alineacion shv1648[1]

7/25/2019 Alineacion SHV1648[1]

1/11

>SHV-C1648-SHV-forward (F)

ATCTCCCTGTTAGCCACCCTGCCGCTGGCGGTACACGCCAGCCCGCAGCCGCTTGAGCAA

ATTAAACNAAGCGAAAGCCAGCTGTCGGGCCGCGTAGGCATGATAGAAATGGATCTGGCC

AGCGGCCGCACGCTGACCGCCTGGCGCGCCGATGAACGCTTTCCCATGATGAGCACCTTT

AAAGTAGTGCTCTGCGGCGCAGTGCTGGCGCGGGTGGATGCCGGTGACGAACAGCTGGA

GCGAAAGATCCACTATCGCCAGCAGGATCTGGTGGACTACTCGCCGGTCAGCGAAAAACA

CCTTGCCGACGGCATGACGGTCGGCGAACTCTGCGCCGCCGCCATTACCATGAGCGATAA

CAGCGCCGCCAATCTGCTGCTGGCCACCGTCGGCGGCCCCGCAGGATTGACTGCCTTTTT

GCGCCAGATCGGCGACAACGTCACCCGCCTTGACCGCTGGGAAACGGAACTGAATGAGG

CGCTTCCCGGCGACGCCCGCGACACCACTACCCCGGCCAGCATGGCCGCGACCCTGCGCAAGCTGCTGACCAGCCAGCGTCTGAGCGCCCGTTCGCAACGGCAGCTGCTGCAGTGGATGG

TGGACGATCGGGTCGCCGGACCGTTGATCCGCTCCGTGCTGCCGGCGGGCTGGTTTATCGC

CGATAAGACCGGAGCTNGCGAGCGGGGTGCGCGCGGNATTGTCGCCCTGCTTGGCCCGAA

TAACAAAGCAGAGCGCATTGTGGTGATTTATCTGCGGGATACGCCGGCGAGCATGGCCGA

GCGAAATCAGCAAATCGCCGGGATCGGCGCGGCGCTGATCGA

>SHV C1648 SHV Forward Reverso Complementario (FRC)TCGATCAGCGCCGCGCCGATCCCGGCGATTTGCTGATTTCGCTCGGCCATGCTCGCCGGCG

TATCCCGCAGATAAATCACCACAATGCGCTCTGCTTTGTTATTCGGGCCAAGCAGGGCGAC

AATNCCGCGCGCACCCCGCTCGCNAGCTCCGGTCTTATCGGCGATAAACCAGCCCGCCGG

CAGCACGGAGCGGATCAACGGTCCGGCGACCCGATCGTCCACCATCCACTGCAGCAGCTG

CCGTTGCGAACGGGCGCTCAGACGCTGGCTGGTCAGCAGCTTGCGCAGGGTCGCGGCCAT

GCTGGCCGGGGTAGTGGTGTCGCGGGCGTCGCCGGGAAGCGCCTCATTCAGTTCCGTTTC

CCAGCGGTCAAGGCGGGTGACGTTGTCGCCGATCTGGCGCAAAAAGGCAGTCAATCCTGC

GGGGCCGCCGACGGTGGCCAGCAGCAGATTGGCGGCGCTGTTATCGCTCATGGTAATGGC

GGCGGCGCAGAGTTCGCCGACCGTCATGCCGTCGGCAAGGTGTTTTTCGCTGACCGGCGA

GTAGTCCACCAGATCCTGCTGGCGATAGTGGATCTTTCGCTCCAGCTGTTCGTCACCGGCA

TCCACCCGCGCCAGCACTGCGCCGCAGAGCACTACTTTAAAGGTGCTCATCATGGGAAAG

CGTTCATCGGCGCGCCAGGCGGTCAGCGTGCGGCCGCTGGCCAGATCCATTTCTATCATGCCTACGCGGCCCGACAGCTGGCTTTCGCTTNGTTTAATTTGCTCAAGCGGCTGCGGGCTGGC

GTGTACCGCCAGCGGCAGGGTGGCTAACAGGGAGAT

Hacer Forward y Reverse en

http:www!attotron!co"cy#ertoryana$ys%sse&'assa(er!ht"

Cop%ar sec)enc%a* re"over todo +$%ne #rea,* n)"#ers* h%te space.

Hacer Reverse y Co"p$e"entar%o
http://www.attotron.com/cybertory/analysis/seqMassager.htmhttp://www.attotron.com/cybertory/analysis/seqMassager.htm


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>SHV-C1648-SHV/Reverso (R)TGCTGATTTCGCTCGGCCATGCTCGCCGGCGTATCCCGCAGATAAATCACCACAATGCGCT

CTGCTTTGTTATTCGGGCCAAGCAGGGCGACAATNCCGCGCGCACCCCGCTCGCNAGCTC

CGGTCTTATCGGCGATAAACCAGCCCGCCGGCAGCACGGAGCGGATCAACGGTCCGGCGA

CCCGATCGTCCACCATCCACTGCAGCAGCTGCCGTTGCGAACGGGCGCTCAGACGCTGGC

TGGTCAGCAGCTTGCGCAGGGTCGCGGCCATGCTGGCCGGGGTAGTGGTGTCGCGGGCGT

CGCCGGGAAGCGCCTCATTCAGTTCCGTTTCCCAGCGGTCAAGGCGGGTGACGTTGTCGC

CGATCTGGCGCAAAAAGGCAGTCAATCCTGCGGGGCCGCCGACGGTGGCCAGCAGCAGATTGGCGGCGCTGTTATCGCTCATGGTAATGGCGGCGGCGCAGAGTTCGCCGACCGTCATGC

CGTCGGCAAGGTGTTTTTCGCTGACCGGCGAGTAGTCCACCAGATCCTGCTGGCGATAGT

GGATCTTTCGCTCCAGCTGTTCGTCACCGGCATCCACCCGCGCCAGCACTGCGCCGCAGA

GCACTACTTTAAAGGTGCTCATCATGGGAAAGCGTTCATCGGCGCGCCAGGCGGTCAGCG

TGCGGCCGCTGGCCAGATCCATTTCTATCATGCCTACGCGGCCCGACAGCTGGCTTTCGCT

TNGTTTAATTTGCTCAAGCGGCTGCGGGCTGGCGTGTACCGCCAGCGGCAGGGTGGCTAA

CAGGGAGATAATACACAGGC

>SHV C1648 SHV Reverso Reverso Complementario (RRC)

GCCTGTGTATTATCTCCCTGTTAGCCACCCTGCCGCTGGCGGTACACGCCAGCCCGCAGCC

GCTTGAGCAAATTAAACNAAGCGAAAGCCAGCTGTCGGGCCGCGTAGGCATGATAGAAAT

GGATCTGGCCAGCGGCCGCACGCTGACCGCCTGGCGCGCCGATGAACGCTTTCCCATGATGAGCACCTTTAAAGTAGTGCTCTGCGGCGCAGTGCTGGCGCGGGTGGATGCCGGTGACGA

ACAGCTGGAGCGAAAGATCCACTATCGCCAGCAGGATCTGGTGGACTACTCGCCGGTCAG

CGAAAAACACCTTGCCGACGGCATGACGGTCGGCGAACTCTGCGCCGCCGCCATTACCAT

GAGCGATAACAGCGCCGCCAATCTGCTGCTGGCCACCGTCGGCGGCCCCGCAGGATTGAC

TGCCTTTTTGCGCCAGATCGGCGACAACGTCACCCGCCTTGACCGCTGGGAAACGGAACT

GAATGAGGCGCTTCCCGGCGACGCCCGCGACACCACTACCCCGGCCAGCATGGCCGCGAC

CCTGCGCAAGCTGCTGACCAGCCAGCGTCTGAGCGCCCGTTCGCAACGGCAGCTGCTGCA

GTGGATGGTGGACGATCGGGTCGCCGGACCGTTGATCCGCTCCGTGCTGCCGGCGGGCTG

GTTTATCGCCGATAAGACCGGAGCTNGCGAGCGGGGTGCGCGCGGNATTGTCGCCCTGCT

TGGCCCGAATAACAAAGCAGAGCGCATTGTGGTGATTTATCTGCGGGATACGCCGGCGAG

CATGGCCGAGCGAAATCAGCA

Rea$%0ar Reverso co"p$e"entar%o para Forward y Reverso


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n C$)sta$ http:www!e#%!ac!),Too$s"sac$)sta$o

En Clustal alinear SHV Forward Reverso Complementario (FRC)con Reverso (R) (amplicon Reverso Complementario)

CLUSTAL 2!"! multiple se#uence ali$nment

SHVC"%&'FRC TCATCACCCCCCATCCCCATTTCTATTTCCTCCCATCTCCCC%!SHVC"%&'Reverso ******************************TCTATTTCCTCCCATCTCCCC+! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC TATCCCCAATAAATCACCACAATCCTCTCTTTTTATTCCCAACAC"2!SHVC"%&'Reverso TATCCCCAATAAATCACCACAATCCTCTCTTTTTATTCCCAACAC-! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC ACAAT.CCCCCACCCCCTCC.ACTCCTCTTATCCATAAACCACCCCC"'!SHVC"%&'Reverso ACAAT.CCCCCACCCCCTCC.ACTCCTCTTATCCATAAACCACCCCC"/! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC CACACACATCAACTCCCACCCATCTCCACCATCCACTCACAC2&!SHVC"%&'Reverso CACACACATCAACTCCCACCCATCTCCACCATCCACTCACAC2"! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC TCCTTCAACCCTCAACCTCTTCACACTTCCATCCCC+!!SHVC"%&'Reverso TCCTTCAACCCTCAACCTCTTCACACTTCCATCCCC20! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC ATCTCCTATTTCCCTCCCAACCCTCATTCATTCCTT+%!SHVC"%&'Reverso ATCTCCTATTTCCCTCCCAACCCTCATTCATTCCTT++! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC TCCCACTCAACTACTTTCCCATCTCCAAAAACATCAATCCT&2!SHVC"%&'Reverso TCCCACTCAACTACTTTCCCATCTCCAAAAACATCAATCCT+-! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC CCCCCACTCCACACAATTCCCTTTATCCTCATTAAT&'!SHVC"%&'Reverso CCCCCACTCCACACAATTCCCTTTATCCTCATTAAT&/! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC CCCCAATTCCCACCTCATCCTCCAATTTTTTCCTACCC/&!SHVC"%&'Reverso CCCCAATTCCCACCTCATCCTCCAATTTTTTCCTACCC/"! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC ATATCCACCAATCCTCTCATATATCTTTCCTCCACTTTCTCACC%!!SHVC"%&'Reverso ATATCCACCAATCCTCTCATATATCTTTCCTCCACTTTCTCACC/0! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC CATCCACCCCCCACACTCCCCAACACTACTTTAAATCTCATCATA%%!SHVC"%&'Reverso CATCCACCCCCCACACTCCCCAACACTACTTTAAATCTCATCATA%+! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC AACTTCATCCCCCACTCACTCCCCTCCAATCCATTTCTATC02!SHVC"%&'Reverso AACTTCATCCCCCACTCACTCCCCTCCAATCCATTTCTATC%-! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC ATCCTACCCCCACACTCTTTCCTT.TTTAATTTCTCAACCTC0'!SHVC"%&'Reverso ATCCTACCCCCACACTCTTTCCTT.TTTAATTTCTCAACCTC0/! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'FRC CTCTTACCCCACCATCTAACAAAT*********** '2"SHVC"%&'Reverso CTCTTACCCCACCATCTAACAAATAATACACAC'!2 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,
http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/http://www.ebi.ac.uk/Tools/msa/clustalo/


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A$%near Forward (F)y Reverso Reverso Co"p$e"entar%o (RRC)


SHVC"%&'F ***********ATCTCCCTTTACCACCCTCCCTCTACACCCACCCCAC&-SHVC"%&'RRC CCTTTATTATCTCCCTTTACCACCCTCCCTCTACACCCACCCCAC%!

,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F CCTTACAAATTAAAC.AACAAACCACTTCCCCTACATATAAAA"!-SHVC"%&'RRC CCTTACAAATTAAAC.AACAAACCACTTCCCCTACATATAAAA"2! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F TATCTCCACCCCACCTACCCCTCCCCATAACCTTTCCCATA"%-SHVC"%&'RRC TATCTCCACCCCACCTACCCCTCCCCATAACCTTTCCCATA"'! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F TACACCTTTAAATATCTCTCCCATCTCCTATCCTAC22-SHVC"%&'RRC TACACCTTTAAATATCTCTCCCATCTCCTATCCTAC2&! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F AACACTACAAAATCCACTATCCCACAATCTTACTACTCCCTCA2'-SHVC"%&'RRC AACACTACAAAATCCACTATCCCACAATCTTACTACTCCCTCA+!! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F CAAAAACACCTTCCACCATACTCCAACTCTCCCCCCCATTACCA+&-SHVC"%&'RRC CAAAAACACCTTCCACCATACTCCAACTCTCCCCCCCATTACCA+%! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F TACATAACACCCCCAATCTCTCTCCACCTCCCCCCCAATTA&!-SHVC"%&'RRC TACATAACACCCCCAATCTCTCTCCACCTCCCCCCCAATTA&2! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F CTCCTTTTTCCCAATCCACAACTCACCCCCTTACCCTAAACAAC&%-SHVC"%&'RRC CTCCTTTTTCCCAATCCACAACTCACCCCCTTACCCTAAACAAC&'! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F TAATACCTTCCCCACCCCCACACCACTACCCCCCACATCCCA/2-SHVC"%&'RRC TAATACCTTCCCCACCCCCACACCACTACCCCCCACATCCCA/&! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F CCCTCCAACTCTACCACCACTCTACCCCTTCCAACCACTCTC/'-SHVC"%&'RRC CCCTCCAACTCTACCACCACTCTACCCCTTCCAACCACTCTC%!! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F ATATTACATCTCCCACCTTATCCCTCCTCTCCCCT%&-SHVC"%&'RRC ATATTACATCTCCCACCTTATCCCTCCTCTCCCCT%%! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F TTTATCCCATAAACCACT.CACTCCC.ATTTCCCCTC0!-SHVC"%&'RRC TTTATCCCATAAACCACT.CACTCCC.ATTTCCCCTC02! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F TTCCCAATAACAAACAACCATTTTATTTATCTCATACCCCA0%-SHVC"%&'RRC TTCCCAATAACAAACAACCATTTTATTTATCTCATACCCCA0'! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHVC"%&'F CATCCACAAATCACAAATCCCATCCCCCTATCA'2"SHVC"%&'RRC CATCCACAAATCACA****************************** '!2 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,


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AMPLICON: utilizo el R RC y le agrego las ultimas bases de F: y ponerlo enCourier 8

Amplicon .o reverso Complementario (Amplicon .ormal)

CCCTTTATTATCTCCCTTTACCACCCTCCCTCTACACCCACCCCACCCTTACAAATTAAAC TAACAAACCACTTCCCCTACATATAAAATATCTCCACCCCACCTACCCCTCCCCATAACCTTTCCCATATACACCTTTAAATATCTCTCCCATCTCCTATCCTACAACACTACAAAATCCACTATCCCACAATCTTACTACTCCCTCACAAAAACACCTTCCACCATACTCCAAC

TCTCCCCCCCATTACCATACATAACACCCCCAATCTCTCTCCACCTCCCCCCCAATTACTCCTTTTTCCCAATCCACAACTCACCCCCTTACCCTAAACAACTAATACCTTCCCCACCCCCACACCACTACCCCCCACATCCCACCCTCCAACTCTACCACCACTCTACCCCTTCCAACCACTCTCATATTACATCTCCCACCTTATCCCTCCTCTCCCCTTTTATCCCATAAACCACTGCACTCCCcATTTCCCCTCTTCCCAATAACAAACAACCATTTTATTTATCTCATACCCCACATCCACAAATCACAAATCCCATCCCCCTATCA

Reali1o El Reverso Complementario del Amplicon en

http:www!attotron!co"cy#ertoryana$ys%sse&'assa(er!ht"

TCATCACCCCCCATCCCCATTTCTATTTCCTCCCATCTCCCCTATCCCCAATAAATCACCACAA

TCCTCTCTTTTTATTCCCAACACACAATNCCCCCACCCCCTCCNACTCCTCTTATCCATAAA

CCACCCCCCACACACATCAACTCCCACCCATCTCCACCATCCACTCACACTCCTTCAACCCTCAACCTCTTCACACTTCCATCCCCATCTCCTATTTCCCTCCCAA

CCCTCATTCATTCCTTTCCCACTCAACTACTTTCCCATCTCCAAAAACATCAATCCTC

CCCCACTCCACACAATTCCCTTTATCCTCATTAATCCCCAATTCCCACCTCAT

CCTCCAATTTTTTCCTACCCATATCCACCAATCCTCTCATATATCTTTCCTCCACTTTCT

CACCCATCCACCCCCCACACTCCCCAACACTACTTTAAATCTCATCATAAACTTCATCCCCCA

CTCACTCCCCTCCAATCCATTTCTATCATCCTACCCCCACACTCTTTCCTTNTTTAATTTC

TCAACCTCCTCTTACCCCACCATCTAACAAATAATACACAC
http://www.attotron.com/cybertory/analysis/seqMassager.htmhttp://www.attotron.com/cybertory/analysis/seqMassager.htm


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En Blast

http://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi?CMD=Web&PAGE!"PE=Blast#ome

$elecciona% n)c$eot%de #$ast2oner >3)"ero de ')estra pe(ar e$ a"p$%con Reverso

Co"p$e"entar%o p%nchar en others y c$%c en 5AST!

En Blast P%esenta ' i(enti(a( con

1: 41878! )epo%ts 9$e#s%e$$a pne)"o!!!(%:;;1147;


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En C%-stal: con amplicon o )eve%so Complementa%io El no%mal


SHV" ATCTTATATTCCCTTTATTATCTCCCTTTACCACCCTCCCTCTACAC%!SHV"%&' *************CCTTTATTATCTCCCTTTACCACCCTCCCTCTACAC&0 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

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SHV" CATATAAAATATCTCCACCCCACCTACCCCTCCCCATAA"'!SHV"%&' CATATAAAATATCTCCACCCCACCTACCCCTCCCCATAA"%0 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHV" CCTTTCCCATATACACCTTTAAATATCTCTCCCATCTCCT2&!SHV"%&' CCTTTCCCATATACACCTTTAAATATCTCTCCCATCTCCT220 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHV" ATCCTACAACACTACAAAATCCACTATCCCACAATCTTAC+!!

SHV"%&' ATCCTACAACACTACAAAATCCACTATCCCACAATCTTAC2'0 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

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SHV" TAAACAACTAATACCTTCCCCACCCCCACACCACTACCCCCC/&!

SHV"%&' TAAACAACTAATACCTTCCCCACCCCCACACCACTACCCCCC/20 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

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SHV" CCACTCTCATATTACATCTCCCACCTTATCCCTCCT%%!SHV"%&' CCACTCTCATATTACATCTCCCACCTTATCCCTCCT%&0 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHV" CTCCCCTTTTATCCCATAAACCACTCACTCCCC02!SHV"%&' CTCCCCTTTTATCCCATAAACCACT.CACTCCC.0!0 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,, ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

SHV" ATTTCCCCTCTTCCCAATAACAAACAACCATTTTATTTATCTC0'!

SHV"%&' ATTTCCCCTCTTCCCAATAACAAACAACCATTTTATTTATCTC0%0 ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

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SHV" ATCACACTCAACCTAA'%"SHV"%&' ATCA**************** '+2

,,,,,


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Pa%a conve%ti% la sec-encia en amino0ci(os en el p%og%ama:http://molbiol1tools.ca/

!%anslation22222E3PA$4 5!%anslate -cleic Aci( $e-ence !ool6 Pega% $ec-encia5Amplicon o%mal67 all 8%ames 9Go

B-sca% la sec-encia -e contenga menos ;

"%&'SHV+LC77SLLATLLAVHASBLEB78DSESBLSRV=7E=4LASRTLTA


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>>' DE!DAD $#@A


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"%&' ATCCTACAACACTACAAAATCCACTATCCCACAATCTTAC2'0SHV2A ATCCTACAACACTACAAAATCCACTATCCCACAATCTTAC+!! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

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"%&' CCCCAATTACTCCTTTTTCCCAATCCACAACTCACCCCCTTACCC&%0SHV2A CCCCAATTACTCCTTTTTCCCAATCCACAACTCACCCCCTTACCC&'! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

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"%&' CCACTCTCATATTACATCTCCCACCTTATCCCTCCT%&0SHV2A CCACTCTCATATTACATCTCCCACCTTATCCCTCCT%%! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

"%&' CTCCCCTTTTATCCCATAAACCACTACACTCCC0!0SHV2A CTCCCCTTTTATCCCATAAACCACTACACTCCC02! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

"%&' ATTTCCCCTCTTCCCAATAACAAACAACCATTTTATTTATCTC0%0SHV2A ATTTCCCCTCTTCCCAATAACAAACAACCATTTTATTTATCTC0'! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

"%&' ATACCCCACATCCACAAATCACAAATCCCATCCCCCT'20SHV2A ATACCCCACATCCACAAATCACAAATCCCATCCCCCT'&! ,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,,

"%&' ATCA**************** '+2SHV2A ATCACACTCAACCTAA'%" ,,,,,

>translation?@=R;7RLC77SLLATLLAVHASBLEB78LSESBLSRV=7E

=4LASRTLTA


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SVLA


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alineacion shv1648[1]

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