antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi
TRANSCRIPT
![Page 1: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/1.jpg)
Antibiotikaresistens:
mikrobiologi, epidemiologiSILF Höstutbildning 2017-10-23
Inga Fröding
Specialistläkare, Klinisk mikrobiologi
Karolinska Universitetssjukhuset, Huddinge
![Page 2: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/2.jpg)
Svåra fall sommaren 2016
Neutropen feber, blododling:
Pseudomonas aeruginosa
Ceftazidim...................... R
Piperacillin-tazobaktam.. R
Imipenem....................... R
Meropenem....................R
Gentamicin.....................R
Amikacin........................ R
Ciprofloxacin.................. R
Bukabscess efter
levertransplantation:
Klebsiella pneumoniae ESBLTrimetoprim-sulfa........... R
Ertapenem..................... R
Cefotaxim.......................R
Ceftazidim...................... R
Piperacillin-tazobaktam.. R
Imipenem....................... I
Meropenem....................R
Gentamicin.....................R
Amikacin........................ I
Ciprofloxacin.................. R
![Page 3: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/3.jpg)
Hjälp! Hur ska jag behandla?
När får jag kompletterande resistensbesked?
...Va? Men varför kan inte de vanliga metoderna användas?
Vilken roll spelar resistensmekanismen för resistensmönstret?
Hur vanligt är det här?
Är det här vardag i andra länder?
Hur blir det i framtiden? – Resistensutveckling?
Frågor som väcks
?
![Page 4: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/4.jpg)
Fokus på MDR Gramnegativa stavar
Aktuellt resistensläge ESBL och karbapenemresistens
Global epidemiologi
Spridning, högriskkloner
Bärarskap
ESBL-CARBA genotyper
Nya och nygamla antibiotika – mikrobiellt spektrum och resistens
SIR-systemet och utmaningar inom resistensbestämning
![Page 5: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/5.jpg)
Antibiotikaresistens
Miljöbakterier
Naturlig resistens
Bärarskap
Lindrig infektion
VS
Patogener/opportunister
Förvärvad resistens
Klinisk infektion
Allvarlig infektion
![Page 6: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/6.jpg)
Vilka bakterier orsakar allvarliga infektioner?
S.pneumoniae
S.aureus
E.coli
Enterococcusspp.
K.pneumoniae
P.aeruginosa
Acinetobacterspp.
S.pneumoniae
S.aureus
E.coli
Enterococcusspp.
K.pneumoniae
P.aeruginosa
Acinetobacterspp.
S.pneumoniae
S.aureus
E.coli
Enterococcusspp.
K.pneumoniae
P.aeruginosa
Acinetobacterspp.
S.pneumoniae
S.aureus
E.coli
Enterococcusspp.
K.pneumoniae
P.aeruginosa
Acinetobacterspp.
E. coli
S. aureus
K. pneumoniae
![Page 7: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/7.jpg)
Gramnegativa stavar: skillnader i Europa
EARS-Net annual report 2012 (ECDC). Sievert et al. Infect Control Hosp Epidemiol. 2013;34:1-14.
0%
10%
20%
30%
40%
50%
60%
70%
80%
90%
100%
Germany Norway Greece Italy France Poland USA - HAI
Acinetobacter
P. aeruginosa
K. pneumoniae
E. coli
Ökning av
Acinetobacter baumannii-
komplexet
![Page 8: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/8.jpg)
WHO prioriterar MDR Gramnegativer högt
Prioritization of pathogens to guide discovery, research and development. WHO 2017 (WHO/EMP/IAU/2017.12)
Critical priority:
Karbapenemresistenta
Acinetobacter baumannii,
Pseudomonas aeruginosa,
Enterobacteriaceae
![Page 9: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/9.jpg)
Anmälningspliktig resistens i Sverige – nya fall
Folkhälsomyndigheten
0
2 000
4 000
6 000
8 000
10 000
12 000
2007 2008 2009 2010 2011 2012 2013 2014 2015 2016
An
tal
nya
fall
ESBL
MRSA
VRE
PNSP*
ESBL-CARBA
![Page 10: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/10.jpg)
Spridning av resistensgener
- plasmidöverföring
Klonal smittspridning -
bakterier
Spridning av resistens – två sätt
![Page 11: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/11.jpg)
Vad är en klon?
MLST Multilocus locus sequence typing
Sekvensering av 7 st s.k. housekeeping-gener
Utvalda för varje art => lagom variation inom arten
Bra för att karakterisera kloner som sprider sig i samhället
Relateras till annan data: geografi, infektionstyp, virulensgener, resistensgener
![Page 12: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/12.jpg)
Multilocus sequence typing
PCR
7 olika gener
Allel-
assignment
i databas
Sekvensering
Kombinationen
av alleler ger
ST
![Page 13: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/13.jpg)
Vad är en klon? – MLST-definition
Isolat Gen A Gen B Gen C Gen D Gen E Gen F Gen G Exempel
ST-
beteckning
1 1 1 1 1 1 1 1 ST1
2 1 1 1 1 1 1 2 ST2
3 1 1 1 1 1 2 2 ST3
4 1 1 1 1 2 2 2 ST4
Två isolat med samma ST har identisk sekvens i alla 7 housekeeping - gener
Klonala komplex brukar definieras som samma allel i 5-6 gener – dessa är besläktade
![Page 14: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/14.jpg)
Rekombinering vanligt – försvårar tolkning
Smith JM. PNAS 1993
Klonal, ingen rekombinering Rekombinering inom huvudgrenar
Panmictic/epidemic
![Page 15: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/15.jpg)
Minimal spanning tree, MLST 7 gener
CC10
CC131 CC101
CC156
CC23
CC38
CC405
CC448
CC46
CC73
![Page 16: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/16.jpg)
Core genome MLST - 2500 gener – har högre upplösning
CC131
CC101, 5 alleles
CC10
CC38
CC23
CC405
![Page 17: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/17.jpg)
Högriskkloner (HiRC)
Högriskkloner kännetecknas av att:
De är associerade med resistensmekanismer av stor klinisk betydelse
OCH
Har förmåga att spridas med hög effektivitet inom slutenvård
ELLER
Har förmåga att orsaka allvarlig (invasiv sjukdom)
ELLER
Har förmåga att effektivt kolonisera normalfloran hos människori längre perioder
Högriskkloner är en viktig förklaring till
spridning av resistens.
![Page 18: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/18.jpg)
Promiskuösa plasmider
Plasmider klassificeras i Inc-grupper
IncA/C: (t ex NDM-1 i Indien)
sprider sig både mellan tarmbakterier och besläktade arter
tex Pseudomonas
IncF: från E. coli,
sprider sig främst mellan tarmbakterier
- en huvudorsak till att CTX-M endast hittas
hos tarmbakterier
IncI2, IncX4: mcr-1
Bidragit till hög spridning mellan tarmbakterier
från djur till människor
Andra inc-grupper finns med variabel förmåga att överföras
mellan bakteriefamiljer.
WGS kommer att revolutionera plasmidkarakterisering
Zurfluch, Antimicrobial Resistance and Inf Control, 2017
![Page 19: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/19.jpg)
Resistensläge, ESBL,
högriskkloner och bärarskap
![Page 20: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/20.jpg)
Resistensläge E. coli – Cefalosporinresistens (ESBL)
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
2003 2015
![Page 21: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/21.jpg)
E. coli – kombinerad resistens mot
cefalosporiner, kinoloner och aminoglykosider
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
2015
![Page 22: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/22.jpg)
K. pneumoniae med ESBL-resistens, 2015
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
![Page 23: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/23.jpg)
Evolution av gramnegativ resistens
1. Hawkey. Antimicrob Chemother. 2008;62:i1-9. 2 Hawkey and Jones. J Antimicrob Chemother. 2009;64:i3-10. 3. Bush. Antimicrob. Agents
Chemother. 2010;54:969-76.4. Livermore. Clin Infect Dis. 2002;34:634-40.5. Olivares et al. Front Microbiol. 2013;4:103.
23
Känsliga
Gram-negativa
patogener Resistent
Escherichia coli
TEM
SHV serine
-lactamases
Resistent
E. coli, Klebsiella spp.
och P. aeruginosa
AcrAB
blaSHV
blaTEM
AmpC-type
-lactamases
1960-talet
Ampicillin
1980-talet
Cefalosporiner
1990-2000-talet
Karbapenemer
Resistent
E. coli, Klebsiella spp.,
P. aeruginosa,
Enterobacter spp.
CTX-M-15
VIM
IMP
NDM-1
KPC
OXA-48
Porin-förlust
![Page 24: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/24.jpg)
Bärarskap av ESBL ökar snabbt
Woerther P et al. Clin. Microbiol. Rev. 2013;26:744-758
24
![Page 25: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/25.jpg)
Bärarskap av ESBL i tarmen kan vara långvarigt
Titelman et al. CMI 2014
Pat Clinisol 1m 3m 6m 12m
1
2
3
4
5 ns ns
6
7
8
9 ns
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19 ns
20
21
22 ns
23
24
25
26
Factor Carriers(%) Non-carriers(%) pBloodstreaminfection 23 3 0.04Carbapenemtreatment 19 3 0.07PhylogroupB2 52 21 0.04ST131 39 17 0.13
41% bär på ESBL efter ett år
Ibland flyttas ESBL-generna
över till en ny stam i tarmfloran
Negativ odling utesluter inte
bärarskap
![Page 26: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/26.jpg)
Spridning av ESBL sker i miljön - Europa
Olika studier:
Människor: 10% är ESBL-bärare
Livsmedel – kyckling: ESBL mycket vanligt
Döda råttor - Tyskland: 16% (9/56) bar på ESBL
Vattenreningsverk –
undersökning av vattenprover i kommunala
reningsverk:
Polen: ESBL i 100% (63/63 prover)
Österrike: ESBL i 61% (44/72 prover)
![Page 27: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/27.jpg)
Bärare i befolkningen har stammar med lägre virulens
Ny et al. JAC 2016
Svensk befolkning: 4.7% är ESBL-bärare
Risk: resor till Asien, Afrika – OR 3,6
![Page 28: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/28.jpg)
ST-131
Högriskklon: E. coli O25b ST131
Uropatogen klon som har förvärvat CTX-M
Nästan alltid kinolonresistent
Ca 40% av ESBL E. coli i Sverige tillhör denna klon
Ofta associerad med samhällsförvärvade infektioner
Även hittat i kött och bland sällskapsdjur
Rapporterad från hela världen
Mathers, Clinical Microbiology Reviews, 2016
![Page 29: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/29.jpg)
De flesta som förvärvar ESBL på resor får inte virulenta stammar
Vading 2016, JAC
![Page 30: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/30.jpg)
En ESBL – teori:
ESBL förvärvad
i samhället
ESBL förvärvad
i samhället
ESBL förvärvad
på sjukhus
Frisk bärare ESBL försvinner
Sjuk bärare UVI
Bärarskap Invasiv infektion
![Page 31: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/31.jpg)
Resistensläge och mekanismer
karbapenem – resistens
![Page 32: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/32.jpg)
ESBL, plasmidmedierad AmpC och karbapenemaser
ESBLA
CTX-M
SHV
TEM
ESBLM (plasmid-AmpC)
CMY
DHA
Karbapenemaser
(ESBLCARBA)
KPC
VIM
NDM
OXA-48-like
OXA-23-, -24, -58-like
![Page 33: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/33.jpg)
Karbapenemresistent men ej ESBLCARBA?
Antibiotikamolekyl
PBP
Cytoplasmamembran
Porinkanal
Periplasmatiska rummet med
peptidoglykan
Yttermembran
Gramnegativ cellvägg
Porinförlust:
Antbiotika kommer inte in.
Ger resistens i kombination med ampC och ESBL
ESBL-A
betalaktamas
![Page 34: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/34.jpg)
Olika karbapenemaser och ursprunglig förekomst
![Page 35: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/35.jpg)
Metallobetalaktamaser - MBL
NDM
New Delhi MBL
Indien
Ofta extremt
multiresistenta
VIM
Verona integron-
encoded MBL
Italien
IMP
Japan, Asien
Nu ovanliga
Olika karbapenemaser och ursprunglig förekomst
Vanligaste karbapenemaser hos
Pseudomonas aeruginosa
![Page 36: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/36.jpg)
Metallobetalaktamaser - MBL
NDM
New Delhi MBL
Indien
Ofta extremt
multiresistenta
OXA-48
Svagt karbapenemas, svårare att påvisa
Turkiet, mellanöstern
R mot Pip-taz, amoxi-clav, temocillin
Kan vara S mot cefalosporiner/meropenem
VIM
Verona integron-
encoded MBL
Italien
IMP
Japan, Asien
Nu ovanliga
Olika karbapenemaser och ursprunglig förekomst
Vanligaste karbapenemaser hos
Pseudomonas aeruginosa
![Page 37: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/37.jpg)
Metallobetalaktamaser - MBL
NDM
New Delhi MBL
Indien
Ofta extremt
multiresistenta
KPC
Klebisella pneumoniae Carbapenemase
USA, Grekland
Klonal spridning ST258
OXA-48
Svagt karbapenemas, svårare att påvisa
Turkiet, mellanöstern
R mot Pip-taz, amoxi-clav, temocillin
Kan vara S mot cefalosporiner/meropenem
VIM
Verona integron-
encoded MBL
Italien
IMP
Japan, Asien
Nu ovanliga
Olika karbapenemaser och ursprunglig förekomst
Vanligaste karbapenemaser hos
Pseudomonas aeruginosa
![Page 38: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/38.jpg)
K. pneumoniae ST258
Klon som är intimt förknippad med
spridning av KPC
Initialt USA, sedan Israel, Grekland och
sporadiska fall i övriga europeiska
länder
Har förmåga att orsaka invasiv infektion
![Page 39: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/39.jpg)
Vilka patienter får invasiv infektion med K. pneumoniae?
Vading et al 2016. Manuscript.
39
![Page 40: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/40.jpg)
Karbapenemresistenta K. pneumoniae
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
2006 2015
![Page 41: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/41.jpg)
Karbapenemresistenta E. coli, 2015
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
![Page 42: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/42.jpg)
20132015
Not participating
or not reporting
Non-EU/EEA countries
Sporadic occurrence
Single hospital outbreaks
Interregional spread
No case reported
Regional spread
Endemic situation
Sporadic hospital outbreaks
CPE spridning i Europa – uppskattning av experter
Glasner C et al., Eurosurveillance 2015 18(28). Albiger B, et al. Eurosurveillance 2015 20(45)
![Page 43: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/43.jpg)
ESBLCARBA i Sverige
Folkhälsomyndigheten
Inhemsk smittspridning 2016?
Närbesläktade kliniska fall
core genome MLSTsiffran visar antal SNPs
(single nucleotide polymorphisms)
E. coli ST167
CTX-M,
CIT,
NDM-5
E. coli ST405
CIT,
NDM-5
![Page 44: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/44.jpg)
P. aeruginosa karbapenemresistens, 2015
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
![Page 45: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/45.jpg)
P. aeruginosa med MDR, 2015
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
![Page 46: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/46.jpg)
Acinetobacter spp. och karbapenemer, 2015
EARS-Net, Data från blododlingsisolat, ECDC, jan 2017
![Page 47: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/47.jpg)
Bild: Science photo library
Paus
![Page 48: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/48.jpg)
Svåra fall sommaren 2016
Neutropen feber, blododling:
Pseudomonas aeruginosa
Ceftazidim...................... R
Piperacillin-tazobaktam.. R
Imipenem....................... R
Meropenem....................R
Gentamicin.....................R
Amikacin........................ R
Ciprofloxacin.................. R
Bukabscess efter
levertransplantation:
Klebsiella pneumoniae ESBL
Trimetoprim-sulfa........... R
Ertapenem..................... R
Cefotaxim.......................R
Ceftazidim...................... R
Piperacillin-tazobaktam.. R
Imipenem....................... I
Meropenem....................R
Gentamicin.....................R
Amikacin........................ I
Ciprofloxacin.................. R
VIM-positiv ESBLCARBA-utredning pågår
![Page 49: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/49.jpg)
Mentometerfråga 1
Går det att förutspå resistensmönstret för kolistin, ceftazidim-avibaktam och
ceftolozan-tazobaktam med det du vet i nuläget?
Fall 1: P. aeruginosa, multiresistent, VIM-positiv.
Fall 2: K. pneumoniae, multiresistent, ESBLCARBA-utredning pågår.
1. Både 1 och 2:
Kan vara känsliga för alla tre alternativ, men resistensbestämning krävs.
2. Fall 1: Kan vara känslig för alla tre alternativ, men resistensbestämning krävs.
Fall 2: Troligen känslig enbart för kolistin.
3. Fall 1: Troligen känslig enbart för kolistin.
Fall 2: Kan vara känslig för alla tre alternativ, men resistensbestämning krävs.
4. Både 1 och 2: Troligen känsliga enbart för kolistin.
![Page 50: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/50.jpg)
Vilka antibiotikaalternativ står till buds?
Antibiotika ESBLA ESBLM KPC MBL OXA-48
MDR
Pseudomonas
utan MBL
MDR
Acinetobacter
Meropenem ++ ++ +- +- +- +- +-
Temocillin + + +- - - - -
Ceftolozan-
tazobaktam+ - - - - + -
Ceftazidim-
avibaktam++ ++ ++ - ++ ++ -
Kolistin + + + + + + +
![Page 51: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/51.jpg)
Metallobetalaktamaser – MBL
Beh alternativ vid MDR:
Kolistin + kombi.
NDM New Delhi MBL
Indien
Ofta extremt
multiresistenta
KPCKlebisella pneumoniae Carbapenemase
USA, Grekland
Klonal spridning ST258
Beh alternativ vid MDR:
Ceftazidim-avibaktam
Kolistin+kombination
OXA-48Svagt karbapenemas, svårare att påvisa
Turkiet, mellanöstern
R mot Pip-taz, amoxi-clav, temocillin
Kan vara S mot cefalosporiner och meropenem
Beh alternativ vid MDR:
Ceftazidim-avibaktam
Kolistin+kombination
VIMVerona integron-
encoded MBL
Italien
IMPJapan, Asien
Nu ovanliga
Olika karbapenemaser – behandlingsalternativ vid MDR
Vanligaste karbapenemaser hos
Pseudomonas aeruginosa
![Page 52: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/52.jpg)
Kolistin: Kolistimetat – Tadim® i.v. (Nigaard Pharma)
Indikation
Vuxna och barn, inklusive nyfödda,
med allvarliga infektioner
som orsakats av
vissa aeroba gramnegativa patogener
hos patienter med
begränsade behandlingsalternativ
God aktivitet mot
De flesta Enterobacteriaceae
ESBL – A, – M och – CARBA
Acinetobacter
Pseudomonas
Saknar aktivitet mot
Vissa Enterobacteriaceae:
Proteus
Serratia
Providencia
Morganella
Grampositiva bakterier
![Page 53: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/53.jpg)
Kolistin-användning
Veterinärmedicin
5:e mest använda antibiotika
inom EU/EAA
Humanmedicin
Användning:
Topikalt för ögon och
öroninfektioner
Cystisk fibros-patienter
(i.v eller inhalation)
Kirurgiprofylax via s.k.
“SDD = selective digestive
tract disinfection”
Behanling av vårdrelaterade
infektioner med MDR
gramnegativer
![Page 54: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/54.jpg)
Kolistinanvändning i humanmedicin
600 gånger lägre användning än i
veterinärmedicin
Fortfarande låg användning i EU
Sverige och Norge lägst användning
Signifikant ökande trender
i flera EU-länder
Följer ökningen av vårdrelaterade
infektioner orsakade av
MDR Gram-negativer
Source: ECDC Summary of the latest data on antibiotic consumption in the European Union, ESAC-Net surveillance data,
November 2015” (ECDC, 2015)
![Page 55: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/55.jpg)
Kolistin destabiliserar cellmembranet och inaktiverar LPS
Martis, Journal of infection, 2014
Förutsättning för effekt:
negativ laddning i lipid A
= gramnegativa bakterier
![Page 56: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/56.jpg)
Kolistinresistens - mekansimer
Martis, Journal of infection, 2014. Giske, CMI, 2015.
Ökad positiv laddning i Lipid A =>
Svagare interaktion med polymyxiner
+++ + ++Ökad positiv laddning kan ske genom
Kromosomala mutationer
MgrB eller PmrB kinas =>
ökad arn transkription =>
ökad produktion av del av LPS
som är mer positivt laddad
Regulatoriskt system =>
utvecklar lätt resistens under behandling
Plasmidmedierad resistens:
Mcr - gener
![Page 57: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/57.jpg)
Kolistinresistens - förekomst
Osäkra data – EARS-Net 2015:
Art Andel testade Andel resistenta Andel av Karba – R
E. coli 16% 1,1% 6,2%
K. pneumoniae 26% 8,8% 32%
P. aeruginosa 43% 0,8% -
A. baumannii 59% 4,1% -
Grekland och Italien står för majoriteten av både testade och resistenta isolat
(95% av kolistinresistenta K. pneumoniae)
Majoriteten utgörs sannolikt av kromosomal resistens.
![Page 58: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/58.jpg)
December 2015: plasmidburen kolistinresistens
![Page 59: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/59.jpg)
+++ +++
Hur ger MCR-1 resistens?
Fosfoetanolamin transferas
(finns även hos Neisseria, Paenibacillus)
Fosfoetanolamin läggs till lipid A
Ökad positiv laddning i lipid A
Lägre affinitet för colistin mot lipid A
![Page 60: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/60.jpg)
Hur hög resistens ger MCR-1?
Isolat med
MCR-1
MIC 4-16 mg/L
![Page 61: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/61.jpg)
2013, Kanada: 62-årig kvinna tidigare vårdad i Egypten med sigmoideumperforation.
E. coli med både blaOXA-48 och mcr-1
2014, Tyskland: patient med infekterat fotsår med E. coli med både blaKPC-2 och mcr-1
2014, Italien: barn med leukemi, screening. K. pneumoniae med blaKPC-3 och mcr-1.2
2014, USA: Urinvägsinfektion med E. coli med blaNDM-5 och mcr-1
2015, Schweiz: 83-årig man med urinvägsinfektion med E. coli med blaVIM och mcr-1
2015, Belgien: Sårodling med E.coli med blaOXA-48 och mcr-1
2017, Portugal: urinodling efter ileusoperation, behandling med meronem och colistin.
E.coli med blaKPC-3 och mcr-1
.
Kolistinresistens är främst ett problem vid samtidig karbapenemresistens
Ellis C, et al. Diagn Microbiol Infect Dis 2013; Yang J. Toronto Star (5 January 2016); Falgenhauer L, et al. Lancet Infect Dis 2016; Poirel L, et al.
Lancet Infect Dis 2016; Di Pilato V, et al. Antimicrob Agents Chemother 2016. Mediaville et al., mbio 2016
![Page 62: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/62.jpg)
Internationella åtgärder för att motverka kolistinresistens
Juli 2016: EMA påbjuder minimering av kolistin-användning
inom veterinärmedicin
Kolistin är andrahandspreparat
Mål: minskning med 65% på EU-nivå
Förbättrad miljö för djuren för att minska infektioner
Maj-juni 2016: Nya metoder för resistensbestämning, screeningtester, utvecklas
2017-2019: ECDC inför övervakningsprogram
för karbapenem- och kolistin-resistenta Enterobactericaeae
=> snabbt identifiera högriskkloner som bär på båda resistenser
EMA Updated advice on the use of colistin products in animals within the European Union: development of resistance and possible impact on human and animal health. 27 July 2016
![Page 63: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/63.jpg)
Kolistinresistens i Sverige
Tom april 2017: 6 fall av mcr-resistens identifierade
Övervakning - Folkhälsomyndigheten samlar in:
ESBL-CARBA, helgenomsekvensering => letar mcr-gener
Kolistinresistenta Enterobacteriaceae (nytt from 1 okt 2017)
![Page 64: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/64.jpg)
Kolistinresistens på Karolinska 2017
Pat. Provlokal ArtMIC
KolistinKommentar
1
Screening sår Acinetobacter baumannii >8 R
Vårdad i Grekland,
koloniserad med alla tre i trakealsekret mmSputum Klebsiella pneumoniae ESBL-CARBA 4 R
Dränagespets Pseudomonas aeruginosa VIM-positiv 8 R
2 Abscess Pseudomonas aeruginosa 16 RKronisk protesinfektion/amputation.
Långvarig karbapenem- och kolistinbehandling
3 Sputum, CF Pseudomonas aeruginosa 4 RCF-patient,
Kolonisation troligen minst sedan 2013
4 Blod Escherichia coli ESBL 8 RAmpC + porinförlust => karbapenemresistent.
Långvarig karbapenem- och kolistinbehandling
Alla isolaten karbapenemresistenta
Majoriteten har erhållit behandling med kolistin innan fynd
Okänd mekanism, troligen kromosomal
Okänd resistensfrekvens – endast karbapenemresistenta har undersökts för kolistin.
![Page 65: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/65.jpg)
Ceftolozan-tazobaktam – Zerbaxa® (MSD)
Ny cefalosporin baserad på
ceftazidim (förbättrad PBP-affinitet)
Kombination med tazobaktam
främst av betydelse för ESBL-A
Förbättrad aktivitet mot
MDR Pseudomonas
ESBL-A
Saknar aktivitet mot
ESBL-CARBA, ESBL-M,
Pseudomonas med MBL
Acinetobacter
Ceftolozan
Indikation
Komplicerad och hög UVI
Komplicerad intraabdominell infektion
- i kombination med metronidazol
![Page 66: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/66.jpg)
Ceftolozan-tazobaktam – Zerbaxa® (MSD)
Tato, Int J Antimicrob Agents, 2015
Pseudomonas aeruginosa
65% av multiresistenta Pseudomonas aeruginosa
var känsliga (S) för ceftolozan-tazobaktam
S RBrytpunkt:
S≤4 mg/L
R>4 mg/L
![Page 67: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/67.jpg)
Escherichia coli Klebsiella pneumoniae
Ceftolozan-tazobaktam
Brytpunkt S≤1 mg/L, R>1 mg/L
S R S R
![Page 68: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/68.jpg)
Kliniska studier ceftolozan-tazobaktam
FAS III: ASPECT cIAI – non - inferiority
Intraabdominella infektioner
vs meropenem 1 g x 3
Endpoint: klinisk respons
83% utläkning jämfört med
87% för meropenem
Wright, CMI, 2017. Munita, CID, 2017. Haidar, CID, 2017.
FAS III: ASPECT cUTI – non - inferiority
Komplicerad UVI
vs levofloxacin 750 mg x 1 i.v.
Endpoint: inga symtom och uropatogen
<104 CFU/mL vid TOC runt 1 v efter sista
dos
77% utläkning jmf med
68% för levofloxacin
Utvärdering på karbapenemresistenta isolat:
Munita, CID, 2017:
35 fall av karbapenemresistenta P. aeruginosa som beh. med ceftolozan-tazob.
87% känsliga in vitro (av 30 resistensbestämda)
Utläkning 70% i monoterapi, 87% som del av kombinationsterapi
Haidar, CID, 2017:
21 fall av karbapenemresistenta P. aeruginosa som beh. med ceftolozan-tazob.
Alla initalt känsliga in vitro. 3 utvecklade resistens under behandling.
Utläkning 71%
![Page 69: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/69.jpg)
Ceftazidim-avibaktam – Zavicefta® (AstraZeneca)
Falcone, J Antimicrob Chemother. 2016 / Shields, Clin inf dis, 2016
God aktivitet mot
ESBL-A, -M
vissa ESBL-CARBA (KPC, OXA-48)
Pseudomonas
Saknar aktivitet mot
MBL (metallobetalaktamas- NDM, VIM)
Acinetobacter
Kliniska studier:
Fas II och III:
non-inferiority jmf. karbapenemer
70-90% utläkning i båda grupper
Shields et al 2016, retrospektiv studie, USA
37 pat med Enterobacteriaceae, karbapenem=R
59% utläkning
8% resistensutveckling under behandling
Avibaktam
Indikation
Komplicerad och hög UVI
Komplicerad intraabdominell infektion
- i kombination med metronidazol
Sjukhusförvärvad pneumoni (inkl VAP)
Infektioner med MDR Gramnegativa
bakterier med få andra alternativ
![Page 70: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/70.jpg)
PKPD indikerar att brytpunkten bör vara 8 mg/L
PKPD-target: ceftazidim fT>MIC 50% och inhibitor fT>1 mg/L 50%
![Page 71: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/71.jpg)
Aktivitet av preparat i fas II/III – Finns det fler hopp?
Falagas ME et al. Expert Review of Anti-infective Therapy 2016; 14:747-763, Wright, CMI, 2017
= Cefiderocol
![Page 72: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/72.jpg)
Neutropen feber, blododling: Pseudomonas aeruginosa
Antibiotikum MIC SIR
Ceftazidim >256 mg/L R
Piperacillin-tazobaktam.. - R
Imipenem >32 mg/L R
Meropenem >32 mg/L R
Gentamicin >256 mg/L R
Amikacin >256 mg/L R
Ciprofloxacin >32 mg/L R
VIM-positiv
![Page 73: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/73.jpg)
Mentometerfråga 2
Hur behandlar du patienten i väntan på kompletterande resistensbestämning?
1. Ceftolozan-tazobaktamDet är särskilt utvecklat för ökad effekt på multiresistenta P. aeruginosa.
2. Ceftazidim-avibaktamAvibaktam är den bredaste och mest effektiva betalaktamashämmaren.
3. Kolistin + rifampicin + meropenemJag har sett i något PM att man bör kombinationsbehandla.
4. Kolistin + rifampicinStammen är höggradigt resistent mot meropenem,
kombinationsbehandling tillför inget.
5. KolistinStammen är resistent mot möjliga kombinationspreperat,
kombinationsbehandling tillför inget.
![Page 74: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/74.jpg)
Resistensbestämning av
kombinations-preparat och kolistin
- Hur svårt kan det vara?
![Page 75: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/75.jpg)
Vad är antibiotikaresistens?
Olika perspektiv
Klinisk: hög sannolikhet för terapisvikt
Molekylärbiologisk: närvaro av resistensgener
Bakteriologisk: tillhör ej normalpopulationen
![Page 76: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/76.jpg)
MIC- Minsta hämmande koncentration
Buljongrör med stigande
antibiotikakoncentration i
hela spädningssteg (mg/L)
Samma mängd bakterier
tillsätts i alla rör
Läses av efter 24 timmars
inkubation.
MIC = Den lägsta koncentration
som fullständigt hämmar synlig växt
….0,06 / 0,12 / 0,25 / 0,5 / 1,0 / 2,0 / 4 / 8 / 16 / 32…mg/L
![Page 77: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/77.jpg)
Normalpopulationen slutar
Vad betyder S – I – R på resistensbeskedet?
Normalpopulationen slutar
LÅG
antibiotika-
koncentration
krävs för
hämmning
HÖG
antibiotika-
koncentration
krävs för
hämmning
E. coli – Ciprofloxacin MIC17 877 observationer (82 datakällor)
EUCAST reference database
![Page 78: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/78.jpg)
Vad betyder S – I – R på resistensbeskedet?
Brytpunkten baseras på:
• Farmakokinetiska data – vilken koncentration uppnås i blodbanan med
standarddosering.
• Kliniska data – Klinisk behandlingseffekt vid olika MIC-värden
• Bakteriepopulationens MIC-fördelning (undvika att dela en population)
=> Sannolikhet för framgångsrik terapi
![Page 79: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/79.jpg)
Normalpopulationen slutar
Vad betyder S – I – R på resistensbeskedet?
LÅG
antibiotika-
koncentration
krävs för
hämmning
HÖG
antibiotika-
koncentration
krävs för
hämmning
E. coli – Ciprofloxacin MIC17 877 observationer (82 datakällor)
EUCAST reference database
S I R
![Page 80: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/80.jpg)
S – I – R – systemet definitioner
S = Känslig (Sensitive)Infektionen kan förväntas svara på behandling med detta antibiotikum vid
dosering rekommenderad för denna typ av infektion.
I = Intermediär Behandlingseffekten med detta medel är osäker. Bakterien kan svara på
behandling med doser som är högre än normaldosering.
R = ResistentKlinisk effekt av behandling med detta medel är osannolik. Bakterien har
förvärvat betydelsefulla resistensmekanismer eller är naturligt resistent mot
medlet.
![Page 81: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/81.jpg)
Resistensbestämning av bakterier – metoder som används
Rutinmetoder (S/I/R):
Diskdiffusion Automatiserade metoder
MIC- bestämning:
Gradienttest Mikrobuljong- Agarspädning
spädning
![Page 82: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/82.jpg)
FDA-krav för godkännande av metod för resistensbestämning
150 testade isolat, varav en viss andel ska vara resistenta
≥90 % categorical agreement (korrekt SIR)
och essential agreement (±1 spädningssteg)
≤1.5 % falsk känslighet (very major error)
≤3 % falsk resistens (major error)
När FDA godkänner saknas ofta isolat med
komplexa resistensmekanismer
Nya resistensmekanismer
Låggradig, men klinisk relevant, resistens
=> Problem med pågående resistensbestämningsmetoder
upptäcks fortlöpande
![Page 83: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/83.jpg)
Kombinationspreparat - betalaktamantibiotika
Amoxicillin – klavulansyra
Piperacillin – tazobaktam
Ceftolozan – tazobaktam
Ceftazidim – avibaktam
(Ampicillin – sulbactam)
![Page 84: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/84.jpg)
Resistensbestämning mot piperacillin-tazobaktam
Rutinmetoder (S/I/R):
Diskdiffusion Automatiserade metoder
MIC- bestämning:
Gradienttest Mikrobuljong- Agarspädning
spädning (Anaerober)
![Page 85: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/85.jpg)
Resistensbestäming mot piperacillin-tazobaktam – Diskdiffusion?
Välfungerande diskdiffusion:
Cefotaxim
http://www.eucast.org/ast_of_bacteria/calibration_and_validation
Fungerar acceptabelt:
Piperacillin-tazobaktam
![Page 86: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/86.jpg)
Resistensbestäming mot piperacillin-tazobaktam – automatiserade metoder?
NordicAST workshop 2017
Au
tom
ati
se
rad
me
tod
Generell underskattning av resistens – svar S istället för I
Minor error: 10%
![Page 87: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/87.jpg)
Resistensbestämning mot piperacillin-tazobaktam – gradienttester?
Exempel Bacteroides fragilis - gruppen
År Metod: Gradienttest Resistensfrekvens (R+I)
2015 Piperacillin-tazobaktam – Företag A 32 %
Företaget återkallar produkten – efter att EUCAST påtalat problemen
![Page 88: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/88.jpg)
Vilken metod fungerar? – Bacteroides fragilis - gruppen
År Metod: Gradienttest Resistensfrekvens (R+I)
2015 Piperacillin-tazobaktam – Företag A 32 %
2016 jan-mars Piperacillin-tazobaktam – Företag B <1 %
EUCAST WARNING !
![Page 89: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/89.jpg)
Vilken metod fungerar? – Bacteroides fragilis - gruppen
År Metod: Gradienttest Resistensfrekvens (R+I)
2015 Piperacillin-tazobaktam – Företag A 32 %
2016 jan-mars Piperacillin-tazobaktam – Företag B <1 %
Hur stor andel av B. fragilis - gruppen
har nedsatt känslighet för piperacillin-tazobaktam?
Åtgärd: införande av agarspädning på Karolinska
= referensmetod för anaeroba bakterier
![Page 90: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/90.jpg)
Varför är det så svårt med kombinationspreparat?
Två olika preparat som samverkar
Fast gradient i remsan
– svårt att tillverka
Fungerar olika bra vid olika MIC
QC-stammar får ofta korrekt resultat
![Page 91: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/91.jpg)
Resistensbestämning mot piperacillin-tazobaktam
Rutinmetoder (S/I/R):
Diskdiffusion Automatiserade metoder
(Aeroba bakterier)
MIC- bestämning:
Gradienttest Mikrobuljongspädning Agarspädning
(Aeroba bakterier) (Anaerober)
![Page 92: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/92.jpg)
Resistensbestämning mot kolistin – diskdiffusion?
Välfungerande diskdiffusion:
Cefotaxim
http://www.eucast.org/ast_of_bacteria/calibration_and_validation/ NordicAST workshop 2017
Fungerar ej:
Kolistin
0
2
4
6
8
10
12
14
16
18
20
6 8
10
12
14
16
18
20
22
24
26
28
30
32
34
36
38
40
No
of
iso
late
s
Inhibition zone diameter (mm)
Colistin 25 µg vs. MICEnterobacteriaceae, 50 isolates
32
16
8
4
2
1
0.5
≤0.25
![Page 93: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/93.jpg)
Resistensbestämning mot kolistin – gradienttest? (Etest®, MICE®)
NordicAST workshop 2017
Generell underskattning av resistens
Very major error (VME): 12/75 = 16%
![Page 94: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/94.jpg)
Varför fungerar inte diffusionsmetoder för kolistin?
Stor molekyl
=> diffunderar dåligt i agarn
=> lika stora zoner i princip oavsett MIC-värde
![Page 95: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/95.jpg)
Resistensbestämning mot Kolistin
Rutinmetoder (S/I/R):
Diskdiffusion Automatiserade metoder
MIC- bestämning:
Gradienttest
Mikrobuljongspädning
![Page 96: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/96.jpg)
Pågående lösning
Större laboratorier:
Inför mikrobuljongspädningsmetoder
=> 1 dygn innan svar på MIC-bestämning
Mindre laboratorier:
Skickar stam till referens-lab
=> Betydligt längre svarstid (upp till 1 vecka)
![Page 97: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/97.jpg)
Svåra fall sommaren 2016 – Hur gick det?
Neutropen feber, blododling:
Pseudomonas aeruginosa
Ceftazidim...................... R
Piperacillin-tazobaktam.. R
Imipenem....................... R
Meropemen....................R
Gentamicin.....................R
Amikacin........................ R
Ciprofloxacin.................. R
Bukabscess, levertranspl.
Klebsiella pneumoniae ESBL
Trimetoprim-sulfa........... R
Ertapenem..................... R
Cefotaxim.......................R
Ceftazidim...................... R
Piperacillin-tazobaktam.. R
Imipenem....................... I
Meropemen....................R
Gentamicin.....................R
Amikacin........................ I
Ciprofloxacin.................. R
Kolistin………..…………..S
Ceftolozan-tazobaktam...R
Ceftazidim-avibaktam..... R
Kolistin………………….... S
Ceftolozan-tazobaktam... R
Ceftazidim-avibaktam......S
VIM-positiv ESBLA + porinförlust
![Page 98: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/98.jpg)
Sammanfattning – 1 (2)
Ökning av karbapenemresistens hos Enterobacteriaceae, Pseudomonas och
Acinetobacter är av WHO högt prioriterat område.
Resistensläge blododlingar 2015 EARS-Net:
ESBL: Italien, Grekland Frankrike/Spanien Nordeuropa
E. coli 20-30% 10-15% 5-10%
Klebsiella pneumoniae 55-70% 20-30% 2-8%
Karbapenemresistens Italien, Grekland Frankrike/Spanien Nordeuropa
E. coli <1% <0,1% <0,1%
Klebsiella pneumoniae 30-60% 0,5-2% <0,1%
Pseudomonas 20-40% 16-20% 4-8%
Acinetobacter 80-90% 5-50% 2-5%
Kolistinresistens:
Okänd frekvens pga avsaknad av screening
Ovanligt, men ökande frekvens.
Högre resistens hos karbapenemresistenta isolat, särskilt i Grekland och Italien.
Stor risk för resistensutveckling vid singelbehandling
![Page 99: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/99.jpg)
Sammanfattning – 2 (2)
Högriskloner - tex E. coli ST131 (ESBL) och K. pneumoniae ST258 (CARBA KPC)
står för stor del av spridningen
Bärarskap och/eller klinisk infektion beror på både
bakteriella faktorer och värdfaktorer.
Genotypen ger viktiga ledtrådar till känslighet för ceftolozan-tazobaktam och
ceftazidim-avibaktam.
Alltid resistensbestämning innan behandling med dessa preparat!
Resistensbestämning av kombinationspreparat och kolistin är svårt!
Kolistin: buljong MIC
Kombinationspreparat med betalaktamantibiotika:
Aeroba bakterier: Diskdiffusion och buljong MIC
Anaeroba bakterier piperacillin-tazobaktam: Agarspädning referensmetod
![Page 100: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/100.jpg)
Lärandemål
Kunna beskriva de viktigaste trenderna inom antibiotikaresistens nationellt
och internationellt
Förstå de viktigaste resistensmekanismerna
Kunna diskutera de viktigaste orsakerna till spridning av resistens, med
fokus på så kallade bakteriella högriskkloner
Få kännedom om nya preparat som registrerats under de senaste två åren
och deras möjliga plats i terapin
Förstå SIR-systemet och principerna för att fastställa SIR-gränser
Förstå utmaningarna vid resistensbestämning av några av de nya
antibiotikapreparaten
![Page 101: Antibiotikaresistens: mikrobiologi, epidemiologi](https://reader031.vdocuments.site/reader031/viewer/2022012409/616a46bf11a7b741a350bda3/html5/thumbnails/101.jpg)
Bild: Science photo library
Tack!