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Localización de Información Científica
IV Simposio de Cardiología del LitoralFederación Argentina de Cardiología
Rafaela, Santa Fe, Argentina, 20 y 21 noviembre de 2003
Prof. Dr. Armando PacherBioingeniería - Universidad Nacional de Entre Ríos
CETIFAC – Centro de Teleinformática de la FAC
•Localización de información científica
•Dónde buscar la información
•Estrategias y tácticas de búsqueda: (AND OR NOT, etc.)
•Utilización de PubMed – Medline y sus herramientas
•La charla de esta mañana puede continuar en forma virtual y permanente en el Foro de Informática en Cardiología:
• cursofac@fac.org.ar
• El material que se proyectará estará en la Web en:
• www.fac.org.ar/fec/cursofac/simlit03
Localización de la información científica
Tipos de información Documentos, imágenes, trabajos científicos
Al ser “no controlada”, Internet tiene contenidos que representan un libre muestrario de la Humanidad: es necesario filtrar para “separar la paja del trigo”
¿Dónde se encuentra la información “filtrada”? En sitios de instituciones académicas y científicas y
bibliotecas: en general se los identifica pues sus direcciones
tienen las extensiones
.edu - .org - .gov *
Localización de la información científica
Se localiza información a través de la Web: accediendo a sitios institucionales y bibliotecas con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline accediendo a Bireme-Lilacs
La información institucional se encuentra “a dos clicks” *
1er click
2do click
Sitios institucionales
A “una distancia de dos clicks”
Sitios institucionales
2do clickSitios institucionales
Organizaciones internacionales “a dos clicks”
Sitios institucionales
Múltiples instituciones “a dos clicks”
Universidades “a dos clicks”
Sitios institucionales
Certificación de ética y calidad en la información científica
Sitios institucionales
Sitios institucionales: Ateneos
Acceso y búsqueda de información en la Web
Se localiza información:
En la Web: accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline *
Buscadores o Searchers
Google Copernic Yahoo! Webcrawler Metacrawler Lycos Excite Infoseek HotBot otros (Magellan, EuroSeek, Altavista, Fast Search, Direct
Hit, YellowPages, Albert, etc., etc. etc.) Información no “filtrada” salvo la de instituciones
científicas y académicas.
Utilizar uno o a lo sumo dos y aprender a fondo sus funcionamientos
(cada uno tiene sus propias reglas)
Buscadores o Searchers
Supongamos una búsqueda de un temade actualidad, como “apoptosis”,
utilizando como buscador a Google
?210.000 citas
Es imprescindible limitar las búsquedas en la Web
Utilización de operadores lógicos
AND
OR
NOT
Recordar la Teoría de ConjuntosConjunto A y Conjunto B
Intersección - Unión - Diferencia
Operador AND (= Y)
A Y Barrhythmia AND ventricular
material que incluya arritmia y ventricular
Limitar las búsquedas en la Web
Intersección
Operador OR (= O)
A OR Barrhythmia OR ventricular
material que incluya o arritmia o ventricular
Limitar las búsquedas en la Web
Unión
Operador NOT ( = NO)
A NOT Barrhythmia NOT ventricular
trabajos que incluyan arritmia pero no ventricular
Limitar las búsquedas en la Web
Diferencia
Operadores AND OR NOT
arrhythmia AND ventricular:
encuentra trabajos de arritmia ventricular
arrhythmia OR ventricular:
encuentra tanto trabajos de arritmia como trabajos que tengan la palabra ventricular
arrhythmia NOT ventricular:
encuentra trabajos de arritmia no ventricular *
Operadores AND OR NOT: combinaciones
arrhythmia AND ventricular NOT ischemia:
encuentra trabajos de arritmia ventricular sin isquemia
arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT ischemia:
encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular sin isquemia
arrhythmia AND ventricular NOT sustained AND treatment NOT ischemia :
encuentra trabajos de tratamiento de arritmia ventricular no sostenida sin isquemia *
AND
OR
NOT
167 citas
Limitar las búsquedas en la Web
Equivalencias:
AND = +
OR = ^
NOT = -
Inclusión de frases:
"radiation induced apoptosis”
"human lymphocytes”
Estudiar los comandos de cada Searcher:
? * “” , <frase> () <NEAR> <NEAR/N> etc., etc.
64 citas
Copiado (download) de la información
Mediante el browser, desde el sitio donde se localizó el o los archivos: definir bien la ubicación, para su localizacion posterior
Se disminuye el tiempo de copiado mediante programas específicos:
www.gozilla.com - www.getright.com - www.speedbit.com
Guardar direcciones de sitios de interéslocalizados en la Web
Favoritos - Bookmarks
Los favoritos se pueden copiar en diskettes, enviar por email, etc.
Acceso y búsqueda de información en la Web
Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers
Se localiza información:
En la Web accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline accediendo a BIREME-LILACS *
Medline
Base de datos bibliográfica de la National Library of Medicine - NLM
abarca los campos de medicina, enfermería, odontología, veterinaria, salud pública y ciencias preclínicas o básicas.
contiene citas bibliográficas y resúmenes de aproximadamente 4300 publicaciones biomédicas sumando más de 10 millones de citas desde 1966.
se actualiza mensualmente
es gratuita
PubMed ofrece acceso a dos bases de datos: MEDLINE y PREMEDLINE (datos aún no indexados en MEDLINE)
PubMed se actualiza semanalmente. *
PubMed (Medline)
Búsquedas simples con o sin operadores AND OR NOT
Utilización de “Limits” acotación de los resultados
Journal Browser para hojear revistas
Citation Matcher ubica trabajos conocidos
MeSH Browser búsquedas avanzadas
Clinical Queries mediante categorías (therapy, diagnosis, etiology,
prognosis) y elección de sensibilidad y especificidad.
Cubby almacenamiento y actualización de búsquedas *
arrhythmia
Búsqueda simple: arrhythmia
Arrhythmia: 101.249 citas
Utilización de operadores
AND OR NOT
Arrhythmia AND ventricular: 36.674 citas
Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained: 15.608
Arrhythmia AND ventricular AND treatment NOT sustained AND 2001: 1074
Utilización de “Limits”
campo de búsqueda (título, autor, etc.) grupo etario sexo humano o animal idioma disponibilidad de abstracts fechas de publicación o de indexación tipo de publicación (ensayo clínico [clinical trial],
editorial, etc.) Nota: la mayoría descartan PREMEDLINE
Agregando “Limits”
Resultado con “Limits”: 31 citas
Id. anterior, trabajos sólo de 2001: 7 citas
Traducción: buscar ensayos clínicos que tengan abstracs, publicados en 2001, sobre tratamiento en adultos de arritmia ventricular no sostenida.
Journal Browser
Herramienta para hojear publicaciones
Se ingresa el nombre de la publicación, o la abreviatura correspondiente de MEDLINE o el identificador ISSN.
Mediante “Limits” se elige el ejemplar buscado
Ingreso del nombre de la publicación
Codificación de la publicación
Acceso a la totalidad de lo publicado: 17.965 citas
Utilización de Limits: fecha de publicación
Utilización de Limits: fecha de publicación: 55 citas
Citation Matcher
Herramienta para buscar artículos cuando se dispone de la cita
Se ingresan los datos conocidos en los diferentes campos *
Cuando se conoce la cita bibliográfica
Cuando se conoce la cita bibliográfica
Obtención directa cuando se conoce la cita bibliográfica
Abstract del artículo
MeSH Browser - Encabezados de Temas Médicos
Herramienta de mayor complejidad y eficacia: aplica la lógica que utilizan los bibliotecarios.
Cada cita en la sección de MEDLINE en la base de datos de PubMed es indexada con los Medical Subject Headings (o MeSH) que describen el tema contenido en el artículo.
El MeSH Browser permite la búsqueda de citas por términos MeSH.
Los términos MeSH se dividen en
encabezados
subencabezados *
MeSH Browser (actualmente Mesh Database)
Buscar el término MeSH
Muestra los términos que tiene indexados
Verificar el árbol y agregarlo (“Add”) a la búsqueda
Buscar subencabezados o subtérminos MeSH
Incluir subtérminos MeSH, de a uno por vez
Realizar la búsqueda en PubMed
Incluir límites si son necesarios
Verificar el esquema MeSH utilizado (Details)
Opción de guardar la búsqueda MeSH
Guardado de la búsqueda como “Favoritos” o “Bookmarks”
Ej.: Inmunología en la Enfermedad de Chagas congénita
Optar por "MeSH Browser“(actualmente Mesh Database)
Escribir en "Search for:" el término a buscar (Chagas) y hacer clic en "Go"
Elegir en el listado el término MeSH más adecuado (Chagas Disease) y hacer clic en "Browse this term"
Aparece un árbol de categorías MeSH relacionadas con el término a buscar.
Hacer clic en "Add this term to the Search using operator: AND"
Aparece en la nueva ventana "Chagas Disease"[MESH]
Hacer clic en "Detailed display" y agregar, de a uno por vez, los términos/subtítulos MeSH necesarios para acotar la búsqueda
Hacer clic en "PubMed Search"
Si es necesario, incluir "Limits”y/o “Add Terms”
Búsqueda compleja
Búsqueda compleja, que localiza un solo artículo
Traducción de una búsqueda compleja
((((((Hypertension/drug therapy[MESH] AND Clinical Trial[ptyp]) AND English[Lang]) AND "adult"[MeSH Terms]) AND "human"[MeSH Terms]) AND ("2001/02/16 01.46"[EDat] : "2001/03/18 01.46"[EDat])) AND ("2001/02/16"[EDat] : "2001/03/17"[EDat]))
Esta sería la traducción aproximada:
"Buscar trabajos de marzo de 2001, sólo escritos en idioma inglés, que sean ensayos clínicos en humanos, mayores de 19 años, sobre el tema terapia con drogas de la hipertensión arterial”
Que es lo que le pediríamos a una bibliotecaria *
Clinical Queries Filtros de categorías, sensibilidad y especificidad
Cubby Almacenamiento y actualización de búsquedas
Filtros de categorías, de sensibilidad y de especificidad
Almacenamiento y actualización de búsquedas
PubMed (Medline)
Técnicas: Búsquedas simples Utilización de “Limits” Journal Browser Citation Matcher MeSH Browser (actualmente MeSH Database) Clinical Queries Cubby
El material de texto completo (full text) puede ser obtenido en forma gratuita o bajo un arancel.
Esto es sólo la técnica para la búsqueda de información en Pubmed: hay que profundizar en la estrategia. *
Si hay dudas con la ortografía inglesa de los términos a buscar
www.hon.ch
Se escribe en castellano y se traducen los términos MeSH a inglés
Aparecen jerarquías, términos y subtérminos
Se eligen las opciones
Acceso y búsqueda de información en la Web
Se va de un sitio a otro (“se navega”) mediante programas denominados Navegadores o Browsers
Se localiza información:
En la Web accediendo a sitios institucionales con programas llamados Buscadores o Searchers accediendo a Medline accediendo a BIREME-LILACS
Participando en mailing lists *
BIREME-LILACS: “Medline Latinoamericana”Herramientas similares a PubMed
Conceptos básicos finales (“para no marearse”)Dr. Alberto Vázquez, XX Congreso Nacional de Cardiología, Córdoba, 2001
Planificar una estrategia No sentarse a la PC sin un plan; escribir antes la búsqueda, que no deberá ser ni muy amplia ni muy acotada; abrir un solo frente por vez y agotarlo; si se encuentra un buen trabajo, detenerse y leerlo ...
al otro día se hará una mejor búsqueda; escribir todo en inglés (ayudarse con un buen diccionario
y/o con HonSelect).
No es difícil, pero hay que sumar “horas de silla”. *
www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/fig910.htm www.fac.org.ar/ateneos/ateneo1/atennecr.htm www.annals.org/issues/v134n12/toc.html www.fac.org.ar www.fac.org.ar/cvirtual/cvirteng/cienteng/mneng/
mnm3004i/dicarli/dicarli.htm www.acc.org www.asecho.org www.americanheart.org www.worldheart.org www.who.int www.who.int/regions/amro www.paho.org www.cochrane.org www.hon.ch www.hon.ch/MedHunt www.bireme.br/bvs/E/ehome.htm www.uba.ar www.un.edu.ar www.copernic.com www.google.com
www.sghms.ac.uk/depts/immunology/~dash/apoptosis
www.yahoo.com www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi world.altavista.com www.gozilla.com www.getright.com www.speedbit.com www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi cursofac@fac.org.ar www.fac.org.ar/fec/cursofac http://cardiofellows.mc.duke.edu http://dukecardiology.duke.edu/home.asp?divisionID=39 http://www.centerwatch.com/patient/studies/area1.html http://www.nhlbi.nih.gov/guidelines/hypertension/
jncintro.htm http://www.ccs.ca/society/conferences/index.cfm http://www.cardiology.med.ucla.edu/Cardiology/
home.htm http://www.mecme.org/ http://www.fac.org.ar/fec/cursofac/pubmed http://www.hon.ch/HONselect/index_sp.html http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/journals/
loftext_noprov.html
Material proyectado:• www.fac.org.ar/fec/cursofac/simlit03
Direcciones citadas en la exposición
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