humanagenetika1-01
TRANSCRIPT
Humana genetika1:Humana genetika1: DNK DNK kakokako genetskigenetski
materijalmaterijal
Prof. Prof. dd--rr
Mirko SpiroskiMirko SpiroskiInstitutInstitut
zaza
imunobiologijaimunobiologija
i i humanahumana
genetikagenetika, , MedicinskiMedicinski
fakultetfakultet, , UniverzitetUniverzitet
SvSv. . KirilKiril
i i MetodijMetodij, Skopje, , Skopje,
RepubliaRepublia
MakedonijaMakedonija
EE--mail: mail: [email protected]@yahoo.comhttp://www.iibhg.ukim.edu.mk/Obrazovanie/KatedHugen.htmhttp://www.iibhg.ukim.edu.mk/Obrazovanie/KatedHugen.htm
FB: mirko.spiroskiFB: mirko.spiroskiFBG: Human GeneticsFBG: Human Genetics
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 2
NakusoNakuso ……
BaraweBarawe
genetskigenetski
materijalmaterijal
GrifitoviotGrifitoviot
eksperimenteksperiment
zaza
transformacijatransformacija
AverieviotAverieviot
eksperimenteksperiment
zaza
transformacijatransformacija
Her{iHer{i--^ejsovite^ejsovite
eksperimentisoeksperimentiso
bakteriofagibakteriofagi
OtkritietoOtkritieto
nana
RNK RNK kakokako
virusenvirusen
genetskigenetski
materijalmaterijal
SostavSostav
i i strukturastruktura
nana
DNK i RNKDNK i RNK
OtkritietoOtkritieto
nana
dvojnatadvojnata
spiralaspirala
nana
DNKDNK
Razli~niRazli~ni
DNK DNK strukturistrukturi
DNK DNK vovo
kletkatakletkata
StrukturaStruktura
nana
RNKRNK
OrganizacijaOrganizacija
nana
DNK DNK vovo
hromozomitehromozomite
VirusniVirusni
hromozomihromozomi
ProkariotskiProkariotski
hromozomihromozomi
EukariotskiEukariotski
hromozomihromozomi
EdinsvenaEdinsvena
sekvencasekvenca
i i povtoruva~kapovtoruva~ka
sekvencasekvenca
nana
DNK DNK
BaraweBarawe genetskigenetski materijalmaterijal
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 4
BaraweBarawe genetskigenetski
materijalmaterijal, , tri tri principniprincipni
osobiniosobini
1.1. Mora Mora dada
sodr`isodr`i
informacijainformacija, , vovo stabilnastabilna
forma, forma, zaza
strukturatastrukturata, ,
funkcijatafunkcijata, , razvojotrazvojot
i i reprodukcijatareprodukcijata
nana kletkitekletkite
vovo
organizmotorganizmot;;
2.2. Mora Mora preciznoprecizno
dada
se se udvojuvaudvojuva
zaza
dada
imaatimaat naslednitenaslednite
kletkikletki
istaista
genetskagenetska
informacijainformacija
kakokako
i i roditelskataroditelskata
kletkakletka;;3.3. Mora Mora dada
imaima
sposbnostsposbnost
zaza
promenipromeni. . BezBez
promenipromeni
organizmotorganizmot
nene
bi bi mo`elmo`el
dada variravarira
i i dada
se se prilagoduvaprilagoduva, a so , a so toatoa
nene
bi bi
mo`elmo`el
dada
evoluiraevoluira..
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 5
BaraweBarawe genetskigenetski
materijalmaterijal, , tri tri principniprincipni
osobiniosobini
August August VajsmanVajsman
vovo
1890 1890 predlo`ilpredlo`il
soedineniesoedinenie
koekoe se se nao|anao|a
vovo
jadrotojadroto;;
Vo 1900 e Vo 1900 e poka`anopoka`ano
dekadeka
hromozomitehromozomite
vovo
jadrotojadroto se se nositelinositeli
nana
naslednanasledna
informacijainformacija;;
SledniteSlednite
godinigodini
e e najdenonajdeno
dekadeka
hromozmitehromozmite
se se sostavenisostaveni
odod
proteiniproteini
i i nukleinskinukleinski
kiselinikiselini, ,
soedinenijasoedinenija
koikoi
se se gradbenigradbeni
elementielementi
nana
DNK i DNK i RNK.RNK.
Vo Vo po~etokotpo~etokot
se se veruvaloveruvalo
dekadeka
proteiniteproteinite
se se
nositelinositeli
nana
genetskatagenetskata
informacijainformacija
bidej}ibidej}i
se se sostavenisostaveni
odod
20 20 razli~nirazli~ni
aminokiseliniaminokiselini, a DNK e , a DNK e
sostavensostaven
samosamo
odod
4 4 nukleotidinukleotidi..
Vo 1920 Vo 1920 godinagodina
definitivnodefinitivno
e e identificiranaidentificirana
DNK DNK kakokako
genetskigenetski
materijalmaterijal..
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 6
ElektronElektron
mikroskopskimikroskopski
prikazprikaz
nana bakterijatabakterijata
StreptococusStreptococus pnaumoniaepnaumoniae
kojakoja
jaja
koristelkoristel
Frederick Griffith, 1928Frederick Griffith, 1928
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 7
GrifitoviotGrifitoviot
eksperimenteksperiment
zaza transformacijatransformacija, , GrifitGrifit
19281928
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 8
EksperimentEksperiment
so so kojkoj
se se doka`uvadoka`uva dekadeka
e DNK, a e DNK, a nene
RNK RNK principotprincipot
nana
transformacijatransformacija
((Avery, 1930, 1940Avery, 1930, 1940))
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 9
ДДijagramijagram
nana
bakteriofagotbakteriofagot
T2T2
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 10
Liti~kiotLiti~kiot
`̀ivotenivoten
ciklusciklus
nana virulentenvirulenten
fag, fag, kakokako
{to e T2{to e T2
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 11
PrigotvuvawePrigotvuvawe radioaktivnoradioaktivno
obele`enobele`en T2 T2 bakteriofagbakteriofag, ,
Her{iHer{i--^ejs^ejs, 1953, 1953
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 12
EksperimentEksperiment
kojkoj
poka`uvapoka`uva
dekadeka
e DNK e DNK genetskiotgenetskiot
materijalmaterijal
vovo
T2 (T2 (Alfred Alfred
HersheyHershey, , NobelovaNobelova
nagradanagrada
1969)1969)
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 13
Tipi~naTipi~na
~~esti~kaesti~ka
odod
tutunskiottutunskiot mozai~enmozai~en
virus (TMV): RNK e virus (TMV): RNK e
virusenvirusen
genetskigenetski
materijalmaterijal
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 14
DokazDokaz
dekadeka
e RNK e RNK genetskiotgenetskiot materijalmaterijal
vovo
tutunskiottutunskiot
mozai~enmozai~en
virus (TMV)virus (TMV)
SostavSostav i i strukturastruktura
nana DNK i DNK i
RNKRNK
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 16
StrukturaStruktura nana
deoksiribozadeoksiriboza i i ribozariboza
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 17
StrukturaStruktura nana
azotniteazotnite bazibazi
vovo DNK i RNKDNK i RNK
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 18
ИмињатаИмињата нана базитебазите, ,
нуклеозидитенуклеозидите ии нуклеотидитенуклеотидите
вово ДНКДНК ии РНКРНК
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 19
HemiskaHemiska strukturastruktura nana
DNK i DNK i RNKRNK
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 20
OsnoviOsnovi zaza
modelotmodelot nana
DNKDNK
PodatociPodatoci
koikoi
imim
pomognalepomognale
nana
XejmsXejms VatsonVatson
i i FrensisFrensis
KrikKrik
zaza
dada
go go sozdadatsozdadat
modelotmodelot
nana
dvojnatadvojnata
spiralaspirala
nana
DNK:DNK:
IspituvawataIspituvawata
zaza
sostavotsostavot
nana
bazitebazite
vovo DNK (^DNK (^argasovotoargasovoto
pravilopravilo););
DifrakciskiteDifrakciskite
studiistudii
nana
DNK so DNK so IksIks zracizraci
nana
RozalindRozalind
FrenklinFrenklin
i i MorisMoris
VilkinsVilkins).).
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 21
СостанСостан нана базитебазите вово ДНКДНК одод различниразлични организмиорганизми
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 22
AnalizaAnaliza
nana
DNK so DNK so difrakcijadifrakcija
nana
IksIks
zracizraci ((RozalindRozalind
Franklin i Franklin i MorisMoris
VilkinsVilkins))
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 23
OsobiniOsobini nana modelotmodelot DNKDNK
DveDve
verigiverigi
svrtenisvrteni
ednaedna
konkon
drugadruga
desnorakodesnorako
((konkon
~~asovnikotasovnikot).).
DeveteDevete
verigiverigi
se se antiparalelniantiparalelni
((poka`uvaatpoka`uvaat
sprotivnasprotivna
polarnostpolarnost).).
[[e}ernoe}erno
fosfatnitefosfatnite
grupigrupi
se se nana
nadvore{natanadvore{nata
stranastrana
odod
dvojniotdvojniot
heliksheliks..
BaziteBazite
odod
sprotivnitesprotivnite
bazibazi
((komplementarnikomplementarni
baznibazni
paroviparovi) se ) se povrzanipovrzani
so so hidrogenskihidrogenski
vrskivrski, A:T , A:T so so dvedve, a G:C so tri , a G:C so tri vrskivrski..
BazniteBaznite
paroviparovi
se se oddelenioddeleni
0.34 nm 0.34 nm ednaedna
odod
drugadruga
vovo
DNK, DNK, kompletniotkompletniot
krugkrug
zazemazazema
3.4 nm, 3.4 nm, odnosnoodnosno
desetdeset
bazibazi
vovo
edeneden
krugkrug. . Nadvore{niotNadvore{niot
dijametardijametar
nana
heliksotheliksot
e 2 nm.e 2 nm.
[[e}ernoe}erno--fosfatnitefosfatnite
grupigrupi
odod
dvojniotdvojniot
heliksheliks
sozdavaatsozdavaat
golemigolemi
((po{irokipo{iroki) i ) i malimali
((potesnipotesni) ) `̀lebovilebovi
((dupkidupki).).
NobelovaNobelova
nagradanagrada
vovo
1962 1962 godinagodina
FransisFransis
KrikKrik, , XejmsXejms
VotsonVotson
i i MorisMoris
VilkinsVilkins..
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 24
StrukturaStruktura
nana komplementarnitekomplementarnite
baznibazni
paroviparovi
vovo DNKDNK
Adenin:TiminAdenin:Timin
se se
vrzuvaatvrzuvaat
so so dvedve vodorodnivodorodni
vrskivrski, ,
dodekadodeka
Citozin:GvaninCitozin:Gvanin so tri so tri vodorodnivodorodni
vrskivrski
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 25
ModeliModeli
nana
razli~nirazli~ni
formiformi
DNK (a) DNK (a) AA--DNK, (b) BDNK, (b) B--DNK, DNK, ((вв),),
ZetZet--DNKDNK
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 26
ОсобиниОсобини нана АА--ДНКДНК, , ББ--ДНКДНК
ии ЗЗ--ДНКДНК
Vo Vo rastvorirastvori
obi~noobi~no
se se nao|anao|a
BB--DNK, a so DNK, a so toatoa
i i vovo
kletkitekletkite. A. A--DNK se DNK se nao|anao|a
kogakoga
e e
dehidriranadehidrirana, pa , pa sporedspored
toatoa
jaja
nemanema
vovo kletkitekletkite, , dodekadodeka
zaza
ZetZet--DNK se DNK se diskutiradiskutira
dalidali
jaja
imaima, , vovo
koikoi
kletkikletki
jaja
imaima
i i kakvakakva
e e nejzinatanejzinata
ulogauloga..
OrganizacijaOrganizacija nana
DNK DNK vovo hromozomitehromozomite
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 28
VirusniVirusni hromozomihromozomi
VirusiteVirusite
se se fragmentifragmenti
odod
nukleinskanukleinska kiselinakiselina
obikolenaobikolena
so so proteiniproteini, , koikoi
gigi
zarazuvaatzarazuvaat
site site vidovividovi
`̀iviivi
organizmiorganizmi..
GenetskiotGenetskiot
materijalmaterijal
mo`emo`e
dada
bide bide dvoveri`nadvoveri`na
DNK, DNK, ednoveri`naednoveri`na
DNK, DNK,
dvoveri`nadvoveri`na
RNK, RNK, ednoveri`naednoveri`na
RNK, RNK, cirkularnacirkularna
iliili
linearnalinearna..
NekoiNekoi
virusivirusi
imaatimaat
edeneden
hromozomhromozom, , drugidrugi rasfrlanirasfrlani
molekulimolekuli
DNK.DNK.
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 29
CirkularnoCirkularno
permutiranipermutirani (a) i (a) i terminalnoterminalno
redundantniredundantni
dvojnodvojno spiralnispiralni
molekulimolekuli
(b) (b)
odod
DNKDNK
TT--parniparni
virulentnivirulentni
bakteriofagibakteriofagi
(T2, T4, T6) (T2, T4, T6) sodr`atsodr`at
edeneden
linearenlinearen
hromozomhromozom
so so
dvojnoveri`nadvojnoveri`na
DNK DNK
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 30
BakteriofagBakteriofag X174X174
GiGi
zarazuvazarazuva
E. coli.E. coli. ImaIma
ednoveri`naednoveri`na
DNK DNK kojakoja
e e cirkularnocirkularno
postavenapostavena..
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 31
ElektronElektron
mikroskopskamikroskopska
slikaslika
i i dijagramdijagram
nana
bakteriofagbakteriofag
lambdalambda
NegoviotNegoviot
hromozomhromozom
se se menuvamenuva
pome|upome|u linearanalinearana
i i cirkularnacirkularna
forma.forma.
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 32
HromozomskataHromozomskata
strukturastruktura
nana bakteriofagotbakteriofagot
se se menuvamenuva
so so
inficiraweinficirawe
nana
E. coliE. coli
Del Del odod
lambda lambda hromozomothromozomot
imaima
dvoveri`nadvoveri`na
komplementarnakomplementarna
strukturastruktura, a , a drugiotdrugiot
del del ednoveri`naednoveri`na
strukturastruktura
kojakoja
se se pretvorapretvora
vovo
cirkularnacirkularna
forma forma kogakoga
}e }e navlezenavleze
vovo
bakteriskatabakteriskata
kletkakletka
i i ostavaostava
dvedve
prazninipraznini
so so koikoi
se se sozdavasozdava
kovalentnokovalentno
povrzanpovrzan
krugkrug..
Koga fagot }e se Koga fagot }e se reproducirareproducira
hromozomothromozomot
se se vra}avra}a
vovo
prvobitnataprvobitnata
forma.forma.
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 33
ProkariotskiProkariotski hromozomihromozomi
NajmnoguNajmnogu
odod
prokariotskiteprokariotskite
kletkikletki
sodr`atsodr`at
edeneden
ednoveri`enednoveri`en
cirkularencirkularen
DNK DNK
hromozomhromozom..
DrugiteDrugite
imaatimaat
edeneden
iliili
pove}epove}e
hromozomihromozomi
koikoi
se se linearnilinearni
iliili
cirkularnicirkularni
((edeneden
golem i golem i
nekolkunekolku
pomalipomali
nare~eninare~eni
plazmidiplazmidi).).
Vo Vo bakteriitebakteriite
hromozomothromozomot
e e
organiziranorganiziran
vovo
gusto gusto klup~eklup~e, ,
nare~enonare~eno
nukleoidnukleoid..
OslobodeniOslobodeni
hromozomihromozomi
odod
liziranalizirana
kletkakletka
nana
E. coli.E. coli.
Dol`inataDol`inata
nana
hromozomothromozomot
e 1.000 e 1.000 patipati
podolgapodolga
odod
bakterijatabakterijata..
ZaZa
dada
mo`emo`e
dada
se se smestismesti
vovo
neanea
DNK e DNK e supersvitkanasupersvitkana
((supercoliedsupercolied).).
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 34
IlustracijaIlustracija nana
superspiralasuperspirala odod
DNKDNK
A) A) LinearnaLinearna
BB--DNK so 20 DNK so 20 svrtuvawasvrtuvawa..B) B) RelaksirnataRelaksirnata
cirkularnacirkularna
DNK.DNK.C) C) LinearnaLinearna
DNK DNK odvrtenaodvrtena
nana
edniotedniot
krajkraj..D) D) CirkularnaCirkularna
DNK so DNK so soedinuvawesoedinuvawe
nana
odvrtenaodvrtena
DNK.DNK.E) E) EnergetskiEnergetski
pritisnatapritisnata
DNK, DNK, iliili
supersvrtenasupersvrtena
DNK so 20 DNK so 20 helikalnihelikalni
svrtuvawasvrtuvawa
i i dvedve
superhelikalnisuperhelikalni
svrtuvawasvrtuvawa..
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 35
ElektronskaElektronska
mikrografijamikrografija
nana cirkularnicirkularni
DNK DNK molekulimolekuli
Relaksirana
(nesvitkana) DNK
Superkolirana
(supersvitkana) DNK
Dvete
molekuli
DNK se prika`ani
so isto
zgolemuvawe
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 36
Model Model odod
strukturastruktura
nana
bakteriskibakteriski hromozomhromozom
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 37
EukariotskiEukariotski hromozomihromozomi
ImaatImaat
diploidendiploiden
brojbroj
hromozomihromozomi
vovo
skoroskoro
site site somatskisomatski
kletkikletki..
Lu|etoLu|eto
imaatimaat
46 46 hromozomihromozomi, , popo
23 23 odod
sekojsekoj roditelroditel..
Koli~estvotoKoli~estvoto
DNK DNK vovo
haploidniothaploidniot
genomgenom
se se ozna~uvaozna~uva
kakokako
C C vrednostvrednost..
C C vrednostavrednosta
variravarira
pome|upome|u
razniteraznite
vidovividovi, , kakokako
i i pome|upome|u
oddelnioddelni
organizmiorganizmi..
NeNe
postoipostoi
direktendirekten
soodnossoodnos
pome|upome|u
C C vrednostavrednosta
i i kompleksnostakompleksnosta
nana
organizmotorganizmot, , sostojbasostojba
nare~enanare~ena
paradoksparadoks
nana
C C vrednostavrednosta
((amebataamebata
imaima
290 290 milijardimilijardi
bpbp, a ~, a ~ovekotovekot
imaima
3.4 3.4 milijardimilijardi
bpbp
DNK).DNK).
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 38
СодржинаСодржина
нана хаплоиднахаплоидна
ДНКДНК
илиили
ЦЦ-- вредноствредност
кајкај
избраниизбрани видовивидови
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 39
Mo`naMo`na nukleozomskanukleozomska
strukturastruktura
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 40
NukleozomiNukleozomi povrzanipovrzani
zaednozaedno so so vrzuva~kavrzuva~ka
DNK i DNK i H1 H1 histonihistoni
Хроматин во
облик
на
“низа
од топченца”
или
ѓердан
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 41
30 nm 30 nm hromatinskahromatinska ni{kani{ka
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 42
Model Model nana 30 nm 30 nm hromatinskihromatinski
vlaknavlakna ((diplidipli))
Здиплени
домени30 нм
хроматинска нишка
Нехистонски
протеини
од
хромозомската
макара
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 43
MetafazaMetafaza nana
hromozomhromozom oslobodenosloboden
odod histonihistoni
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 44
Model Model nana razli~nirazli~ni vidovividovi
hromatinhromatin
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 45
VidoviVidovi hromatinhromatin
EuhromatinEuhromatin
HeterohromatinHeterohromatinKonstitutivenKonstitutiven
heterohromatinheterohromatin
FakultetivenFakultetiven
heterohromatinheterohromatin ((BarovoBarovo
telcetelce))
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 46
KonsenzusKonsenzus sekvencisekvenci
nana centromeritecentromerite
odod SaccharomycesSaccharomyces cerevisiaecerevisiae
Konsenzus
sekvenca
e sekvenca
koja naj~esto
se nao|a
vo
site organizmi
ili
vidovi.
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 47
Model Model nana
kinetohorkinetohor
odod
kvascikvasci
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 48
TelomeriTelomeri
06.03.2012 ДНК како генетски материјал 49
GrupiraweGrupirawe nana
sekvencitesekvencite vovo
DNKDNK
EdinstvenaEdinstvena
sekvencasekvenca
nana
DNK (DNK (ednaedna
do do nekolkunekolku kopiikopii). ). KajKaj
~~ovekovek
65% 65% odod
genomotgenomot..
SrednoSredno
povtoruva~kapovtoruva~ka
DNK (DNK (nekolkunekolku
do 100.000 do 100.000 kopiikopii
vovo
genomotgenomot).).
DispergiranaDispergirana
povtoruva~kapovtoruva~ka
DNK.DNK. InterspergiranaInterspergirana
povtoruva~kapovtoruva~ka
DNK.DNK.
KratkiKratki
interspergiraniinterspergirani
povtoruva~kipovtoruva~ki
sekvencisekvenci
((SINEsSINEs) )
(100 do 500 (100 do 500 bpbp).). DolgiDolgi
interspergiraniinterspergirani
povtoruva~kipovtoruva~ki
sekvencisekvenci
((LINEsLINEs) )
(=>5.000 (=>5.000 bpbp)) TandemskiTandemski
povtoruva~kapovtoruva~ka
DNK.DNK.
VisokoVisoko
povtoruva~kapovtoruva~ka
DNK (100.000 do 10 DNK (100.000 do 10 milionimilioni kopiikopii
vovo
edeneden
genomgenom).).