Download - Kaiken takana on loinen
![Page 1: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/1.jpg)
Kaiken takana on loinen
Tuomas AiveloBiotekniikan instituutti,Helsingin yliopistoDyna-miitti 2.10.2013
![Page 2: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/2.jpg)
Kaikilla maailman eliöillä on loisia.
Yli puolet maailman eliöistä on loisia.
![Page 3: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/3.jpg)
Mitä on loiset?Lä
heis yys+
-
Mutualismi
Kommensalismi
Sym
bi oo
si
Saalistus / laidunnus
ParasitoidismiUlkoloiset Sisäloiset
![Page 4: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/4.jpg)
Loiselämä
Ongelma:
Loisen pitäisi käyttää niin paljon isäntää hyödyksi kuin pystyy vaarantamatta omaa lisääntymiskykyä.
TRAGEDY OF COMMONS!
![Page 5: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/5.jpg)
Virulenssi
• Kuinka suurta haittaa kelpoisuudelle tauti aiheuttaa?
• Trade-off: Jos tapat uhrisi nopeasti, sinun pitää myös siirtyä seuraavaan uhriin nopeasti.
?
![Page 6: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/6.jpg)
![Page 7: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/7.jpg)
Tautien eri taktiikat
• Sukupuoliteitse• Vektorin välityksellä• Pisaratartunta• Yms.
![Page 8: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/8.jpg)
Miksei taudeista päästä koskaan eroon?
John Tenniel
![Page 9: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/9.jpg)
http://www.mpg.de/19341/Computational_disease_models?page=3
![Page 10: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/10.jpg)
Monista taudeista on päästy eroon!
• Isorokko – > rokotukset
• Guineamato– > hygienia
• Malaria Suomessa– > elintason nousu
![Page 11: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/11.jpg)
Monet taudit ovat vaikeita
• Zoonoosit:– Uusia tauteja koti- tai villieläimiltä• Viimeaikaisia mm. HIV, Ebola, influenssat
– Taudit liikkuvat enemmän toiseen suuntaan!
• Antibioottiresistenssiä:– Sairaalabakteerit: MRSA, VRE jne.– Malarialoisiot
![Page 12: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/12.jpg)
Madagaskar Madagaskar
eristyneenä viimeiset n. 85 miljoonaa vuotta
Ihmisasutus vakiintui n. 1500 vuotta sitten
Merkittävä määrä eläimiä kuollut sukupuuttoon viimeisen 1000 vuoden aikana
Alkuperäisestä metsäalasta jäljellä noin 15 prosenttia
![Page 13: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/14.jpg)
Ranomafanan kansallispuisto
• Itäisen Madagaskarin vuoristosademetsä
• Perustettu 1990• Kansainvälisen tason
tutkimusasema, Centre Valbio
![Page 15: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/15.jpg)
![Page 16: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/16.jpg)
Madagaskarin eläimistö
• Neljä endeemistä nisäkäsryhmää:– Makit, puoliapinoita– Tanrekit, afrikkalaisia hyönteissyöjiä– Madagaskarinrotat, jyrsijöitä– Falanukit, kissamaisia
• Tulokaslajeja:– Mustarotta, hiiri– Koira, kissa– Ihminen, zebu
![Page 17: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/17.jpg)
• Puoliapinoita• Pitkäikäisiä, jopa 10
vuotta luonnossa• Pieniä• Suhteellisen
pysyvät reviirit• Monenlaisissa
elinympäristöissä• Aktiivisimmillaan
lokakuussa (tää on vaan bonus)
Hiirimakit
![Page 18: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/18.jpg)
Makit
• Puoliapinoita• Yleisesti naarasdominantteja
![Page 19: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/19.jpg)
• Mallieläin Alzheimerin taudille?• Vanhenevat vankeudessa, eivät luonnossa• Horrostavat, naarasdominantteja, yöaktiivisia• Tulevaisuuden suunnitelmat sekvenoida
![Page 20: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/20.jpg)
Kenttätyö• Syyskuulta joulukuulle• Ansat öisin silmien
korkeudelle• Sisälle banaania
![Page 21: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/21.jpg)
Punkit ja täit:Ulkoloisten määrä
Mikrosiru yksilöt
Karvanäyte genetiikka
Morfometriikka-Paino-Hännän, hauiksen ja reiden ympärysmitta
Ulostenäyte:-Hormoonit-Sisäloiset-Ruokavalio
Vaginan ja kivesten kokoLisääntymistilaSukupuoli
Hammasvalos ikä
Persoonallisuus
Ansan sijainti ja aika
![Page 22: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/22.jpg)
![Page 23: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/23.jpg)
Opportunistista ulosteenkeräystä
Ansoihin tulee monenlaisia muitakin eläimiä
Isoja makeja voi seurata ja kerätä ulosteet
![Page 24: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/24.jpg)
Sukkulamadot
• Prevalenssi lähes 100%• Helppo eristää• Paljon tutkittuja, mutta…
![Page 25: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/25.jpg)
Pyrosekvensointi
• Lajintunnistaminen 18S-geenisekvenssin (ribosomin pieni yksikkö) perusteella
• Yhdessä näytteessä 0-1500 toukkamuotoa
![Page 26: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/26.jpg)
Mitä tehdä miljoonan 700 emäksen sekvenssin kanssa?
![Page 27: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/27.jpg)
Alustavia tuloksia
• Mustarotilla ja koirilla samaa lajistoa, joka eroaa hiirimakeista
• Hiirimakien loisia myös mustarotilla– > tulokaslaji lisää loistaakkaa?
• Horrostaminen tappaa sukkulamadot suolesta
![Page 28: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/28.jpg)
Kysymyksiä?
![Page 29: Kaiken takana on loinen](https://reader033.vdocuments.site/reader033/viewer/2022052316/559961a81a28ab59538b47be/html5/thumbnails/29.jpg)
Lisätietojahttp://twitter.com/aivelo http://www.biocenter.helsinki.fi/bi/evodevo/group_Jernvall.shtml
http://fifi.voima.fi/blogit/tekija/tuomas-aivelo
http://blogs.helsinki.fi/t-retki/author/aivelo/
https://peda.net/oppimateriaalit/e-oppi/lukio/biologia/symbioosi2/1pje/haastattelu
http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/bioteknologia/hiirimakien-loisten-tutkimus-perustuu-dnan-sekvensointiin
http://oppiminen.yle.fi/solubiologia/perinnollisyys/tutkijan-kommentti-perinnollisyyden-opetus-kaipaa-paivittamista