Volume 16, Nomor 10-Oktober 2010

Penelitian

Influenza A (H5N1) Virus dari Babi, IndonesiaPasal IsiChairul A. Nidom, Ryo Takano, Shinya Yamada, Yuko Sakai-Tagawa, Syafril Daulay, Didi Aswadi, Takashi Suzuki, Suzuki Yasuo, Kyoko Shinya, Kiyoko Iwatsuki-Horimoto, Yukiko Muramoto, dan Yoshihiro Kawaoka  Penulis afiliasi: afiliasi Author: Universitas Airlangga, Surabaya, Jawa Timur, Indonesia (CA Nidom) , University of Tokyo, Tokyo, Jepang (R. Takano, S. Yamada, Y. Sakai-Tagawa, K. Iwatsuki-Horimoto, Y. Muramoto, Y. Kawaoka) , Departemen Pertanian, Jakarta, Indonesia (S. Daulay) , Pertanian dan Badan Ternak, Tangerang, Indonesia (D. Aswadi) , Universitas Shizuoka, Shizuoka City, Jepang (T. Suzuki, Suzuki Y. ) , Chubu University, Kasugai Kota, Jepang (Y. Suzuki), Kobe University, Kobe, Jepang (K. Shinya, Y. Kawaoka) , University of Wisconsin, Madison, Wisconsin, USA (Y. Kawaoka)

Disarankan kutipan untuk artikel ini

AbstrakBabi telah lama dianggap host intermediate potensial di mana virus flu burung dapat beradaptasi

dengan manusia. Untuk menentukan apakah potensi ini ada untuk babi di Indonesia, kami

melakukan pengintaian selama 2005-2009. Kami menemukan bahwa 52 babi di 4 provinsi

terinfeksi 2005-2007 tetapi tidak 2008-2009. Analisis filogenetik menunjukkan bahwa virus telah

diperkenalkan ke populasi babi di Indonesia pada setidaknya 3 kali. Salah satu isolat telah

memperoleh kemampuan untuk mengenali reseptor manusia-jenis. Tidak ada babi yang terinfeksi

memiliki gejala influenza seperti, menunjukkan bahwa influenza A (H5N1) virus dapat mereplikasi

terdeteksi untuk waktu yang lama, memfasilitasi adaptasi virus unggas ke host mamalia. Data

kami menunjukkan bahwa babi beresiko untuk infeksi selama wabah virus influenza A (H5N1) dan

dapat berfungsi sebagai host intermediate di mana ini virus flu burung dapat beradaptasi dengan

mamalia.

Sebuah virus influenza patogenik tinggi burung tipe A (H5N1) pertama kali dikenal di kalangan

angsa di Provinsi Guangdong, selatan Republik Rakyat Cina, pada tahun 1996 ( 1 ). Dalam setahun,

ini virus angsa mengalami reassortment dengan virus yang beredar di spesies burung

lainnya. Pada tahun 1997, virus telah menyebar luas di kalangan unggas di Hong Kong, dan

langsung burung ke manusia transmisi influenza (H5N1) virus A dilaporkan ( 2 , 3 ). Sejak akhir

2003, influenza A (H5N1) virus telah menyebar ke unggas domestik di negara-negara Asia

Tenggara ( 4 ). Sejak pertengahan tahun 2005, mereka telah terdeteksi di Asia, Eropa, dan Afrika,

menyebabkan kerusakan parah pada industri unggas dan menginfeksi> 490 manusia, sehingga

tingkat kematian dari 60% ( 5 - 8 ). Indonesia telah sangat terpengaruh oleh virus ini,> 160 kasus

infeksi pada manusia (yaitu, sekitar sepertiga dari total dikonfirmasi influenza manusia A (H5N1)

infeksi di seluruh dunia) dan angka kematian> 80% telah dilaporkan ( 8 ).Oleh karena itu,

pemahaman prevalensi dan adaptasi virus influenza A influenza (H5N1) di Indonesia sangat

penting.

Virus influenza menempel pada sel inang dengan mengikat mereka hemagglutinin (HA) ke sel-

permukaan oligosakarida yang mengandung asam sialat terminal. HA virus flu burung istimewa

mengikat asam sialat terkait dengan galaktosa oleh, α-2 3 keterkaitan (SAα2, 3Gal), bahwa virus

manusia mengikat SAα2, 6Gal ( 9 ). Sejalan dengan itu, sel-sel epitel di saluran pernapasan atas

manusia terutama menanggung SAα2, 6Gal reseptor ( 10 , 11 ), dan orang-orang di usus bebek

(situs replikasi virus utama untuk bebek) terutama memiliki SAα2, 3Gal ( 12). Kekhususan reseptor

Virus dan pola ekspresi reseptor pada sel inang dianggap penentu utama dari pembatasan kisaran

inang virus influenza ( 13 ). Dengan demikian, pengakuan dari manusia-jenis reseptor oleh virus

avian tampaknya diperlukan untuk virus ini untuk bereplikasi dalam saluran pernapasan bagian

atas dan dipindahkan dari manusia ke manusia. Mengingat bahwa influenza A (H5N1) virus yang

diisolasi dari manusia tidak menular secara efisien meskipun kemampuan mereka untuk mengenali

manusia-jenis reseptor ( 14 ), mutasi pada polimerase dan gen virus lainnya juga mungkin

diperlukan untuk replikasi dari influenza A (H5N1) virus di saluran pernapasan bagian atas ( 15 ).

Secara tradisional, babi telah dianggap sebagai "kapal pencampuran" ( 16 - 19 ) karena mereka

mendukung replikasi virus flu burung dan manusia ( 17 ). Sel epitel trakea mereka dilaporkan

menanggung SAα2, 3Gal dan SAα2, 6Gal reseptor ( 18 ). Namun, studi terbaru menunjukkan

bahwa meskipun SAα2, 3Gal dan SAα2, 6Gal reseptor dalam saluran pernapasan babi, SAα2, 3Gal

hanya ditemukan di saluran udara kecil (alveoli dan bronchioli) dan tidak dalam trakea

( 20, 21 ). Kuchipudi et al. ( 22 ) ditemukan SAα2, 3Gal dan SAα2, 6Gal reseptor di dalam bronkus,

bronchioli, dan alveoli ayam dan bebek, namun, SAα2, 6Gal adalah dominan dalam epitel ayam

trakea, dan SAα2, 3Gal, dalam trakea bebek. Mengingat bahwa influenza A (H5N1) virus telah

menular langsung dari unggas ke manusia, dogma sentral dari babi sebagai wadah pencampuran

mungkin tidak lagi berdiri. Selain itu, di bawah kondisi percobaan, kerentanan babi terhadap infeksi

influenza A dengan unggas (H5N1) virus adalah rendah ( 23 ). Namun demikian, pandemi (H1N1)

2009 virus adalah reassortant yang berasal dari 4 virus genetik yang berbeda dan tampaknya

dihasilkan pada babi ( 24 ), menunjukkan peran mereka dalam generasi virus influenza

pandemi. Infeksi babi dengan influenza (H5N1) virus A telah dilaporkan di Vietnam ( 25 ) dan China

( 26 ), namun, status infeksi babi di Indonesia masih belum diketahui. Karena itu, kami meneliti

apakah babi di Indonesia telah terinfeksi influenza (H5N1) virus A dan, jika demikian, apakah virus

yang ditransmisikan beberapa kali dan telah memperoleh kemampuan untuk mengenali manusia-

jenis reseptor.

Bahan dan MetodeSpesimen Koleksi

Gambar 1

Gambar 1 . Provinsi di Indonesia (shading abu-abu) di mana surveilans untuk virus influenza A (H5N1) pada babi dilakukan

selama 2005-2009.

Virologi dan serologi surveilans dilakukan selama 3 musim hujan selama 2005-2009: Januari-

Februari 2005, Oktober-Februari 2007, dan November 2008-April 2009. Sampel hidung, kotoran,

dan serum dikumpulkan dari babi tampak sehat di berbagai kabupaten di Indonesia ( Gambar

1 ). Sampel hidung dan tinja yang disuntikkan ke 10-hari-tua telur berembrio, dan cairan allantoic

diuji untuk hemaglutinasi. Hemaglutinasi-positif cairan allantoic menjadi sasaran untuk

membalikkan transkripsi-PCR dengan menggunakan H5 HA-spesifik dan neuraminidase N1-spesifik

primer, hanya sampel positif diuji lebih lanjut. Serum dianalisis untuk memperkirakan prevalensi

virus infeksi influenza A (H5N1).

Sel Isolasi dan Virus

MDCK sel dan garis sel MDCK yang overexpresses manusia β-galactoside α-2 ,6-sialyltransferase I

gen (MDCK-ST6GalI) ( 27 ) yang dipelihara dalam medium minimal esensial (MEM) yang

mengandung serum betis 5% bayi yang baru lahir pada 37 ° C dalam 5% CO 2 . Virus isolasi dari

spesimen dilakukan dengan menggunakan 10-hari-tua telur ayam berembrio, sel MDCK, atau

MDCK-ST6GalI sel MEM mengandung 0,3% bovine serum albumin (BSA) (Sigma-Aldrich, Inc, St

Louis, MO, USA) ( Tabel A1 ). Virus diisolasi dalam sel MDCK digunakan setiap kali mereka yang

tersedia.

Serologi Analisis

Sampel serum babi diuji untuk antibodi terhadap influenza A / babi / Timur Java/UT6040/2007

(H5N1) dan A/duck/Czechoslovakia/56 (H4N6) virus. Subtipe H4N6 digunakan sebagai kontrol

negatif. Serum dicampur dengan 3 volume reseptor-menghancurkan enzim (Denka Seiken Co, Ltd,

Tokyo, Jepang) semalam pada 37 ° C dan tidak aktif pada 56 ° C selama 30 menit. A 2 kali lipat

pengenceran seri serial serum (1:4-1:512) dicampur dengan volume yang sama dari virus influenza

pada 100 TCID 50 (dosis 50% kultur jaringan menular) dan diinkubasi pada suhu 37 ° C selama 30

menit. Virus diinokulasi ke monolayers sel MDCK selama 1 jam, dicuci 2 ×, dan diinkubasi dengan

MEM mengandung BSA 0,3% selama 2 d pada 37 ° C dalam CO 5% 2inkubator. Efek sitopatik yang

diamati untuk menentukan aktivitas penetralan serum tes. Batas deteksi untuk antibodi adalah <4

pengenceran serum.

Urutan Analisis

Untuk mencirikan influenza babi A (H5N1) virus yang diisolasi di Indonesia, kita sequencing gen HA

dari 39 virus yang diisolasi dari babi di Banten, Jawa Timur, Sumatera Utara, dan Kalimantan

Selatan propinsi dan dikelompokkan sesuai dengan kesamaan genetik mereka. RNA virus

diekstraksi dengan ISOGEN (Nippon Gene, Tokyo, Jepang) sesuai dengan instruksi dari

pabriknya. RNA diekstraksi itu terbalik ditranskripsi dengan superscript III reverse transcriptase

(Invitrogen, Carlsbad, CA, USA) dan melengkapi oligonukleotida dengan urutan 12-nt pada ujung 3

'dari RNA virus dan diperkuat oleh PCR dengan PFU ultra (Stratagen, La Jolla, CA, USA) atau

Phusion (Finnzymes, Espoo, Finlandia) kesetiaan tinggi DNA polimerase dan primer spesifik untuk

setiap segmen dari virus influenza A (H5N1). Urutan Primer tersedia atas permintaan.Produk PCR

dipisahkan dengan elektroforesis gel agarosa, dimurnikan dengan menggunakan Gel Ekstraksi Kit

MinElute (QIAGEN, Hilden, Jerman), dan kemudian sequencing. Urutan nukleotida yang diperoleh

dalam penelitian ini adalah tersedia dari GenBank, nos aksesi.HM440051-HM440154.

Analisis filogenetik

Kami filogenetis menganalisis 13 perwakilan influenza babi A (H5N1) virus untuk semua 8 gen virus

dan dibandingkan urutan ini dengan urutan yang tersedia untuk publik. Semua urutan berkumpul

dan diedit dengan software BioEdit 7 ( 28 ). Tetangga-bergabung Analisis pohon dilakukan dengan

menggunakan CLUSTALW ( www.clustal.org  ). Perkiraan filogeni dihitung dengan melakukan 100

tetangga-bergabung bootstrap ulangan.

Receptor Spesifisitas Tes

Selama replikasi pada babi, virus flu burung dapat beradaptasi untuk mengenali manusia-jenis

reseptor karena reseptor tersebut hadir dalam sel-sel epitel babi trakea ( 18 ). Oleh karena itu kami

menganalisis spesifisitas reseptor virus perwakilan dari masing-masing 3 kelompok babi:

A/swine/Banten/UT3081/2005 untuk kelompok babi 2005, A / babi / Timur Java/UT6012/2007 untuk

2006-07 babi (A ) kelompok, dan A/swine/Banten/UT6001/2006 untuk 2006-07 babi (B)

kelompok. Kami juga menganalisis A/swine/Banten/UT3062/2005 clone 6 dan

A/swine/Banten/3063/05 clone 1, yang masing-masing memiliki perubahan asam amino tunggal

dalam HA yang membedakannya dari klon lainnya. Kekhasan reseptor ini influenza A (H5N1) virus

ditentukan dengan menggunakan alat tes yang mengukur mengikat langsung ke

sialylglycopolymers memiliki baik SAα2, 3Gal atau SAα2, 6Gal. Kami menggunakan ini uji padat-

fase mengikat dengan garam natrium dari sialylglycopolymers (poli-αl-Glutamat backbone asam

yang mengandung N -acetylneuraminic asam terkait dengan galaktosa baik melalui ikatan α-2, 3

atau -2,6 (Neu5Acα2, 3Galβ1, 4GlcNAcβ-PAP dan Neu5Aαc2, 6Galβ1, 4GlcNAcβ-PAP) seperti yang

dijelaskan ( 29 , 30 ) . Secara singkat, piring mikro (Polystyrene Universal-BIND lempeng, Corning,

NY, USA, USA) diinkubasi dengan glycopolymer fosfat buffered saline (PBS) pada 4 ° C selama 3

jam dan kemudian disinari dengan sinar UV pada 254 nm selama 2 menit. Setelah penghapusan

solusi glycopolymer, lempeng yang diblokir dengan 0,1 mL PBS yang mengandung BSA 2%

(Invitrogen) pada suhu kamar selama 1 jam. Setelah dicuci dengan PBS 5 ×, lempeng diinkubasi

dalam larutan yang mengandung virus influenza (128 unit hemaglutinasi di PBS) pada 4 ° C selama

12 jam. Setelah 3 mencuci lebih dengan PBS, antibodi terhadap virus itu ditambahkan ke piring,

yang kemudian diinkubasi selama 2 jam pada 4 ° C, dicuci 3 × dengan es dingin PBS, dan

kemudian diinkubasi dengan lobak peroksidase-conjugated protein A (Organon Teknika NV, Cappel

Produk, Turnhout, Belgia, 2000-kali lipat pengenceran dalam PBS) pada 4 ° C. Setelah dicuci 4 ×

dengan es dingin PBS, lempeng kemudian diinkubasi dengan o -phenylenediamine (Sigma-Aldrich)

di PBS yang mengandung 0,01% H 2 O 2 selama 10 menit pada suhu kamar, dan reaksi dihentikan

dengan menambahkan 0,05 mL dari 1N HCl.Absorbansi ditentukan pada 490 nm.

HasilVirus Prevalensi

Dari 702 penyeka hidung, 52 (7,4%) yang dikumpulkan pada tahun 2005-2007 menghasilkan

influenza A (H5N1) virus ( Tabel 1 , Tabel A1 ), tidak ada virus diisolasi dari sampel kotoran dari

babi yang sama. Semua 35 virus yang diisolasi pada tahun 2005 berasal dari 5 peternakan babi di

Kabupaten Tangerang Provinsi Banten, dekat daerah di mana sebuah wabah influenza A (H5N1)

pada unggas telah dikonfirmasi pada tahun 2004 ( 31 ) dan di mana virus sejak tetap

enzootic. Sampel dikumpulkan dari rumah jagal di distrik Surabaya Provinsi Jawa Timur adalah

negatif untuk virus influenza A (H5N1). Dalam periode pengawasan berikutnya, Oktober 2006-

Februari 2007, kami mendeteksi virus pada babi di 4 peternakan di Tangerang, Kediri, dan

kabupaten Medan Banten, Jawa Timur, dan Sumatera Utara, masing-masing, dan di rumah

pemotongan hewan di Surabaya dan kabupaten Banjarmasin Jawa Timur dan Kalimantan Selatan,

semua situs berada di dekat wabah sebelumnya virus infeksi influenza A (H5N1) pada unggas. Babi

dari mana virus ini diisolasi tidak menunjukkan tanda-tanda penyakit influenza seperti pada saat

pengumpulan sampel. Selama periode 2008-April November 2009 surveilans, virus itu tidak

terisolasi dari setiap penyeka hidung dari babi 300 diuji. Namun, 300 sampel serum diuji

menunjukkan bahwa 3 (1%) babi telah menetralkan antibodi terhadap virus subtipe H5N1 tetapi

tidak subtipe H4N6, menunjukkan paparan terbatas untuk influenza A (H5N1) virus.Sampel ini

positif diperoleh dari sebuah peternakan di Kabupaten Malang Provinsi Jawa Timur, titer penetralan

adalah 4-16 ( Tabel 1 ).

Virus Urutan

Di antara 39 virus sequencing, kelompok pertama terdiri 24 isolat yang dikoleksi di Provinsi Banten

selama Januari 2005-Februari 2005; gen HA dari virus ini entah identik atau berbeda dengan tidak

lebih dari 2 nt. Kelompok kedua terdiri 9 isolat yang dikoleksi selama Oktober 2006-Februari 2007

dan juga berbeda dengan hanya 2 nt, meskipun virus dikumpulkan di berbagai provinsi: Banten,

Jawa Timur, Sumatera Utara, dan Kalimantan Selatan. Gen HA dalam 2 kelompok berbeda satu

sama lain dengan 49-53 nt. Kelompok ketiga termasuk 6 isolat yang dikoleksi di Banten, Jawa

Timur, dan Sumatera Utara selama Oktober 2006-Februari 2007, ini telah identik kecuali untuk 1 nt

dan berbeda dari orang-orang dari kelompok pertama dan kedua dengan 42-45 dan 58-61 nt ,

masing-masing. Dengan demikian, flu babi A (H5N1) virus dikumpulkan dalam penelitian surveilans

kami dapat diklasifikasikan ke dalam 3 kelompok yang berbeda atas dasar urutan gen HA mereka,

terlepas dari provinsi dari mana mereka diisolasi, menunjukkan gerakan luas babi antar provinsi.

Filogeni

Gambar 2

Gambar 2 . Hubungan kekerabatan diantara A) hemagglutinin (HA) dan B) neuraminidase (NA) gen influenza A (H5N1) virus

yang diisolasi di Indonesia. Angka-angka di bawah atau di atas node cabang mengindikasikan tetangga-bergabung bootstrap ...

Gambar A1

Gambar A1 . Filogenetik hubungan protein polimerase dasar (PB) 2 (A) dan (B) PB1 gen influenza A (H5N1) virus di

Indonesia. Semua pohon yang dihasilkan oleh tetangga-bergabung di CLUSTALW (www.clustal.org  ) ....

Gambar A2

Gambar A2 . Filogenetik hubungan protein asam polimerase (PA) (A) dan protein nukleokapsid (NP) (B) gen influenza A (H5N1)

virus di Indonesia.Semua pohon yang dihasilkan oleh tetangga-bergabung di CLUSTALW (<>

Gambar A3

Gambar A3 . Filogenetik hubungan M (A) dan (B) NS gen dari virus influenza H5N1 di Indonesia. Semua pohon yang dihasilkan

dengan metode tetangga-bergabung di CLUSTALW (www.clustal.org  ). Nomor di atas atau ...

Analisis filogenetik gen HA dari virus 13 perwakilan mengidentifikasi 3 kelompok yang sama

dijelaskan di atas. Gen HA dari 4 virus yang diisolasi pada tahun 2005 (2005 babi group)

ditempatkan di clade 2.1.1, dan dari 9 virus tersisa babi diisolasi selama 2006-2007, lima

diklasifikasikan ke dalam sublineage IDN/6/05-like (2006 -07 babi [A] group) dan 4 dalam clade

2.1.3 (2006-07 babi [B] group) (Gambar 2 , panel A). Strain yang paling erat terkait dari masing-

masing kelompok virus influenza babi adalah ayam A (H5N1) virus: A/chicken/Indonesia/R60/2005

untuk kelompok babi 2005, A / / ayam / Timur Java/UT6016/2006 dan A ayam / Timur

Java/UT6031/2007 untuk 2006-07 babi (A) kelompok, dan A / ayam / Timur Java/UT6044/2007

untuk 2006-07 babi (B) kelompok. Analisis dari 7 gen lain yang menunjukkan bahwa hubungan

filogenetik didirikan untuk gen HA dipertahankan, yaitu, virus babi di masing-masing kelompok

memiliki gen hampir identik, dan masing-masing kelompok virus babi yang paling erat kaitannya

dengan virus ayam terisolasi dekat situs di mana virus babi dikumpulkan ( Gambar 2 , panel

B, Gambar A1 , A2 Gambar , Gambar A3 ). Hasil kami menunjukkan bahwa influenza A (H5N1) virus

yang ditularkan dari unggas ke babi spesies pada setidaknya 3 kali.

Receptor Spesifisitas

Gambar 3

Gambar 3 . Reseptor-mengikat aktivitas influenza A (H5N1) virus.Langsung pengikatan virus untuk sialylglycopolymers

mengandung baik α2 ,3-linked (biru) atau α2 ,6-linked (merah) asam sialat diukur. A) Human mengisolasi

A/Kawasaki/173/2001, B) burung mengisolasi ...

Urutan analisis produk PCR dari gen HA dari A/swine/Banten/UT3062/2005 dan

A/swine/Banten/UT3063/2005 menunjukkan bahwa nukleotida yang heterogen di posisi tertentu,

mendorong kita untuk memurnikan plak virus dalam sel MDCK untuk mendapatkan klon virus

dengan urutan HA yang berbeda ( Tabel 2). Kami menemukan bahwa sebagian besar isolat subtipe

flu babi H5N1 terikat hanya SAα2, 3Gal, sedangkan plak-dimurnikan clone 6 dari

A/swine/Banten/UT3062/05 terikat SAα2, 3Gal dan SAα2, 6Gal (Gambar 3 ), menunjukkan bahwa

selama replikasi mereka pada babi, avian influenza A (H5N1) virus dapat memperoleh kemampuan

untuk mengenali reseptor virus manusia.

Diskusi

Berbeda dengan kasus yang dilaporkan beberapa infeksi babi dengan Avian Influenza patogenik A

(H5N1) virus ( 17 , 25 , 26 ), penelitian surveilans kami 7 propinsi di Indonesia selama 3 periode

menunjukkan bahwa 7,4% dari babi yang disurvei selama tahun 2005 - 2007, tetapi tidak 2008-

2009, yang terinfeksi influenza A (H5N1) virus. Analisis filogenetik menunjukkan bahwa virus itu

ditularkan kepada babi pada beberapa kesempatan yang berbeda, mungkin dari unggas di

peternakan di dekatnya. Menurut klasifikasi terbaru dari gen HA ( 32 , 33 ), semua flu burung dan

manusia A (H5N1) virus yang diisolasi di Indonesia milik clade 2.1, yang meliputi 3 garis keturunan

baik-didefinisikan (clades 2.1.1-2.1.3 ) dan garis keturunan berkembang disebut sublineage

IDN/6/05-like.Dalam penelitian kami, semua 24 virus diisolasi selama periode pengawasan pertama

milik cluster yang sama dalam clade 2.1.1 (2005 babi group) atas dasar klasifikasi HA baru-baru ini

( 32 , 33 ).The 9 virus dikumpulkan selama periode pengawasan kedua milik eksklusif kepada

sublineage IDN/6/05-like, dan 6 virus tersisa dikumpulkan selama musim yang sama

diklasifikasikan ke dalam clade 2.1.3, 2006-07 babi (A) dan 2006 - 07 babi (B) kelompok, yang

diwakili masing-masing, oleh A / babi / Timur Java/UT6012/2007 dan

A/swine/Banten/UT6001/2006. Meskipun tidak ada virus diisolasi selama periode pengawasan

ketiga,, 2008-09 total 3 (1%) babi telah menetralisir antibodi terhadap virus influenza A

(H5N1).Temuan ini menunjukkan bahwa meskipun influenza A (H5N1) virus tidak mungkin telah

banyak beredar di babi di Indonesia baru-baru ini, hewan-hewan rentan terhadap influenza A

(H5N1) virus dan dapat berfungsi sebagai reservoir tanpa gejala virus ini.

Karena hubungan filogenetik didirikan untuk gen HA diperluas ke semua gen virus, kami

menyimpulkan bahwa 3 kelompok virus yang diidentifikasi dalam survei ini kemungkinan besar

didirikan secara independen, menunjukkan setidaknya 3 terpisah burung-ke-babi episode

penularan influenza A (H5N1 ) virus selama 2005-2009 di Indonesia. Temuan kami mengkonfirmasi

laporan sporadis kerentanan babi ke virus influenza A (H5N1) infeksi pada alam

( 25 ,26 pengaturan) dan eksperimental ( 23 , 34 ) dan menyarankan bahwa ketika wabah virus

influenza A (H5N1) infeksi terjadi pada unggas peternakan, babi di peternakan terdekat harus

dievaluasi untuk infeksi.

Kami juga menemukan bukti-babi ke babi penularan virus influenza A (H5N1), khususnya di

kalangan hewan sampel selama periode surveilans pertama. Banyak virus memiliki gen hampir

identik diisolasi dari babi di peternakan yang sama ( Tabel 1 , Tabel 2 ).Babi-babi ke-transmisi

kemungkinan akan memperpanjang durasi infeksi virus influenza A (H5N1) dalam populasi babi,

sehingga meningkatkan kemungkinan adaptasi dan generasi berikutnya dari influenza A (H5N1)

virus yang mereplikasi secara efisien pada manusia.

Kurangnya influenza seperti tanda-tanda pada babi yang terinfeksi influenza A (H5N1) virus

memiliki beberapa implikasi kesehatan masyarakat. Di Indonesia, babi yang diangkut ke lokasi

yang berbeda sesuai dengan kebutuhan pasar. Gerakan ini tercermin dalam temuan kami bahwa

kelompok virus babi yang dikumpulkan setelah 2006 tidak konsisten dengan yang umum untuk

wilayah sampling. Memang, virus dikumpulkan di Sumatera Utara, Kalimantan Selatan, Jawa Timur,

dan Banten menunjukkan gen identik atau hampir identik, menunjukkan transportasi luas babi

yang terinfeksi di seluruh Indonesia. Dengan demikian, patogen influenza A (H5N1) virus dengan

mudah bisa menghindari deteksi saat mereka menyebar ke seluruh Indonesia pada babi

asimtomatik yang diangkut dari satu provinsi ke provinsi.

Analisis kami kekhususan reseptor virus menunjukkan bahwa 1 plak-dimurnikan klon dari

A/swine/Banten/UT3062/2005 terikat pada reseptor-burung jenis dan tipe manusia. Serin pada

posisi 134 bertanggung jawab atas pengakuan reseptor manusia-jenis. Posisi ini terletak dalam

komponen 130-lingkaran struktural saku reseptor-binding ( 35 ). Oleh karena itu, perubahan asam

amino pada posisi ini dapat mempengaruhi mengikat reseptor. Karena serin pada posisi 134 tidak

pernah terlihat pada flu burung tipe A (H5N1) virus (alanin sangat kekal di posisi ini dalam avian

influenza A [H5N1] virus), mutasi Ala134Ser mungkin terjadi selama adaptasi virus ke

babi. Menurut laporan sebelumnya ( 36 ), isolat manusia memiliki valin pada posisi ini juga bisa

mengikat reseptor manusia-jenis, meskipun mutasi pada posisi 129 (L129V) juga diperlukan untuk

pengakuan reseptor manusia-ketik ketegangan ini. Oleh karena itu, mutasi pada posisi 134

mungkin berkorelasi dengan manusia-jenis pengenalan reseptor dan dapat berfungsi sebagai

penanda molekuler untuk menilai potensi pandemi virus influenza A (H5N1) isolat.

Walaupun virus infeksi influenza A (H5N1) tidak dilaporkan antara pekerja babi di Indonesia

sementara kita sedang mengumpulkan spesimen babi kami, sebuah studi kohort sebelumnya

menunjukkan bahwa para pekerja tersebut, serta mereka tidak terpapar pasangan, mengalami

peningkatan kadar antibodi terhadap influenza babi A ( H1N1) virus ( 37 ), menunjukkan bahwa

manusia memang rentan terhadap babi-diadaptasi virus ( 38 ). Pandemi asal babi baru-baru ini

(H1N1) 2009 lebih lanjut menunjukkan bahwa babi dapat menjadi sumber potensial virus mampu

menyebabkan pandemi influenza manusia ( 24 ). Temuan ini menunjukkan bahwa sebagai

influenza A (H5N1) virus menyebar di antara babi dan beradaptasi untuk mengenali manusia-jenis

reseptor, petani, pekerja babi, dan keluarga mereka akan berada pada risiko terbesar untuk infeksi

oleh virus baru disesuaikan.

Singkatnya, kami menemukan bahwa influenza A (H5N1) virus telah dikirim beberapa kali untuk

populasi babi di Indonesia dan 1 virus telah memperoleh kemampuan untuk mengenali manusia-

jenis reseptor. Yang dikhawatirkan adalah bahwa babi terinfeksi influenza A (H5N1) virus tidak

menunjukkan signifikan influenza seperti tanda-tanda dan kemungkinan diangkut ke dan dari

berbagai provinsi di Indonesia. Berdasarkan temuan kami, kami mendorong pemerintah Indonesia

untuk mengontrol pengangkutan babi di Indonesia. Jika tidak, peluang untuk virus avian untuk

beradaptasi dengan mamalia akan meningkat, seperti yang akan risiko munculnya virus influenza

pandemi baru.