundt på afdelin-gen både på afsnit 7602 og 9301. Han fik lov til at prøve meget forskelligt og det skyldes bl.a. de dygtige undervi-sere og at kollegaerne i laboratorierne gav sig god tid til at fortælle og vise de studerende, hvad de gjorde og hvorfor.

Den første oplæringsperiode som nyuddannet foregår i Prøvemodtagelsen, hvilket er et godt sted at lære en masse som nyuddannet bioanalytiker, forklarer Lasse. På den måde får man overblik over alle de forskellige prøve-kategorier og udsåningsteknikker.

Efter prøvemodtagelsen venter oplæring i de forskellige laboratorier indtil man har været hele turen rundt i de forskellige laboratorier og arbejdet med forskellige prøve-kategorier.

FremtidenDet er spændende at tænke på, hvad der skal ske i frem-tiden. Der er mange muligheder. Måske bliver det et kan-didatoverbygning eller måske vil jeg specialisere mig på afdelingen. Men først og fremmest handler det om at blive en alsidig og dygtig bioanalytiker, der kan arbejde i alle områderne, understreger han. Derefter vil han se tiden an, se hvad der dukker op, lade sig inspirere og gribe de muligheder, der kommer i hans retning.

”I laboratorierne gav de sig god tid til at forklare og vise, hvad de gjorde og hvorfor” (Lasse Kvich, bioanalytiker).

glabrata. Hvis PNA-FISH er negativ, bliver svartiden forlænget, da det er nødvendigt at tage de konven-tionelle metoder i brug. Over halvdelen af de fundne gær i blodkulturer på KMA identificeres som enten C. albicans eller C. glabrata. En implementering af PNA-FISH i laboratoriet vil derfor være en fordel, da det vil reducere svartiden for C. albicans eller C. glabrata signifikant. Dette kan give en mere effektiv og korrekt behandling af svampe-inficerede patienter.

Posteren blev udvalgt til ECCMID kongressen i Helsinki, men blev desværre ikke fremvist på selve kongressen, da der var alt for mange bidrag. Det var spændende og lærerigt at få lov at deltage i kongres-sen. Ligeledes kom vores poster med på Årets Sym-posium for Bioanalytikere på Rigshospitalet, hvor den vandt prisen for Årets Poster. Det var dejligt at blive anerkendt for sit arbejde på denne måde.

Lige nu (nov. 2009) forbereder Jane sig til at gå på barsel, men hun glæder sig rigtig meget til at komme tilbage igen på afdelingen og forhåbentlig blive oplært i de nye molekylærbiologiske metoder, der er ved at blive indført på afdelingen. Christina glæder sig lige-ledes til at blive oplært i de nye molekylærbiologiske metoder, samt til at være tovholder på implementerin-gen af Malditof i afdelingen.

Christina Nielsen , bioanalytiker.

Bioanalytiker Symposium, 2009: Christina og Jane vinder prisen Årets poster.Foto: Signe Fiig

Bioanalytikerforskning: Årets Posterv/Jane Schøn Skou og Christina Nielsen, bioanalytikere, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

Resumé af poster: PNA-FISHDa identifikation af gær i blodkulturer ofte kan tage op til flere dage ved brug af konventionelle metoder, er det i patientens interesse, hvis denne proces kan gøres hurtigere. En ny pep-tid nucleic acid fluorescent in situ hybridization metode (PNA-FISH) til identifikation af gær, kan udføres direkte på blod fra den positive blodkultur og har dermed en total svartid på 2-3 timer. Dette er en fordel, da patienter med invasive svampein-fektioner kan modtage korrekt behandling hurtigere.

Vi undersøgte identifikation af gær med PNA-FISH sammen-lignet med de konventionelle metoder. Vores projekt er bygget på 35 blodkulturer positive for Candida sp. indsamlet i perio-den nov. 2007 til nov. 2008 på afdelingen. Candida isolater fra 29 (83%) af de positive blodkulturer blev diagnosticeret vha. PNA-FISH og ligeledes sendt til Dansk Mykologisk Reference Laboratorium på Statens Serum Institut til konfirmatoriske test.

Resultater: Hurtigere prøvesvar til patientenResultatet var, at de positive PNA-FISH resultater alle stemte overens med resultaterne fra SSI. Svartiden for PNA-FISH og de konventionelle metoder i vores rutine laboratorium var henholdsvis 4 timer og 3 dage.

Den største fordel ved PNA-FISH er den korte svartid. Man kan dog argumentere for, at denne fordel kun gør sig gældende, hvis PNA-FISH er positiv for C. albicans eller C.

I forbindelse med at afdelin-gen (KMA, RH) skulle im-plementere metoden PNA-FISH på gærsvampe, blev vi opfordret til at skrive en poster om dette til ECCMID kongressen i Helsinki 2009. Ud fra data på gærpositive bloddyrkninger, indsamlet af Helle Krogh Johansen i samarbejde med Statens Serum Institut (SSI) udarbej-dede vi følgende:

Interview med Lasse Kvich, bioanalytiker, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

12

KMA, RH, 2009

13

Sekretariatet har en vigtig funktion i afdelingens daglige arbejde. Den primære opgave består i at registrere samtlige prøver fra RHs afdelinger og også prøver fra patienter tilknyttet andre hospitaler i ind- og udland. Fem gange om dagen sørger sekretariatet for, at der via det elektroniske svarsystem, udskrives prøvesvar direkte til RH’s afdelinger og via post og fax til øvrige modtagere af prøvesvar.

Prøveregistreringen i MADS (Mikrobiologisk Afdelings Data System), kan være en hård fysisk belastning for skuldre og håndled, der er mange cpr-numre, prøveoplysninger mm., der skal indtastes hver dag. For at aflaste sekretariatet er der i 2009 opstartet flere projekter, der skal mindske mængden af indtastninger og dermed forbedre det fysiske arbejdsmiljø. Eksempelvis ved hjælp af stregkoder på prøvesedler og / eller elek-tronisk rekvirering fra afdelingerne på RH. Vi arbejder på, at der i 2010 vil komme en aflastning i sekretariatet i forhold til prøveregistreringen.

Andre opgaver i sekretariatet er bl.a. at besvare de mange daglige telefonopkald fra klinikere der ønsker prøvesvar, så de kan tage stilling til behandling af patienterne. Derudover har sekretariatet ansvar for at bib-liotekets tidsskrifter holdes opdateret, arkivering, timeregistrering, forberedelse til de ugentlige konferencer, varebestilling, referater, mødeplanlægning, statistik og ad hoc administrative opgaver.

Bitte Heckmann, sekretær, tilknyttet afsnit 9301

Sekretariat

Tina Rathmann, se-kretær tilknyttet afsnit 9301 og Prof. Niels Høiby

Rakel Schiøtt, sekre-tær, tilknyttet afsnit 9301.

Bano Noor, sekretær tilknyttet afsnit 7602.

Bonnie Horsted Eriksen, sekretær, (vikar) tilknyt-tet afsnit 9301

Mie Hørbo, kommunikati-onsmedarbejder

Helle Krogh Johansen, overlæge og leder af sekretariatet

Hospitalsmedhjælpere og laboratoriebetjent

Ansvarlig forOprensning/ autoklavering af diverse laboratorie utensilierBestilling af kitlerOpfyldning og pakning af pipetterUdpakning og indstempling af prøver i modtagelsenFylde plader på vogne til laboratorietProducere Virkon til laboratorietKlargøre spande til obduktionAflevere prøvesvar i forhallen på RH hver eftermiddagGenerel rengøring

Alisa Bosnjakovic, hospitalsmedhjælper

Willy Fohlmann,Laboratoriebetejent

Ansvarlig for:Affaldshåndtering efter gældende procedurevejledninger Modtagelse og udpakning af varer, og evt. returneringBestilling af blandgas og udskiftning af disseBestilling af laboratorieartikler til det bakteriologiske rutinelaboratorium og lageretForestå transporten imellem Panum, afsnit 7602 og afsnit 9301 i sam-arbejde med de 2 hospitalsmedhjælpereAkut transport af prøver fra 9301- 7602Forestå forsendelsen af defekt udstyr

Bernado Daminovski, hospitalsmedhjælper

Ansvarlig for:Generel rengøringAffaldshåndtering Oprensning/autoklavering af diverse laboratorie utensilier efter gæl-dende vejledningerBestilling af rengøringsprodukterModtagelse af varer, sætte disse på plads og returnerer fejlleverancerBestille kitlerFylde plader på vogne til laboratoriet.Producere Virkon til laboratoriet

For at de daglige arbejdsgange skal kunne fungere i rutine- og forskningslaboratorierne på både afsnit 9301 og 7602, har KMA tre ansatte til at varetage mangeartede praktiske opgaver.

KMA, RH, 2009

14

KMA, RH, 2009

15

Bihulerne som fokus for kroniske lungeinfektioner hos cystisk fibrose patienter

v/Helle Krogh Johansen, overlæge, dr. med., Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

Cystisk fibrose (CF) er en arvelig sygdom, hvor patienterne i barnealderen ofte har tilbagevendende lungeinfetioner med bl.a. Haemophilus influenzae, staphylokokker og pneumokok-ker. Disse bakterielle infektioner kan udryddes med antibiotika og giver sædvanligvis ikke gener for patienterne. Når CF bør-nene bliver større, kan de lejlighedsvis blive koloniseret med Pseudomonas aeruginosa i deres lunger.

Hver gang disse bakterier optræder, behandles infektionen med intensiv antibiotikaterapi i 3 uger, hvor patienterne in-halerer colistin og tager ciprofloxacin peroralt. Hvis ikke P. aeruginosa infektionerne behandles intensivt, kan de udvikle sig til kroniske lungeinfektioner, hvor patienterne derefter skal behandles med intravenøs antibiotika i 2 uger hver 3. måned i resten af deres liv for at forsinke ødelæggelse af lungevævet pga. inflammation, som i sidste ende medfører lungesvigt og tidlig død.

Vi har tidligere vist, at de initialt koloniserende P. aeruginosa stammer i CF patienternes lunger ofte har den samme geno-type, når de næste gang dyrkes fra patienterne ekspektorat efter antibiotikabehandling og et bakteriefrit interval. Det samme gælder kronisk inficerede CF patienter, som i årevis er inficeret med P. aeruginosa, som har den samme genotype.

Stort set alle CF patienter har ved CT-scanning tegn på kronisk sinusitis (bihulebetændelse) og polypper. Hos lun-getransplanterede CF patienter er der fundet de samme P. aeruginosa genotyper, som patienterne har i deres lunger før transplantation. Ved dyrkning af sekret fra bihulerne og fra bronkoalveolar lavage hos transplanterede patienter er der endvidere påvist overensstemmelse mellem vækst af identi-ske species i hhv. bihuler og lunger.

Pus fra kæbehulen hos en CF patient som ikke er kronisk inficeret med Pseu-domonas aeruginosa, men ved dyrkning af pus var der vækst af P. aeruginosa med den samme genotype som i patientens lunger.

Helle Krogh Johansen, overlæge

Et udvidet behandlingstilbudVi mener derfor, at patienternes bihuler er et vigtigt fokus for de tilbagevendende lungebetændelser specielt hos børnene, før de bliver kronisk inficerede i deres lunger. I samarbejde med øre-næse-hals kirurgisk klinik, CF centret og Klinisk Mikrobio-logisk Afdeling tilbyder vi et udvidet behandlingstilbud til disse patienter, hvor de kan få lavet bihulekirurgi (CT vejledt Functio-nal Endoscopic Sinus Surgery, FESS) mhp. at sanere og skabe afløb for infektionsfokus i deres bihuler, og for at bedre deres livskvalitet. Behandlingen har været tilbudt i snart 3 år og til nu har næsten 80 CF patienter i alderen 6 til 50 år taget imod det nye behandlings tilbud. Ved dyrkning af prøver fra bihulerne og lungerne har vi fundet god overensstemmelse mellem de bak-terier, som vi har dyrket fra patienternes lunger i perioden op til operationen, og de bakterier vi dyrker i prøver fra deres bihuler.

Ved pulsed-field-gel-electrophorese (PFGE) har vi fundet den samme P. aeruginosa genotype i bihulerne og i lungerne, såvel hos kronisk inficerede ældre patienter som hos børn der kun lejlighedsvis er koloniseret med P. aeruginosa.

Efter operationerne tilbydes patienterne efterbehandling og kontrol af deres bihuler hos øre-næse-hals (ØNH) lægerne, ligesom de under operationen skylles med lokal antibiotika mhp. at udrydde de bakterier, som ikke er blevet fjernet ved operationen. I et helt år efter operationen fortsætter patienterne med antibiotikaskylning af bihulerne 2 gange dagligt, ligesom de kommer til kontrol og podning af deres bihuler 5 gange. Målet med dette behandlingstiltag er at forsøge at udrydde et vigtigt fokus for patienternes tilbagevendende P. aeruginosa koloniseringer og dermed udskyde tidspunktet for debut af den kroniske lungeinfektion.

Forskning, udvikling og samarbejdspartnereDe følgende artikler er et udpluk af den vidtrækkende forskningsaktivitet der i 2009 er blevet opstartet eller afsluttet på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på Rigshospitalet.

KMA, RH, 2009

16

KMA, RH, 2009

17

Hvorfor et videnskabeligt arbejde om biofilm?Siden 1976 har man på Rigshospitalet, med stor succes, behandlet CF patienter med kronisk P. aeruginosa infektion intensivt med meget store mænger anti-biotika. I de første år ved rutinemæssige intravenøse (i.v.) anti- P. aeruginosa behandlinger (sprøjtekure) i 14 dage 4 gange om året, og siden 1987 ved en kombination af i.v. behandling og daglige antibiotika inhalationer. Før 1976 over-levede kun 50 % af CF patienterne 5 år med kronisk P. aeruginosa infektion. I dag lever langt de fleste patienter i årtier med deres kroniske infektion.

Til trods for den intensive brug af antibiotika mod kronisk P. aeruginosa infek-tion, så forbliver infektionen kronisk, når den først er etableret i CF patienternes lunger. Behandlingen kan udskyde og dæmpe infektionen, men den kan ikke udrydde den. På sigt oplever patienter med kronisk P. aeruginosa infektion (eller anden kronisk lungeinfektion) en konstant nedbrydning af lungevæv, dels som følge af infektionen og dels som følge af inflammation (kroppens betændelses-reaktion på infektion). Konsekvensen af dette er faldende lungefunktionsniveau over tid. Kronisk lungeinfektion ved CF, er således den primære dødsårsag for patienterne.

Vi har med vores arbejde søgt, at finde en videnskabelig forklaring på, hvorfor den intensive brug af antibiotika ikke kan udrydde den kroniske P. aeruginosa infektion ved CF. Vi ved, at behandlingen kan bremse infektionen. Vi ved også, at P. aeruginosa bakterien danner biofilm, som beskytter denne mod at blive nedbrudt af kroppens eget immunforsvar og antibiotika.

Vi har derfor arbejdet ud fra en antagelse (hypotese) om: At den intensive anti-biotika behandling evner at bremse P. aeruginosa infektionen, men den evner ikke at stoppe bakteriens dannelse/produktion af biofilm. Derved har vi søgt at påvise, at bakteriens evne til at producere biofilm er en af årsagerne til, at P. aeruginosa infektionen forbliver kronisk hos CF patienterne. Hvis bakterien ikke producerede biofilm, ville den, alt andet lige, ikke være en kronisk infektion, men kunne behandles og udryddes.

Hvad vi kan udlede fra vores arbejde? I lighed med andre tidligere undersøgelser indikerer denne undersøgelse, at den kroniske bakterielle lungeinfektion hos CF patienter er en biofilmbaseret infek-tion. Vi fandt således P. aeruginosa bakterien i mikrokolonier indlejret i en matrix af alginat (sukkerslim omkring bakterier), både i sputum og i det mukopurulente sekret i de øvre luftveje. De bakterier, der producerer alginat og vokser i biofilm bliver ikke fagocyteret (spist) af PMNerne. Dette underbygger vores hypotese for hele studiet.

Thomas Bjarnsholt, civil-ingeniør.

Pseudomonas aeruginosa biofilm i luftvejene hos patienter med cystisk fibrose

Vores observationer i dette studie indikerer, at det intensive antibiotika behandlingsregi-me, som praktiseret på Rigshospitalet, holder bakterierne i ave (dog uden at kunne fjerne dem) i den konduktive del af lungerne (øvre del af luftvejene), og behandlingen yder en høj grad af beskyttelse mod at bakterierne trods deres produktion af biofilm spreder sig til den respiratoriske del af lungerne (nedre del af lungerne) over længere tid. Det ser således ud til, at den konduktive del af lungen fungerer som et bakterielt reservoir eller fristed, hvor biofilm bakterierne kan gro, men ikke fjernes selv med meget store mængder antibiotika mm.

Desværre forhindrer det intensive behandlingsregime ikke, at den kroniske infektion og patienternes immunforsvar som reaktion herpå, nedbryder patienternes lungevæv og dermed lungefunktionsniveau på længere sigt.

Forlænget levetidDet intensive antibiotika behandlingsregime fra 1976 har forøget levetiden for CF pa-tienter med kronisk P. aeruginosa infektion markant sammenlignet med overlevelsen før indførslen af regimet. Behandlingsregimet er blevet yderlig forbedret med introduktionen af stoffet azithromycin i 2001, som har en hæmmende effekt på biofilmdannelsen.

Efter vores opfattelse, er det yderst vigtigt, at CF patienterne forstår, hvilke komplikationer en kronisk P. aeruginosa infektion skaber for den enkelte patient, og at hvis man fravæl-ger eller nedprioriterer dele af det intensive antibiotika behandlingsregime, så har man, alt andet lige, et dårligere udgangspunkt for at leve længere med sin kronisk P. aeruginosa infektion. I erkendelse af, at kronisk P. aeruginosa infektion hos CF patienter ikke for tiden kan udryddes, når den er etableret i lungerne hos patienterne, er det derfor yderst vigtig at udnytte alle forhåndenværende muligheder for at søge at fjerne P. aeruginosa infektio-nen, inden den er etableret som kronisk infektion i CF lungerne.

Ovenstående er et uddrag af en artikel skrevet til Cystisk Fibrose bladet med udgangs-punkt i det videnskabelige arbejde, jeg har udført sammen med Peter Østrup Jensen2, Mark J. Fiandaca3, Jette Pedersen4, Christine Rønne Hansen6, Claus Bøgelund Ander-sen5, Tacjana Pressler6, Michael Givskov1 og Niels Høiby1,2

Arbejdet er publiceret som artikel med titlen “Pseudomonas aeruginosa biofilms in the Respiratory Tract of Cystic Fibrosis Patients” i Pediatric Pulmonology. Vi henviser til origi-nalartiklen for alle videnskabelige resultater og referencer, der knytter sig til ovenstående artikeluddrag. Se figurer tilknyttet denne artikel på næste side.

Noter: 1) International sundhed, Immunologi og Mikrobiologi, Sundhedsvidenskabeligt Fakultet, Københavns Universitet. 2) Klinisk Mikrobiologisk afd. 3) AdvanDx, Inc. Woburn, Massachusetts, USA. 4) Bartholin Institutet, 5) Patologisk afd., Rigshospitalet og 6) CF Centret, Rigshospitalet.

v/Thomas Bjarnsholt, civilingeniør, ph.d., Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

18

KMA, RH, 2009

19

Figur A til venstre: Diversiteten af P. aeruginosa biofilm i sputum. Sputum prøver fra 77 kronisk P. aeruginosa inficerede CF patienter blev undersøgt ved Gram farvning og specific farving.Tilstedeværelsen af P. aeruginosa som den eneste bakterie blev verificeret med den specifikke farvning

Figur ovenfor (A,B,C): P. aeruginosa biofilmene forbliver i den konduktive zone, og kun meget få planktoniske (enkelte) bakterier findes I den respiratoriske zone. Her bliver de spist af PMNer. (A) Bakterier i biofilm inde i en bronkie visualiseret med specifik farvning (41-årig CF mand med kronisk P. aeruginosa mucoid og non-mucoid infektion i 28 år). (B og C) viser sammenfald af alveoler.

Figur ovenfor (A,B):Mikroskopisk undersøgelse af ikke intensivt behandlede lunger fra kronisk inficerede CF patienter. (A) Massive bakterielle biofilm visualiseret med specifik farvning, både i den konduktive (A) og den respiratoriske zone (B). Disse P. aeruginosa biofilm observeres i store mængder både i den konduktive og den respiratoriske zone. Store dele af lungevævet er ødelagt i begge zoner.

- Jeg håber vi kan opnå en mere individuel og optimal behandling for den enkelte cystisk fibrose patient og for alle patienter generelt...

Hun er bachelor i medicin, men lysten til at forske, fordybe sig og gå på opdagelse i ”den virkelige verden” fik Chri-stina S. Dalbøge til at tage et års orlov fra medicinstudiet. Hun har allerede hvervet mange af de 30 patienter med cystisk fibrose (CF), der skal deltage i hendes forskningsprojekt. Hun arbejder både på KMA og på CF afsnittet 5003 og 5063 på Rigshospitalet, hvor hun samarbejder med overlæge Tania Pressler.

Hvordan omsættes den medicin i kroppen, som patienter med cystisk fibrose tager? Sådan lyder hovedspørgsmå-let i forskningsprojektet, der inkluderer forsøg med 30 frivillige CF patienter. Helt specifikt er projektets formål at undersøge sammenhængen mellem hastigheden af nedbrydning af antibiotika og de arvelige forskelle, der er i de leverenzymer, der nedbryder antibiotika. Christina på, at hendes forskning i fremtiden vil betyde, at man kan give en mere individuel og optimal antibiotikabehandling til den enkelte CF patient på Rigshospitalet – og alle patienter generelt, der tager den medicin, som testes i undersøgelsen.

Det var til en undervisningstime i mikrobiologi på Panum på 6. semester, at Christina så en mulighed for at komme til at forske og lade pensum være pensum – i hvert fald i en overgang. Forelæseren var Helle Krogh Johansen, overlæge på KMA, der bl.a. fortalte om forskellige forskningsprojekter og muligheden for medicinstuderende til at prøve kræfter med forskning. Efter undervisningen indfangede Christina sin forelæser, og det bar frugt. Helle Krogh Johansen fungerer nu som vejleder på projektet, der er finansieret af Forskningsrådet for Sundhed og Syg-dom. Christina har været scholarstipendiat på KMA siden 1/9/2009 og fortsætter til og med 31/8/2010.

FremtidenChristina ved ikke, om det bliver det mikrobiologiske speciale, der kommer til at optage hende i fremtiden, men hun vil helt sikkert vælge et speciale, hvor der er mulighed for at forske samt have den personlige kontakt med patienterne. Fremtiden er spændende, og hun glæder sig til det praktiske arbejde som læge. Men der skal selvfølgelig også være plads til børn på et tidspunkt, indskyder hun med et skævt smil.

”Det er fedt at lave noget andet end at læse og have 100 procent fokus på ét emne.”

En studerende laver forskning på KMA

Christina S. Dalbøge, skolarstipendiat.

Interview med Christina S. Dalbøge, skolarstipendiat, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

20

KMA, RH, 2009

21

Hvad er en Biofilm?Biofilm er en speciel måde for bakterier og svampe at vokse på. De danner små kolonier, hvor de omgiver sig med en matrix, de selv har dannet. Denne form for organiseret vækst giver mi-kroorganismerne nogle særlige fordele, de ikke ville have ved uorganiseret spredt (planktonisk) vækst. Kendetegnende for biofilm er deres udtalte modstandsdygtighed overfor forskellige forsøg på fjernelse såsom desinfektionsmidler og ekstreme omgivelser. Altså kan man sige, at biofilm vækst er en overlevelsesstrategi for mikroorganismerne.

Oprindelig blev biofilm vækst beskrevet af ikke medicinske mikrobiologer, som arbejdede med mikroorganismer i naturen som f.eks. slimlag på sten i vandløb eller på planterødder. De blev også påvist i andre omgivelser som f.eks. vandrør, brusere, afløb og spabade og er naturligvis også påvist i hospitalsmiljøet. Det blev foreslået, at biofilm-organisering også kunne være bag-grunden for visse kroniske infektioner, som netop er kendetegnet ved modstandsdygtighed overfor immunforsvaret og den antibiotiske behandling. Inden for dette område har vores afde-ling været pionerer.

Nye metoder til at behandle biofilmEn styrke i påvisningen af biofilm har været, at de oprindeligt ikke blev påvist i den medicinske verden, men derimod af mere tekniske videnskaber, som i højere grad mestrer vanskelige laboratoriemetoder. Vores afdeling har til gengæld været utrolig dygtige til at se fordelene ved at implementere disse metoder i den medicinske mikrobiologi; ikke blot til påvisning af infektio-nerne, men også til sammen med de andre videnskaber at opstille modelsystemer til bedre at forstå disse infektioner – hvordan de medfører sygdom hos mennesker, hvordan de afværger angreb fra vores immunsystem, hvordan man bedre kan bekæmpe dem med antibiotika og finde på nye metoder til at behandle biofilm infektioner. I denne forbindelse er dyremodeller et vigtigt redskab. En svaghed, set med medicinske øjne, i hele udviklingen af biofilm-begrebet har netop været den relativt sene involvering af klinikere og dermed udvikling af den medicinsk relevans af observationerne fra andre grene af biofilm forskningen.

Et helt særligt, men meget aktuelt problem er fremkommet med de nye molekylærbiologiske metoder, der påviser mikrobielt genetisk materiale, men ikke nødvendigvis mikroorganismen. Ligeledes kan det genetiske materiale være tilført prøvematerialet ved uheld i hele processen fra selve prøvetagningen til vores håndtering af prøven i laboratoriet.

Sidst, men måske vigtigst, står vi med samme problem som gode gamle Robert Koch gjorde for over 100 år siden – nemlig tolkning af betydning af fund af mikroorganismer. Robert Koch opstillede sine postulater, nemlig at mikroorganismen skulle påvises i relevant materiale, at sygdommen forsvinder, når mikroorganismen var væk, samt at mikroorganisme skulle kunne fremkalde lignende sygdom, når den blev overført til dyr.

Claus Moser, afde-lingslæge

Biofilm – en modstandsdygtig matrix

Mucoide biofilmdan-nende P. aeruginosa på dyrkningsmedie. Bemærk det slimede glinsende udseende.

Fagocytlaboratoriet har i 2009 fortsat fokuseret forskningsaktiviteten på inter-aktioner mellem neutrofilocytter og Pseudomonas aeruginosa biofilm ved kro-nisk lungeinfektion hos patienter med cystisk fibrose. For at belyse aktiviteten af neutrofilocytter i lungerne hos inficerede patienter med cystisk fibrose har vi i sputum undersøgt iltforbrugende mekanismer, der kan ligge til grund for iltsvindet i det endobronkielle mucus, hvor P. aeruginosa gror i biofilm.

Således har vi i 2009 afsluttet et projekt, der påviser, at sputum fra inficerede patienter med cystisk fibrose indeholder neutrofilocytter, der accelererer ilts-vindet pga. aktiveret respiratorisk burst. Det respiratoriske burst består initialt af reduktion af ilt til iltradikaler - i modsætning til terminale oxidasers reduktion af ilt til vand ved aerob respiration. Derfor formodes neutrofilocytternes reduk-tion af ilt til iltradikaler at accelerere iltsvindet i inficeret endobronkialt mucus samt at bidrage væsentligt til det oxidative stress i lungerne hos inficerede patienter med cystisk fibrose. I tilgift til neutrofilocytternes forbrug af ilt til iltra-dikaler har vi i 2009 indledt et projekt til undersøgelse af de aktiverede neutro-filocytters forbrug af ilt til dannelse af kvælstofilte.

Påvisningen i sputum af neutrofilocytter med aktiverede baktericidale meka-nismer, som det respiratoriske burst, understreger relevansen af Fagocytlabo-ratoriets fortsatte samarbejde med ISIM, KU om opklaring af P. aeruginosas evne til at modstå aktive neutrofilocytter. I denne sammenhæng har vi afsluttet 2 projekter, der viser, at P. aeruginosa biofilm kan reagere på neutrofilocytter ved at producere cytotoksiske mængder af rhamnolipid, der kan give P. aer-uginosa biofilm beskyttelse mod neutrofilocytterne både in vivo og in vitro.

Resultatet af projekterne fra 2009 tegner det billede, at P. aeruginosa evner at beskytte sig mod aktiverede neutrofilocytter i det endobronkielle mucus hos patienter med cystisk fibrose. Samt at P. aeruginosa kan vokse ved det ilts-vind, som er konsekvensen af de aktiverede neutrofilocytter.

Derfor har projekterne fra 2009 betydet, at 2010 er fokuseret på de mekanis-mer, hvorved P. aeruginosa kan vokse under iltsvind forårsaget af neutrofilo-cytternes produktion af iltradikaler og kvælstofilte.

Neutrofil granulocyt udsætter fagocyterede Pseudomonas aeroginosa for superoxid

Peter Østrup Jensen, forskningsleder.

Fagocytlaboratoriet 2009

v/ Claus Moser, afdelingslæge, ph.d., Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RHv/ Peter Østrup Jensen, forskningsleder, ph.d. Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

22

KMA, RH, 2009

23

16S analyse giver hurtigere svar til patienten

Sammen med forskere fra Ålborg og Århus har KMA, ved en fondsansøgning, fået penge fra ABT-fonden (Arbejdskraft Besparende Teknologi) til at undersøge forskellige PCR diagnosetek-nikker med henblik på at forkorte indlæggelse af patienter med infektionsrelaterede sygdomme. Et af de områder som Rigshospitalet skulle undersøge var identifikation af bakterier direkte fra bloddyrkningskolber med 16S analyse. Til dette formål er der indkøbt en sekvenator 3130xl, fra Applied Biosystems, og den blev installeret på afdelingen i april måned 2009

Som mit afgangsprojekt på min diplomuddannelse, under vejledning af molekylærbiolog Thomas Bjarnsholt, startede jeg 16S analysen. Dette var et delprojekt, hvor analysen 16S blev imple-menteret i vores afdeling. Mit arbejde var koncentreret omkring oprensning af bakterielt DNA direkte fra blodkolber. Succeskriteriet for en anvendelig analyse var, at svartiden skulle ligge indenfor en arbejdsdag, det vil sige, at der foreligger et identifikationssvar på positive bloddyrk-ningskolber samme dag, den bliver fundet positiv. Alt efter hvilken bakterie der har forårsaget infektionen, kan en identifikation tage 2-3 dage med fænotypisk identifikation, og i nogle tilfælde længere tid.

Selvom molekylære metoder er ved at vinde indpas i det bakteriologiske rutinelaboratorium, og i dag anvendes i større omfang end tidligere, er denne nye teknologi ikke væsentlig udbredt end-nu. Stadig flere metoder bliver afprøvet, og udviklingen er enorm. Set i lyset af KMA´s rolle som serviceafdeling for kliniske afdelinger, finder jeg denne udvikling meget spændende og ser det som vores pligt at implementere de bedst mulige analyser til gavn for patienterne til enhver tid.

Hvorfor dyremodeller er så vigtige!Vi har på vores afdeling, i omkring 20 år, haft en dyremodel af kronisk biofilm infektion med Pseudomonas aeruginosa i lungerne på rotter og mus, og gennem de seneste 3-4 år også en fremmedlegeme biofilm infektionsmodel med P. aeruginosa i bughulen på mus. For tiden er vi ved at etablere en dyremodel af kroniske biofilm infektioner med P. aeruginosa i sår. Tre vidt forskellige kliniske situationer, som hver har deres særlige baggrunde og skal angribes forskelligt. Men der er også lighedspunkter, så-ledes at erfaringer i eksperimentelle behandlinger af en biofilm infektion måske kan overføres til andre biofilm infektioner.Og netop i hele dette scenario er dyremodeller utroligt vigtige for at kunne forstå mekanismerne i biofilm infektionsforløbet, afprøve eksperimentelle behandlinger in-den de overføres til mennesker og ligesom Robert Koch, undersøge den medicinske betydning af nye eller for os ukendte mikroorganismer identificeret ved de nye mole-kylærbiologiske metoder.

KMA og verdenVores afdeling, inklusiv instituttet på Panum (ISIM) og vores samarbejdspartnere på Danmarks Tekniske Universitet og Teknologisk Institut har en overordentlig fremtræ-dende rolle i forskning og behandling af biofilm infektioner. Vi blev for fire år siden bedt om at organisere en workshop ved det fjerde biofilm symposium i Quebec i Ca-nada af det amerikanske mikrobiologiske selskab (ASM). En workshop er kendetegnet ved deltagelse af særligt interesserede folk, og da vi ikke kunne udføre dyreforsøg i Quebec valgte vi i stedet at filme en række af for-søgssituationerne. Workshoppen, der blev formidlet af Peter Østrup Jensen (KMA), Thomas Bjarnsholt (KMA), Oana Ciofu (ISIM) samt mig selv blev således et mix af baggrundsstof, filmklip samt egentlige forsøgsresultater. Vi fik gode evalueringer, og vi blev inviteret igen i 2009 til det femte biofilm symposium afholdt i Cancun i Mexico. Denne gang havde vi inviteret Mark Shirtliff fra Baltimore med, da han udover at være canadier og dansk gift også har en dyremodel med Staphylococcus aureus biofilm infektioner i knoglerne. På denne måde fik vi endnu større perspektiv på vores work-shop og evalueringerne var endnu bedre. Vi havde også Lars Christophersen (KMA) med i Cancun, og jeg satser på, at vi bliver inviteret igen næste gang ASM afholder en sådan kongres. Vi har også en europæisk biofilm kongres, hvor det andet møde er planlagt afholdt i København 2011, og jeg håber på, at vi også der får indført en work-shop om biofilm infektionsmodeller.

Venskaber over hele klodenAl denne aktivitet medfører en del henvendelser fra forskningsgrupper rundt om i verden, som gerne vil komme og se, hvordan vi gør. Enten fordi de gerne vil sætte en tilsvarende model op, hente inspiration til en anderledes model eller blot være her i en periode og udføre forsøg med deres yndlingsmikroorganisme i én af vores model-ler, da ikke alle har facilliter til disse forsøg, og derfor bedre kan få tingene gjort under vores vejledning.

Ofte kommer disse højt begavede mennesker også med kundskaber, vi kan lære af. Sidst men slet ikke mindst, medfører dette venskaber over hele kloden. Og selvom man ikke ses særlig tit, faktisk kun meget sjældent, er det altid noget helt specielt at mødes igen.

P. aeruginosa helt peri-fært i de små alveoler. Muselunge 5 dage efter infektion med mucoide biofilmdannende P. aeruginosa. Non-mucoide P. aeruginosa elimineret fra lungerne tidligere i forløbet

Maria Kristin Björnsdóttir, bioanalytiker, igang med at afpipettere et færdigt sekvensprodukt

v/Maria Kristin Björnsdóttir, specialist bioanalytiker, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

Maria ved sekvenator 3130xl

KMA, RH, 2009

24

KMA, RH, 2009

25

Et nyt virus

Stratagene Mx3005P, Real Time PCR System

Claus Bohn Christiansen,afdelingslæge.

Jeanette Jacobsen, afdelingsbioanalytiker

De seneste år har budt på flere nye og mere eller mindre farlige luftvejsvirus – SARS var løs i 2003 og senere kom fugleinfluenza i flere varianter. I 2009 dukkede så en ny influenza op – den såkaldte svineinfluenza.

Når der dukker et nyt virus op, gælder det om at finde ud af, hvem der skal kunne påvise det pågældende virus. Er det os selv, eller er det vores kolleger på Statens Serum Institut? I denne vurdering ligger blandt andet spørgsmålet, om det er et virus, der spreder sig lokalt i Danmark, eller om det kun kommer til landet med rejsende i et begrænset antal? Hvor lang tid tager det at sætte en test op, og hvor god kan den blive? Nogle virus betragtes at være meget farlige og kræver derfor specielle labo-ratorieforhold for at undgå smitte til personalet. De farligste virus kan vi ikke arbejde med i viruslaboratoriet.

I efteråret 2009 var vi meget optaget af at påvise ”svineinfluenza”. Derfor brugte vi meget energi på at få et fornuftigt flow af prøver gennem viruslaboratoriet, og det har været nødvendigt at undersøge prøver alle dage, også søndage og nogle dage to gange om dagen for at være i stand til at analysere alle prøver. Med nye metoder, er det blevet nemmere at påvise et bestemt virus med stor sikkerhed og relativt hurtigt inden for 1–2 dage. Mange af vores analyser tager kun 4 timer, men for at bruge arbejdskraften fornuftigt, er det nødvendigt at køre et vist antal prøver af gangen. Mange gange er det, der tager længst tid, at få prøven fra patienten fragtet til labora-toriet - i nogle tilfælde er hastigheden under 100 meter i timen!

Flere typer Influenza ADer er mange slags influenza A virus, derfor er det nødvendigt at bestemme, hvad det er for et virus, der skal types. Til det laver vi en ekstra undersøgelse på alle de positive influenza A prøver, vi finder. Vi kan skelne mellem tre influenza A typer; ny H1N1, H3N2 og gammel H1N1. I sidste sæson var det overvejende H3N2-typen vi fandt, og nu er det udelukkende ny H1N1.

Ud over at påvise arvemateriale fra virus (RNA) kan det i nogle tilfælde være nødvendigt at lave yderligere undersøgelser. Når man dyrker bakterier, finder man samtidigt ud af, hvilke antibiotika der kan anvendes til behandling. Det sker ved hjælp af hæmningszoner på en plade, hvor bakterierne vokser. Sådan er det ikke med virus, her skal der en grundigere analyse af RNA til for at finde ud af, om der er mutationer i bestemte områder. Det tager derfor længere tid, hvis vi skal undersøge resistensforhold. Det er meget arbejdskrævende, og vi kan ikke nå at undersøge alle prøver, men må nøjes med at lave det på udvalgte patienter, hvor det skønnes, at der er behov for det.

Øget beredskab i viruslaboratorietv/Jeanette Jacobsen, afdelingsbioanalytiker, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH.

I sommeren 2009 var det uvist, hvilke konsekvenser den nye influenzavariant ville få med henblik på epidemiens størrelse og sygdomsforløb. I virusfunktionen lagde vi en arbejdsplan, som kunne leve op til den efterspørgsel, der formentlig ville opstå i løbet af efteråret 2009. Dette forventede pres på viruslaboratoriet betød, at personale skulle oplæres og indkøb af laboratorieartikler herunder diagnostiske kit skulle være på plads inden den forventede meraktivitet. Det blev hurtigt bestemt, at Influenza PCR-analysen skulle køres mandag til søn-dag. Der blev derfor etableret tilkaldevagt for bioanalytikere søndag, da søndag indtil dette tidspunkt ikke var omfattet vagtordningen i viruslaboratoriet.

I perioden november til januar gik analyseantallet fra omkring 15 op til 120 in-fluenzaprøver om ugen, hvilket betød stor aktivitetsforøgelse og koordinations-problemer, idet der opstod flaskehalse i forhold til de øvrige analyser. Aktiviteten fladede ud primo 2010 og er på nuværende tidspunkt tilbage på det tidligere ni-veau. Virus bioanalytikerne kom godt igennem perioden, med stor interesse og arbejdsomhed for at levere den størst mulige faglighed til fordel for patienterne.

NudiSENS EasyMAG, til oprensning af RNA/DNA. det står på maskinen

v/Claus Bohn Christiansen, afdelingslæge, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

26

KMA, RH, 2009

27

”Sygehuslæger beroliger patienter og pårørende: Der er fuldt fokus på den dødelige bakterie, der har dræbt op mod 20 indlagte”. (Politiken d. 20.03.2009)

Sådan lød en af de talrige overskrifter, der huserede februar og marts måned 2009, efter at man på Gentofte Hospital havde et udbrud af diare forårsaget af Clostridium diffi-cile ribotype 027, en type der i Canada og Nordamerika tidligere var rapporteret som sær-lig sygdomsfremkaldende og epidemisk optrædende. Andre nordsjællandske sygehuse kunne ligeledes meddele om fund af denne ribotype, og alle hospitaler i regionen fik travlt med at diagnosticere og bekæmpe udbruddet.

Ingen grund til panikPå Klinisk Mikrobiologisk Afdeling på RH, har vi siden 1996 rutinemæssigt dyrket for forekomsten af Cl.difficile, og vi kunne straks berolige med, at vi ikke havde epidemiske tilstande. Siden 1976 har man vidst, at toxinproducerende Cl.difficile, en anaerob Gram- positiv sporedannende stav, kunne forårsage diare hos patienter i antibiotisk behandling.

Omkring 20% af alle antibiotisk behandlede patienter udvikler diare, og af disse 20% med diare vil igen 20% være forårsaget af Cl.difficile. Sygdomsbilledet kan variere fra løs til tynde vandige afføringer og i ekstreme tilfælde medføre pseudomembranøs colitis, en toksisk tilstand der kan forløbe fatalt hvis ubehandlet. Derfor har vi, så snart vi fandt vækst af Cl.difficile hos patienter, telefonisk kontaktet de pågældende afdelinger og anbefalet isolation og eventuel behandling. Vi har årligt mellem 150 – 300 nye patienter, der udvikler diare forårsaget af Cl.difficile, og har ikke set nogle ændringer i forekomsten de sidste 10 år.

Isolation er vigtig – uanset årsagDer findes mange ribotyper af toksinproducerende Cl.difficile, og på RH har vi indtil videre diagnosticeret 30 for-skellige typer, der alle kan give både let eller alvorlig diare. Da Cl.difficile findes overalt (jord – dyr – kalve og svi-nekød) og er hyppigt forekommende hos i øvrigt raske børn i alderen 0-2 år vil det næppe kunne lade sig gøre at nedbringe antallet af inficerede med diare symptomer. De patienter der hyppigt rammes af Cl.difficile infektioner er kronisk syge, der ofte bliver behandlet med antibiotika. Hos hæmatologiske, onkologiske, kronisk nyresyge og pa-tienter med kroniske mave tarmsygdomme forekommer Cl.difficile diare væsentligt hyppigere end hos ikke kronisk syge patienter. Som med andre diare fremkaldende bakterier kan der forekomme smittespredning, og derfor er det vigtigt at isolere patienter med diare uanset årsag.

Efter overstået behandling af infektionen forekommer der desværre en del tilbagefald. Hos vores patienter på RH er tilbagefalds frekvensen ca. 15-20%, og nogle patienter risikerer talrige episoder med Cl.difficile forårsaget af diare. I langt de fleste tilfælde er tilbagefaldet forårsaget af samme type bakterie, men i nogle tilfælde findes en anden ribotype, der tyder på ny infektion med Cl.difficile.

Vores anbefalingerDiare forårsaget af Cl.difficile er derfor desværre kommet for at blive. Derfor er det vigtigt hurtigt at sende fæces-prøver fra patienter med diare til Klinisk Mikrobiologisk Afdeling. Vi anbefaler, at der tages tre på hinanden følgende fæcesprøver til dyrkning, gerne fra samme dag, og hvis det drejer sig om svært påvirkede toksiske patienter, kan vores afdeling kontaktes med henblik på hurtig diagnostik samtidig med, at vi anbefaler behandling hos disse pa-tienter med vancomycin umiddelbart efter prøvetagning.

Sygehuse kæmper mod infektion

Michael Tvede, overlæge

I store dele af verden hvor drikkevand er baseret på renset overfla-devand udgør smitte med parasitterne Cryptosporidium og Giardia en alvorlig sundhedsrisiko. En ny teknologi skal overvåge drikke-vandskvaliteten og forhindre at inficeret vand når ud til forbrugerne.

I den industrialiserede verden er drikkevandet for omkring halv-delen af forbrugerne baseret på behandlet overfladevand. Dette medfører en betydelig sundhedsrisiko, og hvert år rapporteres om udbrud af tarminfektioner med parasitterne Cryptosporidium og Giardia overført gennem drikkevandet. For raske personer medfø-rer dette normalt diarré i 10-14 dage, men for svage og syge men-nesker kan infektionen være alvorlig.

Parasitterne påvises i dag gennem ressourcekrævende, manuelle laboratorieanalyser, hvor resultatet foreligger 1-3 dage efter prøve-udtagning. Dette er længe efter, at en eventuel forurening har fun-det sted, og mange mennesker kan i mellemtiden være inficeret.

Et samarbejde mellem Veterinærinstituttet (Danmarks Tekniske Universitet), Center for Medicinsk Parasitologi (Klinisk Mikrobio-logisk Afdeling, Rigshospitalet og ISIM, Københavns Universitet), Unisensor og Grundfos skal nu eliminere den store forsinkelse mellem måling og resultat. Visionen i projektet er, at udvikle en metode der kan overvåge drikkevandet kontinuerligt direkte i vandforsyningen. Dermed kan der gribes ind omgående i tilfælde af tilstedeværelsen af sundhedsskadelige parasitter og forhindre at inficeret vand drikkes af forbrugerne.

En mikrobiologisk udfordringOpgavefordelingen i projektet er, at vi på Center for Medicinsk Parasitologi i tæt samarbejde med Veterinærinstituttet udvikler de grundlæggende principper. Unisensor er teknologileverandør, mens Grundfos er produktudvikler og salgsdistributør. De næste 2½ år bliver derfor utrolig spændende i parasitologisk laboratorium. Dette er en mikrobiologisk udfordring med stor risiko for at slå fejl. Men hvis det lykkes er vejen banet for en helt ny og robust tekno-logi til parasitologiske undersøgelser.

Jørgen Kurtzhals, overlæge

Ny teknologi skal afsløre parasitter i drikkevand

Grethe Gomme, bioanalytiker

En automatisk mikroskopisk sensor udgør kernen i projektets teknologi

Mikrofoto af Giardia og Cryptosporidium

v/Michael Tvede, overlæge, Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH v/Jørgen Kurtzhals, overlæge, lektor, ph.d. Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

28

KMA, RH, 2009

29

Since 1986, positive achievements have [been] made in scientific and technological corporation and exchange of scientists between Guangxi Medical University and Rigshopitalet University Hospital. To improve the mutual friendship, to develop the long-term scientific and technological cooperation, and to train technical personnel, both sides have reached the following agreement through friendly consultation…

Sådan indledes samarbejdsaftalen (1998-2003) mellem Guangxi Medical University (GMU) i Nanning i Kina, og Rigshospitalets Universitetshospital ved Klinisk Mikrobiologisk Afdeling og Epidemiafdelingen. Forskningssam-arbejdet blev igangsat af professor Viggo Faber (1918-2006) med støtte fra DANIDAs Fellowship programme.Før 1992 fokuserede samarbejdet på tropiske sygdomme, f.eks. Malaria og Leismaniasis, der forårsages af parasitter. Dr. Weitao Huang, Ming Chen, Lin Zhai m.fl. kom til Danmark for at forske, og den modificerede la-kridsrodsmedicin blev fokus for både forskning og kommercielle interesser. Efter 1992 blev samarbejdet mellem de to landes regeringer og DANIDA-projektet udvidet og resulterede bl.a. i en udvidet samarbejdsaftale med titlen:

“Effects of Chinese herbal medicine on pathogenic microorganism and the human immune system”

Parterne i udvidelsen af samarbejdet var bl.a. Den Farmaceutiske Højsko-le, Statens Serum Institut og Danmarks Tekniske Universitet. I forbindelse med udvidelsen af samarbejdet tog 14 kinesiske forskere til Danmark og fokus for forskningen var Ginseng og Furanoner, og senest indvirkningen af nye antibiotika rettet imod biofilmvoksende bakterier. Både Furanover, som er fundet i vandplanter i Australien af vores nære samarbejdspartner professor Michael Givskov, og Ginseng hæmmer bl.a. biofilmvækst.Den 19. november 2010 kan det sino-danske forskningsarbejde fejre 25 års tæt samarbejde og venskab. De vigtigste resultater fra samarbejdet er:

Det sino*- danske samarbejde

-Udtræk og test af de aktive komponenter i 12 kinesiske ur-ter, der besidder evnen til at anti-oxidere-Aktive komponenter fra 8 kinesiske urter er blevet testet for deres anti-cancer effekt -Ginsengs aktivitet (immun modulation) og furanoner (hæm-ning af bakteriernes kommunikation (= quorum sensing)) på en af de mest almindelige patogener, der forårsager kronisk lungeinfektion – P. aeruginosa.

Forskningen er blevet udøvet ved eksperimentelle studier in vitro og ved dyreforsøg med de mest moderne molekylærbio-logiske og immunologiske metoder.

Samarbejdet i 2009I efteråret 2009 var Niels Høiby, Zhijun Song og Hong Wu sammen med ph.d studerende Hengzhuang Wang på besøg igen i Nanning, hvor en gruppe ph.d studerende holdt fore-drag bl.a. om vore fælles projekter.

Det sino-danske samarbejde fremover Det omfattende forskningssamarbejde styrkes og inspireres af den kontinuerlige udveksling af resultater og gensidige forskningsbesøg i de to lande. Fremover vil de vigtigste komponenter i samarbejdet være en fortsat udvidelse af samarbejdet, at styrke den akademiske kommunikation mel-lem vore forskningsgrupper i de to lande, at dele de eksperi-mentelle resultater og at videreføre udvindingen af de aktive stoffer fra kinesiske medicinske urter og de immunologiske o.a. studier i GMU især hvad angår biofilm.Noter * Sino betyder kinesisk på kinesisk.

Fra venstre: Hong Wu (RH), Zhijun Song (RH), Niels Høiby (RH), Birgit Høiby, Chen Yiqiang (GMU). Sted: Mingshi Mountain Village, 2009.

Indgangen til Guangxi Medical University

Besøget på Guangxi Medical University efter-året 2009. Fra venstre: Wang Hengzhuang (RH), Meng Ling Liu (GMU), Hai Kuang (GMU), Wenxia Chen (GMU), Niels Høiby (RH), (ukendt), Zhijun Song (RH).

Dr. Wang Chaolin og hans lærer, professor Faber i Danmark.

- Historien om et ambitiøst og succesfuldt forskningssamarbejde og venskab

Prof. Niels Høiby

v/Niels Høiby, professor, overlæge, dr. med., Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

KMA, RH, 2009

30

KMA, RH, 2009

31

”Forskningen indikerer, at te-komponenter kan anvendes specielt i behandling mod Candida glabrata-infektioner” (Ming Chen).

Udvikling af behandling er nødvendigDer mangler antisvampemidler til at bekæmpe det stigende antal svampeinfek-tioner som ses i både Danmark, Europa og USA. Candida glabrata, der ofte opdages i blodet og i slimhinderne i mund og vagina er resistent overfor Flucona-zole, og det nødvendiggør udvikling af forebyggende og bekæmpende behandling. Det forklarer seniorforsker og læge på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, Ming Chen. Han drikker grøn te hver morgen for at styrke immunforsvaret - og det med god grund.

I 2009 har Ming Chen, og den forskergruppe* han er en del af, arbejdet intensivt på forskningsprojektet ”In Vitro activity of twenty-three tea extractions and epigal-locatechin gallate (EGCG) against Candia glabrata”. Et projekt der undersøger følsomheden i udvalgte Candida-species overfor de aktive komponenter i fire for-skellige tegrupper fra både Danmark og Kina.

Opsigtsvækkende resultaterDet konkrete formål med forskningen er at undersøge følsomheden hos Candida (C.)albicans, C. glabrata, C. krusei, C. tropicalis, C. parapsilosis, og Aspergillus fumigatus i forhold til forskellige te-komponenter og EGCG isoleret fra grøn te. Projektet har indtil videre kunnet levere opsigtsvækkende resultater.

De fire tegrupper, der er med i forsøget, og EGCG isoleret fra grøn te, har vist, in vitro, antifungal aktivitet mod C. glabrata. C. glabrata har vist sig at være meget følsom overfor de aktive stoffer i forskellige typer te, og det danner grundlag for yderligere forskning. Nogle teer viser større potens end andre, men nogle af teerne har vist antifungal aktivitet overfor C. albicans og C. parapsilosis, dog krævede det højere koncentrationer, end dem der var brugt mod C. glabrata.

Kan te bekæmpe Candida-infektioner?

Interview med Ming Chen, 1. reservelæge, ph.d., (ansat på Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH, til og med 28.02.2010, derefter ansat på Herlev, KMA).

Ming Chen, 1. reservelæge.

Data fra forskningen indikerer, at te-komponenter og EGCG kan være specielt anvendelige i behandling mod og forebyggelsen af C. glabrata-infektioner.

Det er især candida-infektioner hos immunsvækkede patienter på intensivafdelingerne, der danner baggrund for forskningen. Undersøgelsen retter sig dog også mod lokale infektioner.

For 20 år siden blev Ming Chen ansat som gæsteforsker på Rigshospitalet. Han startede på afdeling M, Epide-miklinikken. Han er uddannet læge fra Guangxi Medical University, i Nanning i Kina, men han tog sin ph.d. på Rigshospitalet. I 2010 stoppede han på KMA på Rigs-hospitalet for at fortsætte sin speciallægeuddannelse på Herlev KMA.

Noter: * Forskergruppen består af: Lin Zhai (RH), Maiken Cavling Arendrup (SSI) og Ming Chen (Herlev Hospital).

KMA, RH, 2009

32

KMA, RH, 2009

33

En af Klinisk Mikrobiologisk Afdelings samarbejdspartnere er Co-penhagen HIV Programme (CHIP), der har til huse på Panum Insti-tuttet. CHIP er en forskningsgruppe med ekspertise indenfor både kliniske studier og koordination, design og analyse af observations-studier. Samarbejdet vedrører dels daglige rutiner, dels forskellige forskningsprojekter.

TransplantationsdatabaseDiagnostik af virusinfektioner og rådgivning vedrørende deres be-handling er blandt de daglige rutineopgaver på KMA, og virusinfek-tioner blandt Rigshospitalets transplanterede patienter udgør hér en særlig kompliceret problemstilling, hvor daglig dialog med de klini-ske afdelinger er nødvendig. Med udgangspunkt i denne problem-stilling har KMA og de transplanterende afdelinger på Rigshospitalet i 2009 indledt et samarbejde med CHIP om oprettelse af en trans-plantationsdatabase over konsekutive patienter transplanteret på Rigshospitalet. Formålet med projektet er at optimere monitorering og behandling af nutidige såvel som fremtidige transplantationspa-tienter på Rigshospitalet.

Etablering af transplantationsdatabasen vil endvidere på sigt give mulighed for en række forskningsmæssige aktiviteter; herunder analyse af de i databasen indsamlede variabler og deres associa-tion med risiko for udvikling af virusinfektioner. Samtidig vil opbyg-ningen af en database og medfølgende systemer til indhentning af data kunne benyttes i fremtidige randomiserede kliniske forsøg. Foreløbigt har arbejdet med virus-infektioner blandt transplanterede patienter resulteret i en poster præsentation ved en international konference i 2009, og der er indsendt et manuskript til et videnska-beligt tidsskrift som forventes publiceret i løbet af 2010.

Influenza A (H1N1)vI forbindelse med den pandemiske Influenza A (H1N1) i 2009 har CHIP i samarbejde med KMA fulgt aktiviteten nøje med hensyn til resistens og løbende ændring af In-fluenza A virus. Til det formål benyttede vi os af offentligt tilgængelige Influenza sekvenser fra National Center for Biotechnology Information efterhånden som de blev publi-ceret. Vi analyserede ændringerne i Influenza A virus med en simplificeret Poisson Maximum Likelihood estimering. Analyserne, som blev foretaget fra slutningen af marts 2009 til januar 2010, viste, at denne variant af Influenza A (H1N1) ændrer sig langsomt.

EuroSIDA studietI de seneste par år har KMA og CHIP samarbejdet om flere projekter indenfor det store HIV observationsstudie EuroSIDA. I EuroSIDA studiet er et af fokusområderne at beskrive naturhistorien af kronisk hepatitis B og C hos HIV patienter og undersøge biomarkører for sygdomsprogres-sion. KMA har hjulpet med at karakterisere patienternes hepatitis status gennem serologiske og PCR undersøgel-ser på nogle af de omkring 70.000 plasmaprøver, der er indsamlet fra patienter, som er inkluderet i dette studie. KMA har også analyseret plasma prøver for leverfibrose markøren hyaluronsyre, der har vist sig at være en lo-vende markør til at prediktere risikoen for lever-relateret død hos HIV/hepatitis koinficerede patienter. Arbejdet med disse studier resulterede i 2009 i én publikation samt to posterpræsentationer på internationale konferencer. Plasmabankens omfang muliggør således en lang række fremtidige studier og et fortsat tæt samarbejde med KMA og CHIP på dette område.

Samarbejde med Copenhagen HIV Programme - CHIPv/Jens Lundgren, professor, overlæge, dr. med., Klinisk Mikrobiologisk Afdeling, RH

Panum Instituttet

Prof. Jens Lundgren

KMA, RH, 2009

34

KMA, RH, 2009

35

Årsstatistik 2009

Prøver til undersøgelser for: Antal prøver Antal UndersøgelserBakterier og svampe 100.814 176.671Virus inkl. Serologi 21.935 56.857Parasitter 3.241 3.241Hygiejne 4.029 12.957Antibiotika fra koncentrationer 8.400 8.400Endotoxin og Granulocyttest 116 116Udvidet identifikation 134 1.340Specielle antistofanalyser (ELISA, Elektroforese) 2.628 13.525DNA typning af bakterier 156 156I alt 141.453 273.263

KMAs Brugervejledning

KMAs Brugervejledning bliver opdateret årligt og er tilgængelig på RHs intranet. Den kan downloades i pdf-format under fanen ”Pleje og behandling” og dernæst ”Politikker, vejledninger og instrukser”. Brugervejledningen sendes i begyndelsen af året til RHs afdelinger. Det er også muligt at få en vejledning sendt med posten. Ring til se-kretariatet 3545 6400.

Ph.d. afhandlinger i 2009Signe Westring Worm: ”HIV and Cardiovascular disease – Contribution of metabolic components and drugs”, Kø-benhavns Universitet d. 29. januar 2009.

Nadine Hoffmann: ”The role of quorum sensing and alginate in the pathogenesis of chronic Pseudomonas aerugi-nosa biofilm lung infection in cystic fibrosis and the development of antibacterial therapy based on quorum sensing inhibitors”, Københavns Universitet d. 29. maj 2009.

Jens-Ulrik Stæhr Jensen: ”Dynamic use of biomarker procalcitonin in the intensive care unit”, Københavns Univer-sitet, 24. august 2009.

Daria Podlekareva: ”Difference in HIV care across Europe with focus on tuberculosis and other opportunistic infec-tions”. Københavns Universitet, 8. december 2009.

Doktordisputatser i 2009

Artikler trykt i 20091) Adjei GO, Darkwah AK, Goka BQ, Bart-Plange C, Alifrangis M, Kurtzhals JAL, Rodriques OP: Parents� percep-Rodriques OP: Parents’ percep-tions, attitudes and acceptability of treatment of childhood malaria with artemisinin combination therapies in Ghana. Ghana Med. J. 43: 99-106; 2009.

2) Adjei GO, Goka BQ, Binka F, Kurtzhals JAL: Artemether-lumefantrine: an oral antimalarial for uncomplicated malaria in children. Expert Review of Anti-Infective Therapy 7:669-81; 2009.

3) Adjei GO, Goka BQ, Rodrigues OP, Høgberg LC, Alifrangis M, Kurtzhals JAL: Amodiaquine-associated adverse effects after inadvertent overdose and after a standard therapeutic dose. Ghana Med. J. 43:135-138; 2009.

4) Alhede M, Bjarnsholt T, Jensen PØ, Phipps RK, Moser C, Christophersen L, Christensen LD, van Gennip M, Parsek M, Høiby N, Rasmussen TB, Givskov M: Pseudomonas aeruginosa recognizes and responds aggressively to the presence of polymorphonucleear leucocytes. Microbiology155:3500-3508; 2009. Ledsaget af editorial: Cor-nelis P: Shielding, a new pathogen defense mechanism against PMNs. Microbiology 155:3474-3475; 2009.

5) Ammerlaan H, Seifert H, Harbarth S, Brun-Buisson C, Torres A, Antonelli M, Kluytmans J, Bonten M, SEPIA Study Group (Tvede M): Adequacy of antimicrobial treatment and outcome of Staphylococcus aureus bacteremia in 9 Western European countries. Clin. Infect. Dis. 49:997-1005; 2009.

6) Andersen LP, Rasmussen L: Helicobacter pylori-coccoid forms and biofilm formation. FEMS Immunol. Med. Microbiol. 56;112-5; 2009.

7) Bak J, Ladefoged SD, Tvede M, Begovic T. Gregersen A: Dose requirements for UVC disinfection of catheter biofilms. Biofouling 25:289-96; 2009.

8) Bergen LK, Meyer M, Høg M, Rubenhagen B, Andersen LP: Spread of bacteria on surfaces when cleaning with microfiber cloths. J. Hosp. Infect. 71:132-7; 2009.

KMAs læger deltager dagligt i 3-4 konferencer på kliniske afdelinger (22/uge) samt tilsyn af patienter og telefonkontakt til klinikerne.Rådgivning i klinisk mikrobiologiske spørgsmål til Grønlands Sundhedsvæsen.

Christian T. Brandt: ”Experimental studies of pneumococcal meningitis”. Københavns Universitet, 27. november 2009.

Rådgivning og Information

KMA, RH, 2009

36

KMA, RH, 2009

37

9) Bjarnsholt T, Jensen PØ, Fiandaca MJ, Pedersen J, Hansen CR, Andersen, CB, Pressler T, Givskov M, Høiby N: Pseudomonas aeruginosa biofilms in the respiratory tract of cystic fibrosis patients. Pediatric Pul-monology 44:547-558; 2009. 10) Bjarnsholt T, Tolker-Nielsen T, Givskov M, Janssen M, Christensen LH: Detection of bacteria by FISH in culture-negative soft tissue filler lesions. Dermatol. Surg. 35:1620-1624; 2009.

11) Bohlius J, Schmidlin K, Costagliola D, Fätkenheuer G, May M, Caro Murillo AM, Mocroft A, Bonnet F, Clifford G, Touloumi G, Miro JM, Chene G, Lundgren J, Egger M, Antinori A, Bonnet F, Boué F, Brockmeyer N, Casabona J, Lopez-Guillermo A, Ribera JM, Costagliola D, Dronda F, Obel N, Fätkenheuer G, Fisher M, Franceschi S, Gibb D, Le Moing V, Mocroft A, Nadal D, Touloumi G, Prins M, Raffi F, Roca B, Verbon A, Wolf T, Fortuny C, Bohlius J, Chakraborty R, Clifford G, Egger M, Franceschi S, May M, Minder C, Sterne J, Zwahlen M, Ellefson M, Kjaer J, Collin F, Colin C: Prognosis of HIV-associated non-Hodgkin lymphoma in patients starting combination antiretroviral therapy.AIDS 23:2029-37; 2009.

12) Bohn Y-ST, Brandes G, Salunkhe P, Rakhimova E, Munder A, Jordan D, Bredenbruch F, Häussler S, Jensen P, Bjarnsholt T, Moser C, Høiby N, Wiehlmann L, Tümmler B: Multiple roles of Pseudomonas aerugi-nosa TBCF 10839 PilY1 in motility, transport and infection. Molecular Microbiology 71:730-47; 2009.

13) Brinch KS, Frimodt-Møller N, Høiby N, Kristensen H-K: Influence of anti-drug antibodies on Plectasin efficacy and pharmacokinetics. Antimicrob. Agents Chemother. 53:4794-4800; 2009.

14) Brinch KS, Sandberg A, Baudoux P, Bambeke F van, Tulkens PM, Frimodt-Møller N, Høiby N, Kristensen H-K: Plectasin shows intracellular activity against S. aureus in human THP-1 monocytes and in the mouse perito-nitis model. Antimicrob. Agents Chemother. 53:4801-4808; 2009.

15) Buhl M, Thybo S, Kurtzhals JAL, Møller NE, Vestergaard LS, Gade K, Glismann, Andersen PH: Malaria 2008.EPI-Nyt uge 24; 2009.

16) Buhl M, Thybo S, Kurtzhals JAL, Møller NE, Vestergaard LS, Gade K, Glismann, Andersen PH: Vaccina-Vaccina-tionsforslag ved udlandsrejse, del I og II. EPI-Nyt uge 26a+b; 2009. 17) Calum H, Moser C, Jensen PØ, Christophersen L, Malling D, Gennip M van, Bjarnsholt T, Hougen HP, Givskov M, Jacobsen GK, Høiby N: Thermal injury induces impaired function in polymorphonuclear neu-Thermal injury induces impaired function in polymorphonuclear neu-trophil granulocytes and reduced control of burn wound infection. Clin. Exp. Immunol. 156:102-10; 2009.

18) Cozzi-Lepri A, Phillips AN, Martinez-Picado J, d�Arminio Monforte A, Katlama C, Hansen AB, Horban A, Bruun J, Clotet B, Lundgren JD; EuroSIDA Study Group: Rate of accumulation of thymidine analogue muta-tions in patients continuing to receive virologically failing regimens containing Zidovudine or Stavudine: Impli-cations for antiretroviral therapy programs in resource-limited settings. J. Infect. 200:687-97; 2009.

19) D�Elios MM, Andersen LP: Inflammation, immunity, and vaccines for Helicobacter pylori.Helicobacter 14:21-8; 2009.

20) Fazli M, Bjarnsholt T, Kirketerp-Møller K, Jørgensen B, Andersen AS, Krogfelt K, Givskov M, Tolker-Nielsen T: Non-Random Distribution of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus in Chronic Wounds. J. Clin. Microbiol. 47:4084-9; 2009.

21) Fenger RV, Linneberg A, Tvede M, Ostergaard C: Increasing seroprevalence of Clostridium difficile in an adult Danish general population. Epidemiol. Infect. 137:278-83; 2009.

22) Fomsgaard A, Christiansen CB, Bødker R: First identification of Tick-borne encephalitis in Denmark out-side of Bornholm. Eurosurveillance 14:2-3, 2009.

23) Fomsgaard A, Mølbak K, Christiansen CB, Bødker R: TBE påvist i nordsjælland. EPI-Nyt 35; 2009.

24) Gennip M van, Christensen LD, Alhede M, Phipps R, Jensen PØ, Christophersen L, Pamp SJ, Moser C, Mikkelsen PJ, Koh AY, Tolker-Nielsen T, Pier G, Høiby N, Givskov M, Bjarnsholt T: Inactivation of the rhlA gense in Pseudomonas aeruginosa prevents rhamnolipid production, disabling the protection against polymor-phonuclear leukocytes. APMIS, 117:537-546; 2009.

25) Gennip M van, Moser C, Christensen LD, Bjarnsholt T, Calum H, Jensen PØ, Christophersen L, Hougen HP, Ciofu O, Molin S, Høiby N: Augmented effect of early antibiotic therapy in mice with experimental lung infections due to sequentially adapted mucoid strains of Pseudomonas aeruginosa. J. Antimicrob. Chemother. 64:1241-1250; 2009.

26) Gerstoft J, Mathiesen L, Lundgren JD, Nielsen HI, Pedersen C, Obel N, Laursen A: Risk of virus transmis-Risk of virus transmis-sion from well-treated patients with HIV? Ugeskr. Laeger 171:1085; 2009.

27) Hansen CR, Pressler T, Høiby N, Johansen HK: Long-term, low-dose azithromycin treatment reduces the incidence but increases macrolide resistance in Staphylococcus aureus in Danish CF patients. J. Cystic Fibro-sis 8:58-62; 2009.

28) Heijerman HGM, Westermann EM, Conway SP, Touw DJ, Döring G. For the consensus working group (N. Høiby member): Inhaled medication and inhalation devices in patients with cystic fibrosis: An European Con-sensus. J. Cystic Fbrosis 8:295-315; 2009.

29) Hein-Kristensen L, Wiese L, Kurtzhals JAL. Staalsoe T: In-depth validation of acridine orange staining for flow cytometric parasite and reticulocyte enumeration in an experimental model using Plasmodium berghei. Exp. Parasitol. 123:152-7; 2009. 30) Homøe P, Bjarnsholt T, Wessman M, Sørensen HC, Johansen HK: Morphological evidence of biofilm for-mation in Greenlanders with chronic suppurative otitis media. Eur. Arch. Otorhinolaryngol. 266:1533-8; 2009.

31) Huong NM, Kurtzhals JAL, Thui TT, Rasch V: Reproductive tract infections in women seeking abortion in Vietnam. BMC Women�s Health 9:1; 2009.

32) Høiby N: Blærebetændelse. Netdoktor (www.netdoktor.dk)

33) Høiby N: Forkølelse. Netdoktor (www.netdoktor.dk)

34) Høiby N: Influenza. Netdoktor (www.netdoktor.dk)

35) Høiby N: RS virus. Netdoktor (www.netdoktor.dk)

36) Høiby N: Salmonellabakterier. Netdoktor (www.netdoktor.dk) 37) Høiby N: Svineinfluenza. Netdoktor (www.netdoktor.dk)

KMA, RH, 2009

38

KMA, RH, 2009

39

38) Høiby N: Verdens bedste sundhedsvæsen? Centratlisering, DJØFisering og sygehusenes kvalitet. Kapitel i debatbog ”Torben Ishøy (red.): Disse løfter om et tidssvarende sundhedsvæsen”. Forlaget Vandkunsten. 2009.

39) Høiby N, Pressler T, Tybkjær H: Erhard Winge Flensborg. Mindeord. Ugeskrift for Læger 171:3458; 2009. Samme bragt i kortere og længere udgaver i Cystisk Fibrose (medlemsbald for Landsforeningen til bekæmpelse af cystisk fibrose), Jyllands Posten og Berlingske Tidende.

40) Høiby N, Skinhøj P (red.): Klinisk mikrobiologi og infektionsmedicin – almen del.” FADLs Forlag, 115 sider. 2009. 41) Islam S, Oh H, Jalal S, Karpati F, Ciofu O, Høiby N, Wretlind B: Chromosomal mechanisms of aminoglycoside resistance in Pseudomonas isolates from cystic fibrosis patients. Clin. Microbiol. Infect. 15:60-6; 2009.

42) Jensen PØ, Larsen J, Larsen JK: Analysis of RNA synthesis by cytometry. In: Essential Cytometry Methods – Reliable Lab Solutions. Darzynkiewicz Z, Robinson JP, Roederer M (eds.) Elsevier/Academic Press, chapter 34, pp 757-67, 2009.

43) Jensen US, Skjøt-Rasmussen L, Olsen SS, Frimodt-Møller N, Hammerum AM, DANRES Study Group (Tvede M): Consequences of increased antibacterial consumption and change in pattern of antibacterial use in Danish hospitals. J. Antimicrob. Chemther. 63:812-5; 2009.

44) Kesselring AM, Wit FW, Sabin CA, Lundgren JD, Gill J, Gatell J, Rauch A, Montaner JS, de Wolf F, Reiss P, Mocroft A: Risk factors for treatment-limiting toxicities in patients starting nevirapine-containing antiretroviral therapy. AIDS 23:1689-1699; 2009.

45) Kirk O, Gerstoft J, Lundgren JD, Obel N: Major breakthroughs in the medical treatment of HIV infection. Ugeskr. Laeger 171:787-789; 2009.

46) Kjeldsen K, Høiby N, Egeblad H: Infektiøs endokardit. Medicinsk Kompendium (Red. O.B. Schaffalitzsky de Muckadell, S. Haunsø, H. Vilstrup) 17. udgave, bd. 1, s. 1047-57, Nyt Nordisk Forlag Arnold Busck, København, 2009.

47) Knudsen PK, Olesen HV, Høiby N, Johanneson M, Karpati F, Laerum B, Meyer P, Pressler T, Lindblad A & The Scandinavian CF Study Consortium: Differences in prevalence and treatment of Pseudomonas aeruginosa in cy-stic fibrosis centers in Denmark, Norway and Sweden. J. Cystic Fibrosis 8:135-142; 2009.

48) Kurtzhals JAL, Gomme G: Malariadiagnostik. I: Kliniske procedurer – en opslagsbog. FADL�s Forlag, Køben-havn 2009.

49) Leinikki P, Høiby N, Aavitsland P: SMI Evaluation. Research – quality, quantity, relevance. In Statens Offentliga Utredningar SOU 2009:55 Ett effektivare smittskydd. Stockholm, Sweden, 2009.

50) Liu XL, Song ZJ, Wu H, Wang LZ, Chen YQ, Kong JL, Wang HZ: Effects of meropenem on young biofilms of Pseudomonas aeruginosa las/rhl mutations in vitro. Chinese Pharmaceutical J. 44:1833-1836; 2009.

51) Luin M van, Bannister WP, Mocroft A, Reiss P, Di Perri G, Peytavin G, Molto J, Karlson A, Castagna A, Beni-owski M, Lundgren JD, Burger DM; the EuroSIDA study group: Absence of a relation between efavirenz plasma concentrations and toxicity-driven efavirenz discontinuations in EuroSIDA. Antiviral Ther. 14:75-83; 2009.

52) Lundgren JD: Procalcitonin monitoring in trauma intensive care patients: how helpful is it? Crit. Care Med. 37:2093-4; 2009.

53) Lundgren JD, Phillips AN, Neaton J: Uncertainty as to whether the use of antiretroviral therapy for persons recently infected with HIV has a favorable risk-to-benefit ratio. Clin. Infect. Dis. 48:1162; 2009.

54) Mandsberg LF, Ciofu O, Kirkby N, Christiansen LE, Poulsen HE, Høiby N: Antibiotic resistance in P. aerugi-nosa strains with increased mutation frequency due to inactivation of the DNA oxidative repair system. Antimicrob. Agents Chemother. 53:2483-91; 2009.

55) Mocroft A, Lundgren JD: Use of risk equations for predicting disease progression in HIV infection. Clin. Infect. Dis. 48:951-953; 2009.

56) Mocroft A, Sterne J, Egger M, May M, Grabar S, Furrer H, Sabin C, Fatkenheuer G, Justice A, Reiss P, d�Arminio Monforte A, Gill J, Hogg R, Bonnet F, Kitahata M, Staszewski S, Casabona J, Harris R, Saag M (The ART Cohort Collaboration): Variable impact on mortality of AIDS defining events diagnosed during combination antiretroviral therapy: Not all AIDS Defining Conditions are Created Equal. Clin. Infect. Dis. 48:1138-51; 2009.

57) Mocroft A, Wyatt C, Szczech L, Neuhaus J, El-Sadr W, Tracy R, Kuller L, Shlipak M, Angus B, Klinker H, Ross M; INSIGHT SMART Study Group: Interruption of antiretroviral therapy is associated with increased plasma cysta-tin C. AIDS 23:71-82; 2009.

58) Moser C, van Gennip M, Bjarnsholt T, Jensen PØ, Lee B, Hougen HP, Calum H, Ciofu O, Givskov M, Molin S, Høiby N: Novel experimental Pseudomonas aeruginosa lung infection model mimicking long-term host-pathogen interactions in cystic fibrosis. APMIS 117:95-107; 2009.

59) Nielsen XC, Justesen US, Dargis R, Kemp M, Christensen JJ: Identification of clinically relevant nonhemolytic Streptococci on the basis of sequence analysis of 16S-23S intergenic spacer region and partial gdh gene. J. Clin. Microbiol. 47:932-9; 2009.

60) Nielsen XC, Nielsen F, Kurtzhals JAL, Moser C, Boye K, Christensen JJ, Johansen U, Westh H: Mangement of recurrent pacemaker-related bacteraemia with small colony variant Staphylococcus aureus in a haemodialysis patient. BMJ, Case report bcr0520091910; 2009.

61) Olsen AL, Reinholdt J, Jensen AM, Andersen LP, Jensen ET: Nosocomial infection in a Danish neonatal inten-Nosocomial infection in a Danish neonatal inten-sive care urit: a prospective study. Acta Paediat. 98:1294-9; 2009.

62) Peters L, Mocroft A, Soriano V, Rockstroh J, Aldins P, Losso M, Valerio L, Reiss P, Ledergerber B, Lundgren J for the EuroSIDA Study Group: Hepatitis C Virus (HCV) Coinfection Does Not Influence the CD4 Cell Recovery in HIV-1 Infected Patients with Maximum Virologic Suppression. JAIDS 50:457-463; 2009.

63) Phillips AN, Gilks C, Lundgren JD: Cost-effectiveness of strategies for monitoring the response to antiretroviral therapy in resource-limited settings. Arch. Intern. Med. 169:904; 2009.

64) Pressler T, Karpati F, Granström M, Knudsen PK, Lindblad A, Hjelte L, Olesen HV, Meyer P, Høiby N & The Scandinavian CF Study Consortium: Diagnostic significance of measurements of specific IgG antibodies to Pseu-domonas aeruginosa by three different serological methods. J. Cystic Fibrosis 8:37-42; 2009.

65) Rodger AJ, Fox Z, Lundgren JD, Kuller LH, Boesecke C, Gey D, Skoutelis A, Goetz MB, Phillips AN; the IN-SIGHT Strategies for Management of Antiretroviral Therapy (SMART) Study Group: Activation and coagulation biomarkers are independent predictors of the development of opportunistic disease in patients with HIV infection. J. Infect. Dis. 200:973-83; 2009.

KMA, RH, 2009

40

KMA, RH, 2009

41

1) Alhede M, Qvortrup K, Jensen PØ, Jakobsen TH, Christensen LD, Gennip M van, Nielsen AK, Høiby N, Givskov M, Bjarnsholt T: Tolerance to antibiotics is linked to a ’matrix-like’ structure found by scanning electron microscopy (SEM) in Pseudomonas aeruginosa aggregates grown in diverse culture settings. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19. 2009.

2) Arendrup MC, Fuursted K, Schønheyder HC, Garhn-Hansen B, Knudsen JD, Jensen IM, Bruun B, Christensen JJ, Johansen HK: Ongoing semi-national surveillance of fungaemia in Denmark: species distribution and antifungal susceptibility. 4th Trends in Medical Mycology (TIMM-4), Athens, Greece, October 18-21, 2009.

3) Bjarnsholt T: Animal models of Biofilm infections. ASM Biofilms 2009, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

4) Bjarnsholt T: Biofilms in chronic wounds. In First European Congress on Microbial Biofilm, Rome, Italy, Septem-ber 2–5, 2009.

5) Bjarnsholt T: Ecology of biofilms in chronic wounds. In Techinal Advisory Conference (TAC), Center for Biofilm Engineering, MSU, USA, February 3-4, 2009.

6) Bjarnsholt T: Medical Biofilm Techniques. ESCMID Postgraduate Technical Workshop, København, DK, August 17-20, 2009.

7) Bjarnsholt T: The role of biofilms in chronic infections. In Blood & Defence/HOPE Centre Retreat, Torekov, Swe-den, September 17-18, 2009.

8) Chen M, Zhai L, Arendrup MC: In vitro activity of twenty-three teas and epigallocatechin gallate against Candida glabrata. 4th Congress on Trends in Medical Mycology, Athens, Greece, October 18-21,2009.

9) Christensen LD, Gennip M van, Alhede M, Kumar N, Kjelleberg S, Høiby N, Bjarnsholt T, Givskov M: Synergistic antibacterial efficacy of tobramycin and a quorum sensing inhibitor against Pseudomonas aeruginosa in an in vivo intraperitoneal foreign-body infections model. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

10) Ciofu O: Biofilm-related and traditional resistance mechanisms. Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, September 2-5, 2009.

11) Core A, Hempel C, Wiese L, Kurtzhals JAL, Pekowa M: Neronal stem cells are stimulated to migrate and dif-ferentiate due to erythropoietin treatment in an experimental model of cerebral malaria. Neurodag (Neuroclusteret), Copenhagen, Denmark, November 11, 2009.

12) Fazli M, Bjarnsholt T, Kirketerp-Møller K, Jørgensen B, Andersen AS, Krogfelt KA, Givskov M, Tolker-Nielsen T: Non -random distribution of Pseudomonas aeruginosa and Staphylococus aureus in chronic wounds. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

13) Fox ZV, Phillips AN, Cozzi-Lepri A, d‘Arminio Monforte A, Karlsson A, Mocroft A, Kronborg G, Kjaer J, Clotet B and JD Lundgren JD for EuroSIDA: Predictors of having a resistance test following at least one episode of viral load (VL) failure of cART: data from EuroSIDA. 7th European Drug Resistance Workshop, Stockholm, Sweden, March 25-27, 2009.

Kongresabstracts, foredrag, posters, korrespondancer o.l.

66) Søe HN, Jensen NV, Dahlin L, Johansen HK: Håndens akutte infektioner. Ugeskr. Læg. 171:1189-93; 2009.

67) Tolker-Nielsen T, Høiby N: Extracellular DNA and F-actin as targets in anti-biofi lm CF therapy. Future Micro-Extracellular DNA and F-actin as targets in anti-biofilm CF therapy. Future Micro-biol., 4:645-647; 2009.

68) Vrankrijker de AMM, Wolfs TFM, Ciofu O, Høiby N, Ent CKvd, Poulsen SS, Johansen HK: Respiratory syncy-tial virus (RSV) infection facilitates acute Pseudomonas aeruginosa colonization in mice. J. Med. Virol. 81:2096-2103; 2009.

69) Worm SW, De Wit S, Weber R, Sabin CA, Reiss P, El-Sadr W, Monforte AD, Kirk O, Fontas E, Dabis F, Law MG, Lundgren JD, Friis-Møller N: Diabetes mellitus, preexisting coronary heart disease, and the risk of subse-Diabetes mellitus, preexisting coronary heart disease, and the risk of subse-quent coronary heart disease events in patients infected with human immunodeficiency virus: the DATA Collection on Adverse Events of Anti-HIV Drugs (D:A:D Study). Circulation 119:805-11; 2009.

70) Worm SW, Sabin CA, Reiss P, El-Sadr W, Monforte A, Pradier C, Thiebaut R, Law M, Richenbach M, De Wit S, Lundgren JD, Friis-Møller N: Presence of the metabolic syndrome is not a better predictor of cardiovascular disease than the sum of its components in HIV-infected individuals: data collection on adverse events of anti-HIV drugs (D:A:D study). Diabetes Care. 32:474-8; 2009.

71) Yang L, Rybtke MT, Jakobsen TH, Hentzer M, Bjarnsholt T, Givskov M, Tolker-Nielsen T: Computer-aided identification of recognized drugs as Pseudomonas aeruginosa quorum-sensing inhibitors. Antimicrob. Agents Chemother. 53:2432-43; 2009.

KMA, RH, 2009

42

KMA, RH, 2009

43

14) Fox ZV, Phillips AN, Cozzi-Lepri A, d‘Arminio Monforte A, Karlsson K, Mocroft A, Kronborg G, Kjaer J, Clotet B, Lundgren JD for the EuroSIDA study group: Predictors of having a resistance test following confirmed viral load (VL) failure of cART. EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

15) Frederiksen CM, Kjær J, Cozzi-Lepri A, Fox Z, Lundgren JD: A Bioinformatic Approach to Indentify New Po-A Bioinformatic Approach to Indentify New Po-tential Resistance Relevant Amino Acid Substitution (AAS) in HIV-1 Protease. Frontiers of Retrovirology: Complex retroviruses, retroelements and their hosts, Montpellier, France, September 21-23, 2009.

16) Garde C, Bjarnsholt T, Givskov M, Jakobsen TH, Hentzer M, Claussen A, Sneppen K, Ferkinghoff-Borg J, Sams: Quorum sensing in Aeromonas hydrophila: experiment and theory. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexi-co, November 15-19, 2009.

17) Gennip M van, Christensen LD, Qvortrup K, Alhede M, Jensen PØ, Høiby N, Givskov M: Cellular response to in vivo biofilm development on silicone implants. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009. 18) Hansen CR, Pressler T, Nielsen K, Bjarnsholt T, Høiby N: Chronic infection with Achromobacter xylosoxidans leads to rapid decrease towards end-stage lung disease in cystic fibrosis. 32nd European Cystic Fibrosis Confer-ence, Brest, France, June 10-13, 2009.

19) Hansen SK, Johansen HK, von Buchwald C, Høiby N, Molin S: Diversification and evolution of Pseudomonas aeruginosa in the upper airways of intermittently colonized CF children. Pseudomonas. XII International Confer-ence Hanover, Germany, August 13-17 2009.

20) Hawdon N, Rosengren J, Gravelle SK, Barnes RJ, Johansen HK, Høiby N, Ulanova M: Epithelial Innate Im-Epithelial Innate Im-mune Responses to Pseudomonas aeruginosa isolated from CF Patients. Society of Mucosal Immunology Meet-ing, 14th International Congress of Mucosal Immunology, Boston, MA, July 5-9, 2009.

21) Hempel C, El-Assaad F, Combes V, Sanchez-Perez A, Kurtzhals JAL, Mathys J-M, Grau GER: Expression of microRNAs involved in inflammatory and endothelial activation in experimental cerebral malaria. Danish Society for Parasitology, Spring Symposium, Copenhagen, Denmark, March 20, 2009.

22) Hempel C, El-Assaad F, Combes V, Sanchez-Perez A, Kurtzhals JAL, Mathys J-M, Grau GER: Expression of microRNAs involved in inflammatory and endothelial activation in experimental cerebral malaria. British Society for Parasitology, Spring Symposium, Edinburgh, United Kingdom, April 6-8, 2009.

23) Hempel C, El-Assaad F, Penkowa M, Kurtzhals JAL, Mathys J-M, Combes V, Grau GER: Direct demonstration of multifocal hypoxia in experimental cerebral malaria. Austral-asian Society for Immunology, Gold Coast, Australia, December 6-10, 2009.

24) Hempel C, El-Assaad F, Penkowa M, Kurtzhals JAL, Mathys J-M, Combes V, Grau GER: Hypoxia is a promi-nent feature of experimental cerebral malaria. Foreningen for Yngre Forskere (foredrag- og posterkonkurrence), Rigshospitalet, Copenhagen, Denmark, May 14, 2009.

25) Hempel C, Wiese L, Kurtzhals JAL, Penkowa M: Demyelination in experimental cerebral malaria. Dansk Sel-Demyelination in experimental cerebral malaria. Dansk Sel-Dansk Sel-skab for Neurovidenskabs jubilæumsmøde, Copenhagen, Denmark, November 26-27, 2009.

26) Høiby N: Advances in cystic fibrosis: Chronic P. aeruginosa biofilm infection – a masterful adaptation! Plenary 2.5th Forum on Respiratory tract infections. Sietges, Spain, February 6, 2009.

27) Høiby N: Antibiotika. Møde om Lungeproblemer hos den voksne CF patient. Dansk Lungemedicinsk Selskab, Rigshospitalet, København, April 21, 2009.

28) Høiby N: At turde sige sin mening – højt! Kursus �Sundhedsjournalistik med gennemslagskraft� (arr. Peter Qvor-trup Geisling & Marion Hannerup, Journalisthøjskolen, København, August 27, 2009.

29) Høiby N: Bacterial biofilms in cystic fibrosis. Key note lecture. Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, September 2-5, 2009.

30) Høiby N: Biofilm and oxygen limitation – P. aeruginosa adaptation in CF patients. Oxygen & Infection, Stock-holm, Sweden, May 8, 2009.

31) Høiby N: Chronic P. aeruginosa biofilm infection – a masterful adaptation! AstraZeneca, Lund, Sweden, Febru-ary 3, 2009.

32) Høiby N: Failure of antibiotic therapy in the abscence of antibiotic resistance – biofilms. Symposium, 19th EC-CMID, Helsinki, Finland, 18 May 2009. 33) Høiby N: Less common Gram-negative microorganisms. Symposium 18 – Diagnosis and management of rare and new pathogens. 32nd European Cystic Fibrosis Conference, Brest, France, June 13, 2009.

34) Høiby N: Pseudomonas aeruginosa and other infections in cystic fibrosis and COPD – what can we learn? AstraZeneca, Lund, Sweden, February 3, 2009.

35) Høiby N: Pseudomonas hos lungepatienten. Gruppen af Inspirerede Seje Pulomonologer (GISP). København, April 22, 2009.

36) Høiby N: Respiratory P. aeruginosa biofilm infection – resistance mechanisms and treatment possibilities. Department of Respiratory Diseases, General Hospital of the People�s Liberation Army, Beijing, P.R. China, Octo-ber 26, 2009.

37) Høiby N: Respiratory P. aeruginosa biofilm infection – resistance mechanisms and treatment possibilities. First Affiliated Hospital of Guaangxi Medical University, Nanning, Guangxi, P.R. China, October 28, 2009.

38) Høiby N: What are biofilms and why are they important: Chronic P. aeruginosa biofilm infection in CF patients – masterful adaptation! Rhinology World 2009, Philadelphia, USA, April 17, 2009.

39) Høiby N: What are biofilms and why are they important: Chronic P. aeruginosa biofilm infection in CF patients – masterful adaptation! Copenhagen,-Malmø-Lund seminars, Copenhagen, April 27, 2009.

40) Høiby N: What is a pathogen – in CF? Klinisk Mikrobiologisk afdeling, Skejby Sygehus, Aarhus, Denmark, Fe-Klinisk Mikrobiologisk afdeling, Skejby Sygehus, Aarhus, Denmark, Fe-bruary 10, 2009. 41) Jakobsen TH, Poulsen L, Hansen CR, Qvortrup K, Johansen HK, Høiby N, Givskov M, Bjarnsholt T: Biofilm formation and antibiotic tolerence of novel cystic fibrosis pathogens. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

42) Jensen PØ: Animal models in Biofilm infections.ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

KMA, RH, 2009

44

KMA, RH, 2009

45

43) Jensen PØ, Bjarnsholt T, Moser C, Hansen CR, Kuhl M, Høiby N: Fates of O2 during the interaction between polymorphonuclear leukocytes and Pseudomonas aeruginosa in sputum from cystic fibrosis patients with chronic lung infection. First European Congress on Microbial Biofilm, Rome, Italy, September 2–5, 2009.

44) Jensen PØ, Bjarnsholt T, Moser C, Hansen CR, Kuhl M, Høiby N: Fates of O2 during the interaction between polymorphonuclear leukocytes and Pseudomonas aeruginosa in sputum from cystic fibrosis patients with chronic lung infection. Blood & Defence/HOPE Centre Retreat, Torekov, Sweden, September 17-18 2009.

45) Jensen PØ, Bjarnsholt T, Moser C, Høiby N: Anoxia prolongs the life and functionality of polymorphonuclear leukocytes. 32nd European Cystic Fibrosis Conference, Brest, France, June 10-13, 2009.

46) Johansen HK: Cystisk fibrose. Videnskabeligt lægemøde på Øre-Næse-Hals afdelingen, Rigshospitalet, Kø-benhavn, 13 maj 2009.

47) Johansen HK: Klinisk mikrobiologi. DBLC-årsmøde, Rigshospitalet, Købenahvn, 20 november 2009.

48) Johansen HK: P. aeruginosa sinusitis in CF - is IgA benefi cial or harmful?. Eurobiofi lms 2009, Rome, Italy, Sep-P. aeruginosa sinusitis in CF - is IgA beneficial or harmful?. Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, Sep-tember 2-5, 2009.

49) Johansen HK: The paranasal sinuses are focus for colonisation and chronic biofilm lung infection in CF pa-tients. ESCMID Postgraduate Technical Workshop Medical Biofilm Techniques 2009. Copenhagen, Denmark, August 18, 2009

50) Johansen HK, Aaanaes K, Pressler T, Hansen SK, Skov M, Nielsen K, Molin S, Høiby N, Buchwald von C: Paranasal sinuses are a focus for P. aeruginosa lung infection in CF. 32nd European Cystic Fibrosis Conference, Brest, France, June 10-13, 2009.

51) Johansen HK, Aanaes K, Pressler T, Hansen SK, Skov M, Nielsen KG, Molin S, Buchwald von C, Høiby N: P. aeruginosa sinusitis in CF – is IgA beneficial or harmless? 23rd Annual North American Cystic Fibrosis Confer-ence, Minneapolis, Minnesota, USA, October 15-17, 2009.

52) Kirk O, Mocroft A, Podlekareva DN, Post FA, Riekstina V, Miro JM, Furrer H, Bruyand M, Panteleev AM, Ra-khmanova AG, Girardi E, Losso MH, Toibaro JJ, Caylá J, Miller RF, Obel N, Skrahina A, Chentsova N, Lundgren JD for the HIV/TB study group: Health Care Index (HCI) and Outcome following a diagnosis of tuberculosis (TB). EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

53) Kolpen M, Hansen CR, Bjarnsholt T, Moser C, Christensen LD, van Gennip M, Ciofu O, Mandsberg L, Kharazmi A, Döring G, Givskov M, Høiby N, Jensen PØ: The Respiratory Burst of Polymorphonuclear Leukocytes Accelerates Oxygen Depletion in Sputum from CF Patients With Chronic Pseudomonas aeruginosa Lung Infection. American Society for Microbiology, 109th General Meeting, Philadelphia, USA, May 17-21, 2009.

54) Kowalska JD, Mocroft A, Ledergerber B, Colebunders R, Ristola M, Begovac J, Sambatakou H, Pedersen C, Lundgren JD, Kirk O: Estimating AIDS and non-AIDS related deaths for patients with missing death data in the EuroSIDA cohort. EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

55) Kruk A, Bannister W, Podlekareva D, Chensova N, Rakhmanova A, Horban A, Domingo P, Lundgren JD, Mocroft A, Kirk O for the EuroSIDA Study Group: Tuberculosis (TB) among HIV-1 infected patients across Europe: change over time and risk factors. EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

56) Kurtzhals JAL: How should Danish tourists protect themselves against malaria. Copenhagen Climate Network Conference. World Malaria Day, Copenhagen, Denmark, April 25, 2009.

57) Lundgren J: Earlier Recognition of HIV: A Pressing Need. EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

58) Lundgren JD, Reiss P, Worm SW, El-Sadr W, DeWit S, Weber R, d‘Arminio Monforte A, Kirk O, Fontas E, Da-bis F, Law MG, Friis-Møller N, Phillips AN, Sabin C on behalf of the D:A:D study group: Risk of myocardial infarc-tion (MI) in those exposed to specific antiretroviral drugs (ARVs) from the protease (PI), non-nucleoside reverse transcriptase (NNRTI) and nucleos(t)ide reverse transcriptase inhibitor (NRTI) drug classes: the D:A:D Study. 16th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Montreal, Canada, February 8-11, 2009.

59) Mirhendi H, Bruun BG, Christensen JJ, Fuursted K, Gahrn-Hansen B, Johansen HK, Nielsen L, Knudsen JD, Schønheyder HC, Arendrup MC: A retrospective molecular screening for Candida orthopsilosis and C. metapsilosis among Danish C. parapsilosis blood isolates. ISHAM, Tokyo, Japan, May 25-29, 2009.

60) Mocroft A, Gazzard B, Karlsson A, Karpov I, De Wit S, Lunzen J v, Katlama C, Zilmer K, Kirk O, Lundgren JD on behalf of the EuroSIDA study group: Improvements in mortality between 2002-2007 across Europe: Differences between regions of Europe. EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

61) Mocroft A, Reiss P, Gasiorowski J, Ledergerber B, Chiesi A, Gatell J, Rakhmanova A, Johnson MA, Kirk O, Lundgren JD for the EuroSIDA study group: Serious Fatal and Non Fatal Non-AIDS Defining Illnesses (non-ADI) in Europe. 16th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Montreal, Canada, February 8-11, 2009.

62) Mocroft A, Trullas JC, Cofan F, Tourret J, Moreno A, Isnard C, Fux C, Katlama C, Reiss P, Lundgren J, Gatell JM, Kirk O, Miro JM and the EuroSIDA Investigators: Dialysis and renal transplantation in HIV-infected patients: a European survey in 2008. EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

63) Mocroft A, Vogel M, Beniowski B, Pradier C, Battegay M, Jevtovic D, Soriano V, Peters P, Lundgren J, Rock-stroh JK for the EuroSIDA Study Group: Has the uptake of treatment for chronic hepatitis C virus infection (CHC) in HIV-positive patients in Europe changed over time? EACS Conference, Cologne, France, November 11-14, 2009.

64) Mortensen KL, Johansen HK, Skov M, Pressler T, Arendrup MC: Aspergillus spp. and other moulds in cystic fibrosis patients in Denmark. ISHAM Working Group on Fungal Respiratory Infections in Cystic Fibrosis. Angers, France, June 8 2009.

65) Mortensen KL, Johansen HK, Skov M, Pressler T, Arendrup MC: Aspergillus spp. and other moulds in cystic fibrosis patients in Denmark. 4th Trends in Medical Mycology (TIMM-4), Athens, Greece, October 18-21, 2009.

66) Moser C: Animal Models on Biofilm Infections. 5th ASM Conference on Biofilms. Cancun, Mexico. November 2009.

67) Moser C: Antibodies to uropathogens after spinal cord lesion and biofilm formation. Symposium – Urinary tract infection after spinal cord lesion. Humlebaek. Denmark. 21 November 2009.

68) Moser C: Can we prevent acquisition of CF pathogens from the environment? 32nd European Cystic Fibrosis Conference, Brest, France, June 10-13, 2009. 69) Moser C: Data Set for UTI in SCL. Humlebaek, Denmark. November 21, 2009.

KMA, RH, 2009

46

KMA, RH, 2009

47

70) Moser C: The Th1/Th2 balance and chronic Pseudomonas aeruginosa biofilm lung infections: Interaction with inflammation and target for treatment. Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, September 2-5, 2009.

71) Moser C, Lanng S, Jensen PØ, Skov M, Pressler T, Høiby N: Inflammation induced by chronic lung infection accelerates the development of diabetes mellitus in patients with cystic fibrosis. 109th ASM, Philadelphia, May 17-21, 2009.

72) Moser C, Jensen PØ, Shirai R, Calum H, Kharazmi A, Høiby N: Granulocyte-macrophage colony stimulating factor (GM-CSF) treatment induces a TH1 response in mice with chronic Pseudomonas aeruginosa lung infection by modulation of dendritic cells. 23rd Annual North American Cystic Fibrosis Conference, Minneapolis, Minnesota, USA, October 15-17, 2009.

73) Nielsen AK, Alhede M, Jakobsen TH, Tolker-Nielsen T, Høiby N, Givskov M, Bjarnsholt T: A novel easy and cheap biofilm set-up for fast screening of different biofilm phenotypes. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

74) Nielsen XC, Dalhoff K, Jensen A, Jürgens G, Hansen CR, Johansen U, Pressler T, Høiby N: Association between CYP3A enzyme activity and ciprofloxacin and chlaritrhomycin pharmacokinetics in patients with cystic fibrosis. 32nd European Cystic Fibrosis Conference, Brest, France, June 10-13, 2009.

75) Nielsen NHS, Jensen NV, Koch J, Jensen AL, Poulsen SS, Pier GB, Johansen HK: Passive immunization against Staphylococcus aureus periprosthetic osteomyelitis in rats. Danish Orthopaedic Society Meeting, Copen-Danish Orthopaedic Society Meeting, Copen-hagen, Denmark, October 22, 2009.

76) Parades R, Bannister W, Cozzi-Lepri A, Pou C, Bellido R, Bogner J, Gargalianos P, Bánhegyi D, Clotet B, Lundgren JD and the EuroSIDA study group: Mutation A376S in the RT connection domain is associated with an increased risk of virological failure to nevirapine- based therapy in NNRTI-naïve HIV-infected subjects in the EuroSIDA Study. 16th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Montreal, Canada, February 8-11, 2009.

77) Peters L, Mocroft A, Soriano V, Rockstroh J, Ledergerber B, Karlsson A, Knysz B, Pradier C, Zimler K, Lund-gren JD for the EuroSIDA study group: Hyaluronic Acid as a Prognostic Marker of Hepatic Coma and Liver-related Death in HIV/Viral Hepatitis Coinfected Patients. 16th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Montreal, Canada, February 8-11, 2009.

78) Peters L, Neuhaus J, Mocroft A, Soriano V, Rockstroh J, Dore G, Puoti M, Tedaldi E, Clotet B, Kupfer B, Lund-gren JD, Klein MB for the INSIGHT SMART Study Group: Interruption of Antiretroviral Therapy and Changes in Hyaluronic Acid as Marker of Liver Fibrosis Progression in SMART Viral Hepatitis Coinfected Participants and Mat-ched Controls. 16th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Montreal, Canada, February 8-11, 2009.

79) Rasmussen AKI, Mortensen A, Houg D, Johansen HK: Comparisons of healthcare-associated and community-associated MRSA strains using SCCmec EVIGENE and routine susceptibility testing. 19th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. Helsingki, Finland, 19-22 May, 2009.

80) Reekie J, Mocroft A, Engsis F, d�Arminio Monforte A, Wiercinska-Drapalo A, Domingo P, Antunes F, Clumeck N, Kirk O, Lundgren JD for the EuroSIDA study group: Relationship between Current Level of Immunodeficiency and Non-AIDS malignancies. 16th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Montreal, Canada, Febru-ary 8-11, 2009.

81) Skou J, Nielsen C, Bjarnsholt T, Johansen HK: Conventional methods versus PNA FISH for Candida albicans/Candida glabrata identification. th European Congress of Clinical Microbiology and Infectious Diseases. Helsingki, Finland, 19-22 May, 2009. (Pub-lication only).

82) Smith C, Weber R, Worm S, Phillips A, Thiebaut R, Friis-Møller N, Pradier C, Kirk O, d�Arminio Monforte A, El Sadr W, Reiss P, Lundgren J, Sabin C on behalf of the D:A:D Study Group: Association between modifiable and non-modifiable risk factors and specific causes of death in the HAART era: Results from the D:A:D study.16th Conference on Retroviruses and Opportunistic Infections, Montreal, Canada, February 8-11, 2009.

83) Song Z: Progress report part 2 for research of antibacterial peptide A1. NPARI meeting, Rigshospitalet, Copen-NPARI meeting, Rigshospitalet, Copen-hagen, Denmark, January 22, 2009.

84) Song Z: Progress report part 3 for research of antibacterial peptide A1. NPARI meeting, The University of Man-chester, Manchester, United Kingdom, June 25, 2009.

85) Song Z: Progress report part 4 for research of antibacterial peptide A1. NPARI meeting, Institut Pasteur, Paris, France, December 15, 2009.

86) Strandmark LB, Schøring JK, Christensen S, Nybroe O, Pedersen JGT, Eilenberg J, Munk L, Rønn R, Ciofu O, Bruun SS, Ørum JE: Sustainable plant production in a changing world-formation of a cross-faculty network.Climate change. Global Risk, Challenges and Decisions, Copenhagen, March 10-12, 2009.

87) Thomsen TR, Wolff TY, Rudkjøbing V, Moser C, Bjarnsholt T, Høiby N, Nielsen PH: Improved diagnosis of bacterial infections by molecular biological techniques. ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

88) Tvede M: Biofilm og anaerobe bakterier. RH biofilmmøde, Rigshospitalet, Copenhagen, February 23, 2009.

89) Tvede M: Clinical use of daily routine measurements of PCT in critically ill patients – is it worthwhile? 19th EC-CMID, Helsinki, Finland, May 17, 2009.

90) Tvede M: Infections related to permanent fillers – Do we need prophylactic antibiotic treatment? Spanish Soci-ety of Dermatologists and Plastic Surgeons, Marbella, Spain, June 20, 2009.

91) Tvede M: Practical use of procalcitonin in clinical routine – useful and safe? European Society of Intensive Care Medicine, Vienna, Austria, October 13, 2009.

92) Vendel-Jensen N, Koch J, Nielsen NHS, Johansen HK: Implant-associated osteomyelitis in a rat knee-pros-Implant-associated osteomyelitis in a rat knee-pros-thesis model using two strains of Staphyloccus aureus with different inoculae. European Conference for Operation Nurses, Copenhagen (EORNA), Denmark, April 1, 2009.

93) Werthén M, Henriksson L, Jensen PØ, Sternberg C, Givskov M and Bjarnsholt T: A in vitro model of bacterial infections in wounds and other soft tissues. Techinal Advisory Conference (TAC), Center for Biofilm Engineering, MSU, USA, February 3-4, 2009.

KMA, RH, 2009

48

KMA, RH, 2009

49

Bjarnsholt T: Opponent ved Wen-Chi Chiangs Ph.D. forsvar: Antimicrobial surfaces. Københavns Universitet, 1 december 2009. Reviewer for Microbiology. Reviewer for Wound repair and regeneration. Reviewer for Biofouling.Reviewer for Journal of antimicrobial chemotherapy. Reviewer for Biofilms. Reviewer for Journal of cystic fibrosis.Reviewer for Journal of medical microbiology. Reviewer for Wound Healing Society Year Book 2010, Microbiology.Sekretær og stifter af biofilm arbejdsgruppen under DSKM. Sekretær for 2nd Eurobiofilm Conference 2011 Copenhagen, Denmark.Session chair Symposium 1 – Biofilms in wounds and in chronic bacterial infections. First European Congress on Microbial Biofilm, Rome, Italy, September 2–5, 2009.Session chair Session 6 – Biofilms in Medical and Dental Infections 4th ASM Biofilm conference, Cancun, Mexico.Vejleder for bachelor studerende Maria Kristin Bjornsdöttir: Implementering af automatisk 16S sekvens analyse til identifikation af bakterier i blodkolber; CVU Øresund EVU og KMA, Rigshospitalet.Vejleder for bachelor studerende Kasper Thomsen: Udvikling af anaerobe biofilm – og dens antibiotikatolerance; KMA, Rigshospitalet og SUND, Københavns Universitet.Vejleder for bachelor studerende Ditte Høvenhoff Hald: Bakteriel kommunikation – Eksperimentel undersøgelse af Quorum sensing inhibitors indvirkning på Aeromonas hydrophila; DTU og SUND, Københavns Universitet.Vejleder for bachelor studerende Susanne Rytter Christoffersen: Bakteriel kommunikation – Eksperimentel under-søgelse af Quorum sensing inhibitors indvirkning på Aeromonas hydrophila; DTU og SUND, Københavns Universitet.Vejleder for bachelor studerende Ôzge Er: Anaerobic Biofilm in soft tissue filler, SUND, Københavns Universitet og KMA Rigshospitalet.Vejleder for OSVAL I studerende Line Rasmussen:Quorum sensing inhibitorer i Pseudomonas aeruginosa biofilm, SUND, Københavns Universitet.Vejleder for Master studerende Marlene Hansen: Full genome sequencing of Achromobacter xylosoxidans, SUND, Københavns Universitet og KMA, Rigshospitalet. Vejleder for Ph.D. studerende Louise Dahl Christensen:Kostkomponenter og deres indvirkning på kroniske Pseudomonas aeruginosa infektioner, SUND, Københavns Universitet.Vejleder for Maria van Gennip: Fremtidige behandlingsstrategier af bakterielle infektioner med multifunktionel anti-mikrobiel medicin, SUND, KU.Vejleder for Morten Alhede: Pseudomonas aeruginosa host interactions: common traits in chronic infections, SUND, Københavns Universitet og DTU.Vejleder for Helle Johansen: Identifikation af anti-mikrobielle stoffer i 2. generations plante-biomasse SUND, Kø-benhavns Universitet.

Christiansen CB:Mødearrangør og mødeleder ved DEKS-møde, session 6, klinisk mikrobiologi. Odense, 10 september 2009. Ciofu O: Vejledningarbejde af bacheloropgaver: 1. En fænotypisk karakterisering af P. aeruginosa CF isolater fra sinus og lunge” af Anja Sander, stud. Molekylær biomedicin ved Københavns Universitet, 15 juni 2009.2. ”Autoimmun anti-NMDA-receptor limbisk encefalit-en ny klassificeret form med antistofmedirete patogenese” af stud.med. Araz Rawshani, juni 2009.3. ”MRSA ST398 fra svin til mennesker” af stud. med. J. Andreas Thomsen, 2 juni 2009.

4. ”Hospital associeret MRSA” af stud. med. Erik Nilsson, 2 juni 2009.Vejledningsarbejde af kandidatopgaver:1. ”Meningokok bærertilstandens betydning for naturlig immunitet mod invasiv meningokok sygdom” af stud.med. Anne Sofie Clausen, 18 juni 2009.2. ”LPS and meningococcal disease” af stud.med. Jon Ragnar Jonsson, 18 juni 2009.Vejleder for ph.D projektet: ”Molekylær karakterisering af P. aeruginosa mutatorstammer og DNA reparations-mekanismer” . cand. scient. Lotte Frigaard Mandsberg (2006-2009).Vejleder for Ph.D projektet “Pharmacokinetics and pharmacodynamics of antimicrobial agents to planktonic and biofilm-growing Pseudomonas aeruginosa and Staphylococcus aureus in vitro and in vivo” af Hengzhuang Wang, Department of Clinical Microbiology, Rigshospitalet (2008-2011). Bedømmer for The National Authority for Scientific Research of the Romanian Government for 4 projects sent in the call: “Increase of Economic Competitiveness”, Priority Axis 2 “RTD and Innovation for Competitiveness”, Operation 2.1.2 “Complex research projects fostering the participation of high-level international experts” Octo-ber 2009.Formand for bedømmelsesudvalget for ph.D. ”The therapeutic potential of plectasin. Studies of antidrug-anti-body development and intracellular antistaphylococcal activity” af Karoline Sidelmann Brinch, DVM.Censor for: “Digital dermatitis in Danish cattle” Master Thesis af Marianne Rasmussen, 2009.Censor for: “Optimization of flow system for biofilm cultivation” and Metabolic adaptation of Pseudomonas aeru-ginosa during cystic fibrosis lung infections” af Inna Dashevsky, 2009.Censor for: “A mathematical approach to understand cystic fibrosis” af Melanie Khodaie og Julie Serritslev, 2009.Censor for: “Phenotypic and genotypic characterization of early Pseudomonas aeruginosa isolates of the blue genotype and comparison to present dominating blue strains” juli 2009.

Høiby, N:Member of: The Board of The Danish Association for Prevention of Cystic Fibrosis. Board Member: Michaelsen Foundation Chairman for: The Danish Pasteur Society, Board member. Expert adviser (Microbiology): Medical-Legal-Council of Denmark.Chairman for: 6.-8. semester undervisningsudvalget,Sundhedsvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet.Chairman for: 6. sem. Bachelor eksamen, Sundhedsvidenskabelige Fakultet, Københavns Universitet.Chairman and founder of: The ESCMID Biofilm Study Group (ESGB). Member of: Antimicrobial Task Force (AMTF), Cystic Fibrosis Foundation, USA 2004-Founder and chairman: for Biofilm arbejdsgruppen under Dansk Selskab for Klinisk Mikrobiologi. 2009-Founder and chairman: of DSLYMember of Scientific Advisory Board for 5th Forum on Respiratory Tract Infections. Barcelona, Spain, Febr. 4-7-2009.Member of: organizing and scientific committee for Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, September 2-5, 2009.Chairman for: Session Bacterial Biofilm: From formation to treatment. 19th ECCMID, Helsinki, Finland, May17, 2009.Organizer of: ESCMID postgraduate technical workshop ”Medical Biofilm Techniques 2009”, (an ESGB pro-posed course) at the Danish Technical University, Copenhagen August 17-20, 2009.Chairman for: Session 1: The early stages of biofilm development. Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, Sept. 2-5, 2009.Chairman for: Closing key-note lectures, Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, Sept. 2-5, 2009.Member of Editorial Board: Journal of Cystic Fibrosis, 2002-Editorial Board: Biofilms. Member of Editorial Board: Future Microbiology, 2006-Referee for numerous journals.Opponent at: Christian T. Brandt�s doctoral thesis:

Diverse

KMA, RH, 2009

50

KMA, RH, 2009

51

”Experimental studies of pneumococcal meningitis”. University of Copenhagen, Denmark, defended 27-11-2009.Opponent at: Shanika Anne-Marie Cruz�s PhD Thesis *Lectin-medicated biofilm maturation, quorum sensing and Pseudomonas aeruginosa infections in cystic fibrosis. University of Nottingham, UK, 5-3-2009.Member of Evaluation committee: 5-year research professor H.C. Schønheyder, evaluation of performance after the 5 years, Aarhus University, Denmark 2009.Member of Evaluation committee: Associate professor and consultancy (overlæge), Department of Clinical Mi-crobiology at Rigshospitalet and Institute of International Health, Immunology and Microbiology, University of Copenhagen, Denmark 2009.

Jensen PØ:Faculty member of ESCMID postgraduate technical workshop ”Medical Biofilm Techniques 2009”, (an ESGB proposed course) at the Danish Technical University, Copenhagen August 17-20, 2009.Reviewer for Pediatric Pulmonology.Reviewer for Expert Review of Anti-infective Therapy.

Johansen HK:Formand for DSKM.DSKMs repræsentant i DANres-gruppen.Arrangør af DSKMs årsmøde 27.-28. februar 2009, Nyborg Strand.DSKMs repræsentant i Dansk Medicinsk Selskab.Medlem i det landsdækkende uddannelsesråd i klinisk mikrobiologi.Medlem af det landsdækkende ansættelsesudvalg i klinisk mikrobiologi.Medlem af lægerådet i Landsforeningen til Bekæmpelse af Cystisk Fibrose. Medlem af the Scientific Committee for the European Cystic Fibrosis Conferences (ECFS).Faculty member of ESCMID Postgraduate Technical Workshop Medical Biofilm Techniques 2009. Copenhagen, Denmark 17-20 August 2009.Reviewer for Journal of Cystic Fibrosis.Reviewer for Clinical Microbiology and Infection.Reviewer for Scandinavian Journal of Infectious Diseases.Ekstern lektor ved ISIM, Københavns Universitet.Medlem af Censor-korpset ved Danmarks Tekninske Universitet (beskikket som censor ved ingeniøruddannel-serne - korpset for kemi).Vejleder for OSVAL2-studerende stud. med. Christoffer Hasselbring. Hur ser bakteriologin ut vid vänstersidig infektiös endokardit i Danmark? Vejleder for scolar-stipendiat (FSS-stipendium) Christina Dalbøge i projektet farmakokinetik og -genetik hos patienter med CF. Medvejleder for ph.d.-studerende Klaus Leth-Mortensen. Medvejleder for ph.d.-studerende Kasper Aanaes.

Kurtzhals JAL:Formand for Dansk Selskab for Parasitologi.Bestyrelsesmedlem, The Danish Research Network for International Health (enrecahealth.ku.dk).Medlem af Center for Medicinsk Parasitologi scientific board og leder af CMP�s forskningsgruppe på Rigshospi-talet. (www.cmp.dk - PATHOGENESIS).Medlem af Scientific Review Board European Development Clinical Trial Platform (EDCTP).DSKM udpeget medlem af arbejdsgruppen til udarbejdelse af rejsemedicinske retningslinier i Danmark.Fagredaktør (parasitologi), EQA News.DSKM udpeget referent for parasitolgiske afsnit, Medicin.dk.Forfatter af tropemedicinske afsnit i Medicinhåndbogen.Scientific reviewer for Danida, Wellcome Trust og EU forskningsansøgninger.

Vejleder for PhD studerende, cand. scient. Casper Hempel, i samarbejde med Institut for Neuroprotektion og Farmako-logi, Københavns Universitet.Vejleder for PhD studerende, cand. scient. Mathias Jul Jørgensen, Statens Serum Institut og Københavns Universitet.Vejleder for humanbiologi-studerende Sarah Bøje (specialeprojekt). Vejleder for stud. med. Lasse Maretty Sørensen (forskningsår), stud. med. Ole Bæk (bachelor projekt).Referee for Antimicrobial Agents and Chemotherapy. Referee for APMIS. Referee for BMC Medicine. Referee for Clinical Microbiology and Infection. Referee for Experimental Parasitology. Referee for Malaria Journal. Referee for Parasite Immunology.Referee for PLoS one.Referee for Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene.Referee for Ugeskrift for Læger.Medlem af GSK advisory board, rejsemedicin.Steering committee medlem af forskningskonsortium til udvikling af sensor til påvisning af parasitter i drikkevand (Sam-arbejde mellem Grundfos, Unisensor, DTU-vet og CMP).

Lundgren JD:Chair steering committee for “Data collection on Adverse events of anti-HIV Drugs” (DAD).Project leader EuroSIDA.Member of international HAART oversight committee of metabolic complications of HIVtherapy.Member of Executive Committee, ESPRIT Study.Member of Programme Committee, ESCMID.Editor HIV Medicine.Member of Editorial Board, Scandinavian Journal of Infectious Diseases.Member of Editorial Board, AIDS Reviews.Member of scientific committee, the EuroGuidelines on HIV resistance.Member Dansk Infektionsmeidicinsk Selskab.Member of committee on use of malaria prophylaxis, Danish Health Authority (Sundhedsstyrelsen).Member of Executive Committee, European AIDS Clinical Society (EACS).Member, ASCI (The American Society for Clinical Investigation).Member of Executive Committee, INSIGHT (International Network for Strategic Initiatives in Global HIV Trials).Member of the editorial board – Future HIV Therapy.Member of Scientific Committee, SILCAAT Study.Senior Consultant PASS-studiet.Honorary lifetime member, IAPAC – The International Association of Phycisians in AIDS Care. Consultant,WHO Collaborating Center for International Drug Monitoring.

Tvede M:Reviewer for Ugeskrift for Læger.Reviewer for Dermatology.Reviewer for Emerging Infectious Diseases.

Wu H:Vejleder for Ph.D. studerende Hengzhuagn Wang.

KMA, RH, 2009

52

KMA, RH, 2009

53

Ciofu O:Deltaget i: Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, September 2-5, 2009.

Johansen HK:Deltaget i: DSKM�s årsmøde, Nyborg Strand, marts 2009.Deltaget i: 19th ECCMID, Helsinki, Finland, May 16-19, 2009.Deltaget i: 32th European Cystic Fibrosis Conference, Brest, France, June 10-13, 2009.Deltaget i: Eurobiofilms, Rome, Italy, September 2-5, 2009.

Kurtzhals JAL:Deltaget i: DSKM�s årsmøde, Nyborg Strand, marts 2009.Deltaget i: ECCMID advanced course in clinical parasitology, Paris, March 29-31, 2009.Deltaget i: 19th ECCMID, Helsinki, Finland, May 16-19, 2009.

Moser C:Deltaget i: 109th ASM, Philadelphia, USA, May 17-21, 2009.Deltaget i: 32nd European Cystic Fibrosis Conference, Brest, France, June 10-13, 2009. Deltaget i: Eurobiofilms 2009, Rome, Italy, September 2-5, 2009.Deltaget i: 49th ICAAC, San Francisco, USA, September 12-15, 2009. Deltaget i: 23rd Annual North American Cystic Fibrosis Conference, Minneapolis, Minnesota, USA, October 15-17, 2009.Deltaget i: ASM Biofilm 2009 Conference, Cancun, Mexico, November 15-19, 2009.

Bjarnsholt T:KU-Nat, Master kursus: Advanced Microbiology, Københavns Universitet, 2 oktober 2009.KU-Life, Bachelor kursus: Biomedicine. Københavns Universitet, 16 juni 2009.KU-Sund, Bakteriologi kursus, Københavns Universitet, uge 50 2009.

Christiansen CB:Bioanalytikeruddannelsen Metropol, Tema om Influenzavirus (ca. 10 timer), Metropol København, 10-12 no-vember 2009.Morgenmøde om diagnostik af virusinfektioner, Øre-næse, hals afd. 2071, Rigshospitalet, København, 19 november 2009.

Ciofu O:Øvelseskursus og forelæsninger i bakteriologi forår og efterår 2009 og formulering og rettelse af eksamensop-gaver til sommer- og vintereksamen for medicinstuderende.Undervisning i mikrobiologi af civilingeniørstuderende og FSV studerende.

Høiby N:Forelæsninger og studenteraktiverende undervisning og 2-ugers kurser for medicinske studenter i 6., 8. og 12. semester. Eksamensformand for bacbeloreksamen i 6. semester.Formand for undervisningsudvalget for 6.-8. semester.Medlem af bachelorudvalget.Ledet, organiseret og undervist ved 2-dages Kursus i antibiotikaterapi, 28.-29. maj 2009.Organiseret og ledet og undervist ved ESCMID-ESGB�s Postgraduate Technical Workshop ”Medical Biofilm Techniques 2009”, 17-20. august 2009, DTU, Lyngby, Denmark. 3 lectures: 1) Høiby: Introduction to medical biofilms: antibiotic resistance and medical importance, 2) Høiby: Cystic fibrosis and biofilms: clinical and ex-perimental scenarios, 3) Medical biofilms and antibiotic resistance mechanisms.Medical Biofilm Techniques PhD Course: P. aeruginosa a biofilm in cystic fibrosis patients. Biocentrum, DTU, 25. august 2009.

Kurtzhals JAL:Forelæsninger og øvelseskurser i bakteriologi og parasitologi på medicinstudiets 6., 8. og 12. semester.Underviser på Summer School in International Health, Københavns Universitet August 2009.Foredrag om malaria for laboratoriepersonale, Siemens workshop, Roskilde, maj 2009.Undervisning i personlig sundhed ved tropeudstationering på Pre-departure course for Danida rådgivere, Udenrigsministeriet, august 2009.Foredrag om ortopædkirurgiske infektioner og infektionsprofylakse, Patientforsikringen, november 2009.

Moser C:Praktisk antibiotika terapi ud fra foreløbige dyrkningssvar - tolkning af dyrkningssvar. Hæmatologisk afdeling, RH. 2009. Cystic fibrosis and biofilms: clinical and experimental scenarios: Immunology. Ph.d course. ESCMID. DTU. August 2009.Animal models of Biofilm infections. Ph.d course. ESCMID. DTU. August 2009.Animal models of Biofilm infections. Ph.d course. Technical Biofilm Course. DTU. August 2009.Pseudomonas, Staphylokokker og Streptokokker. Plastikkirurgisk afdeling. 2009.Præcipitiner og infektioner. Urologisk afdelingen, RH. 2009.Behandling af kroniske urinvejsinfektioner (forårsaget af multiresistente bakterier). Epidemiafdelingen, RH. 2009.

Undervisning

Videreuddannelse og rejser

Status på biofilm-relaterede sygdomme. Kliniske aspekter. A-kursus for kliniske mikrobiologer. Skejby, Aarhus 2009. Karrelateret mikrobiologi og infektioner: Biofilm. A-kursus for karkirurger. Skejby, Aarhus 2009.

Tvede M:Kursus i antibiotikabehandling og infektionsdiagnostik. Arrangeret af Dagens Medicin. KMA 7602, Rigshospita-let, København, 28-29 maj 2009.Traumekursus for ortopædkirurger: Profylakse og antibiotisk behandling af traumatiserede patienter. Rigsho-spitalet, auditorium I, København, 24 januar 2009 og 10. oktober 2009.

KMA, RH, 2009

54

KMA, RH, 2009

55

AfdelingsledelseLaboratoriechef, professor, overlæge, dr. med. Niels HøibyLedende bioanalytiker, Annette Dreyer

OverlægerProfessor, overlæge, dr. med. Jens LundgrenOverlæge, dr. med. Helle Krogh JohansenOverlæge, Michael TvedeOverlæge, lektor, ph.d. Jørgen Kurtzhals

LægerAfdelingslæge Claus Moser, ph.dAfdelingslæge Claus Bohn Christiansen, ph.d1 1. reservelæge4 reservelæger

ForskningslederePeter Østrup Jensen, cand.scient. ph.dArsalan Kharazmi, ph.d

LaboratorieledereNikolai Kirkby, cand.scient. ph.dThomas Bjarnsholt, cand.polyt. ph.d

Forskningsassistenter & ph.d-studerende

BioanalytikereAfdelingsbioanalytiker Vibeke ClausenAfdelingsbioanalytiker Jeanette JakobsenAfdelingsbioanalytiker Anna Marie AastrupBioanalytikerunderviser Imran KhanBioanalytikerunderviser Lisbeth Kanstrup36 bioanalytikere

Sekretariat og øvrigt personale4 sekretærer1 laboratoriebetjent2 hospitalsmedhjælpere1 kommunikationsmedarbejder

Ansatte på KMA

Klinisk Mikrobiologisk AfdelingAfsnit 9301 & 7602Juliane Maries Vej 222100 København ØRigshospitalet

Telefon, sekretariatet 3545 6400