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Aurelio Sanabria ([email protected])Analista/Desarrollador de softwareINBio, Costa Rica
Buenos Aires (Argentina)28 de setiembre de 2011
Curso capacitación sobre publicación de datos de biodiversidad y fitness-for-use en la Red GBIF.Edición 2011
Introducción a las nuevas opciones para publicar datos de biodiversidad.
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Opciones para publicar datos
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Glosario
Data Publisher / Data ProviderData Resource / Data setData resource type (e.g., Metadata,
Occurrence, Taxon)Data recordData record element, term, field, column,
property, attribute, concept (e.g., basisOfRecord, scientificName)
Data valueEstándares, Vocabularios
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Proveedores de datos
Instituciones con varias unidades organizacionales, cada una con múltiples recursos de datos.
Instituciones, grupos o individuos con varios recursos de datos.
Instituciones o individuos con un solo recurso de datos. (data set).
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Tipos de recursos de datos
Datos primarios de biodiversidad (Especímenes, Observaciones, ecología)
• El tipo de datos principal es la occurencia de un organismo.
Catálogos taxonómicos*, y Checklist de especies
• El tipo de datos principal es un Taxon
* Para distingir nuestros esfuersos de los del Catálogo de la vida – GBIF únicamente provee los medios.
Metadatos enriquecidos – Principalmente enfocado en recursos de datos de Occurencias y Taxones.
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Registros de datos
Recurso de datos tipo: Taxon
Recurso de datos tipo: Occurrencia
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Campos de datos
Recurso de datos tipo: Taxon
Recurso de datos tipo: Occurrencia
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Valores de los datos
Recurso de datos tipo: Taxon
Recurso de datos tipo: Occurrencia
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Estándares para datos
Datos primarios deBiodiversidad
Datos taxonómicos
Darwin Core
• 172 Términos• Ratificado en el 2009• Archivos de texto• Extensible
Metadatos
Lenguage para metadatos ecológicos (EML)
• Descripciones de recursos de datos• GBIF Profile
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Opciones para publicar datos
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Opciones para publicar datos
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Si TAPIR permite 1000 registros por solicitud.
Para transferir un recurso de datos de 260 000 registros:• 260 solicitudes / Tranferencia total de datos 500MB.• Duración de la recolección: 2 horas.• De esos 500 MB solo 32MB de los datos tranferidos son
"utilizados".
Ejemplo: Tapir
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Opciones para publicar datos
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Para tranferir un recurso de datos de 260 000 registros:• 1 solicitud / Transferencia total de datos: 3MB.• Duración de la recolección: de minutos a segundos.
Ejemplo: Archivo Darwin Core
ArchivoDarwin Core
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Ejemplo: Archivo Darwin Core
ArchivoDarwin Core
Comparado a Tapir/DiGIR/BioCASE:• 260 solicitudes / Transferencia total de datos: 500MB.• Duración de la recolección: 2 horas.
Para tranferir un recurso de datos de 260 000 registros:• 1 solicitud / Transferencia total de datos: 3MB.• Duración de la recolección: de minutos a segundos.
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• Utiliza un formato simple (texto plano)
• Almacenamiento eficiente (compressed)
• Recolección eficiente (un archivo)
• Fácil acceso (Sin software especializado)
• Extensible (varios archivos en un solo zip)
Archivos Darwin Core:Beneficios
Este es el formato recomendadopara publicar datos en GBIF
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Encontrado los datos
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El registro de GBIF
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GBIF: Portal de datos
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GBIF: Centro de recursos en línea(http://www.gbif.org/orc/)
Bibliografía
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Aurelio Sanabria ([email protected])Analista/Desarrollador de softwareINBio, Costa Rica
Buenos Aires (Argentina)28 de setiembre de 2011
Training course on biodiversity data publishing and fitness-for-use in the GBIF Network, 2011 edition
Introducción a las nuevas opciones para publicar datos de biodiversidad.