chương 4 tái bản của dna
DESCRIPTION
Chương 4 Tái bản của DNA. Sinh sản: sự liên tục của tính kế thừa, đòi hỏi tái bản chính xác của vật liệu DT Mô hình tái bản phân tử DNA tìm thấy trong tế bào E.coli Vật chất di truyền ở các cơ thể sống là DNA sợi kép (virus không được coi là dạng sống có cấu trúc tế bào) - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/1.jpg)
Chương 4Tái bản của DNA
![Page 2: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/2.jpg)
• Sinh sản: sự liên tục của tính kế thừa, đòi hỏi tái bản chính xác của vật liệu DT
• Mô hình tái bản phân tử DNA tìm thấy trong tế bào E.coli
• Vật chất di truyền ở các cơ thể sống là DNA sợi kép (virus không được coi là dạng sống có cấu trúc tế bào)
• Hai sợi của DNA được tổng hợp theo 2 cách khác nhau: một sợi được tổng hợp liên tục, còn sợi kia tổng hợp gián đọan (tổng hợp các đọan Okazaki, sau đó các đọan này nối lại với nhau.
![Page 3: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/3.jpg)
4.1 Các mô hình tái bản DNA: bảo toàn, bán bảo toàn và phân tán
• Mô hình chuỗi xoắn kép của Watson và Crick là chìa khóa để giải thích khả năng tái bản và tái bản chinh xác của DNA
• Nguyên tắc bổ sung cho 2 sợi đơn là mấu chốt của quá trình tái bản
• Vấn đề là sự phân bố phân tử mẹ trong phân tử con
![Page 4: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/4.jpg)
4.1.1 Mô hình bán bảo toàn (Semiconservative): tất cả các phân tử của phân tử DNA mẹ thành một sợi DNA con mà không bị sắp xếp lại và sợi DNA tạo ra hòan tòan mới
4.1.2 Mô hình bảo toàn (Conservative): hai sợi của phân tử DNA mẹ làm khuôn mẫu cho 2 sợi phân tử con và đi đôi với nhau
4.1.3 Mô hình phân tán (Dispersive): phân tử của DNA đều có mặt trong phân tử con nhưng ở dạng các đọan nằm rải rác trong phân tử con
![Page 5: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/5.jpg)
Figure 20.1
![Page 6: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/6.jpg)
Thí nghiệm của Meselson và Stahl
Meselson và Stahl dùng kỹ thuật ly tâm gradient nồng độ (dung dịch CsCl2)
Ly tâm với tốc độ cao, các phân tử bị đẩy tới vùng chênh lệch nồng độ bởi lực ly tâm
![Page 7: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/7.jpg)
Figure 20.2
![Page 8: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/8.jpg)
![Page 9: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/9.jpg)
4.2 Các thành phần cần thiết cho tái bản DNA ở prokaryot
1. Phân tử DNA khuôn
2. Điểm khởi đầu
3. Các protein
4. Các nucleotide
5. Các enzym
![Page 10: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/10.jpg)
4.2.1 DNA khuôn
• Quá trình tổng hợp các sợi DNA mới cần có các sợi DNA gốc là khuôn
• Các nucleotide lựa chọn phù hợp các nucleotide trên sợi khuôn
• Thông tin trên sợi DNA gốc dùng để tạo thông tin trên sợi bổ sung
![Page 11: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/11.jpg)
4.2.2 Điểm khởi đầu
• Điểm khởi đầu tái bản: 245 bp
• Khởi đầu tái bản trải qua 3 bước: 1/ Nhận biết đoạn khởi đầu, 2/ phá vỡ liên kết hydrogen, 3/ gắn enzym helicase
![Page 12: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/12.jpg)
4.2.3 Protein
• AdnA: nhận biết và bám vào đoạn khởi đầu tái bản
• Phức hợp AdnB và AdnC điều khiển bởi AdnA
• SSB có vai trò giữ cho 2 sợi đơn tách nhau.
![Page 13: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/13.jpg)
Protein machinery for DNA replication
![Page 14: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/14.jpg)
4.2.4 Nucleotide
- 4 loại nucleotide: dATP, dGTP, dCTP và dTTP: hợp chất cao năng
- Để tổng hợp các nucleotide cao năng cần 2 hệ thống phản ứng enzym.
- Nucleotide có 3 vai trò:
+ Đơn vị cấu trúc
+ trật tự của nó là nội dung thông tin di truyền
+ là nguồn năng lượng cho họat động tổng hợp
![Page 15: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/15.jpg)
4.2.5 Enzym
• Gyrase: làm giảm sức căng bằng phá vỡ không liên tục các lk phosphodiester. Thường có khoảng 10 Nu thì 1 lk bị phá vỡ
• Helicase: hoạt tính của helicase là đặc tính của protein AdnB và protein Rep, sự kết hợp của 2 protein này được gọi là enzym helicase. Các protein cùng với protein SSB tách rời hai sợi của phân tử DNA bằng phá vỡ lk hydrogen
![Page 16: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/16.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Helicase
![Page 17: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/17.jpg)
Vai trò của DNA Gyrase
Helicase
Supercoiled DNA
Gyrase
![Page 18: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/18.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 19: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/19.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 20: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/20.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 21: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/21.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 22: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/22.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 23: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/23.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 24: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/24.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 25: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/25.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 26: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/26.jpg)
The Role of DNA Gyrase
Gyrase
![Page 27: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/27.jpg)
• RNA polymerase và primase: tổng hợp đoạn RNA ngắn gọi là mồi
• DNA polymerase III: một trong 2 enzym giữ vai trò tái bản.
• DNA polymerase I: có 3 hoạt tính:+ Tạo chuỗi DNA+ Cắt chuỗi DNA theo chiều 5’-3’+ Cắt chuỗi DNA theo chiều 3’-5’ đọc và sửa
• Ligase: nối các đoạn DNA trong quá trình tái bản, sửa chữa và tái tổ hợp
![Page 28: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/28.jpg)
Structures of DNA polymerase during polymerizing and editingE: exonucleolytic; P: polymerization
![Page 29: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/29.jpg)
3
Polymerase III
5’ 3
’
Leading strand
base pairs
5’
5’
3’
3’
Supercoiled DNA relaxed by gyrase & unwound by helicase + proteins:
Helicase +
Initiator Proteins
ATP
SSB Proteins
RNA Primer
primase
2Polymerase III
Lagging strand
Okazaki Fragments
1
RNA primer replaced by polymerase I& gap is sealed by ligase
![Page 30: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/30.jpg)
DNA ligase seals the gaps between Okazaki fragments with aphosphodiester bond (Fig. 3.7)
![Page 31: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/31.jpg)
4.3 Tái bản DNA sợi kép ở prokaryot
Tái bản DNA của E.coli được điều khiển chặt chẽ và chỉ xảy ra một lần cho mỗi kỳ phân bào
1. Thời gian tái bản liên quan với các điều kiện sinh lý, sinh hóa trong phân chia tế bào
2. Thời gian điều khiển sao cho DNA chỉ nhân đôi một lân trong quá trình phân chia
3. Khởi đầu cho tái bản chỉ xảy ra cho điều kiện thuận lợi của sự phát triển tế bào
![Page 32: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/32.jpg)
4.3.1 Tái bản DNA nửa gián đoạn
a, Khởi đầu tái bản
B, Sự hình thành primosome
C, Tổng hợp sợi dẫn đầu (Leading strand)
D, Tổng hợp sợi theo sau (Lagging strand)
![Page 33: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/33.jpg)
DNA replication Fork
![Page 34: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/34.jpg)
Lagging strand synthesis
![Page 35: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/35.jpg)
MCM proteins
PCNA
RPC
Topoisomerase
![Page 36: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/36.jpg)
Khởi đầu tái bản
![Page 37: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/37.jpg)
Sự hình thành primosome
![Page 38: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/38.jpg)
SSBsDNA Polymerase III
Primase
Primer
DNA Pol III Lagging
Strand
DNA Polymerase I
Leading Strand
DNA Ligase
Helicase
![Page 39: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/39.jpg)
4.3.2 Tổng hợp DNA theo hai chiều
a/ DNA Virus dạng thẳng
b/ Plasmid
c/ Phần lớn các cơ thể sống
![Page 40: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/40.jpg)
Replication of Bacterial DNA from a Single Origin
Single replication origin in bacteria.
![Page 41: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/41.jpg)
Tóm tắt quá trình tái bản ở vi
khuẩn
![Page 42: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/42.jpg)
A Summary of DNA
Replication in Bacteria
![Page 43: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/43.jpg)
4.4 Tái bản DNA ở Eukaryot
1. Eukaryot có kích thước và số lượng lớn hơn2. Thời gian cần tái bản 6-8h, ở E.coli – 40 phút3. Có nhiều điểm khởi đầu tái bản trên NST, cách nhau
20 kb4. Tái bản 2 chiều bắt đầu tại 1 điểm và tiếp tục khi 2
chạc tái bản của 2 điểm khởi đầu kế nhau nhập làm một
5. Tốc độ t/b 10-100 Nu/s, ở prokaryot – 1.500 Nu/s6. Trong phase G17. DNA nhân đôi trong phase S của chu kỳ tb8. Có 5 DNA polymerase
![Page 44: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/44.jpg)
![Page 45: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/45.jpg)
Multiple Replicons in Eukaryotic DNA
• Replicon: each region served by one origin.
• Several thousand replicon in large eukaryotic cells.
• 50-300 kb each
![Page 46: Chương 4 Tái bản của DNA](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062301/568150af550346895dbecbd8/html5/thumbnails/46.jpg)
4.5 Tính chính xác của quá trình tái bản
• 1 sai sót trong 1 tỷ cặp base ở E.coli, hay 1 sai sót/1.000 tế bào
• Hai cơ chế: tránh sai sót và sửa sai sót