biovia materials studio gaussian interface...materials studio gaussian interface...

3
BIOVIA MATERIALS STUDIO GAUSSIAN INTERFACE データシート BIOVIA Materials Studio® Gaussian Interface® は、 Gaussianの多様な ab initio 法(Hartree-Fock、密 度汎関数理論(DFT)、ならびにMP2CCSDG3のよう な高度な電子相関法など)にアクセスするための直感的 に理解容易なグラフィカルユーザインタフェース(GUI) す。 このインタフェースを使用すると、 Gaussian の計算 条件設定や結果の可視化表示が簡単にできる上 に、 Gaussian ab initio プログラムと、 BIOVIA Materials Studioのモデリング シミュレーション環境内 のプログラム(力場プログラム・半経験的プログラム・統 計的プログラム)との間で分子構造およびプロパティデ ータ(原子電荷やヘッセ行列を含む)に関して互換性を 持たせることが可能になりました。このような機能を使 ってユーザーはモデリングワークフローを合理化し拡張 することができます。 GAUSSIAN高速な近似計算から 高度な精密計算まで実現する量子力学(QM)化学、製薬、材料科学の分野で活躍している研究者には、多 くの難しい目標が課せられています。それはより効率的な触 媒の開発であるとか、製造プロセスの向上であるとか、ある いは単純に分子、反応、素過程についてより深く理解するこ とでもあり得ます。モデリングを使用してこれらの難しい課 題に取り組むには、高速な近似法から高度で高精度な計算法 まで、一定の幅でのアプローチが必要となります。 Gaussianを使用すると、ab initioの幅広い機能が提供され、 効率的で信頼性のある計算が可能になります。つまり、計算 コストを掛けて結果の正確さをできる限り追求するアプロー チと、コンピュータの性能に見合った概算結果で妥協するア プローチの二者択一を迫られるジレンマは解消され、ユーザ ーの目標達成に一役買うことになるでしょう。 Gaussian,Inc. Webサイト(www.gaussian.com/home. htm)には次のように記載されています。「量子力学の基本 原理から始めて、Gaussianは、エネルギー、分子構造、分子 構造の振動数を予測します。また、これらの基本的な計算タ イプから導かれる数多くの分子特性も予測します。これらの 情報は、短命な中間体や遷移状態構造など、実験では観察が 難しい、または観察不可能な安定化学種や安定化合物の両方 を含む、幅広い条件下での分子や反応の研究に使用すること ができます。」 使いやすいインタフェースによる ワークフフローの効率化 Gaussian Interfaceは、結晶構造、結晶化プロセス、ポリマ ー特性、触媒作用、構造活性相関など、化学薬品や物質を 研究するためのモデリングおよびシミュレーションツール セットであるBIOVIA Materials Studioソフトウェア環境の一 部となっています。BIOVIA Materials Studioのツールはすべ て、Windows®の標準操作に則った、直感的に使いやすいイ ンタフェースを経由してアクセスすることができます。した がって、初めて操作するユーザーでも自信を持ってプログラ ムを使用することができます。たとえば、BIOVIA Materials Studioのコア製品であるMaterials Visualizerが提供するさま ざまなモデル構築および視覚化ツールによって、研究対象の モデル系を迅速に構築し、高度な量子化学計算を簡単に実行 することができます。構造体の構築または解読後は、図1よび図2のような使いやすいダイアログから、理論レベル、 基底関数、収束オプション を設定することができます。 1: 多数の入力パラメーターの指定が可能な、 BIOVIA Materials Studio Gaussian Interface の「Setup」タブ。この例 では、さまざまな基底関数が表示されています。

Upload: others

Post on 09-Jul-2020

2 views

Category:

Documents


0 download

TRANSCRIPT

Page 1: BIOVIA MATERIALS STUDIO GAUSSIAN INTERFACE...Materials Studio Gaussian Interface Setupの「」タブ。この例 では、さまざまな基底関数が表示されています。QMを超えるモデリングプロジェクト

BIOVIA MATERIALS STUDIOGAUSSIAN INTERFACE

データシートBIOVIA Materials Studio® Gaussian Interface®は、Gaussianの多様な ab initio 法(Hartree-Fock、密度汎関数理論(DFT)、ならびにMP2、CCSD、G3のような高度な電子相関法など)にアクセスするための直感的に理解容易なグラフィカルユーザインタフェース(GUI)です。このインタフェースを使用すると、Gaussian の計算条 件 設 定 や 結 果 の 可 視 化 表 示 が 簡 単 に で きる上に、Gaussian の ab initio プログラムと、 BIOVIA Materials Studioのモデリング シミュレーション環境内のプログラム(力場プログラム・半経験的プログラム・統計的プログラム)との間で分子構造およびプロパティデータ(原子電荷やヘッセ行列を含む)に関して互換性を持たせることが可能になりました。このような機能を使ってユーザーはモデリングワークフローを合理化し拡張することができます。

GAUSSIAN̶高速な近似計算から高度な精密計算まで実現する量子力学(QM)法化学、製薬、材料科学の分野で活躍している研究者には、多くの難しい目標が課せられています。それはより効率的な触媒の開発であるとか、製造プロセスの向上であるとか、あるいは単純に分子、反応、素過程についてより深く理解することでもあり得ます。モデリングを使用してこれらの難しい課題に取り組むには、高速な近似法から高度で高精度な計算法まで、一定の幅でのアプローチが必要となります。Gaussianを使用すると、ab initioの幅広い機能が提供され、効率的で信頼性のある計算が可能になります。つまり、計算コストを掛けて結果の正確さをできる限り追求するアプローチと、コンピュータの性能に見合った概算結果で妥協するアプローチの二者択一を迫られるジレンマは解消され、ユーザーの目標達成に一役買うことになるでしょう。Gaussian,Inc.のWebサイト(www.gaussian.com/home.htm)には次のように記載されています。「量子力学の基本原理から始めて、Gaussianは、エネルギー、分子構造、分子構造の振動数を予測します。また、これらの基本的な計算タイプから導かれる数多くの分子特性も予測します。これらの情報は、短命な中間体や遷移状態構造など、実験では観察が難しい、または観察不可能な安定化学種や安定化合物の両方を含む、幅広い条件下での分子や反応の研究に使用することができます。」

使いやすいインタフェースによるワークフフローの効率化Gaussian Interfaceは、結晶構造、結晶化プロセス、ポリマー特性、触媒作用、構造活性相関など、化学薬品や物質を研究するためのモデリングおよびシミュレーションツールセットであるBIOVIA Materials Studioソフトウェア環境の一

部となっています。BIOVIA Materials Studioのツールはすべて、Windows®の標準操作に則った、直感的に使いやすいインタフェースを経由してアクセスすることができます。したがって、初めて操作するユーザーでも自信を持ってプログラムを使用することができます。たとえば、BIOVIA Materials Studioのコア製品であるMaterials Visualizerが提供するさまざまなモデル構築および視覚化ツールによって、研究対象のモデル系を迅速に構築し、高度な量子化学計算を簡単に実行することができます。構造体の構築または解読後は、図1および図2のような使いやすいダイアログから、理論レベル、基底関数、収束オプション を設定することができます。

図1:多数の入力パラメーターの指定が可能な、BIOVIA Materials Studio Gaussian Interface の「Setup」タブ。この例では、さまざまな基底関数が表示されています。

Page 2: BIOVIA MATERIALS STUDIO GAUSSIAN INTERFACE...Materials Studio Gaussian Interface Setupの「」タブ。この例 では、さまざまな基底関数が表示されています。QMを超えるモデリングプロジェクト

QMを超えるモデリングプロジェクトGaussian InterfaceはBIOVIA Materials Studio環境に完全に統合されたコンポーネントであることから、Gaussianプログラムとその他のBIOVIA Materials Studioモジュール間でデータを交換することができます。これにより、単一の ユーザー インターフェイス を使用して、力場、半経験的、ab initio、統計のメソッドが組み込まれた、洗練されたモデリングプロジェクトを実行することが可能になります。たとえば、Gaussianで原子電荷を計算し、BIOVIA Materials Studio COMPASS などの力場に割り当て、BIOVIA Materials Studio Polymorph Predictorで有機結晶の構造を探索することができます。

GAUSSIANとBIOVIAの相乗効果Gaussian Interfaceは、GaussianとBIOVIAの協業による成果物です。強力で柔軟なGaussian 03 プログラムはGaussian,Incから入手可能ですが、BIOVIAではBIOVIA Materials Studioのモデリングおよびシミュレーション環境の一部として、このグラフィック・ユーザー・インタフェースを提供しています。

解析能力の向上と高品質なグラフィックBIOVIA Materials Studioの柔軟なクライアント – サーバーアーキテクチャーでは、ネットワーク上のどのサーバー上でも計算が実行できます。計算結果は使用しているPCに自動的に転送され、このPC上で表示したり解析したりすることができます。図3で説明されているように、分子構造、分子軌道、静電ポテンシャル、または電荷密度の高品質なグラフィックを簡単に作成することができます。Gaussian Interfaceによって生成された構造、グラフ、その他のデータは、即座に他のPCアプリケーションに受け渡すことができ、結果を同僚と共有したり、スプレッドシートやその他のソフトを使用して分析したりすることができます。ファイルの手渡し、デカルト座標の編集、コマンドラインからの実行という時代は終わったのです。

図 2: BIOVIA Materials Studio Gaussian Interface による、電子密度などのさまざまな数値的および3次元立体特性の容易な設定。この例は、3次元立体表示のレンダリングに使用する解像度の設定方法を表したものです。

図 3: BIOVIA Materials Studio Gaussian Interface による3次元立体表示。左上から時計回りに、1)静電ポテンシャルで色分けされた H2CO の電荷密度、2)ベンゼンの LUMO、3)静電ポテンシャルで色分けされた H2NCO の半透明な電荷密度、4)構造最適化に対するエネルギーおよび力の収束のグラフ

Page 3: BIOVIA MATERIALS STUDIO GAUSSIAN INTERFACE...Materials Studio Gaussian Interface Setupの「」タブ。この例 では、さまざまな基底関数が表示されています。QMを超えるモデリングプロジェクト

©20

14 D

assa

ult S

ystè

mes

. All

righ

ts re

serv

ed. 3

DEX

PER

IEN

CE、C

ATI

A、S

OLI

DW

OR

KS、E

NO

VIA

、DEL

MIA

、SIM

ULIA

、GEO

VIA

、EXA

LEA

D、3

D V

IA、3

DSW

YM、B

IOVI

A、お

よび

NET

VIB

ESは

アメ

リカ

合衆

国、ま

たは

その

他の

国に

おけ

る、

ダッ

ソー・

シス

テム

ズま

たは

その

子会

社の

登録

商標

また

は商

標で

す。そ

の他

のブ

ラン

ド名

や製

品名

は、各

所有

者の

商標

です

。ダッ

ソー・

シス

テム

ズま

たは

その

子会

社の

商標

を使

用す

る際

には

、書面

によ

る明

示の

承認

が必

要で

す。

ダッソー・システムズの3Dエクスペリエンス・プラットフォームでは、12の業界を対象に各ブランド製品を強力に統合し、各業界で必要とされるさまざまなインダス トリー・ソリューション・エクスペリエンスを提供しています。ダッソー・システムズは、3Dエクスペリエンス企業として、企業や個人にバーチャル・ユニバースを提供することで、持続可能な イノベーションを提唱します。世界をリードするダッソー・システムズのソリューション群は製品設計、生産、保守に変革をもたらしています。ダッソー・システムズのコラボレーティブ・ソリューションはソーシャル・イノベーションを促進し、現実世界をより良い ものとするためにバーチャル世界の可能性を押し広げています。ダッソー・システムズ・グループは140カ国以上、あらゆる規模、業種の約19万社のお客様に価値を提供しています。より詳細な情報は、www.3ds.com(英語)、www.3ds.com/ja (日本語)を ご参照ください。

Dassault Systèmes CorporateDassault Systèmes10, rue Marcel DassaultCS 4050178946 Vélizy-Villacoublay Cedex France

BIOVIA AmericasBIOVIA 5005 Wateridge Vista Dr., San Diego, CA 92121 USA

BIOVIA Asia Pacificダッソー・システムズ・バイオビア株式会社141-6020 東京都品川区大崎 2-1-1 ThinkPark Tower

GAUSSIAN INTERFACEで使用可能なGAUSSIANの機能以 下 に 示 さ れ て い る と お り 、 数 多 く の G a u s s i a n の 機能を Gaussian Interface 経由で使用することができます。Gaussian サーバープログラム機能の完全なリストについては、Gaussian,Inc.のWebサイト(www.gaussian.com)をご覧ください。

計算タスク• エネルギー一点計算• 構造最適化

メソッド• DFT (including SVWN, x-Alpha, BLYP, B3LYP, B3PW91,

PBEPBE, • BB95, BP86)• MP2, MP4, CID, CISD, QCISD, QCISD(T), CCD, CCSD,

CCSD(T), BD, BD(T), G1, G2, G3, CBS-4M, CBS-QB3

基底関数• Split valence: STO-3G, 3-21G, 4-31G, 6-21G, 6-31G,

6-311G• Huzinaga-Dunning: D95 D95V •• Correlation consistent: cc-pVDZ, cc-pVTZ, cc-pVQZ,

cc-pV5Z,cc-pV6Z• diffuse および分極関数

ジョブ制御オプション• サーバーマシンの指定• Materials Visualizerからの、リモートサーバー上のジョブ

の停止• 入力ファイルの自動アップロードおよび出力ファイルの自

動ダウンロード

プロパティ• 電子密度• 静電• 振動数• NMR分子磁化率およびスピン-スピン結合• ポピュレーション解析

ダイキン工業株式会社 電子システム事業部 営業部 SCグループ 〒108-0075 東京都港区港南2-18-1 JR品川イーストビル   TEL:03-6716-0460 E-Mail : [email protected] URL:http://www.comtec.daikin.co.jp/SC/

お問い合わせ先