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viernes 30 de marzo

Análisis de correspondencia (o ponderación recíproca)

Capítulo 19 de

McCune y Grace 2002

Extensión de promediación ponderada

• En promediación ponderada:– Las muestras se ordenan de acuerdo a

valores de peso de las especies que estén presentes

– Alternativamente, las especies pueden ordenarse de acuerdo a valores de peso de las muestras

• En ponderación recíproca el proceso se hace primero de una forma y luego de la otra hasta alcanzar una ordenación final única.

Análisis de correspondencia

• Es ponderación recíproca pero utilizando un análisis eigen de manera iterativa.

• Solución final es aquella cuyo residual es igual o menor de 0.0000001

• Las distancias entre muestras en el espacio de ordenación preservan las distancias Chi-cuadradas entre muestras.

Distancia Chi-cuadrada

• Da mayor peso a especies con totales menores

Distancia Chi-cuadrada

• Condiciones para que esta distancia represente gradientes:– Muestras distribuidas homogéneamente– Especies con tolerancias iguales o

independientes de su posición en gradiente– Abundancias en óptimos iguales o

independientes de su posición en gradiente– Optimos distribuidos homogéneamente en

gradiente

• Datos de comunidades violan todas

Análisis eigen

Eigen values:1.065 0.974 0.962

Eigen values:2.631 0.297 0.076

Procedimiento

• 1. Asignar posiciones arbitrarias a las muestras en un eje de ordenación

• 2. Calcular las posiciones de las especies como el promedio ponderado por el total de la especie

• 3. Calcular nuevas posiciones de las muestras por promediación ponderada por el total de la muestra

Procedimiento (cont.)

• 4. Centrar y estandarizar las posiciones

• 5. Cotejar la convergencia entre la primera y la segunda ordanción.

• 6. Aceptar la ordenación que difiera por menos de cierto nivel de tolerancia, o volver al paso 2

Problemas

• Orden adecuado en primer eje pero comprime distancias en extremos y aleja las del medio

• Efecto de arco en primeros 2 ejes y contorciones peores en > 2 ejes.

¿Qué informar?

• Justificación para utilizar distancia chi-cuadrada

• Cuantos ejes fueron interpretados y proporcion de varianza expresada

• Si la solucion fue rotada, cómo.

• Ayudas para interpretación