document1

1

החוג להנדסה פרמצבטית

50022קורס ביוכימיה שנה ב' סמסטר א'

מרצה ד"ר תמר גילון164מ-חדר

tamargi@jce.ac.il

2

העקרונות והתהליכים המולקולאריים :משותפים לכל צורות החיים

אותן אבני בניין ]שומנים סוכרים חלבונים •DNA משמשות את כל עולם החי, מחיידקים ועד]..

בני אדם, לבניית מולקולות ביולוגיות. חלבוןDNA RNA  מעבר המידע הגנטי •

נעשה באותה דרך בכל האורגניזמים.

• ATP נוקלאוטיד, מטבע האנרגיה האוניברסאלי,במערכות ביולוגיות, נוצר בדרכים דומות בכל צורות

החיים.

התא מוקף בממברנה שומנית.לקלוט דברים •מבחוץ ולסנן את כניסה החומרים.לפלוט חומרים

לא רצויים

וירוס אינו תא כי אינו מסוגל להתרבות

3

הכרת מבנה, תפקיד מטרת הקורס:ומטבוליזם של ביומולקולות.

נושאי הלימוד: חלבונים.1 .. חלבונים קושרי חמצן: המוגלובין ומיוגלובין.2. אנזימים: מבוא וקנטיקה.3אנזימים: מנגנוני פעולה.. 4. סוכרים 5. ביואנרגטיקה ומבוא למטבוליזם.6.. גליקוליזה7. מעגל החומצה הציטרית.8. זרחון חמצוני.9

. מבנה הממברנה והעברת חומרים דרכם. 10. נוקלאוטידים וחומצות גרעין.11

4

ספרות עזר

1 .Lehninger Principles of Biochemistry, fifth Edition (2008)by David L. Nelson, Michael M. Cox. W. H. Freeman & Co.www.whfreeman.com/lehninger

2 .Biochemistry sixth Edition (2007)By Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer. W. H. Freeman & Co.www.whfreeman.com/stryer/

5

Large molecules3

In living organisms there are four majortypes of biological macromolecules:

Lipid Lipids

6

מבנה ותפקיד של חלבונים

Proteins

Proteios ביוונית - מהמעלה הראשונה

7

החלבונים פועלים בתחומים רבים ומגוונים:

קטליזה אנזימתית (זירוז לפחות פי מליון).• (חמצן, ברזל). העברת חומרים ואחסונם• תנועה (תאים, שרירים, כרומוזומים).• תמיכה מכאנית (קולגן, קרטין).• הגנה חיסונית (הבחנה בין עצמי ולא עצמי).•.והעברתם יצירת אותות עצביים • בקרה על גדילה והתמיינות.•

8

30% ממשקלו היבש של התא. ]מתוך 50%מהווים כ- ]שאינם מים

לכל חלבון מבנה ותפקיד מורכב ושונה מזה של אלף80-90חלבונים אחרים. הערכה שבגוף האדם בין

.חלבונים

מה מייחד את החלבונים משאר חומרי הטבע? •הם בנויים מחומצות אמינו

מדוע הם כלולים בקבוצה אחת? כי יש להם מכנה משותף•הח.אמינו

מה קובע את המבנה והתפקיד המיוחדים לכל חלבון?•DNA וע"פ ה Rה-

חלבונים הם מקרומולקולות בעלות תפקידים חיוניים.

9

מבנה החלבון נקבע על פי רצף החומצות האמיניות.המרכיבות אותו

רצף החומצות האמיניות נקבע על פי האינפורמציה. DNAהנמצאת ב-

10

Proteins are made from 20 different amino acids(monomeric units)

Amino acids

Amino acids have carboxyl and amino groups—they function as both acid and base.

ללא ה ]-[

יש עוד ח.אמינו אך הן לא מרכיבות חלבונים

11

חומצות אמיניות – אבני הבניין של באורגניזמים חיים מצויות חומצות אמיניות החלבוניםLבקונפיגורציה

כדי ליצור איזומר צריך לשבור את הקשרים ויצור מחדש

D. במקרים נדירים

12

Amino acids can be classified based onthe characteristics of their R groups to Four groups.פולרית אבל לא טעונה

These hydrophylic amino acids attract ions of opposite charges.

PH =7

13

Large molecules3

Hydrophylic amino acids with polar but uncharged sidechains form hydrogen bonds הידופילי

14

Large molecules3

Hydrophobic amino acidsהידרופובי

15

Large molecules3

יש אפשרות לחימזור

סימטרית והכי קטנה

טבעת עם הקבוצה האמינית

16

pHמצב היוני של ח' אמינית משתנה לפי ה-

דהפוטונציה-הוצאה של הפרוטון

מתוך החץאמינו 7ביכולה לעבור דהפרוטונציה

17

בסביבה ניטרלית חומצות אמיניות נמצאות בדרך כלל בצורה הדו-יונית )צוויטריון(.

מטען שווה אפס לא Rבתנאי שה

עובר יוניזציה

Pi זהו הPH שסה"כ המטענים

שווה אפס

18

של )R(יוניזציה של הקבוצה הצדדית עולה ph החוחצה אמינית היסטידין

ההיסטידין מאבד פרוטון

19

של -pKaערכי הקובצות צדדיות הניתנות לינון

בחלבונים

20

ניתן לחבר חומצות אמיניות זו לזו. 1.

כאשר מספר החומצות האמיניות המחוברות זו לזו קטן

המבנה שלהם יותר גמיש פפטיד.(, התוצר נקרא 1-20,30 )עד

בגלל שהם קטנים

.כאשר מספרן של חומצות האמיניות המחוברות גדול )גדול 2

חלבון(.( התוצר הינו פוליפפטיד-)אם הוא פעיל אז נקרא 30 מ-

קשר פפטידי)קשר. הקשר המחבר חומצות אמיניות זו לזו נקרא 3

אמידי(.

הקשור לפחמןחיבור קרבוקסיל. קשר פפטידי נוצר על ידי 4

אחרת, חומצה אמינית של להאמין הקשור לפחמן

בתהליך בו יוצאת מולקולה של מים.

פפטידים / חלבונים

21

ראיקצית יצירת קשר פפטידי

נוצר דיפפטיד

באפור זהו הקשר C-Nהפפטידי C+O)קבוניל

( H+Nוחנקן אמין

ביצירת מושקעת אנ' אקטיבציה

לשבור את הקשר ומשתחחרת אנ'

הריאקציה הזו קוראת בעזרת

אנזים

איבדת מימן

22

לפפטידים ולחלבונים יש כיווניותיש קצה אמיני וקצה קרבוקסילי

Ser Gly Tyr Ala

Leu

23

שלד פחמניחוזר על עצמו לכן נקרא שלד

קבוצות צדדיותכאשר מתבצעת הידרוליזה השרשרת מה שנותר נקרא השייר

]מלשון מה שנשאר[

יחידה של חומצה אמינית בשרשרת פוליפפטידית(residue)נקראת – שייר

24

.המבנה האלקטרוני הנוצר מקנה קשיחות לקשר הפפטידי.הוא מישורי ואינו מאפשר חופש תנועה סביבו

הקשר הפפטידי הוא בעל אופי של קשר כפול חלקי

מאוד לאקטרושלילי

ולכן Nיותר מהרזטננס

Oה"לקחת לעצמו"

את ה אלקטרון

לםחמן ולחנקן יש קשר כפול ולכן יותר חזק ויש קיבוע למישור מסויים שלא קורה קשר יש קשר

יחידי

25

הקשר הפפטדי הוא מישורי

יכול להסתוב

ב

יכול להסתוב

ב

זווית הפיתול

בין חנקן לפחמן

זווית הפיתול בין פחמן אלפא

לבין פחמן

26

.קשר קוולנטי נוסף שיכול להתקיים בשרשרת פוליפפטידיתנוצר בין שני שיירי ציסטאין באותה שרשרת או בשתי

שרשרות שונות.רק הח.אמינו הזו מקיימת קשר דיסולפידי4 +3במבנה

(S-S Bond)קשר צילוב דיסולפידי

ציסטיאיןציטין

27

Ramachandran)מפות רמצ'נדרן diagrams)

הפרעה מרחבית לא יכול ירוק כהה לקרות

איזור מועדף

מבנים משנים מועדפים לפי מפות רמצ'נדרן

29

ארבע רמות ארגון בחלבונים

מבנה ראשוני

ח.אמינו+ח.אמינו

2מבנה

מבנה תלת מימד ולרוב מתייחסים אליהם כקטעים

חוזרים בחלבון ומה שמחזיק אותן זה

הקשרי מימן. סדר גודל של פפטיד או

קטע מתוך הפוליפפטיד

מבנה שלישוני

מבנה תלת מימדי של כל השרשרת בעל איזור ים עם מבנה שיניוני וגם ללא מבנה שניוני

מבנה ריבעוני

שמור לאותם חלבונים שיותר משרשרת

פוליפפטידית אחת הדרושה ליצור אותם

30

.לכל חלבון מבנה מרחבי אשר בו מותנית פעילותו.(קונפורמציה הארגון המרחבי של הקובוצות במולקולה)

?כיצד נוצר מבנה זה

מבנה התלת מימדי של החלבון נובע מרצף החומצותהמבנה הראשוניהאמיניות הבונות אותו. רצף זה נקרא

.של החלבון

מבנה של חלבוניםמורכבים מחומרים אורגניים ולא אורגניים

Ser Gly Tyr Ala Leu

31

הדוגמאות הנפוצות ביותר למבניים שניוניים הם:

) כמו במפה) Helixסליל •במפהכמוconformations) –מבני •turn) –כיפוף •

מבניים שניונים הם מבנים מרחביים ידועים )מקומים( החוזרים על עצמם

32

מבנה דמויי קנה. השרשרת הפוליפפטידית העיקרית נמצאת בחלק הפנימי והקבוצות הצדדיות פונות כלפי חוץ

סיבובים5 חומצות אמינו יוצרות 18

(-helix) סליל

קו מקווקו מסמן ק. Oמימן בין

H

המרכז אינו חלול האטומים

תופסים את

החלל שמצוייר

Dכמו ב

33

סכימה של קשרי מימן בסליל

יוצרת קשר מימן עם Ri של שייר COקבוצת קבוצת

NH של שייר Ri+4.

הרבה ח.אמינו שטעונות חיובי יכולות לשבור את מבנה הסליל

34

ימני ושמאלי סליל

Lאיזומר

אינן D ןLתערובת של יכולות

ליצור סליל

Dאיזומר

35

מבנה סופר – הליקס המורכב משני (או שלולש).סלילי

קרטינים.(נוצות, שיער, צמר) משמשים לחיפוי ומגן.(תפקיד חשוב בהתכווצות שריר) מיוזין - חלבון השריר .. אפידרמין - ממרכיבי העור.3. פיברינוגן - ממלא תפקיד בתהליך קרישת הדם.4

גמישיםמאד חלבונים סיביים בעלי מבנה סליל מאורכם(2)נמתחים עד פי

36

קרטינים- מבנה שניוני ושלישוני ורבעוני של

37

פריטין – חלבון מאכסן ברזל, מורכב רובו. מצרור של סלילי

38

מבנה השערה

39

הביוכימיה של סלסול שיער

40

4- 3 המרוחקות Rהאינטראקציות של קבוצות •

מקומות ברצף הליניארי.

)מידת היינוןRהמטען החשמלי של קבוצות •

(.pH תלויה ב-

.Rהנפח של קבוצות - •

.Proline נוכחות •

גורמים המשפיעים על ארגון שרשרת

הליקס פוליפפטידית כ-

41

C

CH2

COOH

H

NH

CH2 CH2

PROLINE

החומצה האמינית פרולין מונעת יצירת סליל

42

( conformation מבנימבנה מתוח יחסית, בעל סידרה שונה של קשרי •

מימן]לא בשלד הפחמני אלא עם שרשראות סמוכות[.

השרשרת הפוליפפטידית נמצאת במבנה זיגזג, •).]במשי וקורי עכביש[ strandהנקרא גדיל

יצירת קשרי מימן בין קבוצות קרבוניליות לבין •קבוצות

אמידיות הנמצאות בשרשרות סמוכות יוצרות ). pleated sheetמשטח, הנקרא משטח קפלים

קשרי המימן מקנים יציבות למבנה.•הקבוצות הצדדיות מעל ומתחת למישור הקפלים.•

43

: כל השרשרות נמתחות באותו כיוון.מקביל: שרשרות סמוכות נמתחות בכיוונים מנוגדים.אנטי-מקביל

ליצירתשתי צורות ארגון של גדילי משטח קפלים

מקביל

צורה יותראנטי-מקביל

יציבה.קשרי המימן יותר קרובים מאשר בצורה המקבילה

Nקצה

Nקצה

Nקצה Cקצה

Cקצה

Cקצה

מימנים שקשורים לפחמן אינם בעלי

מטען יוצרים ולא VDVקשרי

קשרי מימן

44

סכמה של משטח קפליםסגול,צהוב הם

השיירים

חנקן

פחמן קרבוקסיל קבו' צדדיות

גדולות לא יכלו להסתדר בצורת משטח

45

COאלמנט מבני הנוצר על ידי קשר מימן בין קבוצת .i+3 בשייר NH לקבוצת iבשייר

הקיפול מאפשר היפוך כיוון השרשרת ומבנה קומפקטי.

(Turn) כיפוף

הכיפוף נוצר מח.אמינו מסוימות

גליצין ופורולין

46

נפוץ בבעלי חיים רבים. מחלבוני גוף העכבר.20%מאד שכיח: כ-

נמצא ברקמות חיבור, בעור, בעצמות בשיניים ובשרירים. מאורכו).10%מאופיין בקשיות ועמידה בפני מתיחה (עד

מבנה מאוד מאוד קבוע: כמעט כל שייר שלישי הוא גליצין.הרבה שיירי פרולין]טבעת[

והידרוקסיפרולין ]במקור זהו פרולין +תוספות[)Hyp(.(שייר נדיר)

– הסליל המשולש.(Collagen)סליל הקולגן

47

חוזר.Gly- Pro- Hypברצף סליל הקולגן:

48

מבנה הידרוקסיפרולין בהשוואה לפרולין

(Hyp)

49

מבנה מרחבי של ח' האמינו בסליל הקולגן

50

גדילים הנכרכים זה סביב זה לסופר הליקס.3מורכבת מ- NHשלושת הגדילים קשורים ביניהם בקשרי מימן,

של שיירים בשרשרות COמשרשרת אחת לבין קבוצות הידרוקסיפרולין. של הידרוקסילאחרות או עם קבוצת

אין קשרי מימן בתוך הסליל. במקום זאת, כל אחד מהסלילים מיוצב על ידי המבנה המרחבי של טבעות

הפרולין וההידרוקסיפרולין.

למולקולת הקולגן צורה דמוית .קנה בעלת סליל שונה מסליל

51

שלוש שרשרות מלופפות סביב אותו ציר אורך דמיוני

ויוצרות סליל משולש:

מלופפות זו סביב זו שרשרות 3מהוות יחידה בסיסית של

הקולגן ונקראות טרופוקולגן Tropocollagen

אם יהיה סליל אחד אז החלבון 2לא יהיה פעיל חייב עוד

סלילים

סליל הקולגן

52

מבנה מרחבי של סליל הקולגן

אדום זוהי ח.אמינו גליצין הח.הכי קטנה

רק מימן

שרשרת פוליפפטידית

מבנה ריבעוני כמה שרשראות

יחד

53

globular רוב הסוגים של החלבונים דמויי פקעת ()proteinsשהשרשרת הפוליפפטידית שלהם מקופלת,

במבנה דחוס.

הנפח הפנוי קטן.בדר"כ קבוצות צדדיות פולאריות פונות החוצה.

קבוצות צדדיות לא פולאריות הידרופוביות נמצאות בחלק הפנימי.רוב החלבונים נמצאים בציטופלזמה,החלבונים הפולארים הם מסיסים

בממברנה הצד ההידרופובי פונה החוצה כיפופים ואיזורים, מבנה קפלים המבנה מעורב: סליל

בעלי מבנה יחודי.

מבנה שלישוני: המבנה המרחבי הפעיל של השרשרת הפוליפפטידית.

54

מבנה דמוי פקעתבמיוגלובין ובהמוגלובין רוב השרשרת היא בעלת מבנה

מצויים קטעי ביניים סלילקטעיבין של סלילבעלי מבנה קבוע ואופייני אך חסר סימטריה.

מבנה תלת מימדי של מיוגלובין

שיירים ההידרופובים יוצרים את הליבה של •החלבון וכן כיסים הידרופובים על פני השטח.

הח' האמיניות הפולריות נמצאות בעיקר על פני •פולריות השטח ומעורבות ביצירת אינטראקציות

(בעיקר קשרי מימן).

החומצות הטעונות גם הן נמצאות בעיקר על פני •השטח ומעורבות ביצירת אינטראקציות של

).גשרי מלחמטענים (

התכונות הללו יעזרו לנו לנקות את החלבון•

תכונות החלבון הנובעות מהרכב החומצות האמיניות

סולם ההידרופוביות של ח' אמיניות

הכי הידרופילי

הכי הידרופובי

האיזואלקטרי הוא pHנקודה איזואלקטרית או ה- שבו סכום המטענים השלילים בחלבון ( או pHאותו

פפטיד) שווה לסכום המטענים החיובים.

המטען נטו שווה אפס.

במצב זה החלבון חסר תכונות חשמליות.

רוב החלבונים פעילים בנק זו

בדנ"א יש קב פוספט שטעונות שלילית ואליהם נקשרות קב' מול' חיוביות

)Isoelectric pH )pIנקודה איזו-אלקטרית

-pH כתלות ה(pI )גרף המתאר את הנקודה איזו-אלקטרית

. איזואלקטריק פוקוסינגאמינים של הקב הצדדיות יש להם מטען חיובי בסביבה

חומצית

והקב הקרבוקסילית טעונות שלילי ובסביבה חומצי הופכות לנייטרוליות

הראשונים לאבד פרוטונים בסביבה חומצית הם הקרבו בקב פפטידים וחלבונים וזו הנק

האיזואלקטרית

דהפרוטונציה

pKa Values of Amino Acids

PHהשל

קרבו

של PHהאמינן

של PHההקב

הצדדית

בפפטיד ה PK1 ivPK2

מתבטלים

60

1. What is the pI of LEKAT? Answer:The amino acids are:leucine-glutamate-lysine-alanine-threonineThe pKa values are as follows: •pKa1 (carboxyl terminal)= 3.1

•pKa2 (glutamate side chain) = 4.4

•pKa3 (amino terminal) = 8--note that it is different when in a polypeptide.

•pKa4 (lysine amino group) = 10.0

של pI תרגיל חישוב של פפטיד

יכולות לעבור יוניזציה

-

+

+-

המשך פיתרון תרגיל

61

At the pI the net charge of the molecule is zero. 1.Below pH 2, the charge is +2 2.As base is added the first proton is removed from the terminal carboxyl group and the charge on the polypeptide is now +1. 3.As the pH is increased to 6.4 (two pH units above pKa2) the

second proton is removed and the charge on the polypeptide is now 0. 4.As the pH is increased to 10 (two pH units above pKa3) the third

proton is removed and the charge on the molecule is -1. 5.As the pH is increased to 12 (two pH units above pKa4) the forth

proton is removed and the charge on the molecule is -2. To find the pI, average the two pKa values on either side of the neutral form of the polypeptide.

•(pKa2 + pKa3)/2 = pI •(4.4 + 8.0)/2 = 6.2

7לוקחים את הכי קורבים ל- וזו בערך 2מחברים ומחלקים ובהנק האיזואלקטירית

62

מוטיב מבני בחלבונים יש קשר חזק בין מבנה

המרחבי החלבון לתפקידו

נראה הרבה פעמים מוטיבים מבנים שניונים

בחלבונים שונים

בדוגמא מוטיב אלפא הליקס קצר שנשבר

וחוזר שוב אלפא הליקס קצר וחוזר

כמו חלבונים שקושרים דנ"א

63

המקשריםקיפולאזורי בחלבונים קיימים מבניביניהם

מספר מוטיבים מבנים פשוטים,יוצרים מבנה מורכב

מסומן בחץ

כמו חבית להעביר דברים דרך הממברנה .חלבונים

המשמשים כתעלה

64

מורכב משתי תת יחידות (Homodimer)הומודימר )subunits (זהות

של בקטריופאג' Cro החלבון

מבנה רבעוני: מבנה מרחבי של שרשרות פוליפפטידיות שונות שיחד מתחברות

לחלבון פעיל אחד.

65

- תהליך בו חלים שינויים)Denaturation(דנטורציה במבנה החלבון כתוצאה מחימום או טיפול בחומרים

שונים כמו בחומצות חזקות. הגורמים לאובדן הפעילותהביולוגית של החלבון.

–)Reversible Denaturation( דנטורציה הפיכה תהליך מתון בו לא נפגעים קשרים קוולנטיים (המבנה

הראשוני נשמר). נפגעים רק כוחות המייצבים את המבנההמרחבי.

החזרת התמיסה לתנאים המקוריים מובילה לחזרת החלבון.Renaturation(רנטורציה (למבנה המרחבי האופייני –

דנטורציה ורנטורציה של חלבונים

66

גורם לחיזור קשרים דיסולפידיים ולפגיעה במבנה המרחבי, אך לא לקבלת סליל אקראי.

מרקפטואתנול

67

ריאקצית חיזור קשר דיסולפידי בחלבון

-mercaptoethanol על ידי

68

חיזור ודנטורציה של ריבונוקלאז.

המידע לקיפול החלבון מבוסס על רצף ח. האמינו

חומרים מפרקי

s-sקשרי

דיאליזה- סילוק החומרים

המבנה השלישוני מתפרק

1972ניסוי אנפינסן: פרס נובל

70

.NH ו-COקשרי מימן בין הקבוצות הפפטידיות 1.

קשרי מימן בין קבוצות צדדיות.2.

אינטרקציות הידרופוביות בין קבוצות צדדיות.3.

קשרים יוניים בין קבוצות צדדיות טעונות.4.

קשרי מולקולת החלבון עם התווך בו היא נמצאת.5.

תרומתם של הקשרים ההידרופוביים היא הגדולה ביותר. חומצות אמיניות לא30-50%רוב החלבונים מכילים

פולאריות, שמרביתן נמצאות בתוך החלבון.

כוחות המייצבים מבנה של חלבונים גלובולריים

71

.החומצות האמיניות הן אבני הבניין של החלבונים הקבוצה הצדדית שונה בכל חומצה אמינית, ומקנה לה

תכונות אופייניות. .הקשר בין החומצות האמיניות בחלבון הוא קשר פפטידי לכל חלבון שרשרת חומצות האמיניות בעלת שלד פחמני

המכילה קצה אמיני, קצה קרבוקסילי וביניהם פחמן .אליו קשורה הקבוצה הצדדית

,בין חומצות אמיניות באותו פפטיד או בפפטידים שונים יכולים להווצר גם קשרי מימן, קשרים דיסולפידיים,

ואינטראקציות הידרופוביות.

סכום – חומצות אמיניות והקשר הפפטידי.

72

חלבונים הם בעלי תפקידי מפתח ברוב התהליכים הביולוגיים: כמעט כל הזרזים במערכות ביולוגיות הם

אנזימים. משמשים כמתווכים גם בהעברה ואחסון, תנועה, תמיכה מכאנית, הגנה חיסונית, העברת אותות

עצביים, אינטגרציה של מטבוליזם ובקרה של תהליכי גדילה והתמיינות.

יחידת המבנה הבסיסית – חומצות אמיניות. חומצות אמיניות.20כל החלבונים מורכבים מאותן

חומצות אמיניות נקשרות בקשרים פוליפפטידיים שרשרת פוליפפטידית. ויוצרות

סיכום

73

.DNAלכל חלבון רצף חומצות אמיניות יחודי, הנקבע ב-הגורם החשוב לפעילות הביולוגית הוא המבנה המרחבי

של החלבון, הנקבע על ידי רצף החומצות האמיניות.מוכרים מבניים שניוניים של השרשרות הפוליפפטידיות,

וסליל הקולגן., משטח קפלים שלשולה מהם: סליל מבנה החלבון מיוצב על ידי ואינטראקציות הידרופוביות,

קשרי מימן,קשרים אלקטרוסטים אינטראקציות ואן-דר-ואלס.החלבונים הם קבוצה מיוחדת של מקרומולקולות שיכולה

לזהות באופן ספציפי ולהגיב עם מולקולות שונות.

המשך-סיכום

74

1 . .הליקס הינו סוג של מבנה שניוני -

. השרשרת הפוליפפטידית מתארגנת כסליל צפוף2

לאורך ציר דמיוני. כוונו בדרך כלל ימני.

פונות החוצה והמישורים הקשיחים שלR. קבוצות ה- 3

הקשרים הפפטידיים מתארגנים במקביל לציר האורך.

חומצות אמיניות3.6בסיבוב מלא של הסליל מצויות 4.

בממוצע. חומצות אמיניות בחמישה סיבובים18סך הכל מצויות 5.

של הסליל.

סיכום - סליל

75

הסליל מחוזק על ידי קשרים מימניים בין כל חמצן 6.קרבונילי של הקשר הפפטידי לבין כל מימן אמיני

של קשר פפטידי המרוחק ממנו בממוצע ארבע חומצות אמיניות.

-קרטנים מוחזקים ביחד ע"י קשרי סולפיד סלילי7.) s- s( בין השרשרות שנובעות מהימצאות חומצה

אמינית ציסטאין

– סיכום סלילהמשך

76

הליקס. “פתוח” יותר ממבנה מבנה גדיל. 1מספר גדילים פוליפפטידים מונחים במשטח. 2

במרחב זה לצד זה ונראים כמו קפל במשטח.. קשרי מימן בין ח' אמינו של אותה שרשרת או בין3

שרשרות שונות מייצבים את המבנה של המשטח. בולטות מעל ומתחת למשטחיםR. קבוצות ה-4

לסירוגין במשטח המונחים זה לצד זה במרחב.

ומשטח מאפינים של גדיל

77

. השרשרות יכולות להיות מקבילות )כיווניות 5זהה( או אנטי-מקבילות )כיווניות מתחלפת(.

בו השרשרות מונחות קרוב יש . במבנה6שכיחות גדולה של חומצות אמיניות בעלות

.Ala ו-Glyקבוצה צדדית קטנה כמו

המשך - מאפינים של משטח