fdt3
TRANSCRIPT
![Page 1: Fdt3](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022082921/55578d7dd8b42aa3378b4ae4/html5/thumbnails/1.jpg)
FDT probabilisztikus traktográfia 3.
1
2
3
5
6
1: a már feldolgozott, BedpostX-bedpostX könyvtár útvonala
2: SEED maszk. Esetünkben a Harvard-Oxford atlasz egy régiója.
3: A "seed space is not diffusion" kapcsoló beállitásával ÉS a NONLINEAR bekapcsolása jelzi azt, hogy nemlináris transzformáció történt (warp).
4: Két, ún. warp-field megadása kötelező. Az egyik a referenciaképet regisztrálja a diffúziós képhez, a másik ennek inverze (invwarp parancs).
ref2diff-warpdiff2ref-warp
(javasolt nomenklatura)
5-6: Classification targets. Több TARGET kijelölése, amelyekhez egyenként kiszámolja a SEED voxeleinek kapcsolati valószinüségét.
A TARGET maszkok listán történő
megadása is lehetséges, egy egyszerü text file szerkesztésével.
7: Traktográfia kimenő könyvtára..
Cél: SEED terület klasszifikációja TARGET régiók alapján. Olyan képek előállitása, amelyek a TARGET-be való eljutás valószinüségét mutatják a SEED terület minden voxelén. Lehetővé teszi a konnektivitás-alapú szegmentációt (find_the_biggest parancs).
Eredmények
fdt_paths.nii.gz : MINDEN, a SEEDből származó tract.
seeds_to_TARGET.nii.gz : minden egyes TARGET-hez tartozó SEED valószinüségi térkép.
targets.txt: a TARGETek neve.
waytotal.txt: összesitett részecskeszám
4
7
Egy "seeds_to_target" kép (thalamus - precentral gyrus kapcsolat)
![Page 2: Fdt3](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022082921/55578d7dd8b42aa3378b4ae4/html5/thumbnails/2.jpg)