Variasi Genetik

UIN Maulana Malik Ibrahim Malang

Andik Wijayanto M.Si

TIK: Memahami variasi genetik, menumbuhkan sifat

berpikir ilmiah dan toleransi atas perbedaan

UIN Maulana Malik Ibrahim Malang

REVIEW

1. Apa saja bahan genetik itu?

a. untuk semua organisme?

b. virus?

2. Apakah DNA sama dg protein? 3. Apakah DNA dan asam amino semua organisme sama?

4. Apakah gen adalah DNA? protein adalah produk gen?

5. Apakah metabolisme sel/organisme dikendalikan langsung oleh gen?

6. Apa beda genotipe Vs fenotipe?

Apa itu variasi

genetik?

UIN Maulana Malik Ibrahim Malang WATER

NARRATIVE

هحخ

APAKAH PERBEDAAN TERJADI SECARA

KEBETULAN? TANPA ADA SEBAB?

TANPA ADA TUJUAN?

Mengapa ALLAH menciptakan

perbedaan?

Selaginella?

a

b c

f

d

e

Variasi genetik pada (Griffiths et al. 2005):

(a) Biji jagung (fotrografer: Travis Amos)

(b) Paprika

(c) Bunga jam 4

(d) Albino

(e) Manusia

(f ) Wortel

ا خلقناكم من ذكر وأنثى اس إن ها الن يا أي

وجعلناكم شعوبا وقبائل لتعارفوا

عليم خبير أتقاكم إن للا إن أكرمكم عند للا

Hai manusia, sesungguhnya Kami menciptakan kamu dari

seorang laki-laki dan seorang perempuan dan menjadikan

kamu berbangsa-bangsa dan bersuku-suku supaya kamu

saling kenal-mengenal. Sesungguhnya orang yang paling

mulia diantara kamu disisi Allah ialah orang yang paling

takwa diantara kamu. Sesungguhnya Allah Maha Mengetahui

lagi Maha Mengenal.

Tipe Variasi

a. Discontinuous Variation / Variasi Kualitatif

b. Continuous Variation / Variasi Kuantitatif

- Bersifat kualitatif (besar-kecil, halus-kasar,

kencang-keriput, hitam-putih, dll)

- Simple & mudah dianalisis

- Banyak dipakai oleh para peneliti zaman

dahulu

- Bersifat kuantitatif, bisa diukur / ada kisaran

(tinggi, berat, gradasi warna, dll)

- Lebih kompleks & rumit dianalisis

- Banyak dipakai oleh para peneliti zaman sekarang

terutama pemulia tanaman & hewan

1. Variasi Fenotipe

2. Variasi Genotipe

-Variasi pada tingkat gen atau kromosom

a. Single Nucleotide Polymorphysms

(SNPs)

b. Copy Number Variants (CNVs)

b. Variasi kromosom

Penyebab terjadinya Variasi

Perbedaan Genotipe

Perbedaan Lingkungan

- Mutasi

- Gene flow

- Sex -> rekombinasi

- Radiasi

- Angin

Fenotipe = Genotipe + Lingkungan

1. Mutasi

- Perubahan pada DNA

- Meskipun hanya 1 nukleotida yang

berubah, tapi dampaknya besar

- Bersifat random

- Apakah semua mutasi berdampak

pada evolusi?

A single germ line mutation can have a range

of effects:

1. No change occurs in phenotype.

Some mutations don't have any noticeable effect on

the phenotype of an organism. This can happen in

many situations: perhaps the mutation occurs in

a stretch of DNA with no function, or perhaps the

mutation occurs in a protein-coding region, but

ends up not affecting the amino acid sequence of

the protein.

2. Small change occurs in phenotype

A single mutation caused this cat’s ears to

curl backwards slightly.

2. Gen flow

3. Sex

- Perpindahan materi genetik dari

suatu populasi ke populasi lain

- Merubah frekuensi gen

dalam populasi

- Mobilitas

- rekombinasi

3. Big change occurs in phenotype.

Some really important phenotypic changes, like DDT resistance in insects are

sometimes caused by single mutations1. A single mutation can also have strong

negative effects for the organism. Mutations that cause the death of an

organism are called lethals—and it doesn't get more negative than that.

There are some sorts of changes that a single mutation, or even a lot of

mutations, could not cause. Neither mutations nor wishful thinking will make

pigs have wings; only pop culture could have created Teenage Mutant Ninja

Turtles—mutations could not have done it.

Bagaimana mengukur variasi genetik?

1. Frekuensi Alel Resesif

3. Koefisien Keragaman Genotipe

(qx) = √r/n

2. Frekuensi Alel Dominan (Px) = 1- qx

4. Koefisien Keragaman Fenotipe

- Warna, bentuk, ukuran, dll

- dari dulu – sekarang masih dipakai

+ : mudah dan murah

- : dipengaruhi lingkungan tidak stabil

jumlahnya terbatas dan menunggu waktu hingga marka itu

muncul

Penanda/Marka

1. Marka Morfologi/Fenotipe

2. Marka Biokimia

- protein, seperti isoenzim

- sifat isoenzim: kodominan persilangan

+ : tidak/sedikit dipengaruhi lingkungan

-: hanya diekspresikan pada organ dan waktu tertentu,

sehingga jumlahnya terbatas dan menunggu waktu hingga

marka itu muncul

3. Marka Molekuler

- Materi Genetik

+ : Stabil, tidak dipengaruhi lingkungan

- : relatif mahal

memerlukan keahlian khusus

Contoh:

SSR (Simple Sequence Repeat)

RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA)

AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism)

RFLP (Restriction Fragment Length Polymorphism)

Ingin mempelajarinya lebih mendalam?

Ambil saja TABM or Rekayasa Gentika or Biotek

ه الحق سنريهم آياتنا في الفاق وفي أنفسهم حتى يتبين لهم أن

ه على كل شيء شهيد أولم يكف بربك أن

Kami akan memperlihatkan kepada mereka tanda-tanda (kekuasaan) Kami

di segala penjuru dan pada diri mereka sendiri, hingga jelas bagi mereka

bahwa Al Quran itu adalah benar. Tiadakah cukup bahwa sesungguhnya

Tuhanmu menjadi saksi atas segala sesuatu?