eksamensoppgaver/ exam questions: bi 2017 genetics and
TRANSCRIPT
Norges teknisk-naturvitenskapelige universitet
Institutt for biologi
-
EKSAMENSOPPGAVER/ EXAM QUESTIONS:
BI 2017 Genetics and Evolution
Faglig kontakt under eksamen / Contact person during exam:
C. Pelabon: 908 24 159
H. Jensen: 918 97 064
Eksamensdato / Exam Date: 1/12/2014
Eksamenstid / Exam duration: 4
Studiepoeng/ Study points: 7,5
Tillatte hjelpemidler / Allowed aids: authorized calculator
Antall sider/ Totalt (total # of pages bokmål + nynorsk + English): 15
Antall sider vedlegg / No. of pages in Appendix: 1
Sensurdato / Exam results :
The weight of the different questions is indicated in parenthesis
English Exercise 1 (25%) The following table presents different phenotypic characteristics of various species of arthropods.
Trait Species
Presence of chelicerae1
Number of locomotory appendages
Developement Wing folding pattern
Haplodiploid cycle
Reduced hind wing
Wing in adults
Aquatic larvae
Drosophila melanogaster (fruit fly)
no ≤10 holometabolous Folded on abdomen
no Yes yes No
Latrodectus mactans (black widow)
yes ≤10 NA NA no NA NA No
Cordulegaster boltonii (dragonfly)
no ≤10 hemimetabolous Not folded
no No yes Yes
Vespula germanica (wasp)
no ≤10 holometabolous Folded on abdomen
yes No yes No
Lithobius forficatus (centipede)
no >10 NA NA no NA NA No
Formica rufa (red ant)
no ≤10 Holometabolous Folded on abdomen (if wings)
yes No Reproductive individuals only
No
Chironomus plumosus (midge)
no ≤10 Holometabolous Folded on abdomen
no Yes yes Yes
1 - Chelicerae: Mouthparts that are hollow and contain venom glands. They are used to inject venom into prey. a) Using this table, build a phylogenetic tree with the species included. Show the synapomorphies that characterize the different groups. b) Explain why the same character, for example aquatic larvae, can be found in species that are not closely related. Give other examples of such a phenomenon in other groups of animals or plants. Next, let us assume that the exons (coding regions) of two different and imaginary genes, which we will denote winged and quadrowing, were sequenced in both the dragonfly and the midge. In this hypothetical example the gene winged codes for development of wings, whereas the gene quadrowing determines the number of full-grown wings in adults (2 or 4 wings). When the sequences from the two genes in the two species were aligned and compared the following was observed: Gene Number of non-
synonymous substitutions*
Number of synonymous substitutions**
dN/dS-ratio (ratio of non-synonymous to synonymous nucleotide substitutions)
winged 2 42 0.048 quadrowing 25 17 1.471
*More prsite; **M c) Expla d) The Nsequencevolutioevolve uDNA se e) Explaratios oband the
Exerc In a recefemale fThey paon the n(Fig. 1)
Fig. 1 Amstandardiflow varirepresent between xmeasurem
recisely, this sMore precisely,
ain what syn
Neutral theoces are examon, and howunder this nequence to b
ain the evolbserved for midge were
cise 2 (25
ent study, Mfecundity oarticularly anumber and
mong-populatized egg size [ability; (d) sta
t observed popx and y variabments. The an
should be the n, this should b
nonymous a
ory of molemined for siw you expecnull model. Wbe?
lutionary prthe genes w
e compared
5%)
Morrongiellof different p
analyzed thesize of the
ion variation i[i.e. corrected andardized fecpulation averables. Each poinnual flow var
number of nonbe the number
and non-syn
ecular evolugns of select the DNA sWhat do yo
ocesses thatwinged and d.
o and colleapopulations e effects of teggs produ
in raw and stafor variation
cundity [i.e. coages (±1SE), ant represents triability repres
n-synonymour of synonymo
nonymous n
ution is oftenction. Brieflsequences f
ou then expe
t are the moquadrowing
agues (Morrfrom the fr
the hydrolouced. The re
andardized traiin female sizeorrected for v
and lines predithe mean for esents the amon
us nucleotide sous nucleotide
nucleotide s
n used as a nly, explain tfrom the samect the dN/d
ost likely exg when thei
rongiello etresh water fiogy of the rivsults of thei
its along hydre] and (c) fecuariation in femicted relationseach populationg year variat
substitutions p substitutions
substitutions
null-model the neutral tme gene in tdS-ratio calc
xplanations ir sequences
t al. 2012) cfish Nannopvers (variabir survey are
rological gradiundity [numbemale size] vs. ships (±95% con estimated otion in annual
per non-synon per synonym
s are.
when DNAtheory of mtwo speciesculated for t
for the dN/ds in the drag
compared thperca austrability in watre presented
ients. (a) Egg er of eggs] vs.zero flow. Po
confidence intover several yflow, 0.5 repr
nymous mous site.
A molecular s to the
dS-gonfly
he alis. ter flow)
d below
size, (b) annual
oints ervals)
years of resenting
relativelyno water a) Descof offsp b) Suggthe chan c) The afigure (Fclutch vwater flriver at from thethese re
Exerc The Landue to s a) Expla b) Expl
y low and 0.9 rflow in the riv
cribe these rpring size. E
gest a possibnge in annu
authors of thFig. 3) illus
variability inlow at a certthis specifice average w
esults.
cise 3 (15
nde equationselection.
ain the diffe
ain how c
relatively highver (i.e. the w
results and Explain this
ble explanatal flow vari
his study alsstrates the ren egg size. Ttain time cac time (e.g.
water flow a
5%)
n Z = G
erent terms
can be estim
h variability inwater was stagn
explain howtheory in de
tion for the iability.
so recordedelationship bThe predictaan be predic
how much t this month
(Lande 197
of the equa
mated in natu
n flow amongnant).
w they confoetail. Use g
changes in
d the within-between enability of th
cted from thwater flow
h in previou
79) aims at p
ation.
ural popula
g years. Zero f
form to the traph(s) to il
egg size an
-clutch varinvironmentahe environmhe long-term in June a g
us years). G
predicting c
tions. Give
flow gives the
theory of lifllustrate you
nd egg numb
ability in egal predictabi
ment is a meam average wgiven year caive a possib
changes in p
an example
number of da
fe history evur explanati
ber observe
gg size. Theility and witasure of how
water flow inan be predi
ble interpret
phenotypic t
e.
ays with
volution ion.
d with
e next thin w the
n the cted tation of
traits
Exercise 4 (15%) The Hardy-Weinberg principle/model is a very important model in population genetics, and describes allele frequencies and genotype frequencies we expect to observe at a locus with two alleles. a) What is the Hardy-Weinberg model/equilibrium? Give a brief explanation of this important population genetics model and its predictions. There are a number of assumptions underlying the Hardy-Weinberg model. How the predictions of the model change when these assumptions are relaxed (removed/un-fulfilled) often provide us with an important understanding of how different processes affect the genetics and evolution of populations. b) What are the main assumptions of the Hardy-Weinberg model/equilibrium? Explain how violation of each of these assumptions is expected to change allele frequencies and/or genotype frequencies.
Exercise 5 (10%) In a study of Daphnia in a small pond in Illinois, USA, Spitze (1993) reported the following numbers of genotypes at the PGI locus in a sample of 127 individuals:
Genotype Observed number AA 11 AB 55 BB 61
a) What are the observed genotype frequencies and allele frequencies? b) What are the genotype frequencies expected under Hardy-Weinberg equilibrium? Use a Chi-square test to examine whether the observed genotype frequencies agree with the frequencies under Hardy-Weinberg equilibrium expectations.
Exerc Kerstin (1995) smarine zone onIsland cSwedendetermithe enzyaminotrabout wdata arefigure tothe studbloom okilled aintertidisland. Tfor 1988snails liwere exsnails othe splaintertida1990, threcoloniYour tadevelopthe data(selectio a) Why in 1987 b) Whythe evol
c) Why but not d) Predifor anotreasonin
cise 6 (10
Johannessostudied twosnail living
n the shore oclose to Strön. Each yearned the alleyme aspartaransferase (A
what this enze shown in to the right.
dy was 1987of the toxic all of the sndal zone acrThat is why8 and 1989.iving in the xterminated f the same s
ash zone jusal survived he intertidalized by splask in this qu
p a coherenta in the grapon, mutation
was the fre? Name the
y did the allelutionary m
are the curvexactly iden
ict what wother 100 yeang.
0%)
on and colle populationin the inter
of Ursholmeömstad in r, the researele frequencate Aat; don’t wzyme does).the graphs inThe first ye
7. In 1988, aalgae (tan b
nails in the ross the entiy there are n. Although tintertidal zoby the bloo
species livint above the unscathed.
l zone had bash-zone snuestion is tot explanationphs. In each n, migration
equency of te evolutiona
ele frequencmechanism a
ves traced bntical? Nam
ould happenars (assumin
eagues ns of a rtidal en
chers cies for
worry . Their n the
ear of a bars)
ire no data the one
om, ng in
By been ails.
o n for part, be sur
n or drift).
the Aat120 aary mechani
cy decline innd explain.
by the 1990-me the most
n to the allelng there are
re to name t
allele higherism and exp
n both popu
-1993 data likely evolu
le frequencie no more to
the evolutio
r in both popplain.
ulations from
for the two utionary me
ies if we foloxic algal bl
onary mecha
pulations in
m 1990 thro
populationsechanism an
lowed theselooms). Exp
anism invol
n 1990 than
ough 1993?
s generally nd explain.
e two populplain your
lved
it was
Name
similar
lations
Bokmål Oppgave 1 (25%) Tabellen nedenfor viser ulike fenotypiske egenskaper hos ulike arter av leddyr.
Trait Species
Presence of chelicerae1
Number of locomotory appendages
Developement Wing folding pattern
Haplodiploid cycle
Reduced hind wing
Wing in adults
Aquatic larvae
Drosophila melanogaster (fruit fly)
no ≤10 holometabolous Folded on abdomen
no Yes yes No
Latrodectus mactans (black widow)
yes ≤10 NA NA no NA NA No
Cordulegaster boltonii (dragonfly)
no ≤10 hemimetabolous Not folded
no No yes Yes
Vespula germanica (wasp)
no ≤10 holometabolous Folded on abdomen
yes No yes No
Lithobius forficatus (centipede)
no >10 NA NA no NA NA No
Formica rufa (red ant)
no ≤10 Holometabolous Folded on abdomen (if wings)
yes No Reproductive individuals only
No
Chironomus plumosus (midge)
no ≤10 Holometabolous Folded on abdomen
no Yes yes Yes
1 - Chelicerae: Munndeler som er hul og inneholder gift kjertler. De brukes til å injisere gift inn byttedyr. a) Ved hjelp av tabellen, sett opp et fylogenetisk tre som inkluderer disse artene. Indiker synapomorpfiene som karakteriserer de ulike gruppene.
b) Forklar hvorfor den samme karakteren, for eksempel akvatiske larver, kan finnes i arter som ikke er nært beslektet. Gi andre eksempler på et slikt fenomen i andre grupper av dyr eller planter. La oss så anta at eksonene (de kodende regioner) i to forskjellige og hypotetiske gener, som vi vil kalle winged og quadrowing, ble sekvensert i både øyenstikker og mygg. I dette hypotetiske eksempelet koder genet winged for utviklingen av vinger, mens genet quadrowing bestemmer antall fullt utviklede vinger hos voksne individer (2 eller 4 vinger). Da sekvensene fra de to genene i de to artene ble sammenstilt og sammenlignet ble følgende observert: Gen Antall ikke-
synonyme substitusjoner*
Antall synonyme substitusjoner **
dN/dS-ratio (forholdet mellom ikke-synonyme og synonyme nukleotidsubstitusjoner)
winged 2 42 0.048 quadrowing 25 17 1.471 *More precisely, this should be the number of non-synonymous nucleotide substitutions per non-synonymous site; **More precisely, this should be the number of synonymous nucleotide substitutions per synonymous site.
c) Forkl d) Den sekvensnøytralefra det sat dN/dS e) Forklratioeneøyenstik
Oppg Morronpopulasjhydroloproduse
Fig. 1 Amstandardiflow varirepresent between xmeasuremrelativelyno water
lar hva syno
nøytrale teoser blir undee teorien forsamme geneS-ratioen be
lar de evolue som ble fukker og myg
gave 2 (2
ngiello og kosjoner av ferogien i elvenert. Resultat
mong-populatized egg size [ability; (d) sta
t observed popx and y variabments. The any low and 0.9 rflow in the riv
onyme og ik
orien for moersøkt for å r molekylæret i to arter veregna for D
usjonære prounnet for gegg ble samm
5%)
ollegaer (Mrskvannsfiskne (variabilitene fra dere
ion variation i[i.e. corrected andardized fecpulation averables. Each poinnual flow varrelatively highver.
kke-synonym
olekylær evse etter endr evolusjon,vil evolvere
DNA-sekven
osessene somnene winge
menlignet.
orrongiello ken Nannopitet i vannføes undersøk
in raw and stafor variation
cundity [i.e. coages (±1SE), ant represents triability represh variability in
me nukleot
volusjon blirdringer som, og hvordane under dennnsen er?
m er de meed og quadr
et al. 2012)perca austraøring) på ankelse presen
andardized traiin female sizeorrected for v
and lines predithe mean for esents the amonn flow among
idsubstitusj
r ofte brukt m skyldes sel
n du ville fone nullmod
st sannsynliowing da se
) sammenligalis. De ana
ntall og størrnteres neden
its along hydre] and (c) fecuariation in femicted relationseach populationg year variat
g years. Zero f
oner er.
som en nullleksjon. Fororvente at Dellen. Hva v
ige forklarinekvensene ti
gnet fekundalyserte spesrelse av egg
nfor (Fig. 1)
rological gradiundity [numbemale size] vs. ships (±95% con estimated otion in annual flow gives the
lmodell nårrklar kort de
DNA-sekvenvil du da fo
ngene på dNtil disse gen
diteten i uliksielt effekte
gene som bl.
ients. (a) Egg er of eggs] vs.zero flow. Po
confidence intover several yflow, 0.5 repr number of da
r DNA en nsene rvente
N/dS-nene hos
ke ene av e
size, (b) annual
oints ervals)
years of resenting ays with
a) Beskgjelder illustrer b) Foresnår årlig c) Forfa(Fig. 3) Forutsigforutsis (f.eks hvmånede
Oppg Landelifølge av a) Forkl b) Forkl
kriv disse reevolusjon a
re din forkla
slå en muligg vannføring
atterne av stillustrerer f
gbarheten i fra gjennom
vor mye vanen i tidligere
gave 3 (1
gningen Zv seleksjon.
lar de ulike
lar hvordan
esultatene oav avkomstøaring.
g forklaringgsvariabilit
tudien registforholdet mmiljøet målmsnittlig vannføring i jue år). Gi en
5%)
Z = G (Lan
variablene
n kan estim
g forklar hvørrelse. Fork
g på forandret endrer se
trerte også imellom miljø
les ved hvorannføring i euni et gitt åmulig tolkn
nde 1979) ta
i ligningen.
meres i natu
vordan de saklar denne t
ringene i eggeg.
innen-kull vøforutsigbarr godt vannelva på detteår kan forutsning av diss
ar sikte på å
.
urlige popul
amsvarer mteorien i det
gstørrelse o
variasjon i erhet og inne
nføringen påe bestemte tsis fra gjenne resultaten
å forutsi end
lasjoner. Gi
med livshistotalj. Bruk fi
g antall egg
eggstørrelseen-kull variaå et bestemt tidspunktet
nomsnittlig vne.
dringer i fen
et eksempe
orieteori nårigur(er) til å
g som obser
e. Den nesteasjon i eggstidspunkt kover lengrevannføring
notypiske tre
el.
r det å
rveres
e figuren størrelse. kan e tid i denne
ekk som
Oppgave 4 (15%) Hardy-Weinbergprinsippet/-modellen er en svært viktig populasjonsgenetisk modell, og beskriver allelfrekvenser og genotypefrekvenser som vi forventer å se på et locus/gen med to alleler. a) Hva er Hardy-Weinbergmodellen/-likevekten? Gi en kort forklaring av denne viktige populasjonsgenetiske modellen og prediksjonene modellen har. Hardy-Weinbergmodellen har noen antagelser. Hvordan prediksjonene til modellen endrer seg når en eller flere av disse antagelsene ikke er oppfylt gir oss ofte en viktig forståelse av hvordan ulike prosesser påvirker populasjoners genetikk og evolusjon. b) Hva er de viktigste antagelsene i Hardy-Weinbergmodellen? Forklar hvordan en forventer at allelfrekvenser og/eller genotypefrekvenser vil endre seg når hver av disse antagelsene ikke er oppfylt.
Oppgave 5 (10%) I en studie av vannlopper (Daphnia) i en liten dam i Illinois, USA, fant Spitze (1993) følgende antall genotyper på PGI-locuset/genet da han tok en prøve/sampel på 127 individer:
Genotype Observert antall AA 11 AB 55 BB 61
a) Hva er de observerte genotypefrekvensene og allelfrekvensene? b) Hva er genotypefrekvensene som forventes under Hardy-Weinberglikevekt? Bruk en kjikvadrattest for å undersøke om de observerte genotypefrekvensene er som forventet under Hardy-Weinberglikevekt.
Oppg Kerstin hennes populasjsom levUrsholmHvert årallelfrekaspartater ikke nenzymegrafene første stvar det egiftige aalle sneghele Ursat det ik1989. Stidevannalgeoppsneglentidevannhadde tirekolonHer er mlogisk fgrafenenevner ddrift). a) Hvor1987? O b) Hvorevolusjo
c) HvorOppgi d d) Foruttil (anta
gave 6 (1
Johannesso(1995) stud
sjoner av enver i tidevanmen nær Strr bestemte fkvensen for te aminotrannødvendig å
e gjør). Datai figuren til
tudieåret vaen algeoppbalger (grå søglene i tidevsholmen. D
kke er noen elv om snegnsonen ble u
pblomstringne i skvalpesnsonen utenidevannsone
nisert av skvmålet at du sforklaring fo. I hver del de evolusjo
rfor var frekOppgi de ev
rfor gikk allonære meka
rfor er kurveden mest san
tsi hva soma at det ikke
0%)
on og kollegderte to n marin snegnnsonen på römstad i Svforskerne enzymet
nsferase (Aaå vite hva daene deres sl høyre. Det
ar 1987. I 19blomstring aøyler) som dvannsonen p
Dette er årsakdata fra 198
glen i utryddet aven, overlevdsonen rett ovn problem. Ien blitt
valpesone-snskal utvikleor dataene i er det viktignære mekan
kvensen av Avolusjonære
lelfrekvenseanismene og
ene som visnnsynlige e
m vil skje meble flere al
gaene
gle
verige.
at; det dette ser du i t 988 av drepte på ken til 88 og
de venfor I 1990
negler. e en
g at du nismene som
Aat120 allelemekanisme
en ned i begg forklar..
ser 1990-199volusjonære
ed allelfrekvgeoppblom
m er involv
et høyere i bene og forkl
gge populasj
93-dataene e mekanism
vensene ommstringer). F
vert (seleksjo
begge popular.
jonene fra 1
stort sett likmen og forkl
m vi fulgte diorklar hvor
on, mutasjo
lasjonene i
1990 til 199
ke, men ikklar.
isse to popudan du tenk
on, migrasjo
1990 enn d
93? Oppgi d
ke eksakt ide
ulasjonene iker.
on og
den var i
de
entiske?
i 100 år
Nynorsk Oppgåve 1 (25%) Tabellen nedanfor viser ulike fenotypiske eigenskapar hos ulike artar av leddyr.
Trait Species
Presence of chelicerae1
Number of locomotory appendages
Developement Wing folding pattern
Haplodiploid cycle
Reduced hind wing
Wing in adults
Aquatic larvae
Drosophila melanogaster (fruit fly)
no ≤10 holometabolous Folded on abdomen
no Yes yes No
Latrodectus mactans (black widow)
yes ≤10 NA NA no NA NA No
Cordulegaster boltonii (dragonfly)
no ≤10 hemimetabolous Not folded
no No yes Yes
Vespula germanica (wasp)
no ≤10 holometabolous Folded on abdomen
yes No yes No
Lithobius forficatus (centipede)
no >10 NA NA no NA NA No
Formica rufa (red ant)
no ≤10 Holometabolous Folded on abdomen (if wings)
yes No Reproductive individuals only
No
Chironomus plumosus (midge)
no ≤10 Holometabolous Folded on abdomen
no Yes yes Yes
1 - Chelicerae: Munndeler som er hul og inneholder gift kjertler. De brukes til å injisere gift inn byttedyr. a) Ved hjelp av tabellen, sett opp eit fylogenetisk tre som inkluderer desse artane. Indiker synapomorfiane som karakteriserer dei ulike gruppene.
b) Forklar kvifor den same karakteren, for eksempel akvatiske larver, kan finnast i artar som ikkje er nært i slekt. Gi andre eksempel på eit slikt fenomen i andre grupper av dyr eller planter. La oss så anta at eksona (kodande regionar) i to ulike og hypotetiske gen, som vi vil kalle winged og quadrowing, vart sekvenserte i både augestikkar og mygg. I dette hypotetiske eksempelet koder genet winged for utviklinga av venger, mens genet quadrowing bestemmer talet fullt utvikla venger hos vaksne individ (2 eller 4 venger). Da sekvensane frå dei to gena i dei to artane vart samanstilte og samanlikna vart dette registrert: Gen Antal ikkje-
synonyme substitusjonar*
Antal synonyme substitusjonar **
dN/dS-ratio (forholdet mellom ikkje-synonyme og synonyme nukleotidsubstitusjonar)
winged 2 42 0.048 quadrowing 25 17 1.471 *More precisely, this should be the number of non-synonymous nucleotide substitutions per non-synonymous site; **More precisely, this should be the number of synonymous nucleotide substitutions per synonymous site.
c) Forkl d) Den sekvensseleksjoforventenullmodgenet er e) Forklratioaneaugestik
Oppg MorronbestandhydroloResultat
Fig. 1 Amgradients[number size] vs. z(±95% coestimatedin annualgives the
lar kva syno
nøytrale teosar blir undeon. Forklar ke at DNA-sedellen. Kva r?
lar dei evolue som vart fukker og myg
gåve 2 (2
ngiello og kodar av ferskvogien i elventa frå under
mong-populati. (a) Egg size,of eggs] vs. anzero flow. Poionfidence inted over several l flow, 0.5 repnumber of da
onyme og ik
orien for moersøkt for å kort den nøyekvensane fvil du da fo
usjonære prfunne for gegg vart sam
5%)
ollegaer (Mvatnsfisken ne (variabilirsøkinga dei
ion variation i, (b) standardinnual flow vaints represent ervals) betwee
years of measresenting rela
ays with no wa
kkje-synony
olekylær evsjå etter endytrale teoriefrå det sameorvente at dN
rosessane soena winged o
manlikna.
orrongiello Nannopercitet i vatnførira blir pres
in raw and staized egg size [ariability; (d) sobserved pop
en x and y varisurements. Th
atively low andater flow in th
yme nukleot
volusjon blirdringar somen for moleke genet i to
dN/dS-ratioe
om er dei mog quadrow
et al. 2012)ca australis.ring) på tal
sentert nedan
andardized trai[i.e. correctedstandardized fpulation averagiables. Each phe annual flowd 0.9 relativel
he river.
tidsubstitusj
r ofte brukt m skriv seg fkylær evoluartar vil evo
en beregna f
mest sannsynwing da sekv
) samanlikn Dei analysog størrelsenfor (Fig. 1
its along hydrd for variation fecundity [i.e. ges (±1SE), an
point representw variability rly high variabi
jonar er.
som ein nulfrå usjon, og koolvere undefor DNA-se
nlige forklarvensane til d
na fekunditeserte spesiele av egga so).
rological in female sizecorrected for
nd lines predicts the mean forepresents the ility in flow am
llmodell nå
orleis du viler denne ekvensane f
ringane på ddesse gena
eten i ulike lt effektane om vart pro
e] and (c) fecuvariation in fcted relations
or each populaamong year v
among years. Z
år DNA-
le
for dette
dN/dS-hos
av dusert.
undity female hips ation variation Zero flow
a) Beskevolusjoforklarin b) Foresnår årleg c) Forfa(Fig. 3) Kor føretidspunkkor myeGi ei mu
Oppg Landelifølgje av a) Forkl b) Forkl
kriv desse reon av avkomnga di.
slå ei muligg vatnføring
atterane av sviser forho
eseieleg milkt over lenge vatnføringulig tolking
gåve 3 (1
kninga Z =v seleksjon
lar dei ulike
lar korleis
esultata og fmstorleik. F
g forklaring gsvariabilite
studien regioldet mellomljøet er mål
gre tid kan fga i juni i tidg av desse re
5%)
= G (Land.
e variablane
kan estime
forklar korleForklar denn
på forandriet endrar se
strerte ogsåm kor føreseast ved kor
føreseie vatndlegare år kesultata.
de 1979) tar
e i likninga.
erast i natur
eis dei samsne teorien i
ingane i eggeg.
å innen-kulleieleg miljøgodt gjenn
nføringa påkan føreseie
r sikte på å f
rlige bestan
svarer med detalj. Bruk
gstorleik og
l variasjon i øet er og innomsnittlig v dette tidspuvatnføringa
føreseie end
ndar. Gi eit e
livshistorietk figur(ar) ti
talet egg so
eggstorleiknen-kull varivatnføring i unktet i frama i denne m
dringar i fen
eksempel.
teori når deil å illustrer
om blir obse
k. Den nesteiasjon i eggi elva på eit mtida (for e
månaden i eit
notypiske tr
t gjeld re
ervert
e figuren gstorleik.
bestemt eksempel t gitt år).
ekk som
Oppgåve 4 (15%) Hardy-Weinbergprinsippet/-modellen er ein svært viktig populasjonsgenetisk modell, og beskriver allelfrekvensar og genotypefrekvensar som vi forventar å sjå på eit locus/gen med to allel. a) Kva er Hardy-Weinbergmodellen/-likevekta? Gi ei kort forklaring av denne viktige populasjonsgenetiske modellen og prediksjonane modellen har. Hardy-Weinbergmodellen har noen føresetnader. Korleis prediksjonane til modellen endrar seg når ein eller fleire av desse føresetnadene ikkje er oppfylt gir oss ofte ei viktig forståing av korleis ulike prosessar påverkar genetikk og evolusjon i ulike bestander. b) Kva er dei viktigaste føresetnadene i Hardy-Weinbergmodellen? Forklar korleis ein forventar at allelfrekvensar og/eller genotypefrekvensar vil endre seg når kvar av desse føresetnadene ikkje er oppfylt.
Oppgåve 5 (10%) I ein studie av vatnlopper (Daphnia) i ein liten dam i Illinois, USA, fant Spitze (1993) desse genotypane på PGI-locuset/genet då han tok ei prøve/sampel på 127 individ:
Genotype Observert tal AA 11 AB 55 BB 61
a) Kva er dei observerte genotypefrekvensane og allelfrekvensane? b) Kva er genotypefrekvensane som vi forventar å finne under Hardy-Weinberglikevekt? Bruk ein kjikvadrattest for å undersøke om dei observerte genotypefrekvensane er som forventa under Hardy-Weinberglikevekt.
Oppg Kerstin hennar (av ein mtidevatnStrömstbestemtallelfrekaspartater ikkje enzymegrafane første stvar det egiftige aalle snigheile Urtil at detog 1989tidevatnalgeoppsiglene tidevatnhadde tiav skvalat du skforklarindel er deevolusjo a) KvifoNemn d b) Kvifoevolusjo
c) Kvifoikkje ek d) Spå kat det ik
gåve 6 (1
Johannesso(1995) stud
marin snigelnsona på Urtad i Sverigete forskerankvensane fote aminotrannødvendig
et gjør). Dati figuren til
tudieåret vaei algeoppbalgar (grå søglane i tidersholmen. Dt ikkje er no
9. Sjølv om nsona vart upblomstringi skvalpeso
nsona utan pidevatnsonalpesone-sni
kal utvikle eng for dataaet viktig at onære meka
or var frekvden evolusjo
for minka alonære meka
or er kurvenksakt identis
kva som vilkkje vart fle
0%)
on og kollegderte to bestal som lever rsholmen næe. Kvart år
ne or enzymet nsferase (Aaå vite kva aa deira serl høgre. Det
ar 1987. I 19blomstring aøyler) som devatnsona pDette er årsaokre data fråsiglene i
utrydda av a, overlevdena rett ovan
problem. I 1a blitt rekoloiglar. Her erei logisk a i grafane. du nemner anismane so
vensen av Aonære meka
lelfrekvenseanismen og
ne som viserske? Nemn
l skje med aeire algeopp
gaene andar i
ær
at; det
r du i t 988 av drap på aken å 1988
e nfor 1990 onisert r målet
I kvar dei
om er involv
Aat120 allelet anismen og
en i begge bforklar.
r 1990-1993den mest sa
allelfrekvensblomstringa
vert (seleksj
t høgre i begforklar.
bestandane
3-dataa for annsynlege
sane om vi ar). Forklar
jon, mutasjo
gge bestand
frå 1990 til
dei to bestaevolusjonæ
følgde dei tkorleis du t
on, migrasjo
dane i 1990 e
1993? Nem
andane stort ære mekanism
to bestandantenkjer.
on og drift)
enn den var
mn den
t sett like, mmen og fork
ne i 100 år t
.
r i 1987?
men klar.
til (anta
Appendix Chi-square table: Critical values of the Chi-square distribution for up to 5 degrees of freedom (d.f.). The proportions in the table (corresponding to α=0.05, 0.01, etc.) represent the area to the right of the critical value of Chi-square given in the table, as shown in the figure below. The null-hypothesis is usually not rejected unless the probability associated with the calculated Chi-square is less than 0.05.