distribusi genotip cyp2e1 pada penderita kanker nasofaring dari suku sunda dan non sunda
DESCRIPTION
DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA. DWI ANITA SURYANDARI Departemen Biologi Kedokteran FKUI. KARSINOMA NASOFARING. tumor ganas pada sel epitel nasofaring. Etiologi : infeksi EBV, kekerapan konsumsi makanan mengandung nitrosamin. - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/1.jpg)
DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1
PADA PENDERITA KANKER PADA PENDERITA KANKER NASOFARINGNASOFARING
DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDADARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA
DWI ANITA SURYANDARIDWI ANITA SURYANDARIDepartemen Biologi Kedokteran FKUIDepartemen Biologi Kedokteran FKUI
![Page 2: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/2.jpg)
KARSINOMA NASOFARINGKARSINOMA NASOFARING tumor ganas pada sel epitel nasofaring.tumor ganas pada sel epitel nasofaring.
Etiologi Etiologi : infeksi EBV, kekerapan konsumsi makanan : infeksi EBV, kekerapan konsumsi makanan mengandung nitrosamin.mengandung nitrosamin.
DiagnosisDiagnosis : berdasar uji serologi,biopsi, PCR. : berdasar uji serologi,biopsi, PCR. TerapiTerapi : radiokemoterapi (efektif). : radiokemoterapi (efektif).
![Page 3: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/3.jpg)
INFEKSI EBVINFEKSI EBV Hampir Hampir 90% 90% ppopulasiopulasi manusia di duniamanusia di dunia terinfeksi EBV. terinfeksi EBV. EBV : EBV : (h(hospes spesifikospes spesifik).).
Infeksi pada anak-anakInfeksi pada anak-anak asimptomatik Imunitas asimptomatik Imunitas Infeksi pada dewasa mudaInfeksi pada dewasa muda mononukleosis (L) mononukleosis (L)
![Page 4: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/4.jpg)
PETA DISTRIBUSI KNFPETA DISTRIBUSI KNF
Cina Selatan
30-50/100rb
Thailand3/100rb
Indonesia4,7/100rb
Eropa1/100rb
Amerika Utara
1/100rb
![Page 5: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/5.jpg)
MULTIFAKTORIAL KNFMULTIFAKTORIAL KNF
FAKTORLINGKUNGAN
FAKTOR GENETIK
INFEKSI EBV &
KARSINOGEN
GEN VIRUS
GEN PEJAMU
NITROSAMIN
POLIMORFISMEGEN CYP2E1
KNF
![Page 6: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/6.jpg)
Studi pendahuluan : penderita KNF di Indonesia Studi pendahuluan : penderita KNF di Indonesia (RSCM) pada suku sunda lebih banyak (RSCM) pada suku sunda lebih banyak daripada suku non Sunda. daripada suku non Sunda.
Masalah :Masalah :1.1. Bagaimana distribusi genotip CYP2E1 pada Bagaimana distribusi genotip CYP2E1 pada
penderita KNF penderita KNF suku Sunda dan non Sunda?suku Sunda dan non Sunda? 2.2. Apakah genotip dan alotip CYP2E1 Apakah genotip dan alotip CYP2E1
berasosiasi dengan suseptibilitas individu berasosiasi dengan suseptibilitas individu terhadap KNF? terhadap KNF?
![Page 7: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/7.jpg)
GEN CYP2E1GEN CYP2E1
Lokasi : 10q24.3-q terminal, 9 exon dan Lokasi : 10q24.3-q terminal, 9 exon dan 8 intron (11,8 kb) 8 intron (11,8 kb)
Polimorfik = Substitusi 7668T-A pada Polimorfik = Substitusi 7668T-A pada intron 6intron 6
![Page 8: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/8.jpg)
PETA RESTRIKSI CYP2E1PETA RESTRIKSI CYP2E1
874 pb 121 pb
302 pb 572 pb 121 pb
C
D
Dra I
Dra I Dra I
![Page 9: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/9.jpg)
ISOLASI DNA AMPLIFIKASI GEN CYP2E1
PCR Mix: (Sampel DNA; PCR green Go Taq buffer 1X; 1,5 mM MgCl2; 0,2
mM dNTP; 0,4 pmol/µl primer F, primer R ; 0,25 unit enzim DNA
polimerase Taq; dan ddH2O steril sampai volume total 25 µl).
Kontrol negatif (campuran pereaksi PCR tanpa sampel DNA)
94o C 1’
60o C 2’
72o C 7’
DenaturasiEkstensi
30 siklus
95o C 5’
4o C
72o C 2’
Annealing
Denaturasi awal
Ekstensi akhir
ELEKTROFORESIS
Gel agarosa 2% (b/v)
- Produk PCR/RFLP
- Kontrol negatif
- Penanda berat DNA
X174RF/HaeIII
- Kontrol positif
Elektroforesis dengan tegangan 90 V selama 50 menit.
Divisualisasikan di bawah iluminator UV dan difoto dengan Film Polaroid 667 ISO 3000 8,5 x 10,8 cm Black and White Instant Pack Film menggunakan kamera Polaroid.
![Page 10: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/10.jpg)
Hasil digesti enzim DraI pada sekuen gen CYP2E1 Hasil digesti enzim DraI pada sekuen gen CYP2E1
M 4 5 6 7 8
500 pb572 pb
200 pb
121 pb
302 pb
100 pb
874 pb
M DD DD DC DD CC
![Page 11: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/11.jpg)
Sebaran umur kelompok KNF dan KontrolSebaran umur kelompok KNF dan Kontrol
Jumlah % Jumlah %<=20 5 10 9 1821-30 6 12 11 2231-40 14 28 14 2841-50 13 26 10 2051-60 11 22 6 12>=61 1 2 0 0
Rata-rata (Mean) 8.33 16.67 8.33 16.67SD 5.13 10.25 4.84 9.69
KNF KONTROLUmur (tahun)
![Page 12: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/12.jpg)
Perbandingan distribusi genotip dan Perbandingan distribusi genotip dan alotip gen CYP2E1 alotip gen CYP2E1 pada kelompok KNF pada kelompok KNF dan Kontrol.dan Kontrol.
C (%) D (%)KNF 50 2 13 35 17.0 83.0Kontrol 50 1 14 35 16.0 84.0
DDFrekuensi Alel
Kelompok Total CC DC
![Page 13: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/13.jpg)
17
83
16
84
0
10
20
30
40
50
60
70
80
90
alel C (%) alel D (%)
KNF
Kontrol
tidak ada perbedaan secara bermaknatidak ada perbedaan secara bermakna distribusi distribusi genotip dan alotip gen CYP2E1 antara kelompok genotip dan alotip gen CYP2E1 antara kelompok penderita KNF dengan kelompok kontrol.penderita KNF dengan kelompok kontrol.
![Page 14: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/14.jpg)
Tidak ada perbedaan secara bermaknaTidak ada perbedaan secara bermakna genotip dan genotip dan alotip CYP2E1 pada kelompok kontrol suku Sunda alotip CYP2E1 pada kelompok kontrol suku Sunda dan non-Sunda.dan non-Sunda.
C(%) D (%)Suku Sunda 38 2 13 23 22.4 77.6Non Sunda 62 1 14 47 12.9 87.1
DDFrekuensi Alel
Kelompok Jumlah CC DC
Perbandingan genotip dan alotip CYP2E1 pada kelompok kontrol suku Sunda dan nonSunda
![Page 15: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/15.jpg)
Perbandingan genotip dan alotip CYP2E1 pada kelompok KNF suku SUnda dan nonSunda
![Page 16: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/16.jpg)
Chi squareChi square ,CI 95% , α = 0,05 diperoleh nilai p = 0.1846 ,CI 95% , α = 0,05 diperoleh nilai p = 0.1846 ( p>0,05) ( p>0,05) distribusi alotip antara suku Sunda dengan distribusi alotip antara suku Sunda dengan non-Sunda pada kelompok penderita KNFnon-Sunda pada kelompok penderita KNF : : tidak ada tidak ada perbedaan secara bermakna.perbedaan secara bermakna.
Gambar 20. Grafik perbandingan distribusi alotip gen Gambar 20. Grafik perbandingan distribusi alotip gen
CYP2E1 antara suku Sunda dan non-Sunda pada CYP2E1 antara suku Sunda dan non-Sunda pada kelompok KNF.kelompok KNF.
21.9
78.1
14.7
85.3
0.0
10.0
20.0
30.0
40.0
50.0
60.0
70.0
80.0
90.0
Alel C(%) Alel D (%)
Sunda
Non Sunda
![Page 17: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/17.jpg)
KESIMPULANKESIMPULAN
1.1. DDistribusi genotip istribusi genotip DD:DC:CCDD:DC:CC pada kelompok pada kelompok penderita KNF adalahpenderita KNF adalah 70%:26%:4%70%:26%:4% dan dan distribusi alotip distribusi alotip D D : C: C adalah adalah 83% 83% :1:17%.7%.
2.2. Frekuensi alel C pada suku Sunda cenderung Frekuensi alel C pada suku Sunda cenderung lebih tinggi daripada non-Sunda dan berbeda lebih tinggi daripada non-Sunda dan berbeda bermakna pada p<0,10. bermakna pada p<0,10.
3.3. Genotip dan alotipGenotip dan alotip CYP2E1 tidak berhubungan CYP2E1 tidak berhubungan dengandengan suseptibilitas individu terhadap KNF suseptibilitas individu terhadap KNF. .
![Page 18: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/18.jpg)
MANFAAT PENELITIAN :MANFAAT PENELITIAN :
1.1. Hasil penelitian ini merupakan data awal Hasil penelitian ini merupakan data awal tentang pola distribusi alel gen CYP2E1 tentang pola distribusi alel gen CYP2E1 pada populasi di Indonesia. Diharapkan pada populasi di Indonesia. Diharapkan data ini dapat digunakan data ini dapat digunakan sebagai acuan sebagai acuan penelitian keganasan lainnya yang penelitian keganasan lainnya yang dihubungkan dengan aktivitas enzim dihubungkan dengan aktivitas enzim CYP2E1. CYP2E1.
2.2. Dapat dimanfaatkan sebagai Dapat dimanfaatkan sebagai bahan bahan konseling bagi keluarga penderita KNF agar konseling bagi keluarga penderita KNF agar dapat mengambil tindakan preventif untuk dapat mengambil tindakan preventif untuk meminimalkan resiko terkena KNF.meminimalkan resiko terkena KNF.
![Page 19: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/19.jpg)
![Page 20: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/20.jpg)
KARSINOGEN DALAM KARSINOGEN DALAM MAKANAN – KEGANASANMAKANAN – KEGANASAN
NELAYAN HONG KONG(Ho,1972)
TIKUS(Huang, 1978)
IKAN ASIN(NITROSAMIN)
KARSINOMANASOFARING
KARSINOMAKAVUM NASALIS
![Page 21: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/21.jpg)
NITROSAMINNITROSAMIN
Dapat Dapat terbentuk pada saat terbentuk pada saat pemanasan proteinpemanasan protein
terdapat dalam makananterdapat dalam makanan yang diayang diawetwetkkanan, di, diasapasapi, i,
Dan padaDan pada asap asap rokokrokok
![Page 22: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/22.jpg)
Terbentuknya NitrosaminTerbentuknya Nitrosamin
NITRAT/NITRIT
NITRIT
SENYAWAAMIN
ALKILAMIN(IKAN ASIN)
NITROSAMIN
NITROSAMIN
G.I.
![Page 23: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/23.jpg)
FAKTOR GENETIK PEJAMUFAKTOR GENETIK PEJAMU
NITROSAMIN TUBUH
METABOLISMEOLEH CYP
POLIMORFISMEGEN CYP2E1
EExtensive metabolizersxtensive metabolizers ((EMEM))
PoorPoor metabolizers metabolizers (P(PMM))
![Page 24: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/24.jpg)
KARSINOGENESISKARSINOGENESISZAT KIMIA
PROKARSINOGEN
ZAT KIMIAT’konjugasi
Metabolit Reaktif(karsinogen akhir)
Bhn gntk yg pulih(sel Normal)
Makromol ygTelah b’ubah
Metabolitantara
Zat kim yg diexcresi
Makromolekul dlm ∆(bhn gntk yg b’∆)
Inisiasi Sel Tumor
Neoplasma t’diferensiasi
KANKER
P’ikatan thd makromol
Replikasi
Promosi
Konversi & pkb
perbaikan
Ik.kov dg GSH/fenol
excresi
bioaktivasi
![Page 25: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/25.jpg)
Hasil sekuensing gen CYP2E1Hasil sekuensing gen CYP2E1(dari lembaga Biologi molekuler Eijkman)(dari lembaga Biologi molekuler Eijkman)
![Page 26: DISTRIBUSI GENOTIP CYP2E1 PADA PENDERITA KANKER NASOFARING DARI SUKU SUNDA DAN NON SUNDA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062410/568154b8550346895dc2c0be/html5/thumbnails/26.jpg)
Hasil sekuensing (dari LBM.Eijkman)Hasil sekuensing (dari LBM.Eijkman)