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  • DEPARTAMENT DE MEDICINA PREVENTIVA I SALUT PBLICA GASTROENTERITIS AGUDA POR ROTAVIRUS EN POBLACIN INFANTIL INGRESADA EN UNIDADES DE LACTANTES DE VALENCIA M VICTORIA GUTIRREZ GIMENO

    UNIVERSITAT DE VALNCIA Servei de Publicacions

    2009

  • Aquesta Tesi Doctoral va ser presentada a Valncia el dia 24 de mar de 2009 davant un tribunal format per:

    - Dr. Llus Salleras Sanmart - Dr. Rafael Herruzo Cabrera - Dra. Julia Colomer Revuelta - Dr. Vicente Gil Guilln - Dr. Jos Luis Alfonso Snchez

    Va ser dirigida per: Dr. Jos M Martn Moreno Dr. Javier Dez Domingo Copyright: Servei de Publicacions M Victoria Gutirrez Gimeno Dipsit legal: V-3733-2009 I.S.B.N.: 978-84-370-7490-0

    Edita: Universitat de Valncia Servei de Publicacions C/ Arts Grfiques, 13 baix 46010 Valncia Spain

    Telfon:(0034)963864115

  • Departamento de Medicina Preventiva y Salud Pblica, Ciencia de los Alimentos, Toxicologa y Medicina Legal

    GASTROENTERITIS AGUDA POR ROTAVIRUS EN POBLACIN INFANTIL INGRESADA EN UNIDADES DE LACTANTES DE VALENCIA

    TESIS DOCTORAL presentada por M Victoria Gutirrez Gimeno Para optar al grado de Doctora en Farmacia dirigida por Catedrtico Jos Mara Martn Moreno Doctor Javier Dez Domingo

    Valencia, Julio de 2008

  • D. JOS MARA MARTN MORENO, DOCTOR EN MEDICINA Y CIRUGA POR LA UNIVERSIDAD DE GRANADA, DOCTOR EN EPIDEMIOLOGA Y SALUD PBLICA POR LA UNIVERSIDAD DE HARVARD, Y CATEDRTICO DEL DEPARTAMENTO DE MEDICINA PREVENTIVA Y SALUD PBLICA, CIENCIAS DE LA ALIMENTACIN, TOXICOLOGA Y MEDICINA LEGAL DE LA UNIVERSITAT DE VALNCIA & D. JAVIER DEZ DOMINGO, DOCTOR EN MEDICINA Y CIRUGA POR LA UNIVERSITAT DE VALNCIA

    CERTIFICAN:

    Que la Tesis Doctoral que presenta DA. M VICTORIA GUTIRREZ GIMENO (licenciada en Farmacia por la Universitat de Valncia) al superior juicio del Tribunal designado por la Universitat de Valncia, sobre el tema: Gastroenteritis aguda por rotavirus en poblacin infantil ingresada en unidades de lactantes de Valencia, ha sido realizada bajo nuestra direccin, siendo expresin de la competencia tcnica e interpretativa de su autora, que a nuestro juicio rene los mritos necesarios para ser acreedora del grado de Doctora en Farmacia, siempre que as lo considere el citado Tribunal.

    Lo que certificamos en Valencia, a 31 de julio de 2008

    Dr. Jos Mara Martn Moreno Dr. Javier Dez Domingo

  • A mis padres, con todo mi amor, gracias por darme una vida feliz.

    A mi hermana, por ser mi estrella.

    A mi familia

  • AGRADECIMIENTOS

    La realizacin y escritura de la tesis durante estos aos ha supuesto una importante etapa en mi vida, donde no slo he aprendido a nivel cientfico sino que tambin he tenido la oportunidad de conocer a personas maravillosas que me han aportado mucho y a las que quiero agradecer que este proyecto haya llegado a buen trmino.

    Mi mayor gratitud es para Jos Mara Martn Moreno y para Javier Dez Domingo por su gran labor de direccin, por su estmulo y apoyo durante todo el tiempo que ha durado este trabajo, por la enorme paciencia y afecto demostrados y por creer en mi. Gracias porque he aprendido mucho de vosotros en lo acadmico y en lo personal. Siempre os estar agradecida.

    A Quique Hevilla y Eva Garca por su predisposicin permanente e incondicional en todo aquello en lo que los he necesitado y a todo el personal del departamento por su amabilidad.

    A mis compaeros de los tres hospitales, partcipes activos de este proyecto desde el primer momento, que no hubiera sido posible sin vuestra ayuda. A Francesc Asensi, Ana Laura Chindemi, M Carmen Otero, Amparo Prez, Matilde Farga, M Jos Moya y a todo el personal de los servicios de pediatra del hospital La Fe de Valencia. A Roberto Hernndez, Sara Pons, Rafa Bretn y a todo el personal del hospital Dr. Peset de Valencia. A Fernando Calvo, Isidro Vitoria, Patricia Correcher y a todo el personal del hospital Llus Alcanys de Jtiva. Sin vuestra implicacin, profesionalidad, paciencia y amabilidad no hubiera sido posible este trabajo de investigacin. Gracias de nuevo por soportar mi acoso permanente, no es fcil trabajar e investigar al mismo tiempo sin perder la sonrisa.

    A Itziar Oyagez por estar siempre ah cuando te necesitaba, por ser una compaera formidable, por pasar horas revisando datos y rernos al mismo tiempo. Gracias por tu amistad y por tu confianza, me has hecho sentir muy bien.

  • A Patricia Santgueda por las largas conversaciones telefnicas explicndome muchos conceptos en fines de semana, eres un encanto.

    A Alicia Snchez y a todo el personal de la seccin de virus productores de gastroenteritis del Centro Nacional de Microbiologa del Instituto de Salud Carlos III por su profesionalidad y amabilidad.

    Un agradecimiento especial a Santiago Benayas, por la lectura, sugerencias y comentarios que me han ayudado a darle forma a este manuscrito. Gracias por el apoyo constante e incondicional que me ofreces cada da.

    A mi familia y amigos que se han encargado de que mi cuerpo y mi alma se nutriera da a da de la fuerza necesaria para realizar este trabajo con energa y optimismo.

    Gracias de todo corazn a todos los nios y sus familias que hicieron posible este estudio por su altruismo.

    A todos los que de alguna manera, me ayudaron a conseguir hacer de este proyecto una realidad. GRACIAS SIEMPRE.

    Nota adicional de agradecimiento y reconocimiento formal:

    Este estudio ha sido posible gracias al apoyo de la Conselleria de Sanitat de la de la Generalitat Valenciana que, mediante RESOLUCIN de 15 de junio de 2006, otorg a nuestro equipo una beca de las destinadas a proyectos de investigacin en programas de salud, prevencin y prediccin de la enfermedad (Ref: 068/2006, proyecto: Magnitud e impacto de la Gastroenteritis por Rotavirus en poblacin infantil hospitalizada. Estudio observacional multicntrico). Tambin nuestra gratitud al Departamento Mdico de Sanofi Pasteur MSD por la generosa financiacin de los anlisis necesarios para completar el trabajo de campo, respetando la absoluta independencia del presente estudio.

  • ABREVIATURAS

    ARN: cido ribonucleico CDC: Centros para el control y la prevencin de enfermedades de los Estados Unidos CMBD: Conjunto Mnimo Bsico de Datos CNM: Centro Nacional de Microbiologa CRD: Cuaderno de recogida de datos EIA:Enzyme immunoassay (anlisis inmunoenzimtico) ELISA: Enzyme-linked immunosorbent assay (ensayo inmunoabsorbente ligado a enzimas) EMEA: European Medicines Agency (Agencia europea de medicamentos) FDA: Food and Drug Administration (Administracin de alimentos y frmacos de Estados Unidos de Amrica) GEA: Gastroenteritis aguda IC95: Intervalo de confianza del 95% ISCIII: Instituto de Salud Carlos III IV: Intravenoso LCR: Lquido cefalorraqudeo NV: Norovirus RIC: Rango intercuartil RT-PCR: Reaccin en cadena de la polimerasa, transcripcin inversa. RV: Rotavirus SIM: Sistema de Informacin Microbiolgico

  • NDICE

    1-INTRODUCCIN 1 1.1- GEA por rotavirus y su epidemiologa 2 1.1.1-Definicin de GEA y descripcin de GEA por rotavirus 2 1.1.2-Epidemiologa de la GEA por rotavirus 4 1.2-Definicin de Infeccin nosocomial y epidemiologa

    de GEA nosocomial por rotavirus 9 1.2.1-Definicin de infeccin nosocomial 9

    1.2.2--Epidemiologa de GEA nosocomial por rotavirus 10 1.3-Breve revisin de las caractersticas,

    variabilidad y clasificacin de los rotavirus 14 1.3.1-Sntesis de antecedentes histricos de identificacin y caracterizacin 14 1.3.2-Descripcin y caractersticas bsicas 14 1.3.3-Clasificacin 17 1.3.4-Variabilidad molecular 20

    1.4-Vas de transmisin y factores de riesgo del rotavirus 24 1.4.1-Vas de transmisin 24

    1.4.2-Factores de riesgo 26 1.5-Diagnstico 27 1.6-Tratamiento 28 1.7- Prevencin 30 1.8-Coste econmico de la GEA por rotavirus 37 1.9-Justificacin y pertinencia del estudio 41

    2-OBJETIVOS 43 2.1-Objetivos principales 44 2.2-Objetivos especficos 44

    3-MATERIAL Y MTODOS 45 3.1-Definiciones 46 3.2-Tipo de estudio/ diseo epidemiolgico 47

  • 3.3-Poblacin a estudio 48 3.3.1-Definicin de poblacin diana 48

    3.3.2-Poblacin de accesibilidad muestral 48 3.3.3-Criterios de inclusin 49 3.3.4-Criterios de exclusin 49 3.4-Tamao muestral 49 3.5-Desarrollo del estudio 50

    3.5.1- Procedimiento de inclusin de casos 50 3.5.2-Procedimiento general de recogida de datos 52

    3.5.2.1-Adjudicacin del cdigo de identificacin del estudio 52 3.5.2.2-Instrumentos de recogida de datos 52 3.5.3-Proceso de identificacin de rotavirus en la muestra 54

    3.5.3.1-Recogida y conservacin de la muestra 54 3.5.3.2-Identificacin de la muestra 54 3.5.3.3-Transporte de la muestra 55

    3.5.3.4-Anlisis de la muestra 55 3.5.3.5-Diagnstico microbiolgico 57

    3.6- Variables del estudio y flujo de datos 57 3.6.1-Variables del estudio 57 3.6.2-Flujo de datos 67 3.7- Evaluacin estadstica (anlisis de datos) 68

    3.7.1-Gestin de la informacin recogida y evaluacin de las bases de datos 68

    3.7.2-Metodologa del anlisis estadstico 68 3.8- Anlisis de costes 71 3.9- Tratamiento de la Bibliografa 71 3.10-Aspecto ticos del estudio, confidencialidad de datos,

    consentimiento informado, control de calidad y recursos 72 3.10.1-Aspectos ticos del estudio 72 3.10.2-Confidencialidad de los datos 72 3.10.3-Consentimiento informado 72 3.10.4- Control de calidad 73 3.10.5-Recursos humanos, tcnicos y econmico