charla biología sintética en garagelab
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Charla sobre Biología Sintética en GarageLab. Mayo, 2012.TRANSCRIPT
Biología SintéticaDr. Alejandro D. NadraDpto. De Química BiológicaFac. De Cs. Exactas y Naturales – [email protected]
GarageLab
11 de Junio de 2012
Intro
Objetivos:
● Crear vida artificial● Construcción de sistemas biológicos nuevos y el establecimiento de principios para su diseño racional
Premisa:● Los sistemas biológicos pueden ser modificados y construidos a partir de ”partes” reutilizables.
Ingeniería de la vida
Conceptos:
Abstracción
Modularización/desacople
Estandarización
Componentes biológicos:
Modulares
Estandar
Reutilizables
Niveles de organización:
Partes> dispositivos> sistemas
Herramientas
”Módulos” estandarizados (banco de partes)
Principios de diseño/ingeniería (racional)
Síntesis de genes (!)
Modelado y simulación
Proceso de trabajo
Diseño desecuencias
Síntesis del DNA
Evaluación y caracterización
!Diseño delsistema
Modelado ysimulación
Banco de partes
Algunos logros y perspectivas
Logros:
Osciladores/generadores de ruido/switchs génicos (circuitos)Computación in vivo (puertas logicas)Detectores varios Producción de artemisinina recombinante (ing. metabólica)Síntesis y transferencia de un genoma completo (técnico)
Acercar la academia a la industriaMotivar y entusiasmar jóvenes promesas: iGEM
Perspectivas:
Fuentes renovables de energíaBioremediaciónTratamiento/cura de enfermedades esquivas
(Resolver los problemas de siempre con nuevas herramientas)
Ejemplos
BioBricks (Tom Knight, Drew Endy y Christopher Voigt)1) Partes: son los bloques iniciales y codifican funciones biológicas básicas (ej. ungen, una proteína, un promotor, etc)2) Dispositivos: son colecciones de partes que implementan una funcióndefinida. (ej. un grupo de genes que responde a luz y produce un determinadometabolito en respuesta)3) Sistemas: Combinaciones de dispositivos interconectados para ejecutar tareasde alto nivel.
The Registry of Standard Biological Parts
Detector de fase exponencial
Banana Control
http://openwetware.org/wiki/IGEM:MIT/2006
Detector de límite
BactoBlood
Berkeley iGEM team2007
BactoBlood
Controller
Plasmid 1: Controls Copy # and T7Pol BAC 2: Regulated Expression
BactoBlood
recombinant Haemoglobin Haemoglobin Chaperone Hem Biosynthesis
AutoOxidation control
Artemisinin biosynthesis
Jay KeaslingJBEI, Amrys
Artemisinin biosynthesis
Biología Sintética en Argentina
Comenzando...
Curso 2011Curso 2012Equipo iGEM http:igem.qb.fcen.uba.ar
Proyecto en UADEProyecto en FCEyNProyecto en GarageLabKeclon?
Agradecimientos
Ignacio E. Sanchez, QB FCEyN - UBARaik Grünberg, IRIC, CanadaEquipo iGEM Buenos_Aires
Y a ustedes, por su atención!
Algunas críticasBioseguridad:
BioterrorismoEcológicos
Eticos:Creación de nueva vida”Resucitación de patógenos extintos”Manipulación de organismos
Propiedad intelectual:La tendencia open-source boicotea la inversión
Bioquímicos y biólogos moleculares clásicos:Nada nuevo bajo el sol