1. Kelainan pertumbuhan hasil konsepsi, menyebabkan kematian janin atau cacat, penyebabnya antara lain:

a. Kelainan kromosom, misalnya lain trisomi, poliploidi dan kelainan kromosom seks.b. Endometrium kurang sempurna, biasanya terjadi pada ibu hamil saat usia tua, dimana kondisi abnormal uterus dan endokrin atau sindroma ovarium polikistik.c. Pengaruh eksternal, misalnya radiasi, virus, obat-obat, dan sebagainya dapat mempengaruhi baik hasil konsepsi maupun lingkungan hidupnya dalam uterus, disebut teratogen.

2. Faktor anatomiPenyebab terbanyak abortus kerana kelainan anatomik uterus adalah septum

uterus akibat daripada kelainan duktus Mulleri (40-80%), dan uterus bicornis atau uterus unicornis (10-30%). Selain itu, kelainan yang didapat misalnya adhesi intrauterin (synechia), leimioma, dan endometriosis mengakibatkan komplikasi anomali pada uterus dan dapat mengakibatkan abortus.Kelainan plasenta, misalnya endarteritis terjadi dalam vili koriales dan menyebabkan oksigenasi plasenta terganggu, sehingga mengganggu pertumbuhan dan kematian janin. Keadaan ini dapat terjadi sejak kehamilan muda misalnya karena hipertensi menahun.Kelainan traktus genitalis, misalnya retroversio uteri, mioma uteri, atau kelainan bawaan uterus. Terutama retroversio uteri gravidi inkarserata atau mioma submukosa yang memegang peranan penting. Sebab lain keguguran dalam trimester dua ialah serviks inkompeten yang dapat disebabkan oleh kelemahan bawaan pada serviks, dilatasi serviks berlebihan, konisasi, amputasi, atau robekan serviks yang luas yang tidak dijahit.

3. Penyakit ibubaik yang akut seperti pneumonia, tifus abdominalis, pielonefritis, malaria, dan

lain-lain, maupun kronik seperti, anemia berat, keracunan, laparotomi, peritonitis umum, dan penyakit menahun seperti brusellosis, mononukleosis infeksiosa, toksoplasmosis.a. Faktor endokrin

Pada diabetes mellitus, perempuan dengan kadar HbA1c yang tinggi pada trimester yang pertama akan berisiko untuk mengalami abortus dan malformasi janin. IDDM dengan kontrol yang tidak adekuat berisiko 2-3 kali lipat untuk abortus.

Kadar progesteron yang rendah juga mempengaruhi resptivitas endometrium terhadap implantasi embrio.Kadar progenteron yang rendah diketahui dapat mengakibatkan abortus terutamanya pada kehamilan 7 minggu di mana trofoblast harus menghasilkan cukup steroid untuk menunjang kehamilan. Pengangkatan korpus luteum pada usia 7 minggu akan berakibat abortus dan jika diberikan progesteron pada pada pasien ini, maka kehamilan dapat diselamatkan.

b. Faktor infeksiInfeksi plasenta akan berakibat insufisiensi plasenta dan bisa berlanjut kematian janin. Infeksi kronis endometrium dari penyebaran kuman genetalia bawah yang bisa mengganggu proses implantasi. Amnionitis oleh kuman gram positif dan gram negatif juga bisa mengakibatkan abortus. Infeki virus pada kehamilan awal dapat mengakibatkan perubahan genetik dan anatomik embrio misalnya pada infeksi rubela, parvovirus, CMV, HSV, koksakie virus, dan varisella zoster.

c. Faktor imunologi

Beberapa penyakit berhubungan erat dengan kejadian abortus. Antaranya adalah SLE dan Antiphospholipid Antibodies (aPA). ApA adalah antibodi spesifik yang ditemukan pada ibu yang menderita SLE. Peluang terjadinya pengakhiran kehamilan pada trimester 2 dan 3 pada SLE adalah 75%. Menurut penelitian, sebagian besar abortus berhubungan dengan adanya aPA yang merupakan antibodi yang akan berikatan dengan sisi negatif dari phosfolipid. Selain SLE, antiphosfolipid syndrome (APS) dapat ditemukan pada preemklamsia, IUGR, dan prematuritas.