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Expertise : la recherche d’informations et de
documents
PL ToutainUMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales
INRA/ENVT
ECOLENATIONALEVETERINAIRET O U L O U S E
Toulouse, le 28 novembre 2008
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Objectifs de la présentation
1. Identifier les différents types de sources documentaires et d’informations : sources originales et sources secondaires
2. Connaître les bases, plateformes et portails documentaires
3. Savoir utiliser les outils de recherche documentaire (moteur de recherche pour l’exploration des bases)
4. Dresser une liste de références correctement présentée et indexée
5. Se tenir informé par les flux RSS
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Comment se maintenir informé, Comment gérer le flot des informations
I ndustrie pharmaceutique
articles
Livres
I nternet
T.V.quotidiens
Conf érences
I ndustrie pharmaceutique
articles
Livres
I nternet
T.V.quotidiens
Conf érencesarticles
Livres
I nternet
T.V.quotidiens
Conf érences
L’expert clinicien ne peut pas suivre de façon prospective toute la littérature primaire pertinente de son domaine.
Il devra, pour l’essentiel, faire appel de façon rétrospective à des outils documentaires adaptés à son budget « temps »
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Le vocabulaire normalisé en documentation
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Masse de l’information biomédicale
Plusieurs centaines de milliers d’articles originaux
publiés chaque année, dans plusieurs milliers de
revues scientifiques et médicales, publiant de
quelques dizaines à quelques milliers de pages
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Une première idée : consulter les périodiques scientifiques
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Combien de journaux «vétérinaires»?
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Articles publiés dans l’ «American Journal of Physiology » en 2008:
N=2591
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Impossibilité de suivre sa bibliographie en feuilletant les revues et nécessité
d’avoir recours à des bases de données et des outils (moteurs de recherche)
pour les explorer
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Base de données (database)définition européenne
• Une base de données est « un recueil d'œuvres, de données ou d'autres éléments indépendants, disposés de manière systématique ou méthodique, et individuellement accessibles par des moyens électroniques ou par tout autre moyen » (Art. L.112-3 al.2 du code de la propriété intellectuelle)
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Pour s’y retrouver dans les bases de données
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Les bases de données utiles pour la médecine vétérinaires
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Les bases de données médicales
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Les bases de données juridiques
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Un premier exemple de recherche dans une base de
données (Medline) avec PubMed comme outil de
recherche
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Beaucoup de ces références ne concernent pas directement le cheval comme animal
Nombre total de références dans PubMed avec « horse » comme mots clés
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Nombre de références dans PubMed de «2008» à aujourd’hui avec «horse» comme mots clés
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Nombre de références dans PubMed de «2008» à aujourd’hui avec «horse» comme mots clés
et publiées dans l’ «American Journal of Veterinary Research»
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Nombre de références dans PubMed de « 2008 » à aujourd’hui avec « horse » comme mot-clé et publiées dans l’ « American Journal of Veterinary Research »
avec le mot « dexamethasone » dans le texte
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• Nécessité de poser les questions de façon appropriée pour ne pas être noyé par le nombre de références et savoir utiliser les filtres
Recherche dans les bases
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Types de sources documentaires
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Types de sources documentaires
• Sources primaires (originales)– Produites par les auteurs d’un travail de recherche
• Sources secondaires – Type Vulgarisation d’informations originales
• Souvent synthèse et simplification, en fonction du lectorat visé (public large, étudiants, découverte du sujet…)
– Type Méta-analyses et revues systématiques• Visant les professionnels , focalisées, informations
opérationnelles
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1. Sources secondaires de vulgarisation
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• Périodiques spécialisés en formation continue
–Compendium on Continuing Education for the Practicing Veterinarian
https://secure.vetlearn.com/pvsearch.cfm–Veterinary Clinics of North Americahttp://www.us.elsevierhealth.com/product.jsp?isbn=01955616–Encyclopédie médico-chirurgicale (EMC)
vétérinairehttp://www.elsevier.fr/html/dettraiteF.cfm?code=FVET
Articles de formation continue professionnelle
Sources secondaires (vulgarisation)
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Sources secondaires: Wikipedia
Informations différentes selon les langues; non validées
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Les ressources « sœurs » de Wikipedia
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• Le site web d'IVIS propose une large collection d'articles, de comptes rendus, de comptes rendus de conférences (proceedings) et de documents interactifs, ressources particulièrement précieuses pour des étudiants. La newsletter d'IVIS informe nos membres des nouveaux documents publiés sur le site (cliquez ici).
Tous les mois nous publions de nouveaux chapitres dans notre bibliothèque qui embrassent une large variété de disciplines et d'espèces (voir " Recent Additions"). Nos publications les plus récentes concernent :- la médecine clinique aviaire- la dermatologie des petits animaux- l'anesthésie et l'analgésie des animaux de compagnie- les maladies des chèvres et- Maladies respiratoires equines
Voici nos comptes rendus de conférence les plus récents, disponibles dans la section "Proceedings" : American Association of Equine Practitioners - AAEPAmerican College of Veterinary Pathologists - ACVPAmerican Academy of Veterinary Pharmacology and Therapeutics - AAVPTNAVC - North American Veterinary Conference Italian Association of Equine Veterinarians - SIVEWorld Buiatrics Congress - WBCGeneva Congress on Equine Surgery and MedicineWorld Equine Airways Symposium - WEASEuropean Society of Veterinary Orthopaedics and Traumatology - ESVOTEuropean Association of Veterinary Diagnostic Imaging - EAVDICanine Cancer Conference: Genes, Dogs, and CancerCongress of the Italian Association of Companion Animal Veterinarians - SCIVACWSAVA - World Small Animal Veterinary Association Annual CongressInternational Congress on Yak et beaucoup d'autres : cliquez ici pour voir la liste complète.
Les autres domaines de la bibliothèque d'IVIS recouvrent l'anesthésiologie, la reproduction, la chirurgie, la parasitologie, les maladies infectieuses, l'immunologie, la neurologie, et la la gastroentérologie.
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Moodle
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Sources secondaires: les cours en ligne de l’ENVT
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Sources secondaires: les cours en ligne de l’ENVT
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Enseignements et documents relatifs à la documentation et à la communication
scientifiques et médicales, depuis l'initiation (A1) jusqu'à l'approfondissement (Internat)
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Enseignements et documents relatifs à la documentation et à la communication
scientifiques et médicales, depuis l'initiation (A1) jusqu'à l'approfondissement (Internat)
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Pour retrouver la première partie de la conférence sur l’expertise
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Pour retrouver la première partie de la conférence sur l’expertise
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Pour retrouver la première partie de la conférence sur l’expertise
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Les archives ouvertes de Toulouse
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Les archives ouvertesLes références de l’Ecole n=827
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Les thèses vétérinaires sont en libre accès (OATAO pour Toulouse)
![Page 41: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/41.jpg)
Sources secondaires: la presse professionnelle
• Hebdomadaire d’informations professionnelles vivant à plus de 90% des annonceurs– Publicités– Publicité rédactionnelle
• Un site internet associé : Planetevet http://www.planete-vet.com/
– (accès restreint)
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2. Sources secondaires de méta-analyses
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Sélection de ressources pour l’EBM
![Page 44: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/44.jpg)
Revues méthodiques & méta-analyses
Méta-analyseRevue systématique
Essai 1
Essai 2
Essai 3
Essai 4
Méta-analyses et revues méthodiques sont réalisées par des spécialistes de ce type de travail et selon une méthodologie formalisée
La méta-analyse peut faire appel à des outils statistiques capables de créer de la nouvelle information à partir des documents primaires
(ex: rendre significatif des résultats qui individuellement ne l’étaient pas)
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La bibliothèque Cochrane (présentation en français)
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La bibliothèque Cochrane
![Page 47: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/47.jpg)
La bibliothèque Cochrane
• La Cochrane Library a pour objectif d'assurer la dissémination des résultats des essais cliniques et des méta-analyses par la création d'une base de données évaluant les interventions médicales, préventives et thérapeutiques ainsi que les performances des tests diagnostiques.
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Caractéristiques de la bibliothèque Cochrane
• Pertinente sur le plan clinique
• Indépendante
• Actualisée
• Systématique– Revues systématiques et méta-analyse
![Page 49: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/49.jpg)
La collaboration Cochrane
Préparer, tenir à jour, et diffuser les revues systématiques sur l'efficacité desthérapeutiques et des stratégies thérapeutiques
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La collaboration Cochrane
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L’exploration des bases de données
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Les ressources du NCBI
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Les outils d’exploration des bases de données accessibles gratuitement
1. PubMed
2. Google scholar
3. Scirus
4. Agricola
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PubMed
Interface utilisée pour interroger la base Medline
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PubMed: une vue générale
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PubMed: le tutoriel
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Limiter la recherche
• Les filtres permettent de limiter la recherche de documents sur certains critères comme les essais cliniques ne portant que sur l’homme ou au contraire des essais portant sur l’animal; pour l’homme on peut sortir les essais portant spécifiquement sur une tranche d’âge, sur des essais publiés entre deux dates etc.
• Pour appliquer ces limites, cliquez sur LIMITS
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PubMed: les filtres
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Pubmed: question sur un thème horse AND lameness
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Pubmed: question pour un auteurToutain PL AND antibiotics
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Pubmed: questionQuelles sont les publications de Cat (un auteur)
sur les antibiotiques? Cat [AU] AND antibiotics
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Je cherche un auteur dont le nom commence par Tout… et qui publie en pharmacologie:
utilisation du Wildcard *
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Je cherche un auteur dont le nom commence par Tout… et qui publie à
Toulouse
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Les autres bases de données gérées par PubMed: les substances chimiques
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PubMed :systematic review
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Google: recherche avancée
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Google: question horse AND laminitis AND corticosteroids
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Comment « préparer » une conférence Powerpoint sur le dopage du cheval en
quelques minutes
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Comment « préparer » une conférence Powerpoint sur le dopage du cheval en
quelques minutes
![Page 76: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/76.jpg)
Google: question & filtre PDF horse AND laminitis AND corticosteroids
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Google: question & filtre PDF horse AND laminitis AND corticosteroids
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Les outils Google
Conseil: Installer la barre d’outil et visiter « à propos de Google » pour découvrir toutes les bases spécialisées dont « Google Scholar »
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Google Scholar
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Google Scholar: Martineau + Pig
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Google Scholar: recherche avancée
![Page 82: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/82.jpg)
Google Scholar: question horse AND laminitis AND corticosteroids
& au moins triamcinolone acetonide
![Page 83: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/83.jpg)
Scirus
![Page 84: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/84.jpg)
HighWire
![Page 85: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/85.jpg)
Agricola
![Page 86: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/86.jpg)
Les bases et outils payants
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Le Web Of Knowledge
![Page 88: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/88.jpg)
Les bases de données de L’ISI Web Of Knowledge
![Page 89: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/89.jpg)
Web Of Knowledge: question horse AND laminitis AND corticosteroids
![Page 90: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/90.jpg)
Web Of Knowledge:les bases de données
![Page 91: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/91.jpg)
Web Of Knowledge horse AND laminitis AND corticosteroids
![Page 92: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/92.jpg)
Web Of Knowledgehorse AND 31076 (code postal ENVT)
![Page 93: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/93.jpg)
Web Of Knowledgehorse AND 31076 (code postal ENVT)
![Page 94: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/94.jpg)
Web Of Knowledgeque s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009
code postal:94700
Exclusion des articles de l’Afssa qui partage le même code postal
![Page 95: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/95.jpg)
Web Of Knowledgeque s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009
![Page 96: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/96.jpg)
Que s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009?et dans quels champs disciplinaires?
![Page 97: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/97.jpg)
Que s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009Quels nombre de citations?
Quels nombre d’autocitations? Quel H index?
![Page 98: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/98.jpg)
Que s’est-il publié à l’ENVA entre 2000 et 2009Les publications les plus citées
![Page 99: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/99.jpg)
Science Direct
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Comment se procurer un article original
• Quelques revues disponibles gratuitement sur Internet; Souvent 6-12 mois après parution
• Sites de journaux accessibles gratuitement – http://www.freemedicaljournals.com/
– http://www.gfmer.ch/Medical_journals/Free_medical.php
– http://www.medical-journals.com/
– http://highwire.stanford.edu/lists/freeart.dtl
• Ecrire à l’auteur et demander un tiré à part (adresse internet donnée)
• Acheter l’article (INIST)
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Inist
![Page 103: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/103.jpg)
Network pour PL Toutain
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Network pour PL Toutain
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Network pour Horse
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Find an expert
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Trouver un expert pour la triamcinolone acetonide
key words: chemical & drugs
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Trouver un expert pour la triamcinolone acetonide
![Page 109: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/109.jpg)
Trouver un expert pour la triamcinolone & triamcinolone acetonide
![Page 110: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/110.jpg)
Biomedexpertpossibilité d’y tenir à jour son CV
![Page 111: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/111.jpg)
Préparer une liste de références
• Doit comprendre :– toutes les sources qui ont été utilisées– seulement les sources qui ont été utilisées, c’est-à-dire
appelées dans le texte
• Doit utiliser exclusivement des sources validées• Doit être vérifiée avec les publications complètes
(jamais à partir d’une autre liste de références, ni d’une base de données et/ou de résumés)
• Doit donner toutes les indications qui permettent de retrouver la source
• Doit être ordonnée selon les recommandations de la publication à laquelle elle est destinée
![Page 112: Expertise : la recherche dinformations et de documents PL Toutain UMR 181 Physiopathologie et Toxicologie Expérimentales INRA/ENVT ECOLE NATIONALE VETERINAIRE](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081602/551d9d8c497959293b8c0c2d/html5/thumbnails/112.jpg)
Préparer une liste de références• On ne saisit plus ses références (ce qui limite considérablement les
erreurs) : on les récupère dans les bases et on les formate au style voulu avec un logiciel type EndNote