分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - kanazawa...
TRANSCRIPT
![Page 1: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/1.jpg)
1
北国新聞会館20階ホール、7月28日、2007年
金沢大学理学部物理学科(自然科学研究科)
CREST (日本科学技術振興機構)
安藤 敏夫
Myosin V, 240 nm, 30 ms/ frameMyosin V, 240 nm, 30 ms/ frame
日本海イノベーション会議 第1回フォーラム
分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発
![Page 2: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/2.jpg)
2
様 々 な 生 命 現 象① 個体発生 ② 好中球の貧食
③ 細胞内タンパク質の動態 ④ アクチン線維の滑り運動
![Page 3: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/3.jpg)
3
大きさのスケール
m mm μm nm pm
細胞 ウィルス
タンパク質
原子
![Page 4: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/4.jpg)
4
タンパク質とはアミノ酸からでできた物質
![Page 5: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/5.jpg)
5
生物分子機械生物分子機械
モータ蛋白質、モータ蛋白質、AAA AAA 蛋白質蛋白質,, DNADNA結合蛋白質結合蛋白質
Myosin VI
Actin
Kinesin Dynein
Microtubules
TubulinKataninFtsH
Microtubules
Holliday-Junction DNA
Myosin V
![Page 6: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/6.jpg)
6
タンパク質の動的振舞いの情報を得る手段
水中水中
高空間分解能高空間分解能
1分子を対象1分子を対象
高時間分解能高時間分解能
X線結晶構造解析X線結晶構造解析
電子顕微鏡電子顕微鏡
NMRNMR
スペクトロスコピースペクトロスコピー
光学顕微鏡光学顕微鏡
原子間力顕微鏡原子間力顕微鏡
3
2
3
2
2
1
Binnig (1986)
![Page 7: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/7.jpg)
7
原子間力顕微鏡(原子間力顕微鏡(AFMAFM))の原理の原理
![Page 8: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/8.jpg)
8
フィードバック制御の遅れフィードバック制御の遅れ
c
cfπQ
s
sfπQ
cf21
pτ
1.2 MHz in water, 200 pN/nm
L=6 μm, w=2 μm, d=90 nm
Active Damping
![Page 9: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/9.jpg)
9
振幅
位相
周波数
機械を思いどおりに高速に動かすのは難しい
![Page 10: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/10.jpg)
10
入力 出力
力 変位
G(ω)
機械を思いどおりに高速に動かす工夫
G(ω)G(ω)1
G(ω)
H(ω)
+
フィードフォワード型補償 フィードバック型補償
![Page 11: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/11.jpg)
11
振動抑制補償の効果
入 力入 力 出 力出 力
補償前
補償後
補償前補償前
補償後補償後
X-スキャナー
Z-スキャナー
100 kHz
500 kHz
![Page 12: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/12.jpg)
12
80 ms/frame
針で試料に「やさしく」触ることは難しい
タンパク質はとてもデリケート
![Page 13: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/13.jpg)
13
60 ms/frameMyosin VActo-myosin V
Head
AFMが捉えたタンパク質のダイナミックな動作
Dynein C GroEL
![Page 14: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/14.jpg)
14
ミオシンV: 細胞内の物質輸送を担うタンパク質
T. Sakamoto et al. BBRC. 272:586-590 (2000)
蛍光顕微鏡像
AFM像
![Page 15: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/15.jpg)
15
ATP ADP + Pi
化学エネルギー 力学的エネルギー
ATP分解反応ATP分解反応
構造変化構造変化
Actinとの結合Actinとの結合
カップリング
力学的仕事力学的仕事
共 役
![Page 16: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/16.jpg)
16
アクチンアクチン--ミオシンVミオシンV 相互作用相互作用
低イオン強度
矢じり構造
![Page 17: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/17.jpg)
17
30nm
ATPがないときATPがないとき
Imaging Rate: 100 ms/frame
イオン強度
マイナス端
プラス端
矢じり構造矢じり構造
In ADP
![Page 18: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/18.jpg)
18
In 50uM AMPIn 50uM AMP・・PNPPNP
両足の結合両足の結合
30nmイオン強度
前足-AMP・PNP後ろ足
AMP・PNPなし
プラス端マイナス端
![Page 19: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/19.jpg)
19
In ATP: In ATP: ミオシンVの歩行運動ミオシンVの歩行運動
20 20 uMuM ATP, 300 ATP, 300 mMmM NaClNaCl 30nm
Imaging Rate: 100ms/frame
![Page 20: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/20.jpg)
20
前前 足足 のの 屈屈 曲曲With 8uM ATPWith 8uM ATP
With 20uM ATPWith 20uM ATP30nm
前足の屈曲が前方への力を生む前足の屈曲が前方への力を生む
M・ADP・Pi M・ADP
![Page 21: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/21.jpg)
21
なぜ後ろ足しかアクチンに結合できないか?
+-
ATPなし、ADP結合状態
ATPなし、ADP結合状態では、マイナス端を指すよう
な矢じり構造でしかアクチンに結合できない
ATPなし、ADP結合状態では、マイナス端を指すよう
な矢じり構造でしかアクチンに結合できない
![Page 22: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/22.jpg)
22
ATP分解反応の進行と歩行運動とのカップリング
![Page 23: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/23.jpg)
23
ミオシンVの歩行運動の機序
![Page 24: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/24.jpg)
24
シャペロニン GroEL-GroES の結合・解離のダイナミクス
試料のセットアップGroEL
![Page 25: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/25.jpg)
25
0.25 s/frame
シャペロニン GroEL-GroES の結合・解離のダイナミクス
![Page 26: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/26.jpg)
26
スイッチング
主要中間体
![Page 27: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/27.jpg)
27
ストレプトアビジン基板ストレプトアビジン基板ビオチン化タンパク質
His-タグ タンパク質
800nm × 800nmz scale: 4nm
300nm × 300nmz scale: 2nm
100nm × 100nmz scale: 2nm
タンパク質の選択的固定を可能に
ストレプトアビジンの2次元結晶
![Page 28: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/28.jpg)
28
脂質で作る平面2重層膜
リン脂質
リポソーム
基板に支えられた平面2重層膜
![Page 29: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/29.jpg)
29
Speed: ×20
1 s/frame,
800×800 nm
脂質平面2重層膜の形成過程
![Page 30: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/30.jpg)
30
脂質平面2重層膜の流動性の脂質依存性
DPPC-(DOPC-Biotin) DPPC-(DPPC-Biotin)
不飽和炭化水素 飽和炭化水素
![Page 31: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/31.jpg)
31
バクテリオロドプシンの紫膜
光のエネルギーでプロトンを排出
35 ×35 nm2
35 nm
![Page 32: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/32.jpg)
32
Cyt
opla
smic
site
Extr
acel
lula
rsite
40 nm
40 nm
10 nm
10 nm
(a) (b)
(c) (d)
バクテリオロドプシン
40 ms/frame
15 ms/frame
![Page 33: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/33.jpg)
33
探針・試料間相互作用力の更なる低減化
イメージング速度の更なる高速化
将来の展望
カンチレバーが主要な制限因子
cf ckor
唯一の解 非接触高速AFM
![Page 34: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/34.jpg)
34
非接触高速AFMは可能か?非接触高速AFMは可能か?
G. Shekhawat and V.P. Dravid (2005)
Scanning Near-field Ultrasound Holography (SNFUH)
音波は試料表面に沿っている?
![Page 35: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/35.jpg)
35
探針は非接触でも表面を感じる!!
![Page 36: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/36.jpg)
36
■■ ナノメータ世界の高速観察ナノメータ世界の高速観察
高速AFMの大きな波及効果
新しいナノサイエンス・ナノテクノロジーの創成
■■ 表面の迅速評価装置表面の迅速評価装置
■■ 大表面へのナノ構造の形成大表面へのナノ構造の形成
![Page 37: 分子の動きを高速でとらえる顕微鏡の開発 - Kanazawa …biophys.w3.kanazawa-u.ac.jp/paper/T-Ando.pdfIn 50uM AMP・PNP 両足の結合 30nm イオン強度 後ろ足](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022081617/6048fc5b901661353c662214/html5/thumbnails/37.jpg)
37
Kanazawa UniversityKanazawa University
Kansai Advanced Research CenterKansai Advanced Research Center
大岩和弘
OlympusOlympus
戸田明敏
内橋貴之(准教授) FF-control, Photo-thermal, Phase Imaging
古寺哲幸(PD) Dynamic PID, Active damping, Myosin V
山下隼人(D1) Photo-thermal, membrane imaging
宮城 篤(D3) Dynein C, Nucleosome Imaging
中北 諒(卒業生) Scanner, Active damping
坂下 満(卒業生) Drift Compensation, Software
山本大輔(PD) Lipid Bilayers, GroEL-ES Imaging
北沢正志 榊原 斉
谷口雅昭(PD) GroEL Mutation, RuvAB Imaging
Cantilevers Dynein C Prep.
高橋尚久(M2) Phase Imaging, nc-AFM