department of microbiology, nutrition and dietetics head: prof. ing. vojtěch rada, csc

21
Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc. [email protected] Czech University of Life Sciences Prague Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Upload: baird

Post on 16-Mar-2016

58 views

Category:

Documents


2 download

DESCRIPTION

Czech University of Life Sciences Prague Faculty of Agrobiology, Food and Natural Resources. Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc. rada @ af.czu.cz. Hlavní výzkumné oblasti (Katedra m i k robiolog ie , výživy a dietetiky). - PowerPoint PPT Presentation

TRANSCRIPT

Page 1: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics

Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, [email protected]

Czech University of Life Sciences PragueFaculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Page 2: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o gastrointestinální mikroflóra (bifidobakterie, bakterie mléčného kvašení, klostridia, aj.) – kuřata, jehňata, telata, kojenci, aj.; ale i včely, čmeláci

o probiotické bakterie, prebiotikao půdní mikrobiologieo výživa živočichů (hospodářských, psů, exotických

zvířat, aj.)o speciální otázky výživy člověkao kultivace včelích larev in vitro

Hlavní výzkumné oblastiHlavní výzkumné oblasti (Katedra(Katedra mmiikkrobiologrobiologie, výživy a dietetiky)ie, výživy a dietetiky)

Page 3: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o řada mikroskopů, zvláště Nikono kompletní vybavení pro kultivaci a identifikaci

aerobních a anaerobních mikroorganismů o vybavení pro molekulárně-genetické metody; např.:

PCR, DGGE, sekvenace, FISH, elektroforesa, aj.o vybavení pro fyzikálně-chemické analýzy

(spektrofotometry, chromatografy, systém pro detekci forem C a N, aj.)

o vybavení pro kompletní analýzu krmiv

Vybavení pro výzkumVybavení pro výzkum (Katedra(Katedra mmiikkrobiologrobiologie, výživy a dietetiky)ie, výživy a dietetiky)

Page 4: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o detekce a izolace probiotických bakterií z různých zdrojů

o in vitro charakterizace probiotických bakteriío selekce nových probiotických kmenů podle jejich

schopnosti přežívat in vivo podmínkácho růst gastrointestinálních bakterií na prebiotikách

(inulin, FOS, GOS)o bakterie a prebiotické látky v lidském mléce

Probiotika – prebiotika – Probiotika – prebiotika – gastrointestinální mikrofloragastrointestinální mikroflora

prof. Rada, doc. Vlkováprof. Rada, doc. Vlková

Page 5: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o Rada V., Šplíchal I., Ročková Š., Grmanová M., Vlková E.: Susceptibility of bifidobacteria to lysozyme as a possible selection criterion for probiotic bifidobacterial strains. Biotechnol. Lett. DOI 10.1007/s10529-0090170-7

o Killer J., Kopečný J., Mrázek J., Rada V., Benada O., Koppová I., Havlík J., Straka J.: Bifidobacterium bombi sp nov. from the bumblebee degestive tract. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 59, 2020-2024, 2009

o Rada V., Nevoral J., Trojanová I., Tománková E., Šmehilová M., Killer J.: Growth of infant faecal bifidobacteria and clostridia on prebiotic oligosaccharides in in vitro conditions. Anaerobe, 14, 205-208, 2008

o Vlková E., Rada V., Trojanová I., Killer J., Šmehilová M.: Occurrence of bifidobacteria in faeces of calves fed milk or a combined diet. Arch. Anim. Nutr. 62, 359-365, 2008

o Rada V., Vlková E., Nevoral J., Trojanová I.: Comparison of bacterial flora and enzymatic activity in faeces of infants and calves. FEMS Microbiol. Lett. 258, 25-28, 2006

o Vlková E., Nevoral J., Jencikova B., Kopečný J., Godefrooij J., Trojanova I., Rada V.: Detection of infant faecal bifidobacteria by enzymatic methods. J. Microbiol. Meth. 60, 365-373, 2005

SSeelleectedcted papers papers((Department of Microbiology, Nutrition and DieteticsDepartment of Microbiology, Nutrition and Dietetics))

Page 6: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Enzymatic and biochemical methods for Enzymatic and biochemical methods for bifidobacteria detection and identificationbifidobacteria detection and identification

1 2 3 4

Bifidobacteria-positive (1) and bifidobacteria-negative (2) faecal samples (3 – positive

control)

A - bifidobacteria-positive faecal sample, B - bifidobacteria-negative faecal sample (No13 - α-galactosidase, No16 - α-

glucosidase)

fructose-6-phosphate phosphoketolase activity

α-galactosidase and α-glucosidase activity (API ZYM, BioMérieux, Francie)

Biochemical kits API 50 CHL a API ID 32A Rapid (BioMérieux, Francie)

Page 7: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

genus- or species-specific PCR

Nested-DGGE

Molecular methods for detection and Molecular methods for detection and identificationidentification of intestinal bacteria of intestinal bacteria

FISH procedure using bifidobacteria-specific (A) and clostridia-specific (B) probes

PCR – RAPD

Page 8: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Utilization of glucose (glu) ang raffinose (raf) and growt curve (OD620nm) of B. animalis CCM

Influence of prebiotics on bacterial growtInfluence of prebiotics on bacterial growthhGrowth of clostridia and

bifidobacteria on prebiotics

Cells of lysozyme-resistant B. bifidum after incubation (24h) in human milk

Page 9: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o monitoring mikrobiálních procesů rekultivace po těžbě uhlí v SHD uvádění půdy do klidu procesy v různých půdních typech

o kompostování (komunální zeleň + výkopové zeminy + rašelina + agroperlit) jako alternativa zahradnických substrátů pro množení

o biodegradace nově navržených komposit (plastů) na bázi modifikovaného škrobu

PPůdní mikrobiologieůdní mikrobiologieprof. Voříšek, doc. Růžekprof. Voříšek, doc. Růžek

Page 10: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o analýzy forem půdního C rehydratační metoda stanovení C-mikrobiální

biomasy oxidovatelný C, extrahovatelný C mineralizace organického C

o koloběh N : amonifikace (= mineralizace org-C), nitrifikace (vždy aktuální obsah a potenciální aktivita)

PPůdní mikrobiologieůdní mikrobiologiemetodymetody

Page 11: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o navržen biodegradovatelný kompozit s matricí na bázi modifikovaného pšeničného škrobu = potenciální obalový materiál

o již po 18 dnech uložení v kompostu pozorovatelná značná biodegradace

o výstup právní ochrana – dva užitné vzory: CZ24012 U1 a CZ24012 U2

PPůdní mikrobiologieůdní mikrobiologiebiodegradace biodegradace (+VŠCHT + ÚMCH ČAV)(+VŠCHT + ÚMCH ČAV)

Page 12: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

September 29, 2011

Page 13: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o hyperurikemie a její regulaceo extrakce prvků z kávy

PProblematika potravinroblematika potravindoc. Havlíkdoc. Havlík

Page 14: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Purinové deriváty v potravinách• Dietní puriny ovlivňují plasmovou hladinu kyseliny močové

(hyperurikemie)• Zvýšení plasmové hladiny kyseliny močové může vést k dně a

ledvinovým kamenům• Některé potraviny založené na soji (alternativy masa) neměly by být

doporučovány hyperurikemickým subjektům (vysoký obsah purinů)

Page 15: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Xantin oxidase inhibitory v potravinách mají antihyperurikemickou aktivitu

• Léčivé rostliny, koření a bylinné čaje inhibují xantin oxidasu

• Inhibice xantin oxidasy reguluje hyperurikemii

• Studovali jsme rostlinné produkty běžně používané v ČR k eliminaci ledvinových kamenů

Inhibice (% enzymatické aktivity) různých rostlinných produktů tradičně používáných při léčení ledvinových kamenů nebo revmatismu v Evropě

Page 16: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Prvkové složení výluhů kávy

• Na světě se používají různé postupy při přípravě kávy

• Postupy hrají signifikantní roli v extrakci prvků, některé prvky jsou extrahovány z použitých nádob.

• Použitím efektivních metod extrakce káva může být důležitým zdrojem prvků porovnatelná s čajem.

Extrakce vybraných prvků z kávy při použití 3 různých metod (mg/100g mletých zrn), měřeno ICP-OESMud=turecká; moka; drip-brew f. = překapávaná

Havlík J., Drábek O., Száková J.

Page 17: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

o metoda odchovu včelích larviček in vitroo larvičky jako modelový organismuso tkáňové kultury pro testaci přírodních látek

Včelí larvičky, testace přírodních látekVčelí larvičky, testace přírodních látekdoc. Havlík, ing. Doskočil, ing. Hroncovádoc. Havlík, ing. Doskočil, ing. Hroncová

Page 18: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Nová metoda

vizualizace

Testy

in vitro

Odchov včelích larviček in vitro

Page 19: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

bandy představující třídu bakterií

Identifikace mikroflóry v zažívacím traktu včel

VL 1 Astádium (Včela Létavka)

opakování

stanoviště

Kukla Bílá

Page 20: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

In cellulo testovaní antioxidační a cytotoxické aktivity přírodních látek

Page 21: Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics  Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc

Czech University of Life Sciences PragueFaculty of Agrobiology, Food and Natural Resources

Department of Microbiology,Department of Microbiology, Nutrition and Dietetics Nutrition and Dietetics Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc.Head: prof. Ing. Vojtěch Rada, CSc.

[email protected]

Děkuji za pozornostprof. Ing. Karel Voříšek, CSc.