Баранова А. Облачные биомаркеры патологических...
TRANSCRIPT
![Page 1: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/1.jpg)
Полнопрофильные композитные биомаркеры
патологических состояний тканей человека
Анча БарановаМедико-Генетический Научный Центр РАМН, Москва, Россия
George Mason University, Fairfax VA, USA
![Page 2: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/2.jpg)
На решение какой практически-значимой проблемы направлено Ваше исследование?
Как ее решение позволит улучшить этот мир?
НОВЫЙ ТИП БИОМАРКЕРОВ ДЛЯ МОНИТОРИНГА СОСТОЯНИЙ,
в том числе здоровья
![Page 3: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/3.jpg)
Биомаркеры заболеваний – в принципе, хорошая идея.
![Page 4: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/4.jpg)
Однако, все годные биомаркеры уже были найдены.
Зачем эволюции нужно отбирать на биомаркеры????
НИЗАЧЕМ !!!!
![Page 5: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/5.jpg)
Объективные показатели общего состояния для здорового человека
Самый лучший биомаркер здоровья
– это состояние гомеостаза
которое для каждого человека индивидуально
![Page 6: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/6.jpg)
Чтобы определить гомеостаз
Давайте откажемся от минимизации числа
измеряемых параметров
Для каждого состояния мы определяем
«дистаницию» до усредненного
состояния
![Page 7: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/7.jpg)
Может быть описано как Броуновское движение с исходной точкой в центре гомеостаза
Если «случайно» отошли слишком далеко от точки гомеостаза, вернуться “в молодость / “в здоровье”все сложнее
Только точка тут – не один параметр,
а тысячи – сколлапсированные
в дистанцию
![Page 8: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/8.jpg)
Пространство ,занимаемоеБОЛЕЗНЕННЫМИ СОСТОЯНИЯМИ
Центр пространства НОРМАЛЬНОГО
(молодого) организма
DNormal
Индивидуальное Пространство Состояния здорового человека(норма реакции)
![Page 9: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/9.jpg)
ДИСТАНЦИЯ – ЭТО ЛИНЕЙНАЯ МЕТРИКА
DN – Avg dist from normal sample spaceDNglobal DNspecific
(Tone et al. 2008)
(Wurmbach et al. 2007)
DNglobal DNspecific
![Page 10: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/10.jpg)
Тоже самое можно делать и с помощью NextGen Seq
Вполне возможно что потребуется достаточно небольшой уровень перекрытия (удешевление)
![Page 11: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/11.jpg)
Чего Вам удалось и чего еще не удалось добиться
в своей работе?
1) Концепция доказана для опухолей
2) Разработаны общие методические подходы ( но не оптимизированы) 3) Сделаны первые прикидки для хронических заболеваний
и для СТАРЕНИЯ
![Page 12: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/12.jpg)
ПЕРСПЕКТИВНЫЕ ВОПРОСЫ КОТОРЫЕ МОЖНО ПОЗАДАВАТЬ :
DNglobal DNspecific
ЕСТЬ ЛИ РАЗНИЦА В ПРОГНОЗЕ МЕЖДУ ЭТИМИ ДВУМЯ ОПУХОЛЯМИ
![Page 13: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/13.jpg)
![Page 14: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/14.jpg)
Distance to normal center
![Page 15: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/15.jpg)
Correlation to actual survival
Significant!!!
![Page 16: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/16.jpg)
Насколько плоха моя опухоль?
Ответ: дистанция от идеальной нормы
Ваша опухоль
![Page 17: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/17.jpg)
Нормальные эпит клетки
предзлокач
Поле, где катаются злокач клетки
Нормальные МЕЗЕНХИМ клетки
Метастаз.Клетки после транзиции
АТТРАКТОРЫ !!!
![Page 18: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/18.jpg)
George Mason University, Fairfax, VA, USA
A.Baranova, M.Sikaroodi, G,Manyam, P. Gillevet
![Page 19: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/19.jpg)
![Page 20: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/20.jpg)
![Page 21: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/21.jpg)
Нужны ли Вам студенты, какими они должны обладать компетенциями,
и какие для них есть задачи?
Уметь считать Уметь писать
![Page 22: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/22.jpg)
![Page 23: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/23.jpg)
![Page 24: Баранова А. Облачные биомаркеры патологических состояний и процессов](https://reader034.vdocuments.site/reader034/viewer/2022042716/55a763b51a28ab2f058b46df/html5/thumbnails/24.jpg)