genetica di poplazione
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PRESENTATO DA
MOHAMED SARHAN
PROF.SSA. DONATA MARLETTA
CORSO DI GENETICA DI ANIMALE
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Pierce, GENETICA, Zanichelli editore S.p.A. Copyright
© 2005
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Principle of Hardy-Weinberg
Il valore di 2 si calcola come segue:
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Dispersive process, quantifiable,but with random direction
Decreases the level of variability in gene expressionwithin a population and increases the differencebetween populations
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UN INDIVIDUO CON UN DATO GENOTIPO
HANNO PROBABILITÀ DI ACCOPPIAMENTO
CON UN ALTRO
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“
”INBREEDING ED ETEROSI
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•MUTATION (SUBSTITUTIONS, DELETIONS, AND ADDITIONS OF NUCLEOTIDES)
•RECOMBINATION (EXCHANGE OF GENETIC MATERIAL BETWEEN MATERNAL AND PATERNAL CHROMOSOMES
DURING MEIOSIS)
•TRANSPOSITION OR TRANSLOCATION (DISPLACEMENT OF GENES FROM ONE TO THE OTHER PORTION OF
THE CHROMOSOME)
Individual Population
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ACCOPPIAMENTO DI DUE INDIVIDUI PARENTI
QUANDO UNO È DISCENDENTE DALL’ALTRO O
ENTRAMBI DISCENDONO DA UNO O PIÙ ASCENDENTI
COMUNI
LA SOMIGLIANZA TRA INDIVIDUI:PARENTELA E CONSANGUINEITA’
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L’INBREEDING DIMINUISCE L’ETEROZIGOSI
AUMENTA LA PROBABILITÀ DI COMPARSA DI ALLELI RECESSIVI
L’inbreeding è INEVITABILE nelle popolazioni di piccole
dimensioni
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La PARENTELA è la probabilità che 2 individui abbiano nel loro patrimonio genetico copie identiche
dello stesso allele derivanti da un antenato comune.
Ascendenza in linea diretta : tra figli e genitori,
nonni, bisnonni, ecc.
Ascendenza in linea collaterale: tra fratelli e sorelle, cugini, tra zii e nipoti.
Aij
Esprime la proporzione di geni in commune tra due animali (i e j) e dei relativi effetti genetici sul fenotipo
(effetti additivi).
Questo si tradurrà in una certa somiglianza dei loro fenotipi (caratteri morfologici e produzioni)
PARENTELA ADDITIVA
c
A
B
D
E
A
5° degree
c
B
D
E
3° degree
Il grado di parentela
si calcola tra due individui parenti
In linea diretta contando le
Fecondazioni che li separano
A
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Calcolo del coefficiente di parentela
n = generazioni in linea diretta
n’= generazioni in linea collaterale
1 2
3 4
5
Pedigree
la matrice di parentela (A)
Il pedigree ha 5 animali per cui A sarà una matrice di
dimensioni 5x5
Gli elementi della diagonale saranno pari a 1 + f, dove
f è il coefficiente di consanguineità del’individuo considerate
Gli elementi fuori della diagonale sono uguali al grado di
parentela R tra i diversi individui
La CONSANGUINEITA’
discende direttamente dalla parentela
è la probabilità che 1 individuo presenti, nel suo patrimonio genetico, due copie dello stesso allele
(omozigosi) derivanti, attraverso i suoi genitori, da uno, o più, loro antenati comuni.
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LA CONSANGUINEITA’ IN ZOOTECNIA Si distinguono 3 forme di riproduzione consanguinea:
1) Consanguineità stretta : gli animali sono parenti in 1°e 2° grado (inbreeding)
2) Consanguineità media: gli animali sono parenti in 3°e 4°grado (inbreeding)
3) Consanguineità larga : tra gli animali parentela lontana compresa tra il 5° e 10° grado (linebreeding).
la percentuale(% )di geni omozigoti
aumenta progressivamente con un ritmo
tanto più veloce quanto più stretta è la
parentela genetica degli individui che si
accoppiano.
CONSEGUENZE DELLA CONSANGUINEITA’
“le conseguenze
dell’accoppiamento fra parenti
sono la riduzione di statura, la
perdita di
robustezza costituzionale e di
fertilità, talvolta
accompagnate dalla tendenza alle
malformazioni”
CharlesDarwi
Aumento dell’omozigosi
Riduzione variabilità genetica entro razza
Comparsa anomalie genetiche
Aumento delle differenze fra razze
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Depressione da consanguineita’:
• RIDUZIONE vitalità delle produzioni
• RIDUZIONE FERTILITA’E LONGEVITA’
• AUMENTO DELLA MORTALITA’E MORBILIT A’
• DOVUTA A FATTORI GENETICI NON ADDITIVI
Coefficiente di consanguineità tra due individui è definito come la probabilità che due alleli estratti acaso dallo stesso locus siano uguali per discesa.
È pari alla metà del grado di parentela fra i genitori
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ACCOPPIAMENTO DI INDIVIDUI AVENTI UN COEFFICIENTE DI PARENTELA INFERIORE A QUELLO MEDIO
DELLA POPOLAZIONE
ACCOPPIAMENTO FRA INDIVIDUI DI RAZZE DIVERSE
INCROCIO
Conseguenze dell’Incrocio: • Aumento dell’eterozigosi
• Riduzione variabilità tra razze
• Comparsa dell’eterosi
• AUMENTO DELLA VITALITA’, FERTILITA’E LONGEVITA’
• MIGLIORAMENTO DEI PARAMETRI PRODUTTIVI
• DOVUTA A FATTORI GENETICI NON ADDITIVI
ETEROSI
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FINALITA’DELL’INCROCIO
• Ottenimento di animali con caratteristiche intermedie alle due linee parentali (bovini)
• Sfruttare l’eterosi (suini)
• Sfruttare la prolificità (ovini)
• Selezione (Frisona)
♂ Limousine
♀ Sarda
X
Incrocio Industriale o a due vie A x B
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Esempi di incrocio di sostituzione A x (A x AB)
♂Bruno
X
♀ Sarda
♂ ♀La razza Bruno-Sarda
♀ Sarda♂Modicano
X
♂ ♀
XX
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GENOMIC RELATIONSHIP METRICS WERE COMPUTED FOR 30,000ANIMALS OF 3 BREED
TO QUANTIFY FRACTIONS OF IDENTICAL ALLELE
JERSEY WERE MOST HOMOZYGOUS
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Brown Swiss
Holstein
Jersey
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Grazie
mille!