kim309-01,02 kuantum kİmyasi uygulama Ödevİ
TRANSCRIPT
Microsoft Word - Ödev_ÖRNEK_Ca-EDTAOptimizasyon sonrasnda
kompleksin UV ve IR spektrumlar oluturulur.
Molekülün 3D Yaps:
Kompleksin Moleküler Enerji Diyagram:
HOMO orbitali HOMO -1 orbitali HOMO -2 orbitali HOMO -3 orbitali HOMO -4 orbitali
LUMO orbitali LUMO+1 orbitali LUMO+2 orbitali LUMO+3 orbitali LUMO+4 orbitali
Elektronik Geçiler:
HOMO→LUMO 0.0000 272.2
1→3 0.0037 249.7
1→4 0.0000 248.6
1→5 0.0104 232.3
1→6 0.0000 209.9
1. Normal Mod
iyonlarn tutmak için kullanlr. Biyokimya ve moleküler biyoloji iyon tüketici olarak
Enzimlere kar kullanlr. Analitik kimya da kompleksmetrik titrasyon, su sertlii
maskeleyici ajanlar analizlerinde kullanlr. Suyun sertlik tayininde kullanlmasnda ayni
özelliinden yararlanlr. Suya sertliini veren Ca2+ iyonu, EDTA ile kompleks oluturur (Ca-
EDTA) uygun bir indikatör ile Ca2+ miktar, deriimi bilinen EDTA çözeltisi de kullanarak
tayin edilir. Ayrca kursun zehirlenmesinde Ca-EDTA kompleksi içeren çözelti kullanlr. Bu
kompleksi içtiimizde daha kararl bir kompleks olan Pb-EDTA kompleksi oluur ki, bu
kompleks kolaylkla deriden dar atlabilmektedir. Geride ise vücuda yararl olan Ca2+
iyonlarn brakmaktadr.
ÖDEVDE STENLENLER
1. Molekül önce Moleküler Mekanik sonra Semi Empirical/PM3 seviyesinde optimize edilecek ve optimize molekül için IR ve UV spektrumlarn hesaplanacak. (Convergence limit=0.01; Iteration limit=50; Optimization Algorithm= Polac Ribiere; RMS gradient=0.01).
2. Optimize edilmi molekülün 3 boyutlu ekli, IR ve UV spektrumlar, moleküler orbital diyagram ve LUMO+4’ten HOMO-4’e kadar olan 10 orbitalin ekilleri ödeve eklenecek.
3. UV spektrumu log dosyasndan be geçi seçilerek, geçi dalgaboyu, osilatör kuvveti ve geçiin hangi orbitallere ait olduu belirtilerek yazlacak. (Örnek: Geçi=HOMO→LUMO Oscillator Strength=0.1495 Geçi Dalgaboyu=302.5 nm)
4. IR spektrumundan ilk be normal moda ait titreim frekans deerleri verilecek.
5. Molekülün özellikleri hakknda literatür özeti verilecek.
6. Yaplan optimizasyonlarn ardndan moleküller örenci numar ile .HIN dosyas olarak kaydedilecek (Örnek: 20038792.HIN ) ve [email protected] adresine e-posta olarak gönderilecektir. Göndermeyenler deerlendirmeye alnmayacaktr.
7. Ödev listesine http://yunus.hacettepe.edu.tr/~ttugsuz/Kim309.pdf adresinden de ulaabilirsiniz.
1 20018521 OKUTAN SERDAR
2 20217778 ÖZDEMR EBRU
4 20317631 SEYF KAAN
5 20417113 BAARAN AZME
7 20517073 BROL EMRE
51 21122181 DURMU BURCU
74 21122779 YTKN GÜLÇN
75 21122798 YURTLU ENSE
2 20719955 AY GÖKHAN
3 20720158 GÖKMEN BERKAN
5 20720403 ÖZMEN FURKAN
6 20720417 ÖZTAN BEGÜM
26 20921833 KAYALI NERMN
27 20921905 MERCAN HAZAL
28 20921919 NERGZ KÜBRA
29 20921938 ORHAN ÖZGE
30 20921957 ÖZASLAN ECE
41 21021717 ARIDAIR ITIR
59 21022182 NALÇACI NAZLI
60 21022221 ÖZDERE GÖRKEM
62 21022268 ÖZTÜRK GZEM
64 21022417 TANSIK ECEM
71 21121936 AYDEMR BÜRA
73 21121993 BAYSAL MERVE
74 21122009 BEKTA MERVE
75 21122028 BUZ ESN
85 21122597 SUSAM EMRE
Molekülün 3D Yaps:
Kompleksin Moleküler Enerji Diyagram:
HOMO orbitali HOMO -1 orbitali HOMO -2 orbitali HOMO -3 orbitali HOMO -4 orbitali
LUMO orbitali LUMO+1 orbitali LUMO+2 orbitali LUMO+3 orbitali LUMO+4 orbitali
Elektronik Geçiler:
HOMO→LUMO 0.0000 272.2
1→3 0.0037 249.7
1→4 0.0000 248.6
1→5 0.0104 232.3
1→6 0.0000 209.9
1. Normal Mod
iyonlarn tutmak için kullanlr. Biyokimya ve moleküler biyoloji iyon tüketici olarak
Enzimlere kar kullanlr. Analitik kimya da kompleksmetrik titrasyon, su sertlii
maskeleyici ajanlar analizlerinde kullanlr. Suyun sertlik tayininde kullanlmasnda ayni
özelliinden yararlanlr. Suya sertliini veren Ca2+ iyonu, EDTA ile kompleks oluturur (Ca-
EDTA) uygun bir indikatör ile Ca2+ miktar, deriimi bilinen EDTA çözeltisi de kullanarak
tayin edilir. Ayrca kursun zehirlenmesinde Ca-EDTA kompleksi içeren çözelti kullanlr. Bu
kompleksi içtiimizde daha kararl bir kompleks olan Pb-EDTA kompleksi oluur ki, bu
kompleks kolaylkla deriden dar atlabilmektedir. Geride ise vücuda yararl olan Ca2+
iyonlarn brakmaktadr.
ÖDEVDE STENLENLER
1. Molekül önce Moleküler Mekanik sonra Semi Empirical/PM3 seviyesinde optimize edilecek ve optimize molekül için IR ve UV spektrumlarn hesaplanacak. (Convergence limit=0.01; Iteration limit=50; Optimization Algorithm= Polac Ribiere; RMS gradient=0.01).
2. Optimize edilmi molekülün 3 boyutlu ekli, IR ve UV spektrumlar, moleküler orbital diyagram ve LUMO+4’ten HOMO-4’e kadar olan 10 orbitalin ekilleri ödeve eklenecek.
3. UV spektrumu log dosyasndan be geçi seçilerek, geçi dalgaboyu, osilatör kuvveti ve geçiin hangi orbitallere ait olduu belirtilerek yazlacak. (Örnek: Geçi=HOMO→LUMO Oscillator Strength=0.1495 Geçi Dalgaboyu=302.5 nm)
4. IR spektrumundan ilk be normal moda ait titreim frekans deerleri verilecek.
5. Molekülün özellikleri hakknda literatür özeti verilecek.
6. Yaplan optimizasyonlarn ardndan moleküller örenci numar ile .HIN dosyas olarak kaydedilecek (Örnek: 20038792.HIN ) ve [email protected] adresine e-posta olarak gönderilecektir. Göndermeyenler deerlendirmeye alnmayacaktr.
7. Ödev listesine http://yunus.hacettepe.edu.tr/~ttugsuz/Kim309.pdf adresinden de ulaabilirsiniz.
1 20018521 OKUTAN SERDAR
2 20217778 ÖZDEMR EBRU
4 20317631 SEYF KAAN
5 20417113 BAARAN AZME
7 20517073 BROL EMRE
51 21122181 DURMU BURCU
74 21122779 YTKN GÜLÇN
75 21122798 YURTLU ENSE
2 20719955 AY GÖKHAN
3 20720158 GÖKMEN BERKAN
5 20720403 ÖZMEN FURKAN
6 20720417 ÖZTAN BEGÜM
26 20921833 KAYALI NERMN
27 20921905 MERCAN HAZAL
28 20921919 NERGZ KÜBRA
29 20921938 ORHAN ÖZGE
30 20921957 ÖZASLAN ECE
41 21021717 ARIDAIR ITIR
59 21022182 NALÇACI NAZLI
60 21022221 ÖZDERE GÖRKEM
62 21022268 ÖZTÜRK GZEM
64 21022417 TANSIK ECEM
71 21121936 AYDEMR BÜRA
73 21121993 BAYSAL MERVE
74 21122009 BEKTA MERVE
75 21122028 BUZ ESN
85 21122597 SUSAM EMRE