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HABILITATION

Dossier habilitation/ 2-fichier Annexes / 2010-2013

UNIVERSITE DES ANTILLES et DE LA GUYANE

Campus de Fouillole – BP250 - 97157 Pointe-à-Pitre Cedex

CONTRAT 2010-2013

Demande d’habilitation à délivrer

LE MASTER

Sciences-Technologie-santé (STS)

MENTION : ECOLOGIE

SPECIALITE 1 : ECOSYSTEMES TROPICAUX NATURELS ET EXPLOITES (ECOTROP)

………………..

Implantation : Guadeloupe

2. Fichier des annexes :

2-master-STS-Ecologie-Annexes

Pages…01 à 73 / 2

LISTE des ANNEXES

Annexe 0 : Stratégie de formation du domaine

Annexe 1 : Composition de l’équipe pédagogique.

Annexe 2 : Organisation des UE transversaux.

Annexe 3 : Fiches descriptives des UE.

Annexe 4 : Nouvelle habilitation / Renouvellement d’habilitation / Compléments

Annexe 5 : Le RGCCA Master

ANNEXE 0

STRATEGIE DE FORMATION DU DOMAINE

Nom du domaine

STS

Responsable du domaine et de l’équipe de formation :

· Nom

: Méril

· Prénom

: Alex

· Qualité

: PR1

· Section CNU: 25

· Téléphone: 0590483153

Fax : 0590483152

· E-mail

: [email protected]

· Discipline principale enseignée : Mathématiques

· Responsable adjoint

· Nom

: Clergeot

· Prénom

: Henri

· Qualité

:PR1

· Section CNU:61

· Téléphone:0594296227

Fax :0594296210

· E-mail

:[email protected]

· Discipline principale enseignée : Traitement du signal

· Présentation du Domaine

Motivation du domaine : expliquer le choix de ce domaine dans le contexte de l’établissement et présenter les objectifs de formation dans ce domaine et dire à quels publics est destinée cette offre, les principaux débouchés (en termes de métiers ou de poursuite d’études).

L’objectif premier du Master Sciences, Technologies, Santé (STS) est de dispenser aux étudiants, au sein de l’UAG, une formation scientifiques de haut niveau dans les secteurs des sciences exactes, naturelles et de la santé. A l’issue du master, ces étudiants seront titulaires d’un diplôme bac + 5 (niveau M) leur permettant soit de s’insérer directement dans la vie professionnelle (spécialités P), soit de poursuivre leurs études universitaires par une thèse de doctorat (spécialités R) durant une période de 3 ans (niveau D). Parmi les docteurs, une minorité a vocation à continuer dans les carrières de l’enseignement et de la recherche publique, la majorité (au moins au niveau national) étant appelée à s’insérer dans le secteur privé.

Ceci correspond au deuxième objectif des formations de niveau M et D, constituant un élément directeur important de la philosophie LMD, qui est de préparer cette insertion des étudiants, non seulement pour assure la continuité de l’activité de nos laboratoires de recherche, mais, dans la majorité des cas, pour préparer à un emploi dans le secteur privé.

Le public constituant le principal vivier du master ST se trouve essentiellement dans les différentes licences du domaine « Sciences, Technologies et Santé ». Or, l’évolution des effectifs reflète la désaffection, observée au niveau national, pour les disciplines scientifiques, aggravée dans notre cas par la fuite des étudiants vers la métropole. La baisse ainsi observée à comme conséquence directe une limitation notable dans la possibilité de diversifier les spécialités. Ceci fait apparaître une troisième préoccupation que l’équipe de formation doit avoir présente à l’esprit, qui est d’être attentif à l’image et à la promotion de notre offre auprès des étudiants.

Les formations proposées dans ce master, en étroite liaison avec les laboratoires, sont en adéquation avec la politique affichée par l’UAG en matière de regroupement et de structuration de la recherche. La diversité et la qualité des formations proposées doivent également conforter l’établissement dans son environnement régional proche (Caraïbes, Amazonie) et son rayonnement international.

Par rapport à l’offre du précédent contrat, un affichage plus clair est obtenu par les nouvelles dénominations nationales et doit renforcer l’attractivité vis-à-vis des étudiants (de l’UAG ou hors UAG). Un manque a été comblé par la proposition du Master Sciences de la Matière. Ceci permet indirectement un recentrage de l’ancien Master REMI, qui devient « Sciences de la Terre de l’Univers et de l’Environnement », avec une meilleure cohérence thématique. L’adéquation des diplômes proposés avec les préoccupations régionales garantit les débouchés pour les étudiants qui s’engageront dans le master. Elle devrait permettre d’attirer des étudiants extérieurs soucieux d’acquérir une formation répondant à des problématiques spécifiques de la zone intertropicale.

De la même manière, le Master Staps, doit combler un vide notamment pour ce qui concerne l’enseignement du Sport, n’oublions pas qu’une bonne partie des reçus au professorat des écoles vient de cette filière qui ne se verra que mieux conforter avec la mastérisation de la formation des enseignants.

Le Master Ecologie (nouveau nom du master Biotrop) s’est recentré à travers par exemple son parcours en agronomie.

Les autres masters sont en renouvellement d’habilitation en tenant compte de l’expérience passée.

Les équipes animant ces structures et impliquées dans le master STS sont toutes labellisées par le MENRT et certaines d’entre elles sont associées aux organismes publics de recherche comme le CNRS, l’IRD, l’INRA, l’INSERM et le CIRAD. Les spécialités proposées dans le master STS s’appuient sur ces équipes et les contenus des formations sont en parfaite adéquation avec les axes de recherche actuellement soumis à l’expertise du MENRT dans le cadre du prochain contrat quadriennal. Par ailleurs, des intervenants professionnels et des collègues d’autres universités (nationales ou étrangères) viendront compléter les équipes pédagogiques locales.

Notons enfin que la mise en œuvre de l’offre master STS devrait renforcer les liens entre les trois régions et les trois pôles de notre université.

Inclure à la fin de cette présentation une liste exhaustive mais simple des diplôme du domaine sans faire de tableau. Le tableau récapitulatif sera placé dans le fichier 4. Politique Générale de formation master à remplir par l’établissement.

Utiliser la présentation suivante :

nom de la mention – (nom des spécialités -……..) - implantation géographique

1. Mathématiques-Mathématiques et Modélisation-Guadeloupe

2. Informatique-Informatique-Guadeloupe et Martinique……………………………………………

3. Biologie, Santé- Biologie, Santé en Milieu Tropical-Guadeloupe

4. Sciences de la Matière-Physique-Guadeloupe et Guyane

5. Sciences de la Matière-Chimie-Guadeloupe et Guyane

6. Sciences de la Matière-Physique et Chimie-Guadeloupe

7. Ecologie-Ecosystèmes tropicaux naturels et exploités-Guadeloupe

8. Staps- Sport, Santé en Environnement Tropical-Guadeloupe

9. Sciences de la Terre de l’Univers et de l’Environnement- Energies Renouvelables et Télédétections-Guyane

10. Biologie, Chimie, Ecologie-Pathologie Tropicale- Guyane

11. Biologie, Chimie, Ecologie-Ecologie Forestière et Tropicale- Guyane

12. Biologie, Chimie, Ecologie- Matériaux et Molécules- Guyane

13. Valorisation des ressources du Vivant- Guyane

· Composition de l’équipe de formation

Voir note sur équipe de formation ; reprendre la composition type et donner la liste exhaustive des responsables des mentions

Responsable du domaine : A.Méril

Responsable de Mentions

J.Vaillant (Mathématiques)

H.Fouchal (Informatique)

J.Smith-Ravin (Biologie-Santé)

J.L Mansot (Sciences de la Matière)

D.Imbert (Ecologie)

O.Hue (Staps)

H.Clergeot (Sciences de la Terre de l’Univers et de l’Environnement)

A.Dejean (Biologie, Chimie, Ecologie)

Les coresponsables de mention et les responsables de spécialités.

Un représentant de l’Ecole Doctorale.

Un représentant du SCUIO-IP.

Un représentant du SCD.

Un représentant, proposé par le Doyen ou directeur de chacune des composantes ayant à mettre en place au moins une mention de M de ce domaine. Cette personne sera de préférence en lien avec la scolarité de la composante.

Deux tuteurs proposés par les responsables de mentions parmi ceux qui assurent un accompagnement pédagogique dans le domaine.

· Dispositif d’évaluation :

Le dispositif d’évaluation sera celui mise en place par l’établissement. Chaque mention sera évaluée une fois au cours du contrat.

· Stratégie de constitution d’un parcours type

Les différents types de parcours que peut trouver un étudiant dans chaque mention du domaine : professionnel, métiers de l’enseignement, recherche,….

Dans chacune des mentions, les différents parcours sont professionnel et recherche, la différence se faisant en deuxième année

· Les partenariats

Décrire les partenariats qui sont mis en œuvre dans certaines mentions avec d’autres établissements Français ou étranger.

Aucune co-habilitation n’est prévue, mais des coopérations sont tout de même prévues avec l’intervention d’enseignants de la France métropolitaine venant des principales villes universitaires françaises où de l’étranger (Université des West Indies, Université de la Havane, etc…)

ANNEXE 1

Composition de l’équipe pédagogique

- On donne la liste des enseignants référents (ou responsable) d’UE et on précise le semestre de l’UE, pour une même UE il peut y avoir plusieurs enseignants en particulier si dispensé sur plusieurs pôles, cette liste doit comprendre ( selon le cas) les intervenants professionnels

· Liste récapitulative

· Fiches individuelles

· Liste récapitulative

Master : STS

Mention : ECOLOGIE Spécialité(s) : ECOTROP

Nom et Prénom

Qualité

CNU

Composante

N° fiche

U.E de référence

ARCHIMEDE Harry

DR

-

INRA 1

UEO22

BA Amadou

PR

67

SEN 2

UEP 34b

BORREUX Jean-Jacques

-

Univ Liège 3

UEO 32b

BOUCHERERAU Jean-Luc

PR

67

SEN 4

UEP 34c

BOUCHON Claude

MCF HDR

67

SEN 5

UEP 23b, UEP 33c

BUSSIÈRES Francois

CR

-

INRA 6

UEO 11

CABIDOCHE Yves-Marie

DR

-

INRA 7

UEP 23a

DE BARROS Inacio

CR

-

INRA 8

UEP 33a

DULORMNE Maguy

MCF

67

SEN 9

UEO 21

ETIENNE Marie-Pierre

MCF

26

AgroParisTech 10

UEO 32b

HERAULT Bruno

MCF

67

IESG 11

UEP 31

HOARAU Jean-Yves

CR

-

CIRAD 12

UEP 32a

IMBERT Daniel

MCF HDR

67

SEN 13

UEP 33

LEMOINE Soazig

MCF

68

SEN 14

UEP 32

LORANGER Gladys

MCF

67

SEN 15

UEO 13

MARCON Éric

IGREF

-

AgroParisTech 16

UEP 41

MONTI Dominique

MCF

67

SEN 17

UEP 24

OMRANE Abdennebi

MCF

25-26

SEN 18

UEC 35

OZIER-LAFONTAINE Harry

DR

-

SEN 19

UEP 31a

ROUSTEAU Alain

MCF HDR

67

SEN 20

UEO12, UEP 31b&33b

TROUPÉ Marylène

MCF

26

SEN 21

UEC 14

VAILLANT Jean

PR

26

SEN 22

UEC 25

· Fiches Individuelles

(On complète une fiche pour chaque responsable d’UE : fondamental ou caractère prof.)

Fiche N° 01

Nom : ARCHIMEDE Prénom : Harry

Qualité : Chercheur

Composante : INRA

CNU ou profession : 67

Liste des UE dont il a la responsabilité

UEO22 : Physiologie et Écophysiologie Animales et Végétales, semestre 2

Activités Scientifiques

Je conduis des recherches (DR à l’INRA) en nutrition animale (herbivore) et anime (directeur de l’UE143 de l’INRA) une équipe de recherches pluridisciplinaires (génétique, physiologie, nutrition, systèmes biotechniques d’élevage) travaillant sur les animaux mono et poly gastriques. Ci-dessous la liste des 9 dernières publications

1. Archimède, H., Pellonde, P., Despois, P., Etienne, T., Alexandre, G. 2008. Growth performances and carcass traits of Ovin Martinik lambs fed various ratios of tropical forage to concentrate under intensive conditions. Small Ruminant Research. 75, 162-170.

2. Mahieu M, Archimede H, Fleury J, Mandonnet N and Alexandre G. Intensive grazing system for small ruminants in the tropics : The french West Indies experiences and perspectives. Small Ruminant Research. 77, 195-2007.

3. Assoumaya, C., Sauvant, D., Archimède, H., 2007. Etude comparative de l’ingestion et de la digestion des fourrages tropicaux et tempérés. INRA Prod. anim. 20, 383-392.

4. Boval M, Archimède H, Cruz P., Duru M, 2007. Intake and digestibility measured for heifers grazing tropical native grass, at two stages of maturation (14 vs 28 days), Animal Feed Science and Technology, 134, 1-2, 18-31.

5. Boval M., Fanchone A., Archimède, H. and Gibb M.J (2007) Effect of structure of a tropical pasture on ingestive behaviour, digestibility of diet and daily intake by grazing cattle, Grass and Forage Science, 62, 44-54.

6. Assoumaya C., Boval M., Sauvant D., Xande A., Claude Poncet, Archimede H, 2007. Intake and digestive processes in the rumen of rams fed with Digitaria decumbens harvested at four stages of grass regrowth age. Asian-Aust. J. Anim. Sci. 20(6):925-93.

7. Assoumaya C, Boval M, Weisbecker J-L, Saminadin G., Archimede H, 2007. Limits of exogenous fibrolytic enzymes to improve digestion and intake of a tropical grass. Asian-Aust. J. Anim. Sci. 20(6):914-919.

8. Alexandre G. Aumont G., Coppry O., Fleury J. Archimède H. 2007. Age of regrowth of irrigated Digitaria decumbens pastures, season of kidding, milk production and growth rate of Creole goats in Guadeloupe ( F.W.I.) Journal of Agriculture of University of Puerto-Rico (in press).

Fanchonne A., Boval M., Lecomte Ph., Archimède H. (2007) Faecal NIRS to assess intake, in vivo digestibility and chemical composition of the herbage ingested by sheep, Journal of NIRS, 15, 107-113.

Fiche N° 02

Nom : Bâ Prénom : Amadou

Qualité : Pr

Composante : faculté SEN (UAG)


Responsable de l’UEP34 : Ecologie fonctionnelle


Je développe de recherches sur la diversité, le fonctionnement et l’utilisation des symbioses végétales (mycorhizes et nodules fixateurs d’azote) en situation de stress abiotiques (salinité, inondation, déficience du sol en P et N) dans des agrosystèmes et écosystèmes forestiers.

- Cinq publications significatives :

Diédhiou AG, Selosse MA, Diabaté M, Dreyfus B, Bâ AM, de Faria SM, Galiana A & Béna G (2008). High sharing of ectomycorrhizal fungi, without evidence of carbon transfers by mycorrhizal networks, among canopy trees and seedlings in a tropical rain forest. J. of Ecology (in press).

Muller F, Voccia M, Bâ AM & Bouvet JM (2008). Genetic diversity and gene flow in a Caribbean tree Pterocarpus officinalis Jacq. : a study based on chloroplast and nuclear microsatellites. Genetica DOI 10.1007/s10709-008-9268-4.

Rivière T, Diédhiou AG, Diabaté M, Senthilarasu K, Natarajan K, Ducousso M, Verbeken A, Buyck B, Dreyfus B, Béna G & Bâ AM (2007) Genetic diversity of ectomycorrhizal Basidiomycetes in West African and Indian tropical rain forests. Mycorrhiza 17 : 415-428.

Duponnois R, Plenchette C, Prin Y, Ducousso M, Kisa M, Bâ AM & Galiana A (2007). Use of mycorrhizal inoculation to improve reafforestation process with Australian Acacia in Sahelian ecozones. Ecological Engineering 29: 105-112.

Fougnies L, Renciot S, Muller F, Plenchette C, Prin Y, de Faria SM, Bouvet JM, Sylla SNd, Dreyfus B & Bâ AM (2007). Arbuscular mycorrhizal colonization and nodulation improve flooding tolerance in Pterocarpus officinalis Jacq. seedlings. Mycorrhiza 17 : 159-166

·

Fiche N° 03

Nom : BOREUX Prénom : Jean-Jaques

Qualité : Chef de travaux

Composante :Université de Liège

CNU ou profession : Enseignant-Chercheur en modélisation et statistiques


UEP 32b (avec M. Etienne)


- Bernier J, Parent E et Boreux JJ - 2000 - Statistique pour l'environnement: traitement bayésien de l'incertitude. Technique et Documentation.

- Guiot J., Torrea F. , Jolly D. , Peyrona O., Boreux JJ and Cheddadia R. - 2000- Inverse vegetation modeling by Monte Carlo sampling to reconstruct palaeoclimates under changed precipitation seasonality and CO2 conditions: application to glacial climate in Mediterranean region. Ecological Modelling, 127, 119-140

- Boreux JJ, Bernier J, Parent E- 2006- Le rôle pivot des variables latentes pour le raisonnement statistique conditionnel. Exemples d'applications environnementales des processus ponctuels marqués. Revue de statistique appliquée, I54, 85-111

- C. Gaucherela, , , F. Campillob, L. Missonc, J. Guiota and J.-J. Boreux – 2008- Parameterization of a process-based tree-growth model: Comparison of optimization, MCMC and Particle Filtering algorithms Environmental Modelling & Software, 23, 1280-1288

-

Fiche N° 04

Nom : BOUCHEREAU Prénom : Jean-Luc

Qualité : PR

Composante : Faculté SEN (UAG)



Ressources marines aquacoles UEP 34c, semestre 3.


- Étude des écosystèmes lagunaires avec le compartiment biologique « poissons »

- Ichtyologie

- Organisation et fonctionnement des systèmes paraliques et zonation biologique

-

- Bouchereau J.-L., Chaves P. and Albaret J.-J. 2000. Selection of candidate fish species for fish farming in the Bay of Guaratuba, Brazil, Brazilian Archives of Biology and Technology 43 (2-4):15-25.

- Chaves P., J.L. BOUCHEREAU, 2000. Use of mangrove habitat for reproductive activity by the fish community in the Guaratuba Bay, Brazil. Oceanologica Acta. 23, 3: 273-280.

- GUELORGET O., LUCIEN-BRUN H., BOUCHEREAU J.-L., DUCHE D., 2000. Aquaculture, a domain for application of the knowledge of marine ecology, World Aquaculture, 31, 1:35-42.

- CAPAPÉ C., HAMPARIAN R., MARQUÈS A. and J.-L. BOUCHEREAU. 2002. First morphometric data of a gravid female of the southern stingray, Dasyatis americana HILDEBRAND and SCHRŒDER, 1928, (Chondrichthyes: Dasyatidae) in Guadeloupe waters (French West Indies). Acta Adriat., 43 (2):97-104.

- Caberty S., Chaves & J.L. Bouchereau 2004.- Organisation et fonctionnement trophiques de l'ichtyofaune d'une lagune à mangrove: la Manche-à-Eau (Guadeloupe). Cahiers de Biologie Marine,45:243-254.

- BOUCHEREAU J.-L., CHAVES P. de T. et MONTI D., 2008. Factors Structuring the Ichtyofauna Assemblage in a Mangrove Lagoon (Guadeloupe, French West Indies), Journal of Coastal Research: 24 (4) : 969-982.

- Komla-Soukha Nancy et BOUCHEREAU Jean-Luc, 2007. État de la pêche artisanale dans l’Archipel de la Guadeloupe en février 2006 et son évolution depuis 1986, Proceedings of the 59th annual meeting of the G.C.F.I. nov.2006 in Belize City, Belize:275-282..

Fiche N° 05

Nom : BOUCHON Prénom : Claude

Qualité : MCFHC, HDR



Responsable du parcours c : Écosystèmes marins et dulçaquicoles


UEP 23b Pollution des écosystèmes tropicaux

UEP 33c Écologie marine


Dynamique spatio-temporelle des communautés récifales : suivi à long terme de l’évolution des communautés récifales ; études des mécanismes de dégradation des récifs coralliens ; impact des contraintes générées par les perturbations naturelles ou anthropiques sur les groupes fonctionnels récifaux ; interrelations entre communautés benthiques récifales et peuplements de poissons.

- BOUCHON-NAVARO Y., BOUCHON C., LOUIS M., LEGENDRE P. 2005. Biogeographic patterns of coastal fish assemblages in the West Indies. J. Exp. Mar. Biol. Ecol. 315 : 31-47.

- BOUCHON-NAVARO Y., BOUCHON C., KOPP D., LOUIS M. 2006. Weight-length relationships for 50 species collected in seagrass beds of the lesser Antilles. Journal of Applied Ichtyology, 22 : 322-324.

- KOPP D., BOUCHON-NAVARO Y., LOUIS M., BOUCHON C. 2007. Diel differences in the seagrass fish assemblages of a caribbean island in relation to adjacent habitat types. Aquatic Botany, 87 : 31-37.

- VASLET A., BOUCHON-NAVARO Y., LOUIS M., BOUCHON C. 2007. Weight-length relationships for 20 species collected in the mangrove of Guadeloupe. Journal of Applied Ichtyology, 22 : 322-324.

- BOUCHON C., PORTILLO P., LOUIS M., MAZEAS F., BOUCHON-NAVARO Y. 2008. Évolution récente des récifs coralliens des îles de la Guadeloupe et de Saint-Barthélemy. Revue d'écologie (Terre et Vie), 63 : 45-65.

- BOUCHON C., PORTILLO P., BOUCHON-NAVARO Y., LOUIS M., HOETJES P., BRATHWAITE A., ROACH R., OXENFORD H., O’FARRELL S., DAY O. 2008. Status of coral reefs of the Lesser Antilles after the 2005 coral bleaching event. Pp 85-103. In : Wilkinson C., Souter D., (eds). Status of Caribbean Coral reefs after bleaching and hurricanes in 2005. Global Coral Reef Monitoring Network, and Reef and Rainforest Research Centre, Townsville, 152 pp.

- BOUCHON C., PORTILLO P., BOUCHON-NAVARO Y., LOUIS M. 2008. Status of the coral reefs of the Lesser Antilles : 2008. In : « Status of the coral reefs of the world ». WILKINSON C. ed., Australian Institue of Marine Sciences, Australie, sous presse.

Fiche N° 06

Nom : Bussière Prénom : François

Qualité : Chargé de Recherches

Composante : INRA Antilles-Guyane, Unité Agropédoclimatique de la Zone Caraïbe

CNU ou profession : Chargé de Recherches en bioclimatologie

Responsable de l’UEO11 : Introduction aux milieux physiques tropicaux

Activités

Anime une équipe de recherches dans unité APC

Reviewer revues rang A

Thèse encadrée (1), Membre de comités de thèse

Compétences

Agronomie

Bioclimatologie

Physique de l’environnement

Modélisation des cultures

Modélisation physique

Thèse

Bussière F., 1991, Transferts thermiques et hydriques dans le continuum sol-mulch végétal_atmosphère : Modélisation et première validation expérimentale. Thèse de doctorat, Institut National Agronomique Paris-Grignon, 66pp

Publications récentes

Bassette, C. and Bussière, F. (2005). 3-d modelling of the banana architecture for simulation of rainfall interception parameters. Agricultural and Forest Meteorology, 129 ; 95–100.

Bassette C., and Bussière F. (2008). Partitioning of splash and storage during raindrop impacts on banana leaves; Agricultural and Forest Meteorology, 148(6-7), 991-1004;

Cattan, P., F. Bussière and A. Nouvellon (2006). Evidence of large rainfall partitioning patterns by banana and impact on surface runoff generation. Hydrological Processes, 21; 2196-2205.

Dufour-Kowalski S., Bassette C., and Bussière F. (2007). A software for the simulation of rainfall distribution on 3D plant architecture: PyDROP. In: Proceedings of the 5th International Workshop on Functional-Structural Plant Models, 4-9 Nov 2007; P. Prusinkiewicz, J. Hanan, and B. Lane (Eds). Napier, New Zealand, 29; 1-5

Ripoche A., Jacqua G., Bussière F., Guyader S. & Sierra J. (2008). Survival of Colletotrichum gloeosporioides (causal agent of yam anthracnose) on yam residues decomposing in soil. Applied Soil Ecology 38, 270–278

Fiche N° 07

Nom : CABIDOCHE Prénom : Yves-Marie

Qualité : Directeur de Recherches de 2e classe (HDR équivalence)

Composante : INRA Département Environnement et Agronomie

CNU ou profession : Chercheur


UEP 23a : Introduction à l’Agronomie, M1S2

Activités Scientifiques (voir annexe 0 avant de remplir)

Clermont-Dauphin C., Cabidoche Y.-M., Meynard J.-M. 2004. Effects of intensive mono-cropping of bananas on properties of volcanic soils in the uplands of the French West Indies. Soil Use and Management, 20 (2): 105-113.

Feller C., Cabidoche Y.M., Findeling A., Maraux F. (2004) Les bases écologiques du pilotage d'une fertilité durable des écosystèmes tropicaux cultivés et leurs perspectives. Comptes rendus de l'Académie d'Agriculture de France, 90 (3) : 55. Séance de l'Académie d'Agriculture de France "La révolution doublement verte", 2004-05-05, Paris, France.

Dulormne M., Sierra J., Bonhomme R., Cabidoche Y. M. 2004. Seasonal changes in tree-grass complementarity and competition for water in a subhumid tropical silvopastoral system. European Journal of Agronomy, 21: 311-322.

Clermont-Dauphin C., Cabidoche Y.-M., Meynard J.-M. 2005. Diagnosis on the sustainability of an upland cropping system of southern Haiti. Agriculture, Ecosystems and Environment, 105: 221-234.

Cattan P., Cabidoche Y.-M., Lacas J.-G., Voltz M. 2006. Effects of tillage and mulching on runoff under banana (Musa spp.) on a tropical Andosol. Soil & Tillage Research, 86 (1): 38-51.

Cabidoche Y.-M. 2006. Stockage dans les sols à charges variables et dissipation dans les eaux de zoocides organochlorés autrefois appliqués en bananeraies aux Antilles : relation avec les systèmes de culture. Rapport final de contrat de recherche, AP « Pesticides » 2002 MEDD. APC INRA Antilles-Guyane, 99p.

Cabidoche Y.-M., Jannoyer M., Vanniere H., 2006. Conclusions du Groupe d’Etude et de Prospective « Pollution par les organochlorés aux Antilles ». Aspects agronomiques. APC INRA Antilles-Guyane et CIRAD-FLHOR Montpellier, 55p.+annexes.

Cattan, P., Voltz, M., Cabidoche, Y. M., Lacas, J. G., and Sansoulet, J. (2007). “Spatial and temporal variations in percolation fluxes in a tropical Andosol influenced by banana cropping patterns.” Journal of Hydrology, 335(1-2), 157-169.

Sansoulet, J., Cabidoche, Y. M., and Cattan, P. (2007). “Adsorption and transport of nitrate and potassium in an Andosol under banana (Guadeloupe, French West Indies).” European Journal of Soil Science, 58(2), 478-489.

Chabrier C., Carles C., Desrosiers C., Quénéhervé P., Cabidoche Y.-M., (accepté). Nematode dispersion by runoff water: case study of Radopholus similis (Cobb) on nitisol under humid tropical conditions. Applied Soil Ecology.

Chabrier C., Carles C., Quénéhervé P., Cabidoche Y.-M., (accepté). Nematode dissemination by water leached in soil: case study of Radopholus similis (Cobb) Thorne on nitisol under simulated rainfall. Applied Soil Ecology.

Sansoulet, J., Cabidoche Y.-M., Cattan, P., Ruy, S., Simunek, J. (2008) Spatially Distributed Water Fluxes in an Andisol under Banana Plants: Experiments and Three-Dimensional Modeling, Vadose Zone Journal; 7, 819-829

Fiche N° 08

Nom : DE BARROS Prénom : Inácio



CNU ou profession : Charge de Recherches


Responsable de l’UEP33a Conception et évaluation d’agrosystèmes durables


- 15 ans de recherches sur : i) Nutrition minéral des plants, ii) Modélisation des systèmes de culture ; iii) Evaluation de durabilité des systèmes agricoles iv) Comptabilité environnementale

- Cinq dernières publications :

[1] de Barros, I.; Balzy, J-M.; Rodrigues, G.S.; Tournebize, R.; Cina, J-P. (2008). Environmental accounting and Economic performance of banana cropping systems in Guadeloupe (French West Indies). Agriculture, Ecosystems and Environment. (accepted for publication - Under correction)

[2] Gaiser, T.; de Barros, I.; Herfort, J.; Sereke, F.; Lange, F-M. (2008). Regional simulation of food and biomass production in the tropics (1) Model validation at the field scale. Agricultural Systems (Submitted)

[3]Geraldo Stachetti Rodrigues, PhD; Inacio de Barros, PhD; Eugène E Ehabe, Dr; Patrick S Lang, Dr; Frank Enjalric, Dr. (2008). Integrated indicators for performance assessment of traditional agro-forestry systems in South West Cameroon. Agroforestry Systems (Submitted)

[4]de Barros, I., Gaiser, T., Lange, F.-M., Römheld, V. (2007).Mineral nutrition and soil water use patterns of a maize/cowpea intercrop on a highly acidic soil of the tropic semi-arid. Field Crops Research. , v.101, p.26 – 36.

[5]de Barros, I., Williams, J. R., Gaiser, T. (2005).Modeling soil nutrient limitations to crop production in semiarid NE of Brazil with a modified EPIC version. II – Field test of the model. Ecological Modelling. , v.181, p.567 - 580, 2005.

Fiche N° 09

Nom : DULORMNE Prénom : Maguy

Qualité : MCF

Composante : UAG



UEO21 - ECOSYSTEME TROPICAUX - M1S2 (MS2)


· Fonctionnement d’un système agroforestier en milieu tropical

· Etude des flux d’azote de carbone et hydrique

· Fonctionnement d’un écosystème naturel, la forêt marécageuse

· Etude des phénomènes d’adaptations en situation de contraintes édaphiques (sel, anoxie, eau) et microclimatique (rayonnement)

Références relatives à ces thématiques

Saint-Etienne L, Paul S, Tromas N, Imbert D, Dulormne M, Muller F, Rousteau A, Toribio A, Plenchette C, A.M. Bâ. (2006) Arbuscular mycorrhizal soil infectivity along a salinity gradient in a Pterocarpus swamp forest. Forest Ecology and Management, 232 (1-3) : 86-89.

Bandou E, Lebailly F , Muller F , Dulormne M, Toribio A , Chabrol J , Courtecuisse R, Plenchette C, Prin Y, Dreyfus B, Bâ A M (2006) The ectomycorrhizal fungus Scleroderma bermudense alleviates salt stress in seagrape (Coccoloba uvifera L.) seedlings, Mycorrhiza 16, 559-565.

Dulormne M., Sierra J., Bonhomme R. et Cabidoche YM. (2004) Seasonal changes in tree-grass complementarity and competition for water in subhumid tropical silvopastoral system. In Press dans European Journal of Agronomy.

Dulormne M., Sierra J., Nygren P. et Cruz P. (2003) Nitrogen fixation and recycling of the fixed nitrogen in a cut-and-carry silvopastoral system under subhumid tropical conditions (Guadeloupe, French Antilles). Agroforestry Systems. 59 : 121-129.

Sierra J., Dulormne M. et Desfontaines L. (2002) Soil nitrogen dynamics as affected by Gliricidia sepium in a silvopastoral system in Guadeloupe, French Antilles. Agroforestry Systems. 54 (2) : 87-97.

Archimède H., Dulormne M., Tournebize R., Saminadin G., Périacarpin F. et Xandé A. (2001) The effects of Gliricidia sepium supplementation on intake and digestion of Digitaria decumbens hay by black belly sheep. Journal of Agricultural Science. 137 : 105-112.

Cruz P., Sierra J., Wilson J.-R., Dulormne M. et Tournebize R. (1999) Effects of shade on growth and mineral nutrition of tropical grasses in sylvopastoral systems. Annals of Arid Zone. 38 (3-4) : 335-361.

Fiche N° 10

Nom : ETIENNE Prénom : Marie-Pierre

Qualité : MCF

Composante : AgroParisTech – Département Modélisation Mathématique Informatique et Physique

CNU ou profession : section 26 du CNU


UEO32b : Modélisation des Systèmes Ecologiques


-

-Gion J-M, Mortier F, Mandrou E, Hein Gherardi P.R, Costecalde T, Chaix G, Etienne M-P. , Sivadon P., Grima-Pettenati J., Villar E., Saya A., Pollet B., Lapierre C., Vigneron P. Un modèle de variabilité fonctionnelle chez les arbres forestiers : le gène CCR d'eucalyptus Actes du 7ème colloque national "Ressources génétiques" A paraître Octobre 2008.-Ancelet S. , Etienne M.P., H.P. Benoit, Parent E. Modelling spatial zero-inflated continuous data with an exponentially compound Poisson process Environmental and Ecological Statistics submitted february 2007.-Robelin, D., Etienne M.P. Discriminer les inversions de courts segments dans une séquence biolgique. Actes de In XI Rencontres de la Société Francophone de Classification p.291-295. 2004-Etienne M.P. Une approche statistique pour la détection de gènes impliqués dans les maladies multifactorielles. Actes de Jobim juin 2004. Etienne M.P., Vallois P. Approximation of the distribution of the supremum of a centred random walk. Application to the local score Methodol. Comput. Appl. Probab. 6, No.3, 255-275 (2004).

-

Fiche N° 11

Nom : GROS Prénom : Olivier

Qualité : MCF, HDR

Composante : UFR SEN



UEP31c


Etude des interactions bactéries sulfo-oxydantes et invertébrés marins dans les écosystèmes chimiosynthétiques marins.

Etude des développement embryonnaires et larvaires d’invertébrés marins (bivalves, annélides)

Publications

Himmel D., Maurin L.C., Gros O., and Mansot J-L. (2008). Raman microspectrometry sulphur detection and characterization on the marine ectosymbiotic nematode Eubostrichus dianae (Desmodoridae, Stilbonematidae). Biology of the Cell doi:10.1042/BC20080051

Lechaire J-P., Frébourg G., Gaill F., and Gros O. (2008). In situ characterization of sulfur in gill-endosymbionts of the shallow water lucinid Codakia orbicularis (Linné, 1758) by cryo-EFTEM microanalysis. Marine Biology. 154: 693-700

Duperron S., Laurent M.C.Z., Gaill F., and Gros O. (2008). Sulfide-oxidizing extracellular bacteria in the gills of Mytilidae associated with wood falls. FEMS Microbiology Ecology. 63: 338-349.

Pernice M., Wetzel S., Gros O., Boucher-Rodoni R., and Dubilier N. (2007). Enigmatic dual symbiosis in the excretory organ of Nautilus macromphalus (Cephalopoda: Nautiloidea). Proceedings of The Royal Society of London Series B-Biological Sciences. 274: 1143-1152.

Caro A., Gros O., Got P., De Wit R., and Troussellier M. (2007). Characterization of the population of the sulfur-oxidizing symbiont of Codakia orbicularis (Bivalvia, Lucinidae) by single cell analyses. Applied and Environmental Microbiology. 73(7): 2101-2109.

Fiche N° 12

Nom : HERAULT Prénom : Bruno

Qualité : MCF

Composante : Université Antilles-Guyane, IESG

CNU ou profession : 67 – Biologie des Populations et Ecologie

Responsable du parcours b : Ecologie des Forêts Tropicales


UEP 31b : Origine et Maintien de la Biodiversité (co-responsable Alain Rousteau)


Hérault B (2007) Reconciling niche and neutrality through the emergent group hypothesis. Perspectives in Plant Ecology, Evolution & Systematic 9: 71-78

Hérault B, Bornet A, Trémolières M (2008) Redundancy and niche differentiation among the European invasive Elodea species. Biological Invasions 10: 1099-1107

Hérault B, Honnay O (2005) The relative importance of local, regional and historical factors determining the distribution of plants in fragmented riverine forests - an emergent group approach. Journal of Biogeography 32: 2069-2081

Hérault B, Honnay O (2007) Using life-history traits to achieve a functional classification of habitats. Applied Vegetation Science 10: 73-80

Hérault B, Honnay O, Thoen D (2005) Evaluation of the ecological restoration potential of plant communities in Norway spruce plantations using a life-trait based approach. Journal of Applied Ecology 42: 536-545

Hérault B, Thoen D (2008) Diversity of plant assemblages in isolated depressional wetlands from central-western Europe. Biodiversity and Conservation 17: 2169-2183

Honnay O, Hérault B, Bossuyt B (in press) Opportunities and constraints of using understorey plants for the evaluation of forest restoration. In: Drapeau P, Jonsson BG, Villard MA (ed) Setting conservation targets for managed forest landscapes. Conservation Biology Series, Cambridge University Press, Cambridge

Fiche N° 13

Nom : Hoarau Prénom : Jean-Yves

Qualité : Pr / MCF/ MCF(HDR) / Associé / Chercheur / Professionnel /……..

Composante : CIRAD

Déparement des Systèmes Biologiques (BIOS)

Unité 75 (Amélioration génétique d’espèces à multiplication végétative)

CNU ou profession : Chercheur

Responsable de l’UEP32a : Amélioration génétique – Semestre 3


Au sein de l’UR75 (Amélioration génétique d’espèces à multiplication végétative) je développe des activités relatives à l’amélioration génétique de la canne à sucre :

- caractérisation et analyse de la diversité des ressources génétiques chez Saccharum

- étude du déterminisme génétique de caractères complexes d’intérêts agronomiques

- analyse du déséquilibre de liaison chez une plante à amélioration récente d’origine multi-spécifique

Publications récentes les plus significatives :

[1] Hoarau J.Y., Souza G., D’Hont A., Menossi M., Pinto L.R., Pereira de Souza A., Grivet L., Menck C.F., Ulian E.C., Vincentz M., 2007. Sugarcane, a tropical crop with a highly complex genome. In : Functional Plant Genomics, J. F. Morot-Gaudry, P. Lea and J. F. Briat (Eds). Enfield NH, USA, Science Publishers, p. 481-499.

[2] Raboin L.-M., Oliveira K.M., Lecunff L., Telismart H., Roques D., Butterfield M., Hoarau J.-Y., D’Hont A. (2006). Genetic mapping in sugarcane, a high polyploid, using bi-parental progeny : identification of a gene controlling stalk colour and a new rust resistance gene. Theor. Appl. Genet. 112 :1382-1391.

[3] Asnaghi C., Roques D., Ruffel S., Kaye C., Hoarau J.Y., Télismart H., Girard J.C., Raboin L.M., Risterucci A.M., Grivet L., D’Hont A. (2004). Targeted mapping of a sugarcane rust resistance gene (Cru1) using bulk segregant analysis and AFLP markers. Theoretical and Applied Genetics 108 :759-764

[4] Hoarau J.Y., Grivet L., Offmann B., Raboin L.M., Diorflar J.P., Payet J., Hellmann M., D’Hont A., Glaszmann J.C.(2002). Genetic dissection of a modern sugarcane cultivar (Saccharum spp.).II. Detection of QTLs for yield components. Theoretical and Applied Genetics 105:1027-1037.

Fiche N° 14

Nom : IMBERT Prénom : Daniel

Qualité : MCF HDR…..

Composante :Faculté SEN (UAG)



1/ Co-responsable de l’ UEP33b (3ème semestre) « Botanique évolutive »


Thème général : Structure et dynamique forestière des forêts tropicales de basse altitude face aux perturbations climatiques et anthropiques

FLOWER J.M. et IMBERT D, 2006. Recovery deficiency following tree mortality in mangroves of two Caribbean islands: field survey and statisticalclassification. Wetlands Ecology and Management 14, 185-199

IMBERT D. & DELBÉ L, 2006. Ecology of fire-influenced Cladium jamaicense marshes in Guadeloupe, Lesser Antilles. Wetlands, 26 (2), 289-297.

Saint-Etienne L., Paul S., Imbert D ., Dulormne M., Muller F., Toribio A., Plenchette C. & BA A., 2006. Arbuscular mycorrhizal soil infectivity in a stand of the wetland tree Pterocarpus officinalis along a salinity gradient. Forest Ecology and Management, 232, 86-89.

LORANGER-MERCIRIS G., IMBERT D., BERNHARD-REVERSAT F., PONGE J.F. & LAVELLE P., 2007. Soil fauna activity in a secondary semi-evergreen forest in Guadeloupe (Lesser Antilles); influence of soil type and dominant tree species. Biology and fertility of soils 44, 269-273.

IMBERT D. & PORTECOP J., 2008. Hurricane disturbance and forest resilience : assessing structural vs. functional changes in a Caribbean dry forest Forest Ecology and Management 255, 3494-3501.

Loranger-Merciris G., Imbert D., Bernhard-Reversat F., Lavelle P. et Ponge JF, 2008. Litter N-content influences soil millipede abundance, species richness and feeding preferences in a semi-evergreen dry forest of Guadeloupe (Lesser Antilles). Biology &Fertility of Soils (à paraître).

-

Fiche N° 15

Nom : LEMOINE Prénom : Soazig





1/ UEP 32 : Écotoxicologie et techniques palliatives pour la restauration des écosystèmes marins (S3)


- Responsable d’ un projet sur l’utilisation de la toxicogénétique au sein de l’équipe DYNECAR EA 926 afin de mieux identifier les cibles de la Chlordécone sur le ouassou et l’huître de palétuvier dans la perspective d’isoler de nouveaux biomarqueurs spécifiques à ce pesticide à travers l’expression de gènes (banque soustractive et à plus long terme utilisation de microarray). (ANR CES CHLORDEXCO 2008)

- Mise en place d’un réseau de surveillance du milieu côtier guadeloupéen au niveau d’une dizaine de stations. Un suivi par l’analyse des biomarqueurs permettra de préciser si certains polluants ont été introduits dans le milieu naturel.

· Bouchon C., Lemoine S. 2007. Contamination par les pesticides des organismes marins de la baie du Grand Cul-de-Sac Marin (île de la Guadeloupe). Rapport UAG / DIREN, 39 pp

· Monti D., S. Lemoine. 2007. Impacts de la contamination par les pesticides sur la démographie d’une population de Crustacés d’eau douce. Essai conjoint d’un biomarqueur de génotoxicité. Convention Ministère de l’Outremer. 36 pages + annexes.

· Monti D. and Lemoine S. (poster spotlight). 2008. “Impacts of pesticides contamination on the demography of a tropical freshwater crustacean: linkage with results of Comet assay”. Congrés SETAC Varsovie pologne (25-29 mai 2008).

· Ramdine G., Lemoine S. Anthropogenic contaminations in the mangrove of Guadeloupe (Lesser Antilles) – en cours- Use of a biomarker of genotoxicity for monitoring. 61st Gulf and Caribbean Fisheries institute Congress. 10-14 novembre 2008, Guadeloupe.

· Lemoine S., Bouchon-Navaro Y., Bouchon C. 2007. Poster. Pesticides contamination of the coastal marine ecosystems of Guadeloupe island (French Antilles). SETAC Europe 17th Annual Meeting, 20-24 May Porto, Portugal

· Ramdine G., Fichet, D., Lemoine S. Communication orale. 2007. “Metallic contaminations in the mangrove of Guadeloupe (Lesser Antilles) - Use of the comet assay for genotoxicity monitoring”. Congrès annuel de la SETAC Europe (20-24 mai 2007) au Portugal porto.

Fiche N°16

Nom : Loranger- Merciris Prénom : Gladys

Qualité : Pr / MCF / MCF(HDR) / Associé / Chercheur / Professionnel /……..

Composante : Faculté des Sciences Exactes et Naturelles, UAGGuadeloupe

CNU ou profession : Biologie des Populations et Ecologie (67)


Responsable de l’UEO 13 (Ecologie Générale)


- Doctorat Fonctionnement Physique, Chimique et Biologique de la Biosphère Continentale (Université Pierre et Marie Curie-Paris 6, 1999).

- Près de 10 ans de recherches consacrées i) à l’influence des facteurs du milieu sur les organismes du sol et sur le cycle de la matière organique dans les écosystèmes naturels et ii) à l’influence des activités anthropiques sur le fonctionnement des écosystèmes terrestres (une quinzaine de publications de rang A).

- Nommée Maître de Conférences en Ecologie (section 67), Université Pierre et Marie Curie-Paris 6 en 2001 puis mutée à ma demande à l’Université Antilles Guyane (EA DYNECAR).

- Enseignement (Pédologie et Ecologie du sol) dans le cadre de formations de 3ème cycle à l’UAG, à l’université d’Orsay et à l’université Pierre et Marie Curie (MST, DESS, DEA, Master) depuis 1998. Autres enseignements dispensés (DEUG, Licence) : Ecologie, Biologie Végétale, Zoologie.

- Encadrement d’une quinzaine de mémoires (Licence, Maîtrise, DEA) depuis 2000.

- Publications significatives :

Loranger-Merciris G., Imbert D., Bernhard-Reversat F., Lavelle P. & Ponge J.F. (2008) Litter N-content influences soil millipede abundance, species richness and feeding preferences in a semi-evergreen dry forest of Guadeloupe (Lesser Antilles), Biology and Fertility of Soils, sous presse. DOI 10.1007/s00374-008-0321-3.

Lafont A., Risède J-M., Loranger-Merciris G., Clermont-Dauphin C., Dorel M., Rhino B., Lavelle P. (2007) Effects of the earthworm Pontoscolex corethrurus on banana plants infected or not with the plant-parasitic nematode Radopholus similis. Pedobiologia, 51: 311-318.

Loranger-Merciris G., Barthes L., Gastine A. & Leadley P. (2006) Rapid effects of plant diversity and identity on microbial communities in experimental grassland ecosystems. Soil Biology and Biochemistry, 38: 2336-2343.

Loranger G.I., Pregitzer K.S. & King J.S. (2004) Elevated CO2 and O3t concentrations differentially affect selected groups of the fauna in temperate forest soils. Soil Biology and Biochemistry, 36: 1521-1524.

Loranger G., Ponge J.F. & Lavelle P. (2003) Humus forms in two secondary semi-evergreen tropical forest stands. European Journal of Soil Science, 54: 17-24.

Loranger G., Bandyopadhyaya I., Razaka B. & Ponge J.F. (2001) Does soil acidity explain altitudinal sequences in Collembolan communities? Soil Biology and Biochemistry, 33: 381-393.

Loranger G., Ponge J.F., Blanchart E. & Lavelle P. (1998) Impact of earthworms on the diversity of microarthropods in a vertisol (Martinique). Biology and Fertility of Soils, 27: 21-26.

Fiche N° 17

Nom : MARCON Prénom : Eric


Composante : AgroParisTech - Engref

CNU ou profession : Ingénieur du Génie Rural, des Eaux et des Forêts


UEP41, S4 (Co-responsable avec D. MONTI)


- Directeur adjoint de l’UMR Ecofog

- Directeur délégué d’AgroParisTech en Guyane

-Chercheur en écologie : statistiques spatiales, modélisation de la diversité.

- Marcon E. and Puech F – 2003- Evaluating the geographic concentration of industries using distance-based methods. Journal of Economic Geography 3, 409-428

- Ollivier M., Baraloto C. and Marcon E. - 2007- A trait database for Guianan rain forest trees permits intra-and inter-specific contrasts. Ann. For. Sci, 64, 781-786

Fiche N° 18

Nom : MONTI Prénom : Dominique

Qualité : MCF




1/ UEP 24 Stages, MS1

2/ UEP 41 Stages MS4 (co-responsable avec E. MARCON)


Spécialité en l’écologie aquatique, tournée prioritairement vers les eaux douces tropicales. Mes orientations de recherche sont celles un travail intégratif mené à l’échelle du bassin versant, en connexion avec l’agronomie, les sciences du sol, la botanique, l’écologie végétale et l’hydrologie. Mes problématiques principales de recherche portent sur

i) le lien entre ressources en eau douce et biodiversité du vivant dans rivières des îles tropicales. Particulièrement affectée par les conflits d’usage modifiant la ressource naturelle en eau douce, la biodiversité des rivières dépend de la préservation d’une ressource minimale et des conditions de mélange entre eau douce et eau salée. Les préférences d’habitat des espèces locales ont été établies pour un ensemble important de cours d’eau. Elles ont montré une différence fondamentale d’organisation entre petits (ravines) et grands systèmes et une généralisation possible pour les plus grands systèmes.

ii) la quantification, puis la recherche d’incidences des fortes contaminations de la faune d’eau douce par les résidus des traitements phytosanitaires. Profondément modifiée par le lessivage des produits de traitement des cultures, la qualité de l’eau de rivière montre des altérations qui, aux Antilles, conditionnent le niveau de biocontamination des espèces d’eau douce. Le diagnostic généralisé à l’ensemble de la Basse-Terre révèle des atteintes de forte ampleur. Les modalités de transfert des polluants au sein du réseau ainsi que les conséquences en terme de reproduction, de croissance, d’altération des cycles de vie des espèces locales et de modification des équilibres sont les objets de mes recherches actuelles.

Bouchereau J-L., Chaves P., Monti D. 2008. Factors Structuring the Ichtyofauna Assemblage in a Mangrove Lagoon (Guadeloupe, French West Indies). Journal of Coastal Research. 24(4): 969-982.

COAT S., MONTI D. 2006. Lack of significance of usual ecological indicators in predicting pesticides

contamination : Specificities of tropical island freshwaters. Communication 15th meeting of the Caribbean

Academy of Sciences, 21-23 mai 2006, Guadeloupe.

COAT S., MONTI D., BOUCHON C., LEPOINT G. en révision. Trophic relationships assessed by stable isotopes analyses in the food web of a tropical stream. Freshwater biology, ID-FWB-P-Apr-08-0191.

MONTI D., 2005. Evaluation du niveau de contamination des organismes aquatiques d’eau douce par les

pesticides, en Guadeloupe. Convention Direction Régionale de l’Environnement Guadeloupe. 35 pages +

annexes.

MONTI D., COAT S. 2008. La contamination des espèces d’eau douce aux Antilles. In : Numéro spécial,

Cahiers du PRAM, N° 7. (sous presse)

MONTI D., E. GOUEZEC. 2006. Etablissement des préférences d’habitats des espèces de Poissons et

Crustacés d’eau douce, en Guadeloupe. Convention Direction Régionale de l’Environnement Guadeloupe.

151 pages + annexes.

MONTI D., LEMOINE S. 2008. Impacts of pesticides contamination on the demography of a tropical

freshwater crustacean : linkage with results of Comet assey. SETAC Europe 18th Annual Meeting, 20-24

May. Varsovie.

Monti D., Legendre P. Soumis. Shifts between biotic and physical driving forces of species organization under natural flow regimes. Canadian Journal of Fisheries and aquatic sciences, manuscript number 20707, 5 août 2008.

Fiche N° 19

Nom : OMRANE Prénom: Abdennebi

Qualité : MCF (HDR)

Composante : UAG, UFR Sciences Exactes et Naturelles

CNU ou profession : 26-25


UEC35, Semestre 3


Je suis enseignant chercheur en mathématiques appliquées. Je travaille sur le domaine de contrôle optimal et celui des lois de conservation. Voici quelques unes de mes publications au cours des 4 dernières années (2003-2007):

1) O. Nakoulima, A. Omrane, J. Vélin: On the Pareto control and No-regret control for distributed systems of incomplete data, SIAM J. Control Optim. 42/4 (2003) 1167-1184.

1.1. R. Dorville, O. Nakoulima, A. Omrane : Contrôle optimal pour les problèmes de contrôlabilité des systèmes distribués à données manquantes, C. R. Acad. Sci. Paris, Ser. I 338/12 (2004) 921-924.

2.1. R. Dorville, O. Nakoulima, A. Omrane : Low-Regret Control of Singular Distributed Systems : The Ill--posed Backwards Heat Problem, Applied Mathematics Letters 17/5 (2004) 549-552.

3.1. A. Omrane : Error estimates for scalar conservation laws by a kinetic point of view, Int. Journal of Mathematics and Mathematical Sciences, doi:10.1155/IJMMS/2006/41510 (2006).

4.1. R. Dorville, O. Nakoulima, A. Omrane: On the control of ill-posed distributed parameter systems. ESAIM:Proceedings, 17 (2007) 56-66.

5.1. Y. Miloudi, O. Nakoulima, A. Omrane: A method for detecting pollution in dissipative systems of incomplete data. ESAIM:Proceedings, 17 (2007) 67-79.

6.1. Y. Miloudi, O. Nakoulima, A. Omrane: On the instantaneous sentinels for distributed systems of incomplete data, Inverse Problems in Science and Engineering (accepté).-

Fiche N° 20

Nom : Ozier-Lafontaine Prénom : Harry



CNU ou profession : Directeur de Recherche

Responsable du parcours a : Ingénierie des Agrosystèmes

Responsable du parcours Ingéniérie des Ecosystèmes

Responsable de l’UEP31a : Ingéniérie agro-écologique


- Doctorat en Agronomie & Milieu Physique (INA-PG, 1992)

- 20 ans de recherches consacrées i) au fonctionnement hydrique des plantes et ii) au fonctionnement de cultures associées, notamment au fonctionnement souterrain (une trentaine de publications de rang A)

- Directeur d’une Unité de recherche INRA depuis 2001

- HDR obtenue en 2001

- Directeur de recherche en 2004

- Membre de la Commission de Spécialistes de l’UAG (sections 65 et 67)

- Enseignement dans le cadre de formations de 3ème cycle à l’UAG (Magistère, MST, DESS, DEA, Master) depuis 1993

- Encadrement d’une dizaine de thèses, d’une quinzaine de DEA ou équivalents depuis 1993

- Cinq publications significatives :

[5] Ozier-Lafontaine H., Cabidoche Y.-M., 1995 - THERESA : II. Thickness variations of vertisols for indicating water status in soil and plants. Agricultural Water Management 28, 149-161.

[6] Ozier-lafontaine H., Lecompte F., Sillon J. F., 1999 - Fractal analysis of the root architecture of Gliricidia Sepium for the spatial prediction of root branching, size and mass. Model development and evaluation in agroforestry. Plant and Soil 209: 167-180.

[7] Ozier-Lafontaine H., Lafolie F., Bruckler L., Tournebize R., Mollier A., 1998 - Modeling competition for water in intercrops : theory and comparison with field experiments. Plant and Soil 204, 183-201.

[8] Ozier-Lafontaine, H., and Bajazet, T. 2005. Analysis of root growth by impedance spectroscopy (EIS). Plant and Soil, 277: 299-313.

[9] Malézieux, E. ; Crozat, Y. ; Dupraz, C. ; Laurans, M. ; Makowski, D. ; Ozier-Lafontaine, H. ; Rapidel, B. ; de Tourdonnet, S. ; Valantin-Morison, M. (sp2008). “Mixing plant species in cropping systems: concepts, tools and models. A review” Agronomy for Sustainable Development. (numéro spécial : Available online at: http://www.agronomy-journal.org DOI: 10.1051/agro:2007057: 20 p.

Fiche N° 21

Nom : Rousteau Prénom : Alain

Qualité : MCF(HDR)……..

Composante : Faculté des Sciences Exactes et Naturelles, Campus de Fouillole

CNU ou profession : Biologie des Populations et Ecologie (67)


1/ MS1 : UEO 12 Biodiversité tropicale

2/ MS2 : UEP 31b Origine et maintien de la biodiversité (associé à Bruno Hérault)

3/ MS2 : UEP 33b Botanique évolutive (associé à Daniel Imbert)


Travaux de recherche :

- morphologie végétale, portant en particulier sur les plantules,

- caractérisation floristique et structurale, des forêts naturelles antillaises,

- dynamique forestière,

- dynamique de la biodiversité, statistiques spatiales.

Valorisation de la recherche :

- Mise en évidence et protection du patrimoine végétal antillais à travers la mise en place d’un conservatoire botanique aux Antilles françaises.

- Carte écologique de la Guadeloupe

- Livre rouge des espèces végétales menacées aux Antilles françaises.

- Participations (CSRPN, conseil scientifique du Parc National, comité consultatif de la réserve naturelle de Petite-Terre…)

Références

Prugnolle F., Rousteau A. & Belin-Depoux M. 2000. Occupation spatiale de Cyathea muricata Willd. (Cyatheaeceae) en forêt dense humide guadeloupéenne. I – A l’échelle de l’individu. Acta Botanica Gallica 147 (4) : 361-374.

Prugnolle F., Rousteau A. & Belin-Depoux M. 2001. Occupation spatiale de Cyathea muricata Willd. (Cyatheaeceae) en forêt dense humide guadeloupéenne. II – A l’échelle de la population. Acta Botanica Gallica 148 (2) : 81-91.

Rousteau A. 2004- Régénération forestière dans les espaces protégés littoraux : variété des processus naturels ou anomalies menaçant la pérennité des écosystèmes ? Revue d’Ecologie Terre et Vie 59 : 203-211.

Bâ A.M., Samba R., Sylla S., Le Roux C., Neyra M., Rousteau A., Imbert D. & Toribio A. 2004- Caractérisation de la diversité des microorganismes symbiotiques de Pterocarpus officinalis dans des forêts marécageuses de Guadeloupe et Martinique. Revue d’Ecologie (Terre Vie) 59 : 163-170.

Koponen P., Nygren P., Sabatier D., Rousteau A. & Saur E. 2004- Tree species diversity and forest structure in relation to microtopography in a tropical swamp freshwater forest in French Guiana. Plant Ecology 173 (1): 17-32.

Molia S., Frebling M., Vachiéry N., Pinarello V., Petitclerc M., Rousteau A., Martinez D. & Lefrançois T. 2008- Amblyomma variegatum in cattle in Marie Galante, French Antilles: prevalence, control measures, and infection by Ehrlichia ruminantium. Veterinary Parasitology 153 : 338-346.

Fiche N° 22

Nom : TROUPÉ Prénom : Marylène

Qualité : Maître de Conférences

Composante : Université des Antilles et de la Guyane – UFR Sciences Exactes et Naturelles – Département de Mathématiques-Informatique – Equipe GRIMAAG (EA3590)



1/ UEC14 – Semestre 1 (ECOTROP)

2/ UEOMA402 – Probabilités et statistiques (Master MAMO – MS1)


Collaborations

· Depuis 2004 - Université de Sherbrooke, CANADA. Travail des statisticiens de GRIMAAG avec le professeur Bernard Colin, sur l'information mutuelle et le codage optimal de variables.

· Depuis 2007 - Université de Bretagne Sud, FRANCE. Travail avec M. Evans Gouno, enseignant-chercheur, sur l'inférence bayésienne pour les processus ponctuels partiellement observés.

Communications

· Troupé M., Colin B., Vaillant J. (2004) Optimal coding and Interaction study. XIVth Symposium International on Mathematical Methods Applied to the Sciences, San Jose (COSTA RICA).

· Vaillant J., Jacquet O., Troupé M., Edon C. (2005). Statistique d’un modéle d’infestation spatio-temporel. Colloque "Statistique des Processus, applications au Traitement du Signal et de l’Image",

Angers (FRANCE)- 26-28 sept. 2005.

· Vaillant J., Jacquet O., Troupé M., Edon C. (2006). Mathematical modelling of within-field propagation of a desease and its insect vector. 38èmes Journées de Statistique de la SFdS, Clamart (FRANCE) - 29 mai au 02 Juin 2006.

· Troupé M., Vaillant J., Gouno E., (2008). Bayesian inference for auto-excited point processes observed partially. 40èmes Journées de Statistique de la SFdS et 36èmes Journées de Statistique de la SSC, Ottawa (CANADA) - 26-29 mai 2008 Ottawa (Canada).

Fiche N° 23

Nom : VAILLANT Prénom : Jean

Qualité : Pr .

Composante : UFR SEN



UEC25, semestre 1


-

L. Foucan and J. Vaillant, 2007 : Hypertension in the metabolic syndrom among Carbbean non biabetic subjects. Arch. Ma.l Coeur Vaiss., 100, 649-653

J.-H Daugrois, C. Edon, J. Vaillant, J.-C. Girard, P. Rott, 2007 : Status of Sugarcane yellow leaf virus in commercial fields and risk assessment in Guadeloupe. 26th ISSCT congress, Durban, July 2007.

R.Brithmer et J. Vaillant, 2006 : Utilisation de la réponse radiométrique d'une image SPOT1 : une approche statistique sur la croissance et le rendement de parcelles de cannes à sucre. In La Caraïbe, données environnementales, Editions Karthala, Paris.-

-

L. Foucan and J. Vaillant, 2006: Force de l’hypertension artérielle dans le syndrome métabolique chez les sujets non diabétiques dans une population Caribéenne. XXVIème journée de l'Hypertension Artérielle, Paris, Décembre 2006.-

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L. Célini and J. Vaillant, 2004 : A model of temporal distribution of Aphis gossypii (Glover) (Hemiptera, Aphididae) on cotton. Journal of Applied Entomology, 128, 133-139.

--

-

ANNEXE 2

Les Enseignements transversaux :

UE complémentaires / Organisation

Chacun des 3 premiers semestres (MS1, MS2, MS3) comportera un maximum de 5 UE.

Au plus 4 de ces UE sont consacrées à des savoirs, fondamentaux ou à caractère professionnalisant ou permettant une orientation (MS2 et MS3).

La dernière UE, dite UE complémentaire, est consacrée à des savoirs transversaux.

(Chacune de ces 03 UE complémentaires (MS1, MS2, MS3) aura, un volume horaire de 48h, un coefficient 1, une valeur de 05 ECTS et sera décomposée en deux EC de 24h.

( La première EC sera consacrée à une langue vivante étrangère (LVE), dont l’organisation et le contenu visent la délivrance du CLES 2.

La délivrance du diplôme de master est conditionnée soit à l’obtention de la certification CLES 2, soit à l’obtention d’une moyenne arithmétique de 10/20 minimum, sur l’ensemble des 03 EC de LVE.

Le RGCCA de Master sera adapté à cet effet pour tenir compte de l’arrêté master.

( La deuxième EC sera consacrée à un autre enseignement complémentaire dont le choix est déterminé par l’équipe pédagogique de chaque mention de master.

Ce choix sera opéré, pour chaque semestre, dans le cadre de l’acquisition d’une compétence transversale et dans un objectif de mutualisation des enseignements au sein d’un même domaine.

Les choix possibles peuvent être : La méthodologie documentaire ou autre, des outils informatique et multimédia spécifiques, un TER (travail d’études et de recherche), un stage, un enseignement visant une insertion professionnelle dans un secteur précis, un enseignement de culture générale ou scientifique en lien avec le champ disciplinaire,…

Cet EC pourrait en particulier permettre de dispenser des compléments nécessaires aux étudiants qui s’inscrivent dans une démarche de concours dans le secteur « métiers de l’enseignement »

( La configuration de cette UE sera la suivante, pour chacun des semestres 1 à 3 :

UEC

LVE / 24h / 2,5 ECTS

AEC / 24h / 2,5 ECTS

AEC : Autre Enseignement Complémentaire

LVE : Langue vivante étrangère.

( Sur l’ensemble du cursus master, la valeur en ECTS des UE complémentaires serait de 15 (soit un peu plus de 12% du total des crédits) dont la moitié pour la LVE.

ANNEXE 3

FICHES DESCRIPTIVES des UE

1. Les UE Complémentaires

2. Une fiche par UE de savoirs fondamentaux ou à caractères professionnels.

1/ UE Complémentaires

Unité d’enseignement complémentaire du semestre 1 : 05 ECTS UECMS1

EC1 : LVEMS1

Anglais scientifique 1

24 h (TD)

02,5 ECTS

Objectif du programme :

Perfectionnement de la pratique de la langue en environnement scientifique

Résumé du programme :

- expression écrite : traduction d’articles scientifiques, rédaction libre ou résumés d’articles

- expression orale : anglais conversationnel (lecture publique, discussions et débats thématiques)

Qualité des Intervenants : 1 PRAG

EC2 : AECMS1

Outils mathématiques 1

24h (10h CM, 14h TP)

02,5 ECTS

Objectifs du programme :

Initier l'étudiant à la pratique de la statistique exploratoire multidimensionnelle. Au terme du cours, l'étudiant devrait connaître les conditions d'application et de validité des méthodes factorielles classiques, apprendre à adopter la bonne démarche face à des données environnementales.


Analyse en composantes principales

Analyse factorielle des correspondances

Méthodes de classification

Analyse discriminante

Qualité des Intervenants : 1 MCF


EC1 : LVEMS2


24 h

02,5 ECTS


Perfectionnement de la pratique de la langue en environnement scientifique


- expression écrite : traduction d’articles scientifiques, rédaction libre ou résumés d’articles

- expression orale : anglais conversationnel (lecture publique, discussions et débats thématiques)

Qualité des Intervenants : 1 PRAG

EC2 : AECMS2


24h

02,5 ECTS

Objectifs du programme :

Il s’agit d’initier les étudiants aux méthodes de la Statistique Descriptive et de la Statistique Inférentielle, être familier avec les concepts de la planification expérimentale, et des enquêtes par échantillonnage. Connaître les outils d'analyse statistique de dispositifs expérimentaux classiques et des données spatiales.


Statistiques non paramétriques, protocoles expérimentaux et enquêtes, statistiques spatiales

Qualité des Intervenants : 1 PR


EC1 : LVEMS3


24 h

02,5 ECTS


Maîtrise de l’anglais scientifique


- expression écrite : rédaction de résumés d’articles et de notes synthèses

- expression orale : anglais conversationnel (exposés et participation à des séminaires exclusivement en anglais)

Qualité des Intervenants : 1 PRAG ou vacataire anglophone

EC2 : AECMS3


24h

02,5 ECTS


Statistiques : Analyses canoniques : liens avec d’autres méthodes d’analyse de données (analyse des correspondances, analyse discriminante, régression multiple…)

Modélisation : Analyse compartimentale, modèles d’interactions, Systèmes différentiels linéarisés.

Qualité des Intervenants : 2 MCF

2/ UE Fondamentaux ou à Caractères Professionnels

UEO11 : Introduction aux milieux physiques tropicaux

1) Responsable : F. BUSSIERE (fiche individuelle : 6)

2) Liste des spécialités ou autres mentions dont l’UE fait partie:

Spécialité ou mention

ECTS

Coeff.

Semestre

Statut

Master Ecologie, spécialité ECOTROP

(UE Mutualisé en partie avec le Master de Physique-Energétique)

8

1,5

S1

Ossature Obligatoire

Type de statut : Ossature Obligatoire ; Ossature au choix ; Parcours obligatoire ; Parcours au choix

3) Objectifs : (Décrire les objectifs en terme de savoirs et de compétences acquises)

Donner aux étudiants les capacités de comprendre le fonctionnement des écosystèmes face aux ressources et contraintes, parfois drastiques, des milieux tropicaux.

4) Pré-requis (le cas échéant) :

Cette UE risque de poser quelques difficultés aux étudiants ne disposant pas de solides connaissances de base en physique et physico-chimie.

5) Contenu de l’UE :

Intitulé des EC

(réduire le nombre de lignes selon le nombre d’E C)

Préciser :

- Le Programme succinct

- La Nature des enseignements (CM,TD,TP, travail personnel, ..)

- Le Volume horaire

ECTS

EC111 Climatologie et bioclimatologie tropicale

Resp. F. Bussière

Les interactions entre circulations atmosphérique et océanique sont présentées, y compris leurs inflexions possibles dans le cadre du changement global, ainsi que leurs conséquences sur les régimes thermiques et pluviométriques. Les bases de la bioclimatologie sont abordées : bilan hydrique, énergétique, et carboné des interfaces écosystèmes-atmosphère.

21h CM, 4 h TD

3

EC112 Cycles biogéochimiques

Resp. Y.M. Cabidoche, J. Sierra

Le cycle de l’eau, dans des conditions climatiques contrastées, est confronté aux ressources minérales, pour aboutir à la disponibilité des principaux bio-éléments, mais aussi des ETM. La « séquestration » du carbone est traitée.

11 h CM, 4 h TD

2

EC113 Orogenèse et pédogenèse tropicales

Resp. YM Cabidoche

L’évolution des reliefs sous l’influence de l’érosion physique et chimique est traitée dans les milieux tropicaux continentaux et insulaires, ainsi que les sédimentations résultantes. Le cadre géodynamique externe et géochimique est appliqué à la formation des sols et substrats marins, ainsi qu’au développement de leurs propriétés de support des peuplements, et de biotopes. Les concepts sont ancrés à mis parcours sur une tournée de terrain en Guadeloupe.

27 h CM, 8 h TD

3

6) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en F. C.) :

L’essentiel de l’enseignement se fait sous forme de cours magistraux. Les TD s’appuient sur les milieux contrastés qu’offre la Guadeloupe sur une petite superficie, et sur les installations de la recherche agronomique.

7) Type d’évaluation retenue (A harmoniser au niveau de la mention et du domaine)

Examen en fin de semestre, écrit.

8) Qualité des Autres Intervenants dans l’UE : (indiquer le nombre et la qualité des intervenants : enseignants chercheurs, enseignants de lycée, missionnaires, professionnels, autres que le responsable)

2 DR2 INRA

1 PR de Physique atmosphérique UAG

UEO12 : Biodiversité tropicale

1) Responsable : Alain Rousteau (fiche individuelle : 21)



ECTS

Coeff.

Semestre

Statut


7

1,5

MS1

Ossature


L’UEO12 doit d’abord définir la diversité du monde vivant, incluant les différentes expressions de cette diversité : diversité taxonomique, diversité organisationnelle, diversité des fonctions, diversité infraspécifique, diversité génétique. L’UE12 doit aussi fournir les outils pour comprendre l’origine de la diversité, ses rapports à l’environnement, ses fonctions et ses limites. Enfin l’enseignement prodigué inclut l’applications des connaissances à l’utilisation des ressources génétiques et à la biologie de la conservation.



Intitulé des EC


Préciser :



- Le Volume horaire

ECTS

EC121 : Les biomes tropicaux

Resp : A. Rousteau

1- Notions de biogéographie, concept de biodiversité, diversité des formes de vie, les principaux biomes. Biogéographie insulaire. Causes et enjeux de la biodiversité tropicale.

2- Relations aires-espèces. Le peuplements des îles, métapopulations et fragmentation. La définition des communautés, sa représentation cartographique.

3- Conservation : invasion, restauration, réintroduction, hot spots, aires protégées.

CM 22 TD 15

3,5

EC122 : Diversité génétique

Resp : JY. Hoarau

1- Structure génétique des populations, modèles en génétique, fitness, dérive génétique, sélection naturelle, spéciation.

2- Description génétique d’une population, effets génétiques élémentaires, génétique des caractères quantitatifs, parenté et consanguinité, estimations des paramètres génétiques, la sélection.

3- Application à la génétique de la conservation, dépression de consanguinité, introgression

CM 27h TD 8h

3,5

6) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en F. C.) : L’essentiel des enseignements sont dispensés sous forme de cours magistraux. Les travaux dirigés complètent les cours en permettant l’application des connaissances à problèmes réels (cartographie écologique, génétique de populations menacées)


Examen écrit en fin de semestre


1 MCF (UAG), 1 CR CIRAD

UEO13 : Ecologie générale

1) Responsable : Gladys Loranger-Merciris (fiche individuelle : 16)



ECTS

Coeff.

Semestre

Statut


10

2

MS1




Cette unité d’enseignement fournit aux étudiants les bases nécessaires en écologie fonctionnelle et appliquée.



Intitulé des EC


Préciser :



- Le Volume horaire

ECTS

EC 131 Structure et dynamique des écosystèmes

Responsable : D. Imbert

- L’écologie des écosystèmes est abordée à travers les concepts fondamentaux suivants : concept d’écosystème et ses fondements théoriques, théorie de la niche, niveaux de perception en écologie, stabilité des systèmes et notion de climax, perturbations et successions écologiques, écologie des paysages.

- 20 h CM.

2,5

EC132 Structure et dynamique des populations

Responsable : D. Monti

- Les notions de base nécessaires à l’étude de la dynamique des populations animales et végétales sont abordées : descripteurs, stratégies d’échantillonnage, capture et recapture, relations entre taille et âge, taille et poids, processus démographiques (distributions, cohortes, mortalité, recrutement, croissance, production…), successions, interactions dans le domaine végétal, aires de distribution, notion de stock et son exploitation.

- 20 h CM

2,5

EC133 Ecologie fonctionnelle des sols

Responsable : G. Loranger-Merciris

- Le but de cet enseignement est de donner des bases indispensables en écologie fonctionnelle des sols qui permettent de mieux appréhender le fonctionnement global des écosystèmes terrestres. Les concepts abordés sont les suivants : biocénose du sol et techniques d’étude, classification fonctionnelle des organismes du sol, interactions écologiques au sein de la biocénose du sol (associations plantes-microorganismes, fonctionnement de la rhizosphère, boucle microbienne, prédation, mutualisme, compétition, réseaux trophiques), cycle des nutriments dans le sol.

- 20 h CM

2,5

EC134 Introduction à l’écotoxicologie 1

Responsable : Soazig Lemoine

- Cet enseignement permet d’acquérir des notions de bases en écotoxicologie environnementale en abordant les concepts suivants : évaluation des risques toxiques et écotoxiques, approches théoriques et pratiques des essais écotoxicologiques de laboratoire (tests sur les microalgues, le ver de terre, les daphnies, bioessais…), principaux effets physiotoxicologiques induits par l’exposition à des polluants (plantes et animaux), techniques d’observation des effets toxiques dans des systèmes naturels, évaluation du risque pour les écosystèmes.

- 16h de CM et 4h de TP

2,5

6) Modalités pédagogiques retenues pour l'UE (dont enseignement non présentiel et mode d'accompagnement en F. C.) : L’enseignement se fait principalement sous forme de cours magistraux.


Examen en fin de semestre, écrit.


5 MC UAG, 1 Pr UAG

UEO 21 Ecosystèmes tropicaux

1) Responsable : DULORMNE Maguy (fiche individuelle No 9)



ECTS

Coeff.

Semestre

Statut


7,5

1,5

MS2




Renforcer les notions de bases sur le fonctionnement des écosystèmes terrestres et aquatiques, naturels et anthropisés, par une approche intégrée (théorique et pratique) qui devrait permettre un choix éclairé du parcours en Master 2


Concepts de base en écologie


Intitulé des EC


Préciser :



- Le Volume horaire

ECTS

EC211 Ecosystèmes naturels continentaux

Resp D. Imbert

Cet enseignement est conçu en continuité avec l'enseignement théorique dispensé dans l'EC 131. Les étudiants seront amenés à appliquer aux principaux écosystèmes terrestres (forêt dense humide, forêt sèche, forêts inondables) et aux milieux dulçaquicoles des Antilles, les concepts et méthodes relatifs à l'approche écosystémique.

TD : 23h - TP : 3h

2,5

EC 222 Ecosystèmes marins

Resp C. Bouchon

Etudes de cas sur les écosystèmes marins : mangrove, récif corallien, herbier de phanérogames marine

Cours 8h – TP 22 h

3

EC 223 Agrosystèmes

Resp M. Dulormne

Apparition des systèmes de culture et d'élevage. Concept de durabilité. Systèmes cultivés, monoculture, et agroforesterie. Interactions dans les agrosystèmes (plantes-pathogènes-auxiliaires-milieu abiotique-milieu naturel).

Cours 10h - TP: 3h

2



EC 221 et 222 : Evaluation des rapport écrits remis à l’issue des travaux réalisés sous forme de TD et TP

EC 223 Evaluation écrite en fin de semestre


4 MCF (UAG), 1 CR (INRA), 1 DR (INRA)

UEO22 : Physiologie et Écophysiologie Animales et Végétales

1) Responsable : ARCHIMEDE Harry (fiche individuelle n° 1)



ECTS

Coeff.

Semestre

Statut


2.5

1

MS2

Ossature



Approfondir les connaissances sur le fonctionnement du végétal (aux échelles de la plante et du peuplement) face à des contraintes édaphiques et environnementales, compléter les acquis sur l’écophysiologie des animaux en développant les phénomènes d’osmorégulation, de rythmes biologiques, de symbiose et de parasitisme.

Approfondir certaines fonctions physiologiques et mécanismes des animaux face aux contraintes du milieu


Notions de physiologie végétale et animale de Licence


Intitulé des EC


Préciser :



- Le Volume horaire

ECTS

EC 221 Ecophysiologie végétale

Resp. A. Bâ

Ecophysiologie du fonctionnement d’un peuplement cultivé.

Fonctionnement photosynthétique à l’échelle de la feuille, effet des facteurs environnementaux et mesure des flux de CO2 à l’échelle du couvert. Modélisation, capture et utilisation des ressources, fluorescence chlorophyllienne en situation de contraintes, discrimination isotopique naturelle. Apparition de stress oxydatif. Adaptation des plantes à des stress abiotiques (salinité, inondation, polluants telluriques) : aspects écophysiologique et moléculaire.

CM : 25h

2.5

EC222a Physiologie comparée des animaux

Resp. H. Archimède

Physiologie digestive, orientation des flux de nutriments entre les différentes fonctions, utilisation métabolique des nutriments et conséquences pour l’animal et son milieu. Adaptation aux stress environnementaux et conséquences sur certaines fonctions physiologiques

2.5

EC 222b Ecophysiologie animale

Resp. S. Gustave

CM : 25hOsmorégulation dans les environnements aqueux et terrestres. Rythmes biologiques. Symbioses et parasitisme : moyen d'acquisition de voies métaboliques nouvelles ; stabilité, spécificité et reconnaissance ; régulation de la population symbiotique ; symbiose et évolution. Parasites : mode de transmission et cycles biologiques, parasitisme et évolution. Symbioses sur les récifs coralliens : coraux, tridacnes, zooxanthelles.

CM : 25h

2.5


Cours magistraux et TD


Examen écrit basé sur des questions de cours, des synthèses de documents scientifiques, la rédaction d’un article de type scientifique sur un sujet donné.


1 PR (UAG), 1DR (INRA), 2 MCF (UAG), 3 CR (INRA), 2 IR (INRA)

UEP 23a : Introduction à l’agronomie

1) Responsable : Y.-M. Cabidoche ( fiche individuelle : 7)



ECTS

Coeff.

Semestre

Statut


7,5

1,5

S2

Parcours au choix



Cette UE de parcours est destinée à préparer les étudiants au parcours « Ingénierie des agrosystèmes » du M2. Elle fournit une première approche des objectifs, organisations et contraintes de l’exploitation des écosystèmes manipulés.



Intitulé des EC


Préciser :



- Le Volume horaire

ECTS

EC 231a Systèmes de production agricole

I. de Barros

Les différents systèmes de production agricole (conventionnel, organique, biologique, agriculture de précision, intégré) sont analysés, en particulier sous l’angle de l’économie des intrants, de leur caractère renouvelable, et de leur coûts énergétique et carboné.

15 h CM, 7 h TD

2,5

EC 232a Systèmes de culture et d’élevage

Y.M. Cabidoche, M. Mahieu

Les bases agronomiques de l’agriculture et de l’élevage sont fournies, notamment les techniques de production et de manipulation du milieu et leurs combinaisons, ainsi que les outils d’analyse du rendement et des performances de production.

20 h CM, 8 h TD

2,5

EC 233a Patho-systèmes

S. Guyader

Les interactions hôtes/pathogènes sont abordées sur quelques exemples, couvrant le végétal et l’animal ; la prévention et le traitement des pathologies sont abordés, avec un accent sur les risques environnementaux des traitements chimiques.

15 h CM, 4 h TD

2,5

habilitation - université des...

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