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DNA MICROSATELLITE O STR (SHORT TANDEM REPEAT)
❖ 2-5 paia di basi del DNA ripetute in modo variabile (da 3 a 100 volte)
❖ molto frequenti nel genoma ❖ alleli uguali ereditati dai genitori = microsatellite
omozigote ❖ alleli diversi ereditati dai genitori = microsatellite
eterozigote
CA CA CA CA
CA CA CA CA CA
CA CA CA CA
CA CA CA CA CA
CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA CA
Allele 1
Allele 2
Allele 3
3. analisi dei prodotti di PCR mediante elettroforesi
PROCEDURA SPERIMENTALE
su gel su capillare
http://www.torinoscienza.it/media/giochi/dna_fingerprinting/index.html
http://geneed.nlm.nih.gov/topic_subtopic.php?tid=37&sid=38
confronto tra colonne: due profili uguali hanno le stesse bande
su gel su capillare
confronto tra picchi: due profil i uguali hanno p i c c h i d i s t e s s e dimensioni e forma e si trovano nella stessa posizione
TEST DI PATERNITA’ madre padre figlio
http://dwb4.unl.edu/Chem/CHEM869N/CHEM869NLinks/chemistry.about.com/science/chemistry/library/weekly/aa070698a.htm
Percorso sul sito del CODIS: - http://www.cstl.nist.gov/strbase/fbicore.htm - cliccare su un microsatellite e riportare la ripetizione nucleotidica - NCBI -> nucleotide -> nome del microsatellite -> selezionare il link corrispondente a tutto il DNA ->FASTA -> trovare ripetizione con la funzione “trova” -> possono contare quante ripetizioni ha questo individuo www.torinoscienza.it/media/giochi/dna_fingerprinting/index.html (slide 10 per elettroforesi capillare) http://unlockinglifescode.org/media/genomic-stories-archive