journees des avril 2014 rouen
DESCRIPTION
JOURNEES DES AVRIL 2014 ROUEN. PLAN. - Introduction - Tube digestif - Définition du Microbiote intestinal - Méthodes de caractérisation - Composition - Établissement, stabilité, Adaptabilité - Fonctions - Dysbiose - Applications thérapeutiques - Conclusion - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
JOURNEES DES AVRIL 2014 ROUEN
PLAN - Introduction
- Tube digestif
- Définition du Microbiote intestinal
- Méthodes de caractérisation
- Composition
- Établissement, stabilité, Adaptabilité
- Fonctions
- Dysbiose
- Applications thérapeutiques
- Conclusion
- Bibliographie
TUBE DIGESTIF
10x plus de bactéries dans l'intestin que de cellules dans le corps humain !!!!!!!
Grande Surface 400m2 !!!
X2
DEFINITION MICROBIOTE INTESTINAL
MICROBIOTE = communautés de micro-organismes qui résident ou transitent dans le tube digestif.
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-10 bactéries : 10 fois le nb de cellule de l’organisme environ 100 fois plus de gènes que le génome humain
- >500 espèces différentes réparties le long du tube digestif
METHODES DE CARACTERISATIONS
Seulement 20-30% des bactéries du tractus digestif sont cultivables par les méthodes classiques de culture A-
> Utilisation ARN ribosomal 16S en tant que marqueur de la diversité génétique > Gène codant l’ARN 16S (ADNr 16S) présent chez toutes les bactéries
- méthodes de séquençage
- empreintes
- PCR quantitative
- Hybridation in situ
- METAGENOMIQUE = étude des génomes de l’ensemble des organismes présents dans un échantillon( MICROBIOME <-> Génome associé au Microbiote)
COMPOSITION
COMPOSITION ET FACTEURS DE VARIATIONS
FLORE COLIQUE
FLORE DOMINANTE – SOUS DOMINANTE
Flore DOMINANTE 10-20 espèces avec Niveau de population élevé
Flore SOUS-DOMINANTE
Bactéries Anaérobies Surtout BGN non sporulés Bacteroides +++ BG+ = eubacteria, clostridiaBifidobacteriumCatenabacteriumCocci GP
Bactéries aero/anaérobies facultatives Enterobacteries, strepto,
Flore de passage
Entérobacteries Citrobacter, klebsiella, proteusLevures Candia albicans présent dans 50-60% cultures.
ETABLISSEMENT, STABILITE, ADAPTABILITE
DU MICROBIOTE
CONDITIONS D' HYGIENE
3. SPECIFICITE.
On peut classer les individus selon leur Entérotype.
Chaque individu : Héberge environ 200 espècesA un Microbiote qui lui est propre
FONCTIONS
ÉpithéliumIntestinal
Synthèse
Absorption
Fermentation des glucides ++++++
AGCCGAZ
- - BUTYRATE : directement utilisé par l’épithélium colique tirant 60-70% de son énergie des produits de fermentation bactérienne. - ACETATE : fournit énergie au tissu musculaire + substrat à la synthèse de cholestérol. - PROPIONATE : utilisé par le foie pour la néoglucogénèse
Métabolisme des protéines
Par Protéases
désamination
désamination
Cellule de paneth
Cellule souche
Différenciation + Prolifération des cellules épithéliales intestinales
Développement de l’angiogenèse
- Maturation épithélium intestinal- Vascularisation des villosités - Renforcement des jonctions cellulaires- Augmentation de la cellularité du chorion- Augmentation des cryptes
Jonctions renforcées
5. FONCTIONS EMERGENTES
- Neuromodulation Relation Microbiote -Intestin- Cerveau
- Rôle dans la régulation du stockage des graisses
DYSBIOSEET
PATHOLOGIES
DYSBIOSE = état de déséquilibre
Prise IPP
Prise ATB
Ingestions de micro-organismes
Voyages, changements d'environnements
Implications de la Dysbiose dans :
- Infections intestinales
- Diarrhées aux ATB
- Pullulation du grêle
- Colites de diversion
- MICI
- SII
- Cancérogènése dans le tractus digestif
- Maladies extra-digestives :
Syndrome Métabolique, Obésité
Allergies
Sokol et al. IBD 2009
=>=> Rôle anti-inflammatoire de F. prausnitzii
homéostasie Dysbiose Transitoire
Dysbiose Persistante INFECTION à CD
Exposition à C.D
Ex : Diarrhées à Clostrium Difficile
Exposition à un ATB
MODULATIONS THERAPEUTIQUES
c v=> OBJECTIF = EUBIOSE
=> MOYENS :
Approche Nutritionnelle modification des apports en fibres fermentescibles
Approche Microbiologique Probiotique Prébiotique Symbiotiques ATB
Transplantation Fécale
- Microbiote intestinal = véritable organe complexe et riche- Unique = carte d’identité d’un individu- Interactions majeures avec l’hôte- Rôles : barrière + métabolique + immunologique- Implication dans de nombreuse pathologies en cas de déséquilibre - De nombreuses implications restent à explorer…
Gigantesque et passionnant défi à relever !
CONCLUSION