Transcript
Analiza danych z technik sekwencjonowania
nowej generacji
Krzysztof Chojnowski
Opiekun naukowy: prof. dr hab. inż. Krzysztof Zaremba
DNA
● Kwas deoksyrybonukleinowy
● Biopolimer złożony z nukleotydów
DNA
● Kwas deoksyrybonukleinowy
● Biopolimer złożony z nukleotydów
DNA
Chromatyna
ChIP-Seq
ChIP-Seq
● Sekwencjonowanie nowej generacji
ChIP-Seq
● Mapowanie do genomu referencyjnego
ChIP-Seq
● Mapowanie do genomu referencyjnego
ChIP-Seq
● Wykrywanie pików
WTD
Window Tag Density
MSP
Matching Strand Peaks
Mirror Tag Correlation
MTC
ChIP-Seq
● Tworzenie profilu wiązania
jChIP
jChIP
jChIP
jChIP
Dziękuję za uwagę!