データベース活用のための基礎知識...
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概 要
2020年度
大学院基盤医科学実習「文献検索」
データベース活用のための基礎知識医学系データベースの概要
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基盤医科学実習「文献検索」の目的
医学系データベースの特徴を理解し、研究に必要な文献情報を効率よく引き出すスキルを習得する
データベースを検索して得た情報をもとに、論文を入手する方法を知る
はじめに
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基盤医科学実習「文献検索」
講義一覧
1. 概要
2. 医中誌Web
3. PubMed
4. Web of Science, JCR
5. OPAC 文献の取り寄せ
* 質問があればNUCTのチャット機能で問合せください !
はじめに
各動画の途中に「小テスト」が出題されます。NUCTで回答をしてください。
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名古屋大学医学部図書館のサイト
https://www.med.nagoya-u.ac.jp/medlib/
よく使うデータベースへのリンク
はじめに
過去の講習会の資料など
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概要
1.データベース活用のための基礎知識
2.医学系データベースの概要
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1.データベース活用のための基礎知識
1-1 検索の方針
1-2 検索語入力の留意点
1-3 論理演算
1-4 部分一致(truncation)
1-5 シソーラス(thesaurus)①同義語の整理 ②関連語の組織化
1-6 自動マッピング機能
1-7 検索のコツ
前提:漏れとノイズ
漏れ:検索結果に必要としている論文や本が含まれていないこと
ノイズ:検索結果に必要としていない論文や本が含まれていること
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所蔵データ
ノイズ
漏れ
必要論文 検索結果
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1-1 検索の方針
PICO…リサーチクエスチョンを定式化することができる枠組み
例「小児期に発症した成人喘息患者に対して、ステロイド剤の吸入は症状を緩和するか?」
P(Patient):喘息・成人
I(Intervention):ステロイド剤・吸入
C(comparison):他の治療
O(outcome):予後
1. データベース活用のための基礎知識
⇒検索
⇒検索
AND
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1-2 検索語入力の留意点
異なる表記形
癌-がん-ガン, tumor-tumour
同義語=言い換え
癌- 悪性腫瘍, cancer- tumor
語尾変化
biology-biological, kid-kids
1. データベース活用のための基礎知識
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1-3 論理演算
AND(論理積)
A AND B
OR (論理和)
A OR B
NOT(論理差)
A NOT B
BA
BA
BA
1. データベース活用のための基礎知識
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1-4 部分一致(truncation)
検索語(自然語)の一部を入力すると、同じ文字列をもつ文献を検索できる
*、?、$などの記号を前後に付与
前方一致 代謝* 代謝異常
中間一致 *代謝* 基礎代謝量
後方一致 *代謝 基礎代謝
※記号はデータベースによって異なるので注意する
医中誌Webのように記号付与が不要なデータベースもある
1. データベース活用のための基礎知識
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1-5 シソーラス(thesaurus)
データベースが持つ一種の類語集
同義語を「統制語」に統一する
階層構造を持つ
上位語-下位語
文献データは、シソーラスに基づいた統制語を付与されている
主なデータベースのシソーラス
PubMed・・・「MeSH」 Medical SubjectHeadings
医中誌Web・・・「シソーラス用語」
1. データベース活用のための基礎知識
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1-5 シソーラスの効果 ① 同義語の整理
統制語
Neoplasms
文献上の表現
CancerTumor
Neoplasm
MeSH
MeSHの例
統制語を使って検索することにより、言葉の表現の違いによる「検索もれ」を防ぐ
1. データベース活用のための基礎知識
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階層構造をもつ
位置づけを知ることにより、的確な統制語がわかる
下位の概念も一括して検索できる(オプション)
MeSHの階層構造(Tree Structures)
Neoplasms by Site [部位による…]
Thoracic Neoplasms [胸部…]
Respiratory Tract Neoplasms [気道…]
Lung Neoplasms [肺…]
Bronchial Neoplasms [気管支…]
Multiple Pulmonary Nodules [多発性肺結節…]
1-5 シソーラスの効果 ② 関連語の組織化
上位
下位
1. データベース活用のための基礎知識
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1-6 自動マッピング機能
シソーラスを持つデータベース特有の機能で自然語検索による「検索もれ」を防ぐ
自然語を入力すると、システムが自動的に適切な統制語を案内する(マッピング)
自然語と統制語の論理和検索になる
シソーラスにない場合は自然語単独で検索される
1. データベース活用のための基礎知識
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1-7 検索のコツ
検索を進めるときは 多い→ 少ない へ
検索結果0(ゼロ)件!→入力誤りでは?
精度の高い検索をするためにはシソーラスを活用する
自然語でとりあえず検索 → 検索結果で統制語を確認 → 統制語で再検索
1. データベース活用のための基礎知識
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2-1 概要
2-2 データベースへのアクセスとガイド
2-3 実習を行わないデータベースの紹介① EBM関連のデータベース UpToDate
② EBM関連のデータベース Cochrane Collection
③ EBSCOhost で利用できる他のデータベース
④ 日本の論文をさがす CiNii Articles
⑤ 大学図書館の本をさがす CiNii Books
⑥ 学術文献専用の無料サーチエンジン Google Scholar
2.医学系データベースの概要
20引用文献
ImpactFactor
論文記事
MEDLINE etc
日本語
MEDLINEのインターネット版 早い
← ↓ Web of Science と EBSCO から利用
EBM関連
CochraneCollection
最善の患者治療を支援
2-1 概要2.医学系データベースの概要
自宅からでも入手OK
名古屋大学電子ジャーナル・アクセスサービス
フルテキスト入手
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2-2 データベースへのアクセスとガイド ①
過去の講習会の資料など
よく使うデータベースへのリンク
https://www.med.nagoya-u.ac.jp/medlib/
2.医学系データベースの概要
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2-2 データベースへのアクセスとガイド ②
http://www.nul.nagoya-u.ac.jp/index.html
①②
2.医学系データベースの概要
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2-2 データベースへのアクセスとガイド ③
①
2.医学系データベースの概要
②
③
http://www.nul.nagoya-u.ac.jp/guide/gsheets/index.html
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2-3 実習を行わないデータベースの紹介①
EBM関連のデータベース UpToDate 1
日常の診療で生じる臨床上の疑問に対して、最新のエビデンスを使用し、具体的で実用的な回答を素早く容易に得るための臨床支援ツール
25の専門分野にわたる11,000件以上の臨床レビューには、9,500件を超える格付け推奨治療法が提供されている
(鶴舞キャンパス内のみ利用可)
https://www.uptodate.com/contents/search
2.医学系データベースの概要
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2-3 実習を行わないデータベースの紹介①
①
2.医学系データベースの概要
UpToDate 2
②
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UpToDate 3 検索画面
アカウントを取得する場合「登録」ボタンをクリック
検索語を入力して検索ボタンをクリック
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介①
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UpToDate 4 検索結果画面
2.医学系データベースの概要
結果を展開する
2-3 実習を行わないデータベースの紹介①
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UpToDate 5 トピックの表示例
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介①
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UpToDate 6 トピックの参考文献からフルテキスト入手
①
②
PubMed、PubMedID
③
④
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介①
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UpToDate 7 トピックで「図表」を表示
① ③
②
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介①
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EBM関連のデータベース Cochrane Collection 1
Cochrane共同計画は、1992年イギリスの国民保健サービスの一環として始まった、治療・予防に関する医療技術を評価するプロジェクト
Cochrane Collectionは、共同計画が作成するデータベースで、EBM(Evidence BasedMedicine)の実践を支援するデータベース
厳選されたデータのみで、収録件数は多くない
http://search.ebscohost.com/
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介②
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Cochrane Database of Systematic Reviews
システマティック・レビュー(ある医学的介入について、エビデンスを明らかにするために、一定基準で、世界中から論文を収集し、批判的評価、要約、公表するための方法)のフルテキストが入手できる
年4回更新
Cochrane Clinical Answers CDSRの質の高いエビデンスをQ&A形式で簡潔にまとめたもの
Cochrane Central Register of Controlled Trials 比較臨床試験の論文書誌情報データベース
Cochrane Methodology Register 比較臨床試験の方法に関する書誌データベース
Cochrane Collection 24つのデータベースが利用できます
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介②
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1.研究テーマの設定
2.研究結果を漏れなく収集
3.各研究の妥当性の評価
4.アブストラクトフォームに要約
5.メタアナリシスによる統計学的解析
6.結果の解釈
7.編集と定期的更新
システマティックレビューの手順
注: メタアナリシス(メタ分析)とは、過去に行われた複数の研究結果を統合して、より信頼性の高い結果を求めること、またはそのための手法や統計解析のこと
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介②
Cochrane Collection 3
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Cochrane Collection 4
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介②
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①利用したいデータベースをチェック(複数選択可)
②続行ボタンをクリック
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介②
Cochrane Collection 5
①
②
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Cochrane Collection 6Cochrane Database of Systematic Reviewsの検索
検索語を入力して「検索」ボタンをクリック
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介②
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Cochrane Collection 7検索結果からフルテキストを入手
①
2.医学系データベースの概要
「全文へのリンク」にチェック
③
②
2-3 実習を行わないデータベースの紹介②
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EBSCOhost で利用できる他の主なデータベース
MEDLINE (1809年~)
医学、看護学、薬学、歯学など医学系
PubMedと収録データ(5,600誌以上)はほぼ同じ。タイムラグあり
Academic Search Premier (1975 年以前 のPDFも
利用可能)
4,600 を超える学術誌の全文
*複数のデータベースの同時検索も可能
▼ 詳しい検索方法 「EBSCOhost2.0 検索ガイド」
http://www.nul.nagoya-u.ac.jp/db/guide-ebsco.pdf
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介③
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日本の論文をさがす CiNii Articles 1
学術論文データベース
学協会刊行物・大学研究紀要・国立国会図書館の雑誌記事索引
データベースなどの学術論文情報が検索できる
※ 医学分野の学術商業誌は収録対象外
収録件数:約 2,150万件(2019.3現在)
検索結果からフルテキストの入手可能(一部有料)
https://ci.nii.ac.jp/
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介④
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CiNii Articles 2 検索画面と結果一覧
フルテキストへのリンク
など
②
①
③
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介④
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CiNii Articles 3 検索結果からフルテキストを入手
①
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介④
②
③
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大学図書館の本をさがす CiNii Books
https://ci.nii.ac.jp/books/
切り替え①
② ③
全国の大学図書館等の所蔵情報が分かる
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介⑤
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学術文献専用の無料サーチエンジン Google Scholar
https://scholar.google.co.jp/
2.医学系データベースの概要
2-3 実習を行わないデータベースの紹介⑥
①被引用数が表示される
フルテキストへのリンク
②
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以上で「概要」を終わります。
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