TAXONOMIABACTERIANA

CONCEPTO

Ciencia de la clasificación biológica

Taxo: Estructuración u orden

Nomos: Ley

PARTESClasificación: Ubicación de los organismos en grupos (taxones) en función de semejanzas y/o parentesco evolutivo

Nomenclatura: Asigna los nombre de acuerdo a normas

Identificación: Determina a que taxones pertenece un microorganismo aislado

IMPORTANCIAOrdena los conocimientos

Permite hacer predicciones y formular hipótesis

Establecer un lenguaje común y universal

Caracterizar e identificar aislados

Realizar estudios evolutivos

NO CONFUNDIR

Taxonomía

Identificación

•Estudio exhaustivo•Aplica teorías y métodos de clasificación•Grupos taxonómicos•Nomenclatura

•Caracteriza por pruebas limitadas•Compara spp conocidas•Asigna una sp•No identificado: Estudio taxonómico

CONCEPTOS, CLASIFICACION Y

RANGOS

RANGOS TAXONOMICOSDominio

Phylum

Clase

Orden

Familia

Genero

EspecieImportante en clínica y ecología

CLASIFICACIONA nivel de especie (sp) o subespecie (spp):

Serovariedad o serotipo: Ag distintos

Fagovariedad: tipificación por fagos

Biovariedad: diferencias bioquímicas o fisiológicas

Patovariedad: Patogenicidad

Morfovariedad: Apariencia morfológica

Genovariedad: Grupos ADN similares

NOMENCLATURA

Sistema binomial (Linneo):

Staphylococcus intermedius

Staphylococcus aureus

S. intermedius

S. aureus

Streptococcus sp

ESPECIEUnidad taxonómica básica

Grupo de cepas con alto grado de similitud y que difieren de otro grupo de cepas

Cepa: Población de organismos que desciende de un único organismo o de una sola célula

ESPECIE BACTERIANAHomología mayor al 70% (Bergey’s Manual, 1984)

Hoy, criterio Polifásico: Fenotipo y genotipo (incluye filogenético)

Posible criterio futuro: Definición genomica

Cepa Tipo: Primera cepa estudiada, siendo la mas caracterizada.

No necesariamente es la representativa del grupo

Existen bancos de cepas a nivel mundial

Se tratan de mantener con el menor numero de pases (subcultivos)

Centro de Colecciones Microbiologicas (Facultad de Ciencias, UCV)Vzla.

American Type Culture Collection (ATTC), USA

CIP (Coleccion Instituto Pasteur) Francia

DSMZ, Alemania

Genero:

Grupo definido de especies con muchas similitudes que estan claramente separados de otros

Actualmente muchas especies estan en estudio a raiz de nuevas evaluaciones

ESTUDIOS TAXONOMICOS

TAXONOMIA POLIFASICA Es la tendencia moderna

Integra los caracteres:

Fenotipicos

Genotipicos

Filogenéticos

Características fenotipicas

También conocida como clasificación Fenética

Porcentaje de G+C

Ponderación de caracteres con Claves Dicotómicas

TAXONOMIA CLASICA

CARACTERES FENOTIPICOS

Morfológicas Fisiológicas

CONTENIDO G+CPermite distinguir 2 organismos si difieren mas del 10%. Si tienen igual porcentaje, no funciona

TAXONOMIA NUMERICASe utiliza para evaluar datos fenotipicos

Utiliza gran numero de caracteres (>60)

Cada dato tiene el mismo valor

Los caracteres comunes indican similitud entre especies

TAXONOMIA NUMERICA

TAXONOMIA NUMERICA

Matrices de asociación

Grupos de similitudes

Dendogramas

TAXONOMIA MOLECULAR

Basada en análisis moleculares

Técnicas utilizadas:

Hibridación ADN-ADN

Huella molecular (Molecullar Fingerprinting)

HIBRIDACIONDependen de la secuencia

Util en organismos muy cercanos

Criterio actual para definir especie

Se basa en:

Porcentaje de hibridación ADN-ADN

Temperatura de desnaturalización del híbrido

PROCEDIMIETO

HUELLA MOLECULAR

Secuencias especificas de ADN

Las mismas son sometidas a digestión con enzimas de restricción

Su resolución se ubica a nivel de sub-especies

Fingerprinting

CARACTERIZACION FILOGENÉTICA

Evalúa la evolución

Se basa en la conservación de secuencias dentro de los genomas y su comparación con las variaciones que aparecen

CARACTERIZACION FILOGENÉTICA

Plantea hipótesis de evolución, es decir, determina relaciones de parentesco entre especies

Compara las secuencias de moléculas (cronómetros evolutivos) y establece la relación entre ellas

Las secuencias de las moléculas son el registro histórico de la evolución

MOLECULAS UTILIZADAS

ARNr: 5S, 16S, 23S

Subunidad beta de ATPasa

RecA

Factor de elongacion Tu

Genes funcionales

RIBOSOMA

RIBOSOMA

Esquema del ARNr 16S

ARBOL FILOGENÉTICO