biokemi mnxa10/12 hans-erik Åkerlund
DESCRIPTION
Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund. Proteiner. Aminosyror. Enklaste. Aminogrupp -NH 3 + Karboxylsyragrupp -COO - Väte Variabel sidogrupp 20 olika. Primärstruktur Vilka aminosyror och vilken ordning. Peptidbindning. Dipeptid. Aminosyror. Kovalent bindning - PowerPoint PPT PresentationTRANSCRIPT
![Page 1: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/1.jpg)
Biokemi MNXA10/12Hans-Erik Åkerlund
Proteiner
![Page 2: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/2.jpg)
![Page 3: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/3.jpg)
Aminosyror
Aminogrupp -NH3+
Karboxylsyragrupp -COO-
VäteVariabel sidogrupp 20 olika
Enklaste
![Page 4: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/4.jpg)
PeptidbindningDipeptid
Kovalent bindningSpecialfall av Amidbindning
PrimärstrukturVilka aminosyror och vilken ordning
N - C - C
Riktning Amminoterminal / N-terminalKarboxyterminal / C-terminal
Stommen
Aminosyror
![Page 5: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/5.jpg)
a-helix (Sekundärstruktur)erVätebindningar
Vätebindning
Vätebindning
![Page 6: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/6.jpg)
b-veckstruktur (Sekundärstruktur)
Utsträckt strukturVätebindnigar mellan kedjorAntiparalella eller paralellaR-grupper upp och ner
![Page 7: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/7.jpg)
TertiärstrukturTrediminsionell veckning
Ferritin
FA binding protein Lysozym
Opolära grupper innePolära grupper på ytan
![Page 8: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/8.jpg)
Den hydrofoba effekten
Vattenstruktur
Störande molekyleropolära
![Page 9: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/9.jpg)
Cysteinbryggor = SS Bryggor = DisulfidbryggorStabiliserar tertiärstrukturen
![Page 10: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/10.jpg)
KvartärstrukturAntal och arrangeman av subenheter
Ex. Hemoglobin från människafyra subenheter
![Page 11: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/11.jpg)
HastighetPåskyndar reaktioner utan att själv förbrukas. Kan ingå i delreaktioner men återbildas alltidPåverkar inte jämvikten, K lika som utan enzym.Påskyndar att jämvikten ställer in sig
SpecificitetReglerbarhet
Enzymer, Katalys och Kinetik
![Page 12: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/12.jpg)
Varför påskyndas reaktioner?Aktiveringsenergi
Enzymer
-gör att det krävs mindre aktiveringsenergi.
-påverkar inte energiskillnadenmellan substrat och produkt
![Page 13: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/13.jpg)
Enzymkatalyserad reaktionUpvisar mättnad Karaktäristiskt för enzymkatalyserad reaktion.
![Page 14: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/14.jpg)
Avsätt v0 som funktion av [S]
Michaelis-Menten
v = Vmax*[S]/(KM+[S])
![Page 15: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/15.jpg)
Ex. KarboanhydrasZn2+ prostetisk gruppMetalljonkatalysAktivering av vatten
pKa=7 (jfrt med 15.7 för fritt vatten)
ca 7 miljoner ggr snabbare än utan katalys
![Page 16: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/16.jpg)
Nukleinsyror: DNA och RNA
![Page 17: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/17.jpg)
Nukleotider som byggstenar
Fosfat – Socker -Kvävebas
![Page 18: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/18.jpg)
Sockret
R i RNA D i DNA
Syre saknasDeoxy
![Page 19: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/19.jpg)
Kvävebaser:
Adenin Guanin Cytosin Uracil (i RNA)/Thymin (i DNA)
![Page 20: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/20.jpg)
5´
5´
3´
3´
A G C T C
T C G A G
5´
3´3´5´
DNA struktur.1) polynukleotid, kvävebaser A,G,C,T2) har polaritet: 5´ o 3´ ändar3) basparning mellan två antiparella strängar4) H-bindingar, 2 st mellan A o T, 3 st mellan G o C
![Page 21: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/21.jpg)
DNA dubbelhelix
Stor fåra (major groove)
Liten fåra (minor groove)
Mörk färg: fosfodiester o socker(huvudkedja)Ljus färg: basparade kvävebaser
10 nukleotider
eller
Baspar (bp)
5´ 3´
3´ 5´
![Page 22: Biokemi MNXA10/12 Hans-Erik Åkerlund](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022062222/56816521550346895dd7a009/html5/thumbnails/22.jpg)
Cellulära processer
DNA RNA PROTEIN
Replikation Transkription Translation
Process Huvudsaklig funktionell enhet/ enzymReplikation DNA polymeras. (DNA templat, mall)Transkription RNA polymeras. (DNA templat eller )Translation Ribosom, består av rRNA, protein. (mRNA templat)