dr. kiss erzsébetgbi.mkk.szie.hu/sites/default/files/files/a_szak...elstar 119 135 190 198 168 170...
TRANSCRIPT
Mezőgazdasági biotechnológusMSc szak
dr. Kiss Erzsébet
SZIE Mezőgazdaság- és Környezettudományi Kar
Genetika és Biotechnológiai Intézet
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak
SzakvezetőDr. Kiss Erzsébet
egyetemi tanárkiss.erzsebet @mkk.szie.hu
Szakvezető-helyettesDr. Veres Anikóegyetemi docens
Genetika és Biotechnológiai IntézetIgazgató
Dr. Varga László
Egyetemi docens
Titkár
Katona Melinda
Genetika és Biotechnológiai Intézet
Telefonszám
+36 28 522 069
+36 28 522 000/1691
Fax
+36 28 522 069
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak
Alapítás
2006
Dr. Heszky László
MTA rendes tagja
Genetika és Biotechnológiai Intézet akkori igazgatója
Genetika és Biotechnológiai Intézet
A hazai nemesítő utánpótlás képzésének meghatározó bázisa;
Három fő diszciplina oktatásának felelőse: Genetika
Növénynemesítés
Növénybiotechnológa
Genetika és Biotechnológiai Intézet
Elsőként indított Magyarországon mezőgazdasági biotechnológusmesterképzést 2008-ban
Nappali és levelező tagozaton
Ez a mesterszak- az országban egyedülállóan – két szakirányt foglal magában: növénybiotechnológia és állatbiotechnológia szakirányokat.
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak
Hallgatószáma jelenleg 52 fő
49 fő diplomázott eddig
Az Agricultural Biotechnology angol nyelvű MSc szakot külföldi hallgatókkal (12 fő) 2012-ben indította a genetika és Biotechnológiai Intézet.
14 új hallgató 2014-ben
A Mg. Biotech. MSc Szakonkét szakirány között lehet
választani
Növénybiotechnológia Állatbiotechnológia
Program
1. félév: azonos tantárgyak
2. félév: szakirány-választás / diplomamunka
2-4. félév közös és szakirány-specifikus tantárgyak
Diplomamunka
Saját kísérletek!
Ízelítő a választható témákból Gyujtoványfű, cickafark, imola és csodatölcsér fajok
molekuláris vizsgálata taxonómiai pontosítás céljából
Az Orange gén öröklődése karalábé és karfiol hibridpopulációkban
Emlős embriók in vitro előállítása vágóhídról származó petesejtekből
Transzpozon alapú transzgenezissel előállított transzgénikus nyulak molekuláris jellemzése
Mikrobiológiai témát is lehet választani
Szakirány -választás Az 1. szemeszter végén!
Molekuláris markerek alkalmazása szántóföldi és kertészeti növények
nemesítésében
Kiss E., Gyulai G., Veres A., Szőke A., Tóth-Lencsés K.,
Kerekes A., Heszky L.
Mezőgazdasági biotechnológus MSc szak
Ízelítő a diplomamunka- témákból korábbi dolgozatok és publikációk alapján
Molekuláris markerek alkalmazása
Genotipizálás
Pedigré elemzés
Hibridazonosítás
Kapcsolt markerek
Miért van szükség a genotipizálásra? Nem elegendő a morfológiai
összehasonlítás?
Perenne évelő rozs
Kárpát-medencei szőlőfajták mikroszatellit
elemzése
Szőlő fajták összehasonlító elemzése mikroszatellit /SSR
primerekkel
SSR allél adatok átalakítása vonalkóddá
MAGYAR SZŐLŐ MIKROSZATELLIT / SSR ADATBÁZIS
HUNGARIAN VITIS MICROSATELLITE / SSR DATABASE
KISS, Erzsébet; HALÁSZ, Gábor; *KOZMA, Pál; HESZKY,
László
Szent István Egyetem, Genetika és Növénynemesítés Tanszék
Szent István University, Department of Genetics and Plant
Breeding H-2103, Gödöllő, Magyarország / Hungary *FVM
Szőlészeti és Borászati Kutatóintézet (FVM-SZBKI) Institute
for Viticulture and Enology H-7634, Pécs, Magyarország /
Hungary
Primerek / Primers:
Fajták / Varieties:
A-B - C-CS - D-E - É-F - G-H - I-J - K - L-
M -
N-NY - O-Ó - Ö-Ő - P-Q - R-S - SZ-T - U-Ú
- Ü-Ű - V-Z - ZS
List of Varieties / Teljes fajtalista
European Vitis Database: közel 6 000 fajta/klón mikroszatellit/SSR és ampelográfiai
adata
259 magyarországi fajta/klón
European Vitis DatabaseN-coded SSR values in 9 loci
Accession name Allél_1 Allél_2
HUN045-P14#30 - APROFEHÉR N+8 N+18
HUN045-P14#49 - AGASFARK N+8 N+8
HUN045-P14#60 - BAJOR, KÉK N+8 N+8
HUN045-P14#61 - BAJOR, SZÜRKE N+8 N+8
HUN045-P14#62 - BAKARKA N+18 N+18
HUN045-P14#63 - BAKATOR, KÉK N+8 N+18
HUN045-P14#64 - BAKATOR, PIROS N+8 N+22
HUN045-P14#65 - BAKATOR, PIROS
TÜDOSZINU * N+8 N+22
HUN045-P14#66 - BAKSZEM N+16 N+22
HUN045-P14#68 - BALAFANT N+18 N+18
Almafajták mikroszatellit mintázata és allélmérete a CH03G07 primerpárral
CULTIVARSCH03g07 CH04g10 CH04e03 CH05c02 CH05d11 CH05e03
Ozark Gold 119 129 135 168 196 196 168 172 173 173 168 179
JerseyMac 165 165 135 137 184 198 160 176 165 173 197 163 173
Piros 165 179 135 135 196 198 168 176 173 175 173 173
Gala 119 129 135 135 196 198 168 170 173 173 173 185
Pioana 129 129 135 137 190 198 170 174 169 171 163 185
Gloster 123 129 127 137 198 198 160 168 195 197 160 191
Julyred 165 165 123 135 143 184 198 160 176 175 197 163 163
Wellspur Delicious 127 127 137 168 198 202 168 168 173 197 191 191
Judeline 123 129 135 135 196 198 168 174 173 173 163 185
Jonagold 119 123 129 135 135 186 198 168 174 200 169 173 175 163 179 185
Jonathan 119 123 135 135 186 196 168 200 173 175 163 185
Pinova 119 127 129 127 135 198 222 168 174 169 173 163 179 185
Mutsu 129 179 135 135 198 198 168 168 173 173 173 179
Akane 123 179 123 135 143 196 210 216 170 200 173 173 185 185
Sampion 119 129 135 135 190 198 170 174 169 173 179 193
Charden 119 129 135 135 198 198 168 174 200 169 173 175 175 179 185
Jonager 123 127 135 135 196 196 170 200 173 175 168 185
Summerred 129 165 135 135 184 208 168 176 173 177 170 185
Goldstar 119 129 123 135 143 190 198 168 170 173 173 185 193
Golden Delicious 119 129 135 135 198 198 168 174 169 173 179 185
Angold 119 129 135 135 198 198 168 170 171 173 173 185
Granny Smith 129 153 127 137 196 198 160 172 171 173 168 181
Kró óriás 129 129 123 137 143 196 202 168 172 173 197 168 191
Liberty 123 129 137 137 178 198 168 168 173 211 163 176
Mizsei 123 129 135 135 186 208 160 168 173 173 163 185
Reglindis 129 179 135 135 198 198 168 168 169 173 173 173
Sir Prize 119 123 129 135 135 198 204 168 168 169 173 173 179
Red Stayman 127 129 127 135 196 204 168 172 169 173 163 191
Rewena 119 123 135 135 178 210 168 168 173 173 164 185
Rubinola 129 129 135 135 184 198 168 176 173 173 179 193
Braeburn 127 129 168 168 198 202 168 168 171 173 191 191
Rajka 119 129 135 135 190 196 160 170 174 171 173 177 164 176 185
Idared 123 129 135 135 186 198 168 200 173 197 172 185
Fuji 119 127 123 143 168 196 198 168 168 173 197 163 191
Florina 123 127 135 168 196 198 168 200 173 197 163 191
Prima 129 165 123 135 143 184 204 168 176 169 173 179 185
Elstar 119 119 135 135 190 198 168 170 173 187 164 179
Remo 119 123 135 135 178 190 168 170 173 173 163 172
Red Rome Van Well 123 129 135 135 186 198 168 168 173 173 163 163
Topaz 119 129 135 135 190 198 168 168 169 173 185 193
Pink Lady 129 129 135 137 198 204 160 168 169 171 168 179
Relinda 123 129 123 135 143 196 208 168 172 173 173 172 185
Greensleeves 129 129 123 135 143 190 198 170 174 171 173 173 185
Reanda 119 129 135 137 196 208 168 168 173 181 173 185
Pilot 129 179 135 135 196 196 168 168 173 173 164 185
Fiesta 119 123 135 135 186 196 168 168 173 197 164 185
Snygold 129 129 135 135 198 198 170 174 173 205 173 179
65 kereskedelmi és
38 tájfajta
Dinnyegenotipizálás
Szamócafajták molekuláris összehasonlítása
M 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 M
3000
500 OPE 02
Adh 1f/ Adh1r
WFRVC
RAPD
AP-PCR
Gén-specifikus
Diploid, oktoploid szamóca fajták SSR adatai
Fajta SSR / UDF-004 (bp)
Fragaria vesca‘Rügen’
133:133
F. ananassa‘’Hakras romata’
129:143
F. ananassa‘Avalon classique’
125:131:137
F. ananassa‘Frapendula’
125:129:143:149
F. ananassa‘Fertődi 5’
125:127:129:133:149
F. ananassa‘Gorella’
125:129:133:139:143:149
Repce genotipizálás SSR markerekkel
GKH 724 162:166:174:192
TPES 7 166:192
TPR 24 162:174
Tetraploiditás repcében
Származás, pedigré
Szőlő
Alma
Évelő rozs
Az SSR allélek méretezése/ALF-Express/
Lokusz ♀ Izsáki Mátraimuskotály
♂Ottonel muskotály
Scu08vv 185:185 185:185 185:185
Scu10vv 208:214 214:214 208:214
VVMD21 244:250 244:267 267:267
VVMD36 254:276 276:264 264:276
ssVrZAG62 191:207 191:191 191:197
ssVrZAG64 139:161 139:161 139:161
ssVrZAG79 240:246 240:258 258:262
ssVrZAG83 197:203 197:203 193:203
ssVrZAG112 237:245 237:237 237:245
VVMD5 226:232 232:226 226:228
VVMD7 242:252 242:246 242:246
VVMD32 258:274 274:266 242:266
ssVrZAG21 208:208 208:208 208:208
Vmc4f3 170:170 170:204 170:204
VVMD28 234:258 258:269 258:269
VVMD31 206:208 206:206 206:210
VMC4c6 157:166 157:163 162:163
VMC4g6 123:127 123:135 125:135
VVS2 143:143 143:143 133:143
SSR allélek méretei bp-ban
SSR lokusz Leányka Királyleányka
Scu10vv 202:208 208:214
Scu08vv 185:185 185:185
VVMD21 250:250 244:250
VVMD36 266:276 254:266
VrZag64 161:165 161:161
VrZag79 240:254 252:254
VrZag62 195:197 197:207
Zalagyöngye
Csabagyöngye
X
Seyve-Villard 12375
NEM!
Perenne évelő rozs
Kapcsolt markerek
Ivar
kender
Rezisztencia
Paradicsom: nematóda
Szőlő: lisztharmat és peronoszpóra
Hímsterilitás
repce
Szín
Karfiol: rózsa
Szőlő: bogyó
Ivarspecifikus marker fejlesztése RAPD fragmentumból kenderben
Nematóda rezisztens paradicsom genotípusok azonosítása molekuláris markerekkel
Restrikciós emésztés után ahomozigóta és a heterozigótarezisztens genotípusokelkülöníthetőek
A heterozigóta és homozigóta rezisztens genotípusok megkülönböztetése CAPS markerrel
Rezisztens és fogékony genotípusok domináns markerrel
RUN1, REN1 lisztharmatrezisztenciagénekkel kapcsolt
SSR markerekalkalmazása szelekcióra
Egyszeres PCRMultiplex PCR
A RUN1 gén jelenlétét a (RUN1+ növényeket) a 160 bp méretű csúcs jelzi
95 bp méretű külső, ill. belső
sandard
275 bp méretű külső, ill.
belső standard
A BC4, a Kismis vatkana (szülők) és érzékeny fajta (Cardinal)alléljei a VMC8g9 markerrel R: Run1+ Sz: run1-
Multiplex PCR 4%-os Metaphor agarózon (BMA) elválasztva
2. Kismis vatkana: Run1-/Ren1+ 3. BC4: Run+/Ren1-, Az utódpopuláció egyedei 601: Run1-/Ren1- 90: Run1+/Ren1+, 6: Run1+/Ren1-, 36: Run1-/Ren1+
286 bp 286 bp 286 bp
160 bp 160 bp 160 bp
VMC9h4.2
VMC8g9
Hímsterilitás
Csak a hímsteril növényekben jelenik meg a 278 bp fragmentum
Színes karfiol
Kárpát-medencei bogyószín variánsok
Lisztes piro Lisztes fehér Bakator piros Bakator tüdőszínű
Gohér piros Gohér fehér Gohér változó Piros Sárga
muskotály muskotály
Csíkos muskotály Furmint piros Furmint fehér
Antocyanin biosynthesis
White berried grapes No UFGT expression
Reason: Gret-1 insertion into the promoter of VvMybA1
transcription factor gene
SNP a VvMybA2 kódoló szekvenciában
VvMybA1 allél-variációk
M: MW marker, 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4. Lisztes piros,5. Lisztes fehér, 6. Bakator piros, 7. Bakator tüdőszínű, 8. Gohér piros, 9.Gohér fehér, 10. Gohér változó, 11. Piros muskotály, 12. Fekete muskotály,13. Sárga muskotály, 14. Csíkos muskotály, 15. Furmint piros, 16. Furmintfehér, 17. Furmint változó, 18. Kék barátcsuha, 19. Szürke barátcsuha
VvMybA1a
VvMybA1b
VvMybA1c
20D18CB9 markerVvMybA1 linked CAPS marker
PCR product
DdeI digestion
M: molecular weight m., 1. Barbera, 2. Pinot noir, 3. Chardonnay, 4.Bakator piros, 5. Bakator tüdőszínű, 6. Gohér piros, 7. Gohér fehér, 8.Gohér változó, 9. Sárga muskotály, 10. Csíkos muskotály, 11. Furmintfehér, 12. Furmint változó, 13. Kék barátcsuha, 14. Szürke barátcsuha
329 bp
248 bp
329 bp
248 bp329 bp
213 bp
329 bp
213 bp329 bp
248 bp
213 bp
Munkatársak, együttműködők
SZIE GBIHeszky LászlóGyulai Gábor
Szőke AntalVeres AnikóGalli ZsoltGalbács ZsuzsannaHalász GáborKatuláné Debreceni DiánaKerti BalázsKovács LászlóLencsés Andrea KittiMolnár StellaPilinszky KatalinWichmann Barnabás
PTE SZBIKozma PálHoffmann SaroltaGK KhtFalusi JánosGyümölcskutató FertődDénes Ferenc
Proplant Kft DánszentmiklósSipos ElvíraLehoczky Péter
Gyümölcskutató ÚjfehértóSzabó TiborInántsy Ferenc
MGSZH BudapestPernesz GyörgyHarangozó Tamás
Köszönöm a figyelmet!