29/05/2012

1

Urs Hafeli, May 23, 2012

University of British ColumbiaFaculty of Pharmaceutical Sciences

Exhibitors Sponsors

Travel Grants

Reviewers Participants

29/05/2012

2

This presentation might be very incomplete, opinionated, one‐sided, and might NOT mention your research

But that's why you all have to stay around for the next 4 days …

0

100

200

300

400

500

600

700

1980

1982

1984

1986

1988

1990

1992

1994

1996

1998

2000

2002

2004

2006

2008

2010

2012

Magnetic Nanoparticles

Magnetic Microspheres

Worldwide

?

29/05/2012

3

1975

1980

1985

1990

1995

2000

2005

2010

2015

0

50

100

150

200

250

300

350

400

450

500

Jour

nal c

itatio

ns

Magnetic Microspheres

World wide

29/05/2012

4

1975

1980

1985

1990

1995

2000

2005

2010

0

500

1000

1500

2000

2500

3000

3500

4000

Jour

na

l cita

tions

Magnetic Microspheres Magnetic Nanoparticles

World wide

Lennon NJ, Lintner RE, et al. (2010). Genome Biol 11, R15.

Column‐based reaction clean‐ups and gel‐based size selection steps are labor‐intensive and resistant to automation. To make these processes scalable and amenable to automation, we redesigned these steps based on paramagnetic bead‐based solid phase reversible immobilization (SPRI) of DNA.

As an example, the authors below describe the Roche/454 Genome Sequencer.Taking advantage of this, we use SPRI for three applications during library construction:• as a buffer‐exchange mechanism for washing in sample cleanup (without 

size selection) after fragment polishing and adapter ligation• as a low cutoff size selection to remove small (<300 bp) fragments after 

shearing• and as a high‐ and‐low cutoff size selection, removing fragments outside the 

desired size range on both the low (<300 bp) and high (>1,000 bp) ends.

29/05/2012

5

Next MPI‐Workshops will take place in Berkeley (2013) and Berlin (2014).

29/05/2012

6

Connolly Group, University of California, Berkeley

29/05/2012

7

Osborne EA, Atkins TM, et al. (2012). Nanotechnology 23, 215602.

Benyettou F, Guenin E, et al. (2011). Nanotechnology 22, 055102.

Rhodamine coupling with simple carbodiimide chemistry

29/05/2012

8

e.g., the Biotage Initiator system

Ahn BK, Wang H, et al. (2012). Green Chemistry, in press.

29/05/2012

9

Das M, Bandyopadhyay D, et al. (2011). BioconjugChem 22, 1181‐93.

Calcagnile P, Fragouli D, et al. (2012). ACS Nano, in press. 

29/05/2012

10

Brown P, BushmelevA, et al. (2012). Angewandte Chemie International Edition, in press.

Upadhyay D, Scalia S, et al. (2012). Pharm Res  (in press)

29/05/2012

11

Charoenphol P, Mocherla S, et al. (2011). Atherosclerosis 217, 364‐70.

29/05/2012

12

Charoenphol P, Mocherla S, et al. (2011). Atherosclerosis 217, 364‐70.

Incubation of endothelial progenitor cells (EPC) with magnetic nanoparticles

Injection i.v. in rats with hind‐leg ischemia

Koiwaya H, Sasaki K, et al. (2011). J Mol Cell Cardiol 51, 33‐40.

29/05/2012

13

Koiwaya H, Sasaki K, et al. (2011). J Mol Cell Cardiol 51, 33‐40.

Akiyama H. et al., Int. J. Mol. Sci. 2010, 11, 2910

29/05/2012

14

Srinivasan B, Li Y, et al. (2011). Anal Chem 83, 2996‐3002.

10 nm

c b

Meng X, Seton HC, et al. (2011). Nanoscale 3, 977‐84.

29/05/2012

15

Dawson KA, Salvati A, Lynch I (2009). Nature Nanotechnology 4, 84‐85.