КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/lab2021/5....
TRANSCRIPT
![Page 1: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/1.jpg)
КОВИД 19 халдварын лабораторийноношилгоо
Б.Дармаа АУ-ны доктор,ХӨСҮТ, Вирүс судлалын лабораторийн эрхлэгч
![Page 2: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/2.jpg)
Агуулга:
1.COVID-19 лабораторийн оношилгоо2.Оношилгооны чанарын асуудалд3.Цаашдын зорилт
![Page 3: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/3.jpg)
COVID-19 лабораторийн оношилгоо
Халдварын сэжигтэй тохиолдол
Эмнэл зүйн сорьц
SARS CoV-2 илрүүлэг(Амьсгалын замын сорьц)
Ийлдэс судлалыншинжилгээ (Ийлдэс)
Аг илрүүлэх хурдавчилсан тест
Өвөрмөц геном илрүүлэх бх-ПГУ
Мастер холимогRoche LightMix®: SarbecoV E-gene plus EAV) болон RdRP ген өвөрмөц праймер/проб, эерэг хяналтын бүрдэл+Applied Biosystems AgPath-ID™, Invitrogen Superscript PlatimumTaqNIID: N1, N2 праймер/проб+ Applied Biosystems AgPath-ID™, Invitrogen Superscript PlatimumTaq
Цомог ашиглах: AllplexTM SARS-CoV-2: IC, Е, RdRP, S, N Wuhan EasydiagnosisBiomedicine: ORF1ab, NStandart M SD BIOSENSOR nCoVrt detection kit: IC, RdRP, E BGI Biotechnology (Wuhan): IC, ORF1ab
Ат илрүүлэх хурдавчилсан
тест
ФХУ, Химилюминесце
нц
SD B
IOSE
NSO
R CO
VID
19
Ag
test
Mag
lum
inC
oV-I
gG,
Wan
taiB
iolo
gica
l Ig
G, T
otal
Ig
![Page 4: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/4.jpg)
Өвөрмөц геном илрүүлэх молекул биологийн арга(ПГУ)
Вирүсийн нүклейн хүчлийг олшруулж илрүүлэх арга
Шаардлагатай зүйлПГУ оношлуур: Энзим, Буффер, праймер, пробЭмнэл зүйн сорьцноос ялгасан вирусийн РНХ (Сөрөг, эерэг хяналт)Шинжилгээ хийх тоног төхөөрөмж Сургагдсан мэргэжилтэн
Мастер холимог
бэлтгэх
Эмнэл зүйн сорьцноос
РНХ ялгах
ПГУ шинжилгээ хийх, дүгнэх
![Page 5: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/5.jpg)
Полимеразийн гинжин урвал-ПГУ(Polymerase chain reaction-PCR)
https://theory.labster.com/PCR_amplification/
Үүсгэгчийн РНХ өвөрмөц нүклейн хүчлийн дараалал/праймер ашиглан энзимийн тусламжтайгаар геномыг олшруулж илрүүлэх арга техник юм. Хэрэв эмнэл зүйн сорьцонд үүсгэгчийн РНХ байвал хос ДНХ болж температурын ялгаа бүхий циклийн явцад олширдог. ПГУ-ын 1 цикл нь үе 3 шаттай: ДНХ хос гинж салах (95-98C -15-30 сек), праймерхолбогдох (54-65C -20-40 сек), Гинж уртасах (68-72C -1 мин )= 35-40 цикл/1 цаг 30 мин
Гель электрофорезоор илрүүлдэгуламжлалт арга
![Page 6: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/6.jpg)
Бодит хугацааны ПГУ -Real-time PCR ( Taqman проб ашиглах арга)
https://www.thermofisher.com/jp/en/home/life‐science/pcr/real‐time‐pcr/real‐time‐pcr‐learning‐center/real‐time‐pcr‐basics/how‐taqman‐assays‐work.html
1 цикл 3 шат адил. Геном өвөрмөц праймер+өвөрмөц TaqMan probe ашигладаг. Сорьцонд вирүсийнгеном байгаад өвөрмөцөөр холбогдсон тохиолдолд TaqMan probe задарч флуоресценцит гэрэл өгдөг. Сорьцонд байсан РНХ-ийн олширсон хэмжээгээр флуоресценцит гэрлийн эрчим нэмэгддэг, нүклейн хүчлийн олшролтыг бодит хугацаанд харж илрүүлдэг технологийг Бх-ПГУ -Real-time PCR гэнэ.
Бх-ПГУ -Real-time PCR
![Page 7: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/7.jpg)
Анхаарах зүйл
Мастер холимог
бэлтгэх
Маш мэдрэг арга: Геномыг 10^12 дахин түүнээс дээш тоогоор олшруулж илрүүлдэг. Хуурамч эерэг ба сөрөг хариу гарах эрсдэл ихтэй
Бохирдлоос сэргийлэх хамгийн чухал асуудал• Сорьц хоорондын харилцан бохирдол • ПГУ-ын бүтээгдэхүүнээр бохирдох• Эерэг хяналтаар бохирдох
Урвалж задарч хүчингүй болохоос сэргийлэх (хадгалах
горим, хүчинтэй хугацаа, техник ажиллагаа)
Мэргэжлийн өндөр ур чадвар шаарддаг(ур чадварын сургалт)
Эмнэл зүйн
сорьцноос РНХ ялгах
ПГУ шинжилгээ хийх, дүгнэх
![Page 8: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/8.jpg)
Оношилгооны чанарын асуудалд
![Page 9: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/9.jpg)
SARS CoV-2 илрүүлэгт хэрэглэж байгаа оношлуур
2020/01/27Японы
ХӨҮХ-ээс 200
праймер/проб
2020/02/12
Японы ХӨҮХ 2000
праймер/проб
2020/02/15-27 Happy veritas company: 482020/02/27
Gyals company: 200test/Sansure, China
2020/04/03: 3000
test A*Star
kit/Singapur
e
26/03/2020: 5000test/Sans
ure, Biotech,,
China
2020/04/03:
36000 test N1,
N2 primer/pr
obeJapan
2020/04/06: 2000
test, SeegenAllplex
kit/ Korea
2020/04/08ДЭМБ: 10000
primer/probe Roche
2020/12 сар BGI- 31000
Biotechnology (Wuhan)
2020/11 сар43000
test/SansureBiotech, China
2020/10 сар : 30000 test,
Seegen Allplexkit/ Korea
2020/06/04 8000 кит,
БНХАУ-ын Wuhan Easy
Diagnosis Biomedicine
Company
2020/05/01:2400 SD biosensor
kit, Korea
![Page 10: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/10.jpg)
https://academic.oup.com/clinchem/article/66/7/977/5819547Limits of Detection of 6 Approved RT–PCR Kits for the Novel SARSCoronavirus-2 (SARS-CoV-2)
![Page 11: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/11.jpg)
https://www.who.int/publications/m/item/200922-eul-sars-cov2-product-list
![Page 12: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/12.jpg)
Олон улсын гадаад чанарын хяналт үнэлгээнд үнэлэгдсэн байдал, 2020 он
Хяналт үнэлгээ хийсэн ОУ-ын байгууллага
Үнэлгээнд орсон он сар өдөр
Үнэлгээний дүн
1 Хонг Конгын НЭМ-ийн лавлагаа лаборатори
2020 оын 3 сар 100%
2 Хонг Конгын НЭМ-ийн лавлагаа лаборатори
2020 оын 5 сар 100%
3 Хонг Конгын НЭМ-ийн лавлагаа лаборатори
2020 оын 7 сар 100%
4 Их Британи улсын үндэсний гадаад хяналт үнэлгээ (United Kingdom National External Quality Assessment Service -UK NEQAS)
2020 оын 10 сар Хүлээгдэж байгаа
5 Австрали Улсын Эмгэг Судлалын Коллеж, Гадаад үнэлгээний хөтөлбөр(Royal College of Pathologists of Australasia Quality Assurance Programs-RCPAQAP)
2020 оын 12 сар Хүлээгдэж байгаа
![Page 13: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/13.jpg)
SARS CoV 2 болон улирлын CoV илрүүлэх УТ ПГУ/rt RT PCR гадаад чанарын хяналт үнэлгээ (2020/07 сар) 100%
![Page 14: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/14.jpg)
Өвчтөн Нас хүйс Тохиолдол Сорьц авсан огноо Сорьцын төрөл ОношКонкук Их
сургуулийн баталгаажилт
А 32 эр Импортлогдсон 3/25/2020 Хамарзалгиурын арчдас COVID 19
эерэг
Х 33 эр Импортлогдсон 3/21/2020 Хамарзалгиурын арчдас COVID 19
эерэг
Б 40 эр Импортлогдсон 3/21/2020 Хамарзалгиурын арчдас COVID 19
эерэг
С 17 эм Импортлогдсон 3/22/2020 Хамарзалгиурын арчдас COVID 19
эерэг
У 35 эм Импортлогдсон 3/16/2020 Хамарзалгиурын арчдас COVID 19
эерэг
С 24 эр Импортлогдсон 8/12/2020 Хамарзалгиурын арчдас COVID 19
эерэг
С 21 эр Импортлогдсон 4/14/2020 Хамарзалгиурын арчдас COVID 19
эерэг
Зөөвөрлөгдөж ирсэн тохиолдлуудын сорьцыг БНСУ-ын Конкук Их сургуулийн лабораторит
илгээж баталгаажуулсан жагсаалт
![Page 15: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/15.jpg)
Монголд илэрсэн SARS-CoV-2 вирүсийн гадаргуугийн S уургийн генийн удмын холбоо(БНСУ-ын Конкук Их сургуультай хамтаран хийсэн)
Гадаргуугийн S ген
Байршил 21563-25384, урт: 3821нт
![Page 16: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/16.jpg)
Шинжилгээний дотоод чанарын хяналт• РНХ ялгалтын хяналт:
EAV/адууны артритын вирүсийг ашиглана;
• Эмнэлзүйн сорьц авагдсан эсэх хяналт:
Хүний RNP праймер ашиглан шинжилгээ бүрт сорьц бүрт шалгана (Цомог оношлуурт IC).
• БхПГУ-ын шинжилгээний хяналт:
• Шинжилгээ бүрт эерэг, сөрөг хяналтуудыг хэрэглэж дараах байдлаар хянаж дүгнэнэ.
a. Сөрөг хяналтын урвалын нүхэнд флюресценцийн муруй гарахгүй эсвэл босго шугамын дагуубайх ёстой.
b. Эерэг хяналтууд дээр оношлуур үйлдвэрлэгчийн тогтоосон зааврын дагуу тодорхой циклээс(Ct) өмнө флюресценцийн муруй босго шугамаас дээш гарах ёстой.
c. - ба + хяналтууд шаардлага хангасан байгаа нөхцөлд сорьц бүхий урвалын нүхэндфлюресценцийн муруй (Ct) цикл буюу түүнээс өмнө босгоос дээш гарсан байвал уг сорьцыг“эерэг” гэж үзнэ.
d. Бүх хяналтууд шаардлага хангасан байгаа нөхцөлд сорьц бүхий урвалын нүхэндфлюресценцийн муруй (Ct) циклээс хойш босго давсан эсвэл босгын дагуу байвал угсорьцыг “сөрөг” гэж дүгнэнэ.
Дотоод хяналт эргэлзээтэй үед шинжилгээг давтаж, протокол хөтөлнө
![Page 17: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/17.jpg)
Цаашдын зорилт
![Page 18: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/18.jpg)
Монгол улсад COVID-19 халдварын лабораторийн оношилгооны байдал (Нийт 12 лаборатори)
УБ 5 лаб: ХӨСҮТ-д 3; ЗӨСҮТ-1 лаб, НЭМҮТ-1Орон нутагт 6 лаб: Ховд, Дорнод, Орхон, Дархан Уул, Сэлэнгэ, Замын Үүд сумЗӨСҮТ, машинт лаб: ӨМ, Гашуун сухайтад
![Page 19: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/19.jpg)
Цаашдын зорилт
![Page 20: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/20.jpg)
Цаашдын зорилт 1. Сургалт, Давтан сургалт, ажлын байранд дэмжлэгт сургалтыг хийж лабораториудын үйл ажиллагааг жигдрүүлэх, з/б халдвар хамгааллыг сайжруулах;2. Цомог оношлууруудыг лабораториудын тоног төхөөрөмжид тохируулан захиалж, жигд хангах;3.Оношлуур, урвалж, лабораторийн хэрэгслийн хангалт, зарцуулалтын цахим бүртгэл үүсгэж жигдрүүлэх;4. Лабораториуд цаашид COVID-19+ТТӨ-ий үүсгэгчийн тандалтыг тогтмолжуулах, амьсгалын замын өвчний улмаас үйлчлүүлэгчдээс сорьц цуглуулж илгээх, шинжлэх;5. COVID-19 шинжилгээ хийх бүх лабораториудыг гадаад болон хөндлөнгийн хяналт үнэлгээнд хамрагдана;6. Сорьц цуглуулах, шинжилгээ хийх үеийн халдвар хамгаалал аюулгүй ажиллагааг сайжруулж тогтмол хяналт үнэлгээ хийх;7. COVID-19 оношилгооны лабораториуд сүлжээгээр мэдээлэл солилцож, хамтран ажиллах.
![Page 21: КОВИД 19 халдварынлабораторийн оношилгооflu.mn/images/LAB2021/5. Molecular diagnosis of SARS CoV2... · 2021. 1. 14. · лаборатори 2020](https://reader036.vdocuments.site/reader036/viewer/2022071501/6120f956389779247b7aa5f0/html5/thumbnails/21.jpg)
Анхааран сонссонд баярлалаа