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  • tude compare de la diversitmicrobienne sur les sites de Berre,

    Entressen, Touloubre et Coulon.

    Prsent par :Timothe ADRIEN

  • Introduction

    Prsentation de latelier de microbiologie

    Prsentation du principe des diffrentes techniques employes

    Les rsultats obtenus en fonction des diffrents sites tudis

    Conclusion

  • Prsentation de latelier de microbiologie.

    Trois objectifs:- Ltude des caractres microbiologiques tel que la morphologie, la mobilit, des bactries prsentes sur les sites tudis.- Mesurer lactivit mtabolique nergtique des bactries de ces sites.- Isoler les bactries capables de dgrader les hydrocarbures, doxyder larsenic trivalent ou le fer ferreux ou de rduire le fer ferrique. En ce qui concerne le site de ltang de Berre on tentera aussi de suivre la dgradation des hydrocarbures. (objectif ralis en partie seulement)

    Un but:Identifier et recenser la population bactrienne sur chacun de nos sites.

  • Prsentation de latelier de microbiologie.

    Deux paillasses diffrentes:- Une pour les manipulations tel que les ensemencements de milieu de culture (les manipulations sy font sous flamme pour travailler en milieu strile).- Un microscope optique pour lobservation des bactries (tat frais ou aprs coloration de GRAM).

  • Prsentation de latelier de microbiologie.

    Les limites lies au manque de place, et un lieu de passage important.

  • Prsentation du principe des diffrentes techniques employes.

    Remarque pralable:-Toutes les manipulations faites en microbiologie doivent tre effectues sous flamme pour viter toute contamination de nos chantillons.-Les bactries auront pralablement taient concentres 10 100 fois.

  • tude des caractres morphologiques.

    Lobservation dun tat frais (cellules vivantes) permet dobserver la mobilit des bactries (linaire, circulaire) ou leurs immobilits, mais aussi leurs agencements (en chanette, en amas). Celle-ci seffectue au microscope.Lobservation des bactries aprs coloration de Gram. Diffrents colorants permettent de mettre en vidence la prsence ou labsence dune paroi bactrienne.On observera en rose les Gram (prsence dune paroi) et en violet les Gram+ (bactries dpourvues de paroi).Les limites:Dans le milieu naturel les bactries sont trs petites et par consquent les rsultats de la coloration de Gram ne sont pas toujours pertinents.

  • Isolement sur milieux slectifs solides.

    Ici on procde par talement des bactries prsentes dans nos chantillons sur un milieu solide.Trois milieux sont utiliss:- Un milieu non slectif trycase soja (TS) qui permet la croissance de toutes les bactries.- Milieu Chapman sur lequel seul les staphylocoques poussent.- Milieu Drygalski sur lequel seul les bacilles courant se dveloppent.

  • Mtabolisme nergtique.

    Permet une identification prsomptive de la famille ou du genre bactrien.Le test oxydase permet la diffrenciation des bacilles Gram . Le test pouvant tre positif ou ngatif.Le test catalase permet la diffrenciation des staphylocoques. Le test pouvant tre positif ou ngatif.

  • Test oxydase

  • Test catalase

  • Expriences propre ltang de Berre.

    Culture dun mlange de germe.A partir dun mlange de germe on inocule un bouillon TS. Ce dernier est agit 500 rpm. On suivra labsorbance 600 nm.Ce qui nous permet de dterminer la concentration bactrienne dans le milieu.1 UA reprsente 108 bactries.Dgradation des hydrocarbures.Dterminer si les bactrie de ltang de Berre ont la capacit de dgrader les HBPas de rsultats car nous navons pas suivi la formation de produit de dcomposition des HB par chromatographie.Analyse de lactivit ferri-rductrice.Ici, nos valeurs sont insatisfaisantes, et on ne peut conclure sur lactivit ferri-rductrice de nos bactries.

  • Les rsultats obtenus en fonction des diffrents sites tudis

    La Touloubre.

    Coulon.

    Ltang de Berre.

    La dcharge dEntressen: lagune dentre, lagune de sortie.

  • Rsultats Touloubre

  • Rsultats Touloubre

    Types de bactries identifies: Pseudomonas et Acinetobacter

    Quantit dnombre: Sur Drygalski environ 500 000 UFC/ml Sur glose TS environ 450 000 UFC/ml Sur Chapman 0, donc pas de coque

  • Rsultats Coulon

  • Rsultats Coulon

    Ici on ne peut rien conclure

  • Rsultats tang de Berre

  • Rsultats tang de Berre

    Types de bactries identifies: Pseudomonas et Acinetobacter Vibrio et ou Aeromonas Staphylococcus et ou microccus

    Quantit dnombre: Sur Drygalski: environ 32 000 UFC/ml Sur glose TS: aucune observation Sur Chapman: environ 49 000 UFC/ml

  • Rsultats dcharge dEntressen

  • Rsultats dcharge dEntressen

    Lagune dentre: Types de bactries

    identifies:AcinetobacterEnterobacterStaphylococcus (Aureus ou Saprophyticus) et microccus.

    Quantit dnombre:Sur Drygalski: environ 450 000 UFC/mlSur Chapman: environ 4 500 UFC/mlSur glose TS: environ 1 700 000 UFC/ml

    Lagune de sortie: Types de bactries

    identifies:Pseudomonas et ou Acinetobactermicrococcaceae

    Quantit dnombre:Sur Drygalski: environ 63 000 UFC/mlSur glose TS: environ 67 000 UFC/mlSur Chapman: environ 400 UFC/ml (possibilitcontamination

  • Conclusion

    Les limites: Au niveau des manipes Des tests eux mme (e.g coloration de gram) Du matriel (e.g absence dun chromatographe) Du protocole (e.g on aurait pu faire des tests pour

    dterminer le type respiratoire) Donc il y a des limites certaines quant la

    pertinence de nos rsultats.

    tude compare de la diversit microbienne sur les sites de Berre, Entressen, Touloubre et Coulon.IntroductionPrsentation de latelier de microbiologie.Prsentation de latelier de microbiologie.Prsentation de latelier de microbiologie.Prsentation du principe des diffrentes techniques employes.tude des caractres morphologiques.Isolement sur milieux slectifs solides.Mtabolisme nergtique.Test oxydaseTest catalaseExpriences propre ltang de Berre.Les rsultats obtenus en fonction des diffrents sites tudisRsultats TouloubreRsultats TouloubreRsultats CoulonRsultats CoulonRsultats tang de BerreRsultats tang de BerreRsultats dcharge dEntressenRsultats dcharge dEntressenConclusion