![Page 1: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/1.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.
Přírodovědecká fakulta MU
Ústav experimentální biologie
Oddělení genetiky a molekulární biologie
![Page 2: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/2.jpg)
1) Praktikum z obecné genetiky
2) Praktikum z genetiky rostlin
3) Praktikum z genetiky populací
![Page 3: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/3.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
• zájem se pohybuje v průměru kolem 200 studentů
• ostatní si volí dobrovolně
• Speciální biologie
• Ekologická a evoluční biologie
• Matematická biologie (2. ročník)
• Biologie se zaměřením na vzdělávání (4. ročník)
• ~ 1/3 (78/245) má předmět povinný
• Molekulární biologie a genetika
• Lékařská genetika a mol. diagnostika
• Antropologie
Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.; doc. Jana Řepková, CSc.; Mgr. Aneta Mikulášová
![Page 4: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/4.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
• rozdělení do seminárních skupin po 18 až 20 studentech
![Page 5: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/5.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Podmínky splnění:
• 80% docházka
• vyřešené zápočtové příklady
• odevzdaných 5 protokolů
• úspěšně složený zápočtový test (75 %)
![Page 6: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/6.jpg)
• v průměru kolem 85 %
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Úspěšnost získání zápočtu:
![Page 7: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/7.jpg)
• řešení zápočtových příkladů na téma
praktika
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Struktura praktika
(2 h, 90 min)
• úvodní prezentace tématu praktika
• experiment – praktický, simulovaný
![Page 8: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/8.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
především s využitím modelových organizmů
• Arabidopsis thaliana
• Drosophila melanogaster
![Page 9: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/9.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
1) Pozorování štěpení recesivně letálního znaku albina u monohybrida modelového
organizmu Arabidopsis thaliana
• seznámení se s výhodami genetického modelu
• rozpoznávání vybraných mutantů
![Page 10: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/10.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
• seznámení se s výhodami genetického modelu
• rozpoznávání vybraných mutantů
• založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida
![Page 11: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/11.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
• seznámení se s výhodami genetického modelu
• rozpoznávání vybraných mutantů
• založení pokusu pro sledování segregace znaku v potomstvu monohybrida
![Page 12: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/12.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
![Page 13: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/13.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
2) Pozorování dědičnosti s vazbou na pohlaví u modelového organizmu Drosophila
melanogaster (mutace white)
• seznámení s modelem
• nácvik manipulace
• rozpoznávání vybraných mutantů
• rozpoznávání pohlaví
![Page 14: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/14.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
• založení pokusu
• v lichých týdnech usmrcení rodičů
![Page 15: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/15.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
• založení pokusu
• v lichých týdnech usmrcení rodičů
• v sudých týdnech vyhodnocování první a druhé
generace potomků (celkem 1 měsíc s octomilkou)
![Page 16: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/16.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
3) Sledování dědičnosti kvantitativního znaku u modelového organizmu Drosophila
melanogaster
• základní charakteristika kvantitativních znaků
• popis vzniku populace jedinců F2 pro vyhodnocení
• stanovení počtu chloupků na vzorku 20 jedinců
![Page 17: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/17.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Experimenty
• vyhodnocení pokusu
![Page 18: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/18.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
„Experimenty“
4) konstrukce vlastního rodokmenu
• seznámení s pravidly tvorby rodokmenů
• pokyny pro tvorbu
![Page 19: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/19.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
„Experimenty“
4) konstrukce vlastního rodokmenu
• seznámení s pravidly tvorby rodokmenů
• pokyny pro tvorbu
• v následujících 4 týdnech si zvolí znak, zjistí výskyt u příbuzných a namalují
rodokmen
klepněte na obrázek pro přesměrování na video
Klepněte
pro přímý
odkaz do
aplikace
![Page 20: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/20.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
„Experimenty“
4) konstrukce vlastního rodokmenu
![Page 21: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/21.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
„Experimenty“
5) sestavení karyotypu neznámého člověka
• seznámení s pravidly pro identifikaci lidských chromozomů
• obdrží vyfotografované chromozomy – polovina sestavených, polovina
neidentifikovaných = mají zařadit do páru
![Page 22: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/22.jpg)
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
„Experimenty“
5) sestavení karyotypu neznámého člověka
• mohou si vyzkoušet také elektronicky
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764
klepněte na obrázek pro přesměrování na video
Klepněte
pro přímý
odkaz do
aplikace
![Page 23: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/23.jpg)
• segregace vloh, kombinace vloh, vazba genů
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Další dovednosti
6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript
klepněte na obrázek pro přesměrování na video
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764
Klepněte
pro přímý
odkaz do
aplikace
![Page 24: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/24.jpg)
• genetické mapování
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Další dovednosti
6) ověření znalostí pomocí animací z e-skript
klepněte na obrázek pro přesměrování na video
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764
Klepněte
pro přímý
odkaz do
aplikace
![Page 25: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/25.jpg)
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764
Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU
![Page 26: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/26.jpg)
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764
klepněte na obrázek pro přesměrování na video
Klepněte
pro přímý
odkaz do
aplikace
Elektronická skripta jsou volně k dispozici přes elportál MU
![Page 27: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/27.jpg)
• vzhledem k zájmu (200 a více studentů) praktika navržena tak, aby:
• nebyla finančně nákladná
• byla realizovatelná ve standardních prostorách
• a přitom byla pro studenty přínosná a zajímavá
PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY
Koncepce
http://is.muni.cz/elportal/?id=1317764
Ohlasy
![Page 28: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/28.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY ROSTLIN
Zaměření na metody genetické analýzy rostlin a problematiku genetických markerů
1. Genetická analýza a identifikace počtu genů odolnosti k padlí u planého ječmene
Hordeum vulgare subsp. spontaneum.
2. Určení mikrosatelitních DNA markerů v genetické vazbě s genem odolnosti k
padlí travnímu u ječmene.
3. Genetické mapování genů odolnosti k padlí travnímu u ječmene. Využití softwaru
pro mapování.
4. Identifikace transgenních rostlin Arabidopsis thaliana prostřednictvím genu
rezistence k antibiotiku.
5. Expresní analýza genu pro polyfenoloxidázu u jetele lučního pomocí RT-PCR.
Vyučující: doc. Jana Řepková, CSc.
![Page 29: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/29.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
• zájem se pohybuje v průměru kolem 60 studentů
54
• má dvě části:
• výpočtovou
• praktickou (pro omezený počet zájemců)
- obvykle 15 až 20 studentů
• úspěšnost kolem 92 %
Vyučující: RNDr. Pavel Lízal, Ph.D.
![Page 30: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/30.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
Výpočtová část
• řešení populačně-genetických příkladů
• formou e-learningu
![Page 31: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/31.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
Výpočtová část
• řešení populačně-genetických příkladů
• formou e-learningu klepněte na obrázek pro přesměrování na video
![Page 32: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/32.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
Praktická část
• pracují v 5 členných týmech
1) Celosemestrální pokus s octomilkou
Sledování ustavení Hardy-Weinbergovy rovnováhy pro znak vázaný na pohlaví
![Page 33: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/33.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
Praktická část
• vyhodnocování populace v generacích t+1 až t+4
• odevzdání týmových protokolů
![Page 34: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/34.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
Praktická část
2) Vyhodnocení dotazníků z populačního výzkumu v populaci člověka
Stanovení Snyderových podílů, ověření HW rovnováhy pro dva znaky v populaci
člověka a výpočet podílů heterozygotů mezi fenotypově dominantními jedinci
![Page 35: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/35.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
Praktická část
• každá skupina pracuje s 50 dotazníky
![Page 36: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/36.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
3) Stanovení shody v profilu DNA
Praktická část
![Page 37: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/37.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
3) Stanovení shody v profilu DNA
Praktická část
![Page 38: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/38.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
3) Stanovení shody v profilu DNA
Praktická část
![Page 39: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/39.jpg)
PRAKTIKUM Z GENETIKY POPULACÍ
4) Exkurze na Ústavu soudního lékařství a v Laboratoři forenzní genetiky
![Page 40: PRAKTIKUM Z OBECNÉ GENETIKY - fns.uniba.sk · PDF file• Molekulární biologie a genetika • Lékařská genetika a mol. diagnostika ... Elektronická skripta jsou volně k dispozici](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022052313/5a7879317f8b9a1f128b8294/html5/thumbnails/40.jpg)
Děkuji za pozornost