galen claudia bärthel 08.01.2004. inhalt was ist galen? –entwicklung –komponenten top level...
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GALEN
Claudia Bärthel
08.01.2004
Inhalt
• Was ist GALEN?– Entwicklung– Komponenten
• Top Level Ontologie– Category Ontologie– Attribute Ontologie
Was ist GALEN?
• Generalized Architecture for Languages, Encyclopaedias and Nomenclatures in Medcine
• Repräsentation klinischer Information in neuer Art und Weise
• Neuartiges mehrsprachiges Kodiersystem für die Medizin
• Handhabbarkeit der Komplexität medizinischer Begriffsysteme
Was ist GALEN?
• Arbeitet unabhängig vom verwendeten Kodiersystem und verwendeter Eingabesprache
• Brücke zwischen Klassifikationssystemen und klinischen Anwendungen
Entwicklung
• 1992 - 1995– The GALEN Projekt
• 1995 - 1999– The GALEN-IN-USE Projekt
• 1999 –– OpenGALEN
The GALEN Project
• Basis: PEN&PAD Projekt der University of Manchester
• Finanziert durch Europäische Kommission• Bildung eines Konsortiums aus 11 Mitglieder
(UK, Schweiz, Niederlande, Schweden, Finnland, Deutschland und Italien)
• Entwicklung GRAIL und GALEN Referenzmodell
GALEN-IN-USE Projekt
• Förderung durch Europäische Kommission• Europäisches Referenzmodell für
medizinische Prozeduren• Unterstützung bei Entwicklung nationaler
Klassifikationen und Ontologien, Medikamentenlexika und chirurgische Prozeduren
• GRAIL-Implementationen
OpenGALEN
• Gegründet durch Universitäten Manchester u. Nijmengen
• Non-for-profit Organinsation
• Vorstand: Prof. Alan Rector, Prof. Pieter de Vries Robbe und Pieter Zanstra
Komponenten
• GALEN Common Reference Model
• GRAIL
• Terminologieserver
CORE Modell (1)
• Modell für medizinische Konzepte– Wiederverwendbar– Anwendungsunabhängig– Sprachunabhängig
• „Herz“ von GALEN
CORE Modell (2)
• Verwendung für– Elektronische Krankenakte– Klinische Benutzerschnittstellen– Klassifikations- und Kodiersysteme– Entscheidungsunterstützung– Wissens-Management-Systeme– Natürliche Sprachprozesse
CORE Modell (3)
GRAIL
• Basis für CORE Modell• Spezialisierte Beschreibunglogik• Entities
Categories Individuals
• Statements• Kriterien• Zusammengesetze Entitäten
Terminologieserver
High Level Ontologie
• Category Ontologie– Primary High Level Ontologie– Secondary High Level Ontologie
• Attribute Ontologie
High Level OntologieCategory Ontologie
Primary High Level OntologieCategory Ontologie
Primary High Level OntologieCategory Ontologie
Primary High Level OntologieCategory Ontologie
Primary High Level OntologieCategory Ontologie
• Ausdruck veränderlicher Eigenschaften durch Feature-State-Pairsz.B. Disease which hasFeature (Severity
which hasState severe)
• Selectors u. Statuses immer mit der Entität, die sie näher bestimmen, durch einzelnen semantischen Link verbundenz.B. Hand which hasLeftRightSelector right
Selection
Primary High Level OntologieCategory Ontologie
Secondary High Level OntologieCategory Ontologie
Secondary High Level OntologieCategory Ontologie
• Disease wird definiert als:Phenomenon which hasPathologicalStatus
pathological
• Disorder wird definiert als:Phenomenon which hasAbnormalityStatus
nonNormal
High Level OntologieAttribute Ontologie
• DomainAttribute
ConstructiveAttribute ModifierAttribute
TemporalAttribute
High Level OntologieAttribute Ontologie
• ConstructiveAttribute
PartitiveAttribute StructuralAttribute
FunctionalAttribute LocativeAttribute
z.B. (Phenomenon whichG <LocativeAttribute Heart hasPathologicalStatus phatological>) name Heart Disease
High Level OntologieAttribute Ontologie
High Level OntologieAttribute Ontologie
High Level OntologieAttribute Ontologie
High Level OntologieAttribute Ontologie
• ModifierAttributes
hasFeature hasState hasStatus
hasSelector hasModality
z.B. Disease which hasSeverityFeature (Severity which hasSeverityState severe)
High Level OntologieAttribute Ontologie
• Roles and RoleDesignatingAttributes– Roles
• XRole
– RoleDesignatingAttributes• playsXRole• hasXRole
Modelle basierend auf High Level Ontologie
• Chirurgische Prozeduren
• Anatomie
• Krankheiten
• Arzneimittel
GALEN Arzneimittel Ontologie