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1918年（スペイン風邪）

クラシカルブタウイルス

1998年頃～（北米型ブタ）

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1905年頃

ユーラシア型ブタ

1957年（アジア風邪）1968年（香港風邪）

1977年（ソ連風邪）

H0型（イタリア風邪）

1950年頃

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PB1

HA

27年間の凍結H1N1

H3N2

New H1N1

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Swine-Origin H1N1 Influenza A Virus

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同義置換 0.01106 0.00796 0.0141

非同義置換 0.00041 0.00125 0.0029

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1999 - 2001年ごろに分岐？1999.99 (95％HPD: 1998.51-2002.05)

by http://tree.bio.ed.ac.uk/groups/influenza/

6KNN!L!6KNíOPQ MNNKO

Y] *RSTU:2+, XY

2008.63 (mid Sep) (95％HPD: 2008.13-2008.96)


http://tree.bio.ed.ac.uk/groups/influenza/




A/California/04/2009(H1N1) 1 DTLCIGYHANNSTDTVDTVLEKNVTVTHSVNLLEDKHNGKLCKLRGVAPLHLGKCNIAGWILGNPECESLSTASSWSYIVETPSSDNGTCYPGDFIDYEELREQLSSVSSFERFEIFPKT 120

A/Texas/04/2009(H1N1) 1 ..................................................................................S..................................... 120

A/Swine/Indiana/P12439/00(H1N2) 1 ...................................R........................L.........F...........S.............N....................... 120

A/Turkey/MO/24093/99(H1N2) 1 ...................................R........................L.........F...........SN............N.....................E. 120

A/swine/Korea/CY08/2007(H1N2) 1 ...................................R........................L.........I...........SN............N.....................R. 120

A/swine/Iowa/2/1987(H1N1) 1 ...................................R........G.I.............L.......L.F.V.........SN............N......................A 120

A/swine/Ehime/1/1980(H1N2) 1 ..................I................R........G.I.............L.......L.F.V.........SN............N....................... 120

A/swine/Illinois/63(H1N1) 1 ...................................R........G.I.............L.......L.L.V.........SN............N......................I 120

A/swine/Iowa/15/1930(H1N1) 1 ...................................S......R.G.I...Q.........L......DL.L.V.........RT.....................N.M....K....... 120

A/New York/1/18(H1N1) 1 ..I................................S........K.I...Q.........L......DL.L...........SN.E..........................K....... 120

A/South Carolina/1/18(H1N1) 1 ..I................................S........K.I...Q.........L......DL.L...........SN.E..........................K....... 120

A/Brevig Mission/1/18(H1N1) 1 ..I................................S........K.I...Q.........L......DL.L...........SN.E..........................K....... 120

A/PR/8/34(H0N1) 1 ..I................................S......R.K.I...Q.........L......DP.LPVR.........N.E..I..............................E 120

A/USSR/90/1977(H1N1) 1 ..I................................S......R.K.I...Q...................FSKK.....A...N.E.......Y.A.......................E 120

A/Yokohama/50/1998(H1N1) 1 ..I................................S......L.K.I...Q..N.SV...........L.ISKE.........NPE.......Y.A.......................E 120

A/Ohio/UR06-0177/2007(H1N1) 1 ..I................................S......L.K.I...Q..N.SV...........L.ISKE.........NPE.......Y.A.......................E 120

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A/California/04/2009(H1N1) 121 SSWPNHDSNKGVTAACPHAGAKSFYKNLIWLVKKGNSYPKLSKSYINDKGKEVLVLWGIHHPSTSADQQSLYQNADTYVFVGSSRYSKKFKPEIAIRPKVRDQEGRMNYYWTLVEPGDKI 240

A/Texas/04/2009(H1N1) 121 ............................................................................A........................................... 240

A/Swine/Indiana/P12439/00(H1N2) 121 .......T.R.......Y.......R........E............N............................A..................A.......A..I............. 240

A/Turkey/MO/24093/99(H1N2) 121 .......T.R...........N...R.....A...D...........N..............P.............A..................T.....G.A................ 240

A/swine/Korea/CY08/2007(H1N2) 121 ......NTDR..........TS............E.....I......N...............N....RT......A.............T....T.....G.................. 240

A/swine/Iowa/2/1987(H1N1) 121 ......ET.R.......Y...N...R...................V.N..............P..T..........A.......K.N........T.....G.A..............T. 240

A/swine/Ehime/1/1980(H1N2) 121 ......ET.R.......Y...N...R........E......R...V.N..............P..T..........A.......K.NR.......E....KG.A.........I....T. 240

A/swine/Illinois/63(H1N1) 121 ......ET.R.......Y...N..FR........ES.........V.N..............P..T..........A.......K.NR.......A.....G.A.........I....T. 240

A/swine/Iowa/15/1930(H1N1) 121 ......ETT........Y...S...R..L.....E..........V.N..........V...P..T..........A..S....K.YRR.T....A.....G.A.........L....T. 240

A/New York/1/18(H1N1) 121 ......ETT.......SY...S...R..L..T...S.........V.N..........V...P.GT..........A..S....K.NRR.T....A.....G.A.........L....T. 240

A/South Carolina/1/18(H1N1) 121 ......ETT.......SY...S...R..L..T...S.........V.N..........V...P.GT..........A..S....K.NRR.T....A.......A.........L....T. 240

A/Brevig Mission/1/18(H1N1) 121 ......ETT.......SY...S...R..L..T...S.........V.N..........V...P.GT..........A..S....K.NRR.T....A.......A.........L....T. 240

A/PR/8/34(H0N1) 121 ......NTT.......S...KS...R..L..TE.EG.....KN..V.K...............N.K...NI...ENA..S.VT.N.NRR.T....E.......A.........LK...T. 240

A/USSR/90/1977(H1N1) 121 R...K.NVTR....S.S.K.KS...R..L..TE.NG...N..S..V.N.E........V....NIE..KTI.RKENA..S.V..N.NRR.T....E.....G.A..I......L....T. 240

A/Yokohama/50/1998(H1N1) 121 ......TVTG-.S.S.S.N.KS...R..L..TG.NGL..N.....V.N.E........V...PNIG..RAI.HTENA..S.V..H..RR.T....K..........I......L....T. 239

A/Ohio/UR06-0177/2007(H1N1) 121 ......TVTG-.S.S.S.N.KS...R..L..TG.NGL..N.....A.N.E........V...PNIG..RA..HTENA..S.V..H..RR.T....K..........I......L....T. 239

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A/California/04/2009(H1N1) 241 TFEATGNLVVPRYAFAMERNAGSGIIISDTPVHDCNTTCQTPKGAINTSLPFQNIHPITIGKCPKYVKSTKLRLATGLRNIPSIQS 326

A/Texas/04/2009(H1N1) 241 ................................................................................V..... 326

A/Swine/Indiana/P12439/00(H1N2) 241 ....................S.........S..........................V...E...........M......V..... 326

A/Turkey/MO/24093/99(H1N2) 241 .................K..SE.......IS..........................V...E...........M......V..... 326

A/swine/Korea/CY08/2007(H1N2) 241 ................LK..S.........S..........................V...E...........M............ 326

A/swine/Iowa/2/1987(H1N1) 241 .................N.GS.................................V..V...E...........M............ 326

A/swine/Ehime/1/1980(H1N2) 241 .................N.DP........A...........................V...E...........M............ 326

A/swine/Illinois/63(H1N1) 241 .I...............N.GS........A...N...K...................V...E...........M............ 326

A/swine/Iowa/15/1930(H1N1) 241 .........A......LN.GS.....T.NA.....D.K....H....S......V..V...E...........MV........... 326

A/New York/1/18(H1N1) 241 ........IA.W....LN.GS.....T..A.......K....H....S.........V...E.....R.....M............ 326

A/South Carolina/1/18(H1N1) 241 ........IA.W....LN.GS.....T..A.......K....H....S.........V...E.....R.....M............ 326

A/Brevig Mission/1/18(H1N1) 241 ........IA.W....LN.GS.....T..A.......K....H....S.........V...E.....R.....M............ 326

A/PR/8/34(H0N1) 241 I...N...IA......LS.GF.....T.NASM.E...K....L....S.........V...E.....R.A...MV........... 326

A/USSR/90/1977(H1N1) 241 I...N...IA.WH...LN.GF.....T.NASMDE.D.K....Q....S.........V...E.....R.....MV........... 326

A/Yokohama/50/1998(H1N1) 240 I...N...IA.W....LS.GF.....T.NA.MGE.DAK....Q....S......V..V...E.....R.A...MV........... 325

A/Ohio/UR06-0177/2007(H1N1) 240 I...N...IA..F...LS.GF.....T.NA.MGE.DAK....Q....S......V..V...E.....R.A...MV........... 325

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HA1緑：N-結合糖鎖赤：190 & 225

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ÌÍ��Spanish Flu vs. S-OIV Spanish Flu vs. USSR

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Spanish Flu vs. S-OIV Spanish Flu vs. USSR

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6KN56mMMí56jp4^,tHA 190番目E：トリ型レセプターD：ヒト型レセプターを認識

HA 225番目G：トリ型レセプターD：ヒト型レセプターを認識

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赤：190Dヒト／225Dヒト型緑：190Dヒト／225Gトリ型

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1900 - 1905年頃？ 2009年

トリ（クラシカル）ブタヒト

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1998 年ごろに分岐？予想記述無し。図より1998年ごろ


2008.55 Late July-2008

(95％HPD: 2007.79-2009.11)


NS1遺伝子による系統樹（同義置換）





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S/T-X-V/I/Lモチーフ

1967年以降欠失

新型H1N1

PDZ domain：約90アミノ酸からなるモジュールを持つ一群の細胞裏打ち蛋白。PDZ ligand domain：PDZドメインに結合しうるC末端モチーフ（S/T-X-V/I/L)を持つ

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1979年頃？ 2009年

トリ（ユーラシア）ブタヒト

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1979年頃？ 2009年


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1990 - 1998年ごろに分岐？1992.81 (95％HPD: 1989.4-1996.21)


2008.65 (mid Sep) (95％HPD: 2007.88-2009.09)






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1979年頃？ 2009年


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1995 - 2001年ごろに分岐？1996.79 (95％HPD: 1994.55-1998.79)


Early to mid-2008 (95％HPD: 2007.58-2009.14)


.F.03

M1遺伝子による系統樹（同義置換）

121番：トリ型T（スレオニン）、ヒト型A（アラニン）、新型T（スレオニンン）115、137番は、ソ連型(H1N1)はトリ型の性質を残しているが、115番：トリ型V（バリン）、ヒト型 I（イソロイシン）、新型T（スレオニンン）137番：トリ型T（スレオニン）、ヒト型A（アラニン）、新型T（スレオニンン）

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新型H1N1

ユーラシアブタ型

北米ブタ型

ヒト型

トリ、ウマ型

31番目のアミノ酸がセリン(S)からアスパラギン(N)に変異すると抗インフルエンザ薬のアマンタジンとリマンタジンに対して耐性になることが知られている。Sとあるところは、感受性。何も書いてない所は耐性。

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1998年以前の1990年代 2009年

トリ北米ブタ（トリプル遺伝子交雑）ヒト

ãB_`aPA遺伝子による系統樹（全塩基 3パラメータ法）

1998年以前の1990年代 2009年


同義置換

2008.40 Late May-2008

(95％HPD: 2008.56-2009.0)


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1993 - 98 年ごろに分岐？1993.16 (95％HPD: 1988.65-1997.48)


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1980 - 95年頃？ 2009年


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2008.45 Mid June-2008

(95％HPD: 2007.53-2009.13)


1995 - 96 年ごろに分岐？1995.55 (95％HPD: 1989.26-2000.91)


.F.4;

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1995年頃 2009年


1968年

ヒト（香港かぜ）

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1995年頃 2009年


1968年

ヒト（香港かぜ）

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2008.72 mid-late Septenber-2008

(95％HPD: 2008.19-2009.15)


1999 年ごろに分岐？予想記述無し。図より1998年ごろ


.F.44





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PB1

PB1-F2

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atggatgtcaatccgactctacttttcctaaaaattccagcgcaaaatgccataagcaccacattcccttatactggagatcctccatac

M D V N P T L L F L K I P A Q N A I S T T F P Y T G D P P Y

100 110 120 130 140 150 160 170 180

agccatggaacaggaacaggatacaccatggacacagtaaacagaacacaccaatactcagaaaagggaaagtggacgacaaacacagag

S H G T G T G Y T M D T V N R T H Q Y S E K G K W T T N T E

M E Q E Q D T P W T Q * T E H T N T Q K R E S G R Q T Q R

190 200 210 220 230 240 250 260 270

actggtgcaccccagctcaacccgattgatggaccactacctgaggataatgaaccaagtgggtatgcacaaacagactgtgttctagag

T G A P Q L N P I D G P L P E D N E P S G Y A Q T D C V L E

L V H P S S T R L M D H Y L R I M N Q V G M H K Q T V F * R

280 290 300 310 320 330 340 350 360

gctatggctttccttgaagaatcccacccaggaatatttgagaattcatgccttgaaacaatggaagttgttcaacaaacaagggtagat

A M A F L E E S H P G I F E N S C L E T M E V V Q Q T R V D

L W L S L K N P T Q E Y L R I H A L K Q W K L F N K Q G * I

370 380 390 400 410 420 430 440 450

aaactaactcaaggtcgccagacttatgattggacattaaacagaaatcaaccggcagcaactgcattggccaacaccatagaagtcttt

K L T Q G R Q T Y D W T L N R N Q P A A T A L A N T I E V F

N *

yz{0f

ãý6L-Mj:�Úy^PB1遺伝子による系統樹（全塩基置換 3 パラメーター法）

349fg:hfi

北米ブタ型

香港風邪

アジア風邪

クラシカルブタ

ソ連風邪イタリア風邪スペイン風邪

349fg:hfi

北米ブタ型

香港風邪

アジア風邪

クラシカルブタ

ソ連風邪イタリア風邪スペイン風邪 :�4�Ü¨

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トリ型トリ型

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