Download - Vancouver et Zotero en santé 2012 (en 3h)
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Prsenter votre bibliographie avec la norme Vancouver et Zotero
L3 Sanitaire et SocialSCD UBO novembre 2012Sandrine Nicolas-Guihot & Perrine Helly
Avant toute formation,
- vrifier que tous les postes de la salle de formation sont quips de la dernire version de Firefox (3.5) et d'Open Office (3.1)- vrifier que le module d'import Zotero dans Open Office est bien install sur tous les postes- vrifier que Zotero est bien dsinstall sur tous les postes, sauf celui du formateur.
Bibliographie
Le but dune bibliographie :
viter le plagiat
Vrifier que le contenu a un fondement rel dans la littrature scientifique et universitaire .
Permet aux lecteurs de retrouver facilement linformation originale
Bibliographie : Vancouver
Les atouts de la norme Vancouver :
Facile lire
Gain de place
Norme utilise dans les sciences mdicales lUBO .
Un article de revue
Modle
Nom de l'auteur Initiale(s) du (des) prnom(s). Titre de l'article dans la langue originale. Titre de la revue. Anne;volume(fascicule):pages de dbut et de fin de l'article (spares par un tiret).
Exemple
Kiessling WR. Thyroid function in 44 patients with amyotrophic lateral sclerosis. Arch Neurol. 1982;39(4):241-242.
Payne DK, Sullivan MD, Massie MJ. Womens psychological reactions to breast cancer. Semin Oncol. 1996;(1 suppl 2):89-97.
Un ouvrage
Modle
Nom de l'auteur Initiale(s) du (des) prnom(s). Titre de l'ouvrage : sous-titre. Numro de l'dition partir de la 2me. Ville d'dition : Nom de lditeur; anne de parution: nombre de pages. (Nom de la collection ; n)
Exemple
Bach JF. Trait d'immunologie. Paris : Flammarion Mdecine Sciences; 1993:1205 p.
Chapitre dun ouvrage
Modle
Nom de l'auteur du chapitre Initiale du prnom. Titre du chapitre. In : Nom de lauteur de louvrage Initiale du prnom. Titre de louvrage. Numro de l'dition partir de la seconde. Ville d'dition : Editeur; anne de l'dition: pages de dbut et de fin du chapitre (spares par un tiret).
Exemple
Phillips SJ, Whisnant JP. Hypertension and stroke. In : Laragh JH, Brenner BM, editors. Hypertension : pathophysiology, diagnosis, and management. 2nd ed. New-York : Raven Press; 1995: 465-78.
Une thse un mmoire
Modle
Nom de l'auteur Initiale(s) du (des) prnom(s). Titre de la thse. Nature du document et discipline. Universit de soutenance;anne :pages.
Exemple
Hebert S. Mningites haemophilius influenzae chez l'enfant en Polynsie Franaise. Thse de mdecine. Universit Paris XI; 1997: 219 p.
Article, ouvrage ou thse en ligne
Modle
Pour les articles, ouvrages et thses en ligne, faire suivre la rfrence par
[En ligne]. Lien URL. Consult le date de consultation
ExemplePiro LD, Carrera CJ, Carson DA, Beutler E. Lasting remissions in Hairy-Cell Leukemia Induced by a Single Infusion of Chlorodeoxyadenosine. N. Engl. J. Med. 1990;322(16):1117-1121. [En ligne]. http://content.nejm.org/cgi/content/abstract/322/16/1117 Consult le 13 novembre 2012
Site internet
Modle
Pour les documents extraits dun site web.
Organisme ou Auteur. Titre du site ou de la page. [En ligne]. Lien URL. Consult le date de consultation.
Exemple
OMS:Organisation Mondiale de la Sant. Rapport sur la sant dans le monde 2008. [En ligne]. http://www.who.int/whr/2008/fr/index.html. Consult le 13 novembre 2012.
Bibliographie : Vancouver
Il faut citer et numroter les rfrences bibliographiques selon leur ordre dapparition dans le texte .
Les rfrences sont notes sous forme de n entre parenthses ou dexposant.
Bibliographie : Vancouver
A retenir :
Respecter la ponctuation.
Respecter la forme abrge du titre de la revue.( Pubmed ou Sudoc)
Si une rfrence est cite plusieurs fois, elle conserve toujours le mme numro .
Suivre le mme type de prsentation tout au long de la bibliographie .
Pour gagner du temps : Zotero
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Le principe est d'abord de montrer rapidement l'avantage du logiciel et son intrt, avant de le faire installer puis de faire travailler les stagiaires sur une srie d'exercices.
Les comptences acqurir sont les suivantes :- comprendre l'intrt du logiciel Zotero- savoir l'installer sur son propre poste- savoir importer une rfrence- savoir ajouter une note une rfrence- savoir grer ses rfrences dans des dossiers ou avec des mots-clefs- savoir exporter une ou plusieurs rfrences sous forme de bibliographie dans un document texte- savoir sauvegarder sa bibliothque Zotero pour la rimporter ventuellement plus tard.
1. Dcouverte
Dmonstration en direct ou visionnage de la vido.
En fonction du temps disponible, choisir de montrer soi-mme un exemple d'importation puis d'exportation de rfrence ou bien montrer la vido (3 minutes).
Problme : si le son ne marche pas, il faudra commenter soi-mme la vido.
La dmonstration peut se faire en deux temps :- import d'une rfrence d'ouvrage depuis le sudoc- depuis un document Open Office texte, crire citation et montrer un ajout de note de bas de page avec lien vers l'ouvrage prcdemment import.
Comment a marche?
Zotero rcupre les donnes bibliographiques sur internet et les enregistre dans un format de description bibliographique (Zotero RDF).
Il peut ensuite les rexporter en format texte en respectant plusieurs styles de prsentation prparamtrs.
Les logiciels pour diter des bibliographies
Prsentation du logiciel
Une extension de Firefox, gratuite
Existe aussi en logiciel indpendant Zotero StandAlone (compatible avec les navigateurs Chrome et Safari)
La question de la gratuit conduit tout droit aux avantages et inconvnients de Zotero.
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Exercice
Installer Zotero sur Firefox
L'installation de Zotero correspond une installation classique de module complmentaire sur Firefox.
Ceux qui connaissent dj cet outil iront trs vite pour l'installer, tandis que d'autres peuvent tre un peu dboussols par cette interface qu'il ne connaissent pas du tout (surtout s'ils ont l'habitude de travailler avec Explorer).
Installer Zotero
http://www.zotero.org
Installation termine!
2e tape de l'installation
Crez votre compte personnel sur http://www.zotero.org[register]
Exercice
Affichez puis masquez Zotero dans votre navigateur.
Zotero affich
Zotero masqu
Zotero en pleine page
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Importation de rfrences bibliographiques depuis le web
Exercice
http://portail-scd.univ-brest.fr
Trouvez dans le catalogue des BU de Brest la notice de l'ouvrage suivant
Huas D, Rueff B. Abord clinique des malades de l'alcool en mdecine gnrale. Paris: Springer; 2005.
Cette tape permet de vrifier que les stagiaires connaissent le Sudoc et sinon, de le leur faire dcouvrir.
Ne pas hsiter si le catalogue leur est totalement inconnu faire un petit appart sur le rebond localisation qui permet de savoir si l'ouvrage est disponible dans les bilbiothques de l'enseignement suprieur de France...
Et rappeler que depuis une requte Google Books, on peut rebondir dans Amazon mais aussi dans le Sudoc.
Exercice
Importez cette notice dans votre liste de rfrences Zotero.
Correction
Correction (suite)
Exercice 3
Trouvez et importez depuis le catalogue Sudoc trois rfrences d'ouvrages sur le sevrage tabagique.
Correction (2)
On peut importer dans sa bibliothque Zotero une liste de plusieurs ouvrages la fois.
Correction (3)
Correction (4)
Cochez les trois ouvrages que vous souhaitez importer...
Astuce : pour que vos rfrences aillent directement dans votre dossier Sevrage tabagique, il vous suffit de crer le dossier d'abord et de le slctionner avant d'importer vos rfrences.
Les rfrences sont alors automatiquement importes dans le dossier qui est dj ouvert par Zotero.
Correction (5)
Remarque : dans cet exemple, une des rfrences importes est une thseLes thses sont reprsentes par une icne spcifique
Exercice
Trouvez puis importez depuis la base PubMed la rfrence suivante
Dubar G. et al. French Experience of 2009 A/H1N1v Influenza in Pregnant Women. PLoS One [En ligne]. 2010, Vol. 5, n10.
.
Correction
Quand on importe un article, l'icne droite de la barre d'adresse est cette fois non pas un livre, mais une petite feuille.
Exercice : import d'une page web
Importez dans votre bibliothque Zotero l'article de blog suivant
Flahaut, Antoine. Grippe, la France Sentinelle de l'Europe? in Le Blog d'Antoine Flahaut, 24 septembre 2009.
Correction
Mme sans icne dans la barre d'adresse, il est toujours possible de capturer une page web
Correction
Ici, il faudra cependant corriger la notice importe pour indiquer qu'il s'agit d'un billet de blog et non pas d'une page web classique
Nota Bene
Il est toujours possible dans Zotero de crer manuellement une notice.
C'est la premire option qui est la plus intressante, condition d'avoir la place sur son disque dur ou sa clef USB de stocker une copie de ces fichiers;
Rcapitulatif des icnes d'importation
Importation d'une rfrence d'ouvrage
Importation simultane d'une liste de rfrences d'ouvrages ou d'articles
Importation d'une rfrence d'article
Importation d'une page web
Importation d'une rfrence de thse
Rappel : si aucune icne n'apparat, il faut alors entrer manuellement la notice ou bien importer la page web en se servant de la barre d'outil.
___________________________________
Dans le cas d'un titre de chapitre, il faut tlcharger la rfrence du livre, puis changer ensuite le type de notice dans le menu droulant de l'onglet info pour choisir chapitre de livre.
Puis il faudra corriger pour ajouter le titre et l'auteur du chapitre.
Quelques sites Zotero-compatibles
http://www.zotero.org/translators
Sites compatiblesCatalogue UBO
Sudoc
Pubmed
EbscoHost (Pascal)
Science Direct
CAIRN
HAL (archives ouvertes CNRS)
etc
Incompatible Cismef
Partiellement compatiblesUbodoc
Partiellement compatiblesUbodoc
BDSP
Cochrane
Rappeler aux stagiaires qu'il faut dans tous les cas vrifier que la rfrence importe est bien complte (auteur, titre, date, au minimum).> sinon, la modifier.
Import par ISBN, DOI ou PMID
La barre d'outils
Crer un dossier ou un sous-dossierImporter, exporter une bibliothque, rglage des prfrences etc...Annoter votre bibliothque ou vos dossiers ou sous-dossiers
Faire une recherche dans les lments de votre bibliothqueSaisir manuellement une notice
Joindre un fichier une rfrence
Crer une notice partir de la page web en cours
Importer par numro (ISBN, DOI, PMID...)
Crer un groupe ou une bibliothque partagePrsentation de la barre d'outil qui se trouve au-dessus des trois colonnes.
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6. Partager
Interface : les trois panneaux1 : La bibliothque (possibilit dorganiser en dossiers et sous-dossier,2 : Liste des notices du dossier slectionn,3 : La fiche de llment (article, ouvrage, page Internet etc.) slectionn.Source : Mathieu Poujol
Prsenter successivement les 3 colonnes
1) colonne de classementClasser les rfrences dans des collections facilite le travail. Il est possible de renommer les collections, les dplacer (pour les transformer en sous-dossier). Attention, les sous-collections ne sont pas prise en compte lors de la cration de bibliographie partir du dossier parent.
Ma bibliothque contient lensemble des rfrences rparties dans les collections ainsi que les rfrences non classes.
2) Colonne de liste des rfrencesOn voit dans cette colonne, en fonction du dossier slectionn, la liste des rfrences avec leur titre et une icne qui prcise le type de rfrence.
3) Colonne de description d'une rfrenceLa colonne de droite propose plusieurs onglets dlivrant des dtails sur llment slectionn dans la colonne du milieu et permettant dy associer des informations complmentaires.
Organiser sa bibliothque
Par collections/dossiers
Par marqueurs/mots-clefs
Source : Mathieu Poujol
Il y a deux faons possibles d'organiser sa bibliothque- par dossiers et sous-dossiers (conseill)- par mots-clefs (marqueurs ou tags) : attention, sur de nombreux sites des mots-clefs sont imports en mme temps que la notice.
Exercice
Enregistrez vos rfrences sur le sevrage tabagique dans- un sous-dossier intitul sevrage tabagique- qui se trouvera lui-mme dans un nouveau dossier de la bibliothque intitul : Tabacologie.
Correction
Correction (2)
Correction (3)
Associer un fichier une rfrence
Pour garder sous la main le pdf d'un article ou d'une thse
2 tapes
1) on tlcharge la rfrence
2) on associe le document pdf la rfrence
Exercice
http://hal.archives-ouvertes.fr
Dans l'archive ouverte HAL, trouvez et importez dans Zotero la rfrence de la thse suivante
Abtey, Catherine. La confiance chez les femmes primipares de la grossesse au post-partum. [Thse] Universit de Nantes, 2008.
Les mdecins auront normalement abord HAL durant le cours prcdent avec Catherine Bertignac.
Exercice (suite)
Associez la rfrence importe le fichier PDF du document (texte intgral de la thse version 1).
Correction
1. On slectionne la rfrence d'abord
2. On enregistre le pdf qui est affich dans Firefox
Correction
Il sera possible, mme sans connexion internet, de retrouver et de lire ce fichier.
Astuce : cette thse n'est pas encore rfrence dans le Sudoc (elle n'a sans doute pas encore t soutenue et corrige).
Dans le cas o la thse est prsente dans le Sudoc, il vaut mieux importer la rfrence depuis le sudoc avant d'y ajouter le fichier pdf tlcharg dans HAL
Le bouton afficer le fichier de gauche permet de lire le fichier dans son navigateur Firefox.
Le bouton afficher le fichier de droite permet de voir le fichier dans son contexte / emplacement sur l'ordinateur.
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Exportation d'une bibliographie dans un document texte
Par copier-coller
Avec la barre de citation
(dans Word)
OU BIEN
Exercice
Exportez l'ensemble de vos rfrences traitant du sevrage tabagique sous forme de bibliographie dans un document texte avec le style Vancouver
Par copier - coller
Correction
Par copier - coller
Correction (2)
Par copier - coller
Correction (3)
Coller le presse-papier dans un document texte.
1. Tanguy C. Addiction et sevrage tabagique. 2008 ;1 vol. (125 f.-X-10l.en coul.
2. Metzger-Flock A. Particularits de l'aide au sevrage tabagique en mdecine gnrale : propos d'une enqute ralise auprs des mdecins gnralistes de la rgion mulhousienne. 2005 ;89 f.
3. Perriot J., Llorca P., Boussiron D, Schwan R. Tabacologie et sevrage tabagique. Montrouge: J. Libbey Eurotext; 2003.
Installer la barre de citation
Quitter Word d'abord
Installer la barre de citation Zotero pour Word depuis l'adresse suivante
http://bit.ly/RWfAJO
Avec la barre de citation
O trouver la barre de citation dans Word?
La barre de citation Word/LibreOffice/OpenOffice
Source : Daniel Bourrion
Barre de citation : 2 tapes
Insrer des citations rfrences
Insrer la bibliographie complte
Exercice
Dans un nouveau document Word, insrez trois rfrences de votre bibliothque Zotero sous forme de citations avec le style Vancouver
Insrer des citations rfrences
Il faudra trouver une adresse plus courte pour que l'import du document soit plus facile.
Correction
Insrer des citations rfrences
Dans le cas du style Vancouver, l'insertion d'une rfrence dans un texte en cours de rdaction se fait en deux tapes1) insertion du numro de la rfrence2) insertion, la fin du document, de la bibliographie complte.
L'tudiant est dans ce cas invit diter sa bibliographie seulement la toute fin de son travail.
La barre de citation
Word / Libre Office /Open Office
Source : Daniel Bourrion
Exercice
Insrer la bibliographie complte des rfrences dj ajoutes en citation.
Insrer la bibliographie complte
Exercice
Ajouter cette bibliographie une rfrence qui ne fait pas partie des citations du document.
Insrer la bibliographie complte
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Sauvegarde de donnes
On peut sauvegarder manuellement sa bibliothque Zotero sur un disque dur
Pour l'utiliser plus tard sur un autre ordinateur avec Zotero
Pour l'importer dans un autre logiciel de gestion bibliographique si on dcide d'en changer : EndNote, Mendeley etc
Sauvegarde de donnes (2)
Il est aussi possible de sauvegarder sa bibliothque Zotero automatiquement par synchronisation avec son compte Zotero en ligne.
Exercice
Depuis votre bote mail, activez votre compte personnel Zotero en ligne (cr en dbut de sance)
Exercice (suite)
Dans les prfrences de Zotero, entrez les paramtres de votre compte Zotero pour la synchronisation de vos rfrences avec votre compte en ligne
Correction
Correction
Exercice
Synchronisez votre Zotero local avec votre profil Zotero en ligne
Correction
Vous avez dornavant 2 bibliothques Zotero
Une bibliothque locale
Une bibliothque en ligne
Ces 2 bibliothques sont synchronises.
Ma bibliothque Zotero (Library) en ligne
Ma bibliothque Zotero locale
Synchronisation
Exercice
- Connectez vous sur le site de Zotero (login) afin de pouvoir visualiser et grer votre bibliothque Zotero en ligne.
- Modifiez les paramtres de visibilit de votre page selon votre convenance
Paramtres de confidentialit : un exemple
Possibilit de travailler en groupe sur des bibliographies partages
Groupes privs
Groupes publics accs plus ou moins restreints
Groups publics avec bibliographie partage publiquecf. childhood obesity
Crer son groupe
Merci de votre attention !http://formation.scd.univ-brest.fr
Perrine HellySandrine Nicolas-Guihot
Pour nous contacter:
02.98.01.64.77
Crdits photographiques
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Caroline & Laurent sur Picasa
Universit de Bretagne Occidentale Service Commun de documentation
Mj novembre 2012