Sorveglianza infezioni invasive da pneumococco

Annalisa Pantosti Istituto Superiore di Sanità

Workshop: Sorveglianza delle Malattie Batteriche Invasive ISS 28-29 Febbraio 2012

• 1 • 2 • 3 • 4 • 5 • 6A, 6B, 6C, 6D • 7A,7B,7C,7F • 8 • 9A,9L,9N, 9V • 10A, 10B, 10C, 10F • 11A,11B,11C,11D, 11E,11F • 12A,12B,12F • 13

• 14 • 15A,15B,15C,15F • 16A,16F • 17A,17F • 18A,18B,18C,18F • 19A,19B,19C,19F • 20 • 21 • 22A,22F • 23A,23B,23F • 24A,24B,24F • 25A,25F • 27

• 28A,28F • 29 • 31 • 32A,32F • 33A,33B,33C,

33D,33F • 34 • 35A,35B,35C,35F • 36 • 37 • 38 • 39 • 40

93 Sierotipi • 41A,41F

42 • 43 • 44 • 45 • 46 • 47A,47F • 48

Negli adulti:

Vaccino polisaccaridico (PPV23) (1983) contenete 23 polisaccaridi purificati no memoria immunitaria no effetto booster Nei bambini:

Vaccini glicoconiugati 7-valente (PCV7) 10-valente (PCV10 13-valente (PCV13) immunogeni nei bambini memoria immunitaria

Vaccini pneumococcici

Pneumococcal conjugate vaccines

2001 2010 2010

Diminuzione dell’ incidenza delle malattie invasive da pneumococco (USA- sierotipi vaccinali)

MMWR Sept 16, 2005

Figure. Annual Incidence of Invasive Pneumococcal Disease by Age Group for Adults ≥50 Years—Active Bacterial Core Surveillance, 1998-2003

Lexau, C. A. et al. JAMA 2005;294:2043-2051

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Casi annuali di meningite da S. pneumoniae per classe di età

0

50

100

150

200

250

300

350

400

1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010

n° to

tale

di c

asi Tutti i casi

anno 1<anni 1-4 anni 5-14 15-24 25-64 anni 64<

dati SIMI

Bambini- casi annuali di meningite da S. pneumoniae per classe di età

0

10

20

30

40

50

1998 1999 2000 2001 2002 2003 2004 2005 2006 2007 2008 2009 2010

n° to

tale

di c

asi

anno 1 > anni 1-4 anni 5-14

dati SIMI

Malattie Batteriche Invasive in Italia

www.simi.iss.it

Totale segnalazioni= 851 Meningite 36 % Sepsi 64 %

S.pneumoniae

N.menigitidis

H.influenzae

Streptococcus B

M.tuberculosis Listeria

Altro Non identificato 2010

MIN SAL

REGIONE REGIONE

ISS

ASL ASL ASL ASL ASL

Azienda Osp Ospedale 2

Ospedale 1

Centro rif regionale

FLUSSO DI DATI E CEPPI NEL SISTEMA DI SORVEGLIANZA

2005-2007 2008-2010

Regione n° casi n° sierotipizzati n° casi n° sierotipizzati

Piemonte 135 6 559 75

Valle d'Aosta 1 0 2 0

Lombardia 256 59 668 446

Trentino Alto Adige 20 2 112 43

Veneto 172 2 386 1

Friuli Venezia Giulia 37 2 58 33

Liguria 42 4 70 8

Emilia Romagna 181 0 270 35

Toscana 66 0 50 5

Umbria 1 2 4 2

Marche 6 0 14 7

Lazio 56 0 120 28

Abruzzo 7 2 9 4

Molise 1 1 1 0

Campania 64 6 42 11

Puglia 16 0 11 1

Basilicata 1 0 0 0

Calabria 6 0 12 1

Sicilia 17 2 27 6

Sardegna 10 0 13 3

Casi segnalati/ceppi sierotipizzati per regione

Evoluzione dei sierotipi confronto tra 3 periodi

Periodo precedente PCV7 o basso uso PCV7 (2001-2003)

Implementazione vaccinazione (2005-2007) Uso PCV7 >50% su scala nazionale (2008-2010)

0

5

10

15

20

25

30

4 6B 9V 14 18C 19F 23F 1 3 5 6A 7F 19A 15B 22F 24F Altri

2001-2003

2005-2007

2008-2010

%

Bambini

NVS 20%

PCV13 80%

Bambini ≤5 anni

NVS 40%

PCV7 60%

2001-2003

NVS 54%

PCV7 46%

2005-2007

NVS 69%

PCV7 31%

2008-2010

0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

PCV7

PCV13

Bambini ≤5 anni (2008-2010)

31%

80%

0

2

4

6

8

10

12

14

16

18

14 19F

23F

9V 6B 4

18C 3 7F

19A 1

6A

5 31 22F

15B

10A

11A

12F

18A

33F 8

18F

6C 16 20

23A

23B

24F

35F

29 38

15A

15C

35B

9N 21

12A

12B

NT 17 34

18B

2001-2003

2005-2007

2008-2010

PCV7

PCV13

Adulti ≥50 anni

0

2

4

6

8

10

12

14

16

71%

0

2

4

6

8

10

12

14

16

PCV13

PPV23

53%

%

%

Adulti ≥50 anni (2008-2010)

NVS51%

PCV749%

2001-2003 Adulti ≥50 anni

NVS66%

PCV734%

2005-2007

NVS81%

PCV719%

2008-2010

NVS47%PCV13

53%

2008-2010NVS 29%

23PPS 71%

2008-2010

PCV7

PCV13

Adulti ≥65 anni

NVS51%

PCV749%

2001-2003 Adulti ≥65 anni

NVS72%

PCV728%

2005-2007

NVS69%

PCV731%

2008-2010

NVS50%

PCV1350%

2008-2010

NVS 30%

23PPS 70%

2008-2010

0

2

4

6

8

10

12

14

16

0

2

4

6

8

10

12

14

16

PCV13

PPV23

%

%

70%

50%

Adulti ≥65 anni (2008-2010)

0

5

10

15

20

25

30

35

40

1999

2000

2001

2002

2003

2004

2005

2006

2007

2008

2009

2010

penicillina eritromicina

Resistenza - Eritromicina

Resistenza - Penicillina EARS-NET

Resistenza agli antibiotici in ceppi invasivi di S. pneumoniae

2010

2010

Resistenza in Italia

Distribuzione delle MIC per la penicillina

0

10

20

30

40

50

60

70

2001-2003

2005-2007

2008-2010

Breakpoint meningite EUCAST e CLSI

%

S NS

0

10

20

30

40

50

60

70

19A 1 3 7F 14 23

F22

F19

F24

F 6A 6B 9V 4 15B

18C

11A

Sierotipi

n° c

eppi

ResistentiSensibili

Sierotipi e resistenza alla penicillina

0

10

20

30

40

50

60

70

19A 1 3 7F 14 23F 22F 19F 24F 6A 6B 9V 4 15B 18C 11A

Sierotipi

n° c

eppi

ResistentiSensibili

Sierotipi e resistenza alla eritromicina

Fallimenti vaccinali • 2011: Regione: PIEMONTE sesso: F età: 1 anno diagnosi: SEPSI

POLMONITE vaccino: PREVENAR n° dosi: 3 sierotipo: 19F • 2010: Regione: EMILIA

ROMAGNA sesso: M età: 1 anno diagnosi: SEPSI vaccino: PREVENAR n° dosi: 3 sierotipo: 19F

• 2009: Regione: FRIULI VENEZIA GIULIA

sesso: M età: 2 anni diagnosi: POLMONITE vaccino: PREVENAR n° dosi: 3 sierotipo: 23F • 2008: Regione : LOMBARDIA sesso: M età: 4 mesi diagnosi: SEPSI vaccino: PREVENAR n° dosi: 1 sierotipo: 23F

Caratterizzazione di S. pneumoniae

Resistance genes

Antibiotic susceptibility

INTERNATIONAL CLONES

MLST

Clonal cluster

PFGE

Serotyping

Streptococcus pneumoniae

Genetic elements

spneumoniae.mlst.net

http://spneumoniae.mlst.net/�

Studi sui ceppi

Nuovi sierotipi: Tipizzazione del sierotipo 6C e 6D e conferma tramite PCR Analisi dei ceppi con sierotipo 11A, per distinguere in questo gruppo il nuovo sierotipo 11E Caratterizzazione dei ceppi non tipizzabili e conferma identificazione Identificazione dei cloni prevalenti circolanti in Italia Evoluzione dei cloni nel tempo Associazione con la resistenza agli antibiotici

0 5 10 15 20 25 30 35

Spain 9V-3/ST156/CC156

Sweden15A-25/ST63/CC63

Denmark14-32/ST230/CC230

Colombia23F-26/ST338/CC156

Spain23F-1/ST81/CC81

Taiwan 19F-14/ST236/CC271

Spain19F/ST88 minorclone

England14-9/ST9/CC15

Poland6B-20/ST315/CC315

no PMEN clone/ST473/CC473

no PMEN clone/ST675/Singleton

Spain 6B-2/ST90/CC90

no PMEN clone/ST676/CC156 2006-2010

1999-2003

9V;14;35F

9V;14

14; 15A; 19A; 19F; 23F

15A; 15B; 19A; 19F; 23F

14; 19F

19A; 24F

6C; 7F; 19A; 19F; 23B; 23F

19F; 23F

19F; 23F

19A; 19F

19F

14

6B

6B

6A

6A

6A

6B

6B

35F

%

Pneumococco resistente alla penicillina Evoluzione dei cloni

1999-2003

2006-2010

NON-TYPEABLE PNEUMOCOCCI

2,000 ceppi da infezioni invasive : 1 ceppo S. pseudopneumoniae 5 pneumococci non tipizzabili AP422 e AP426 isolati da due casi di polmonite batteriemica nel 2006

AP425 sierotipo 7F AP426 NT AP422 NT

M D E K G L K I F L A V L Q S I I V I L L V Y F L S F V R E A E L E R S S M V I L Y L L H F F V F Y F S S Y G N N F F K R G Y L V E F N S T I R Y I F F F A I A I S V L N F F I A E R F S I S R R G M V Y F L T L E G I S L Y L L N F L V K K Y W K H V F F N L K N S K K I L L L T V T K N M E K V L D K L L E S D E L S W K L V A V S V L D K S D F Q H D K I P V I E K E K I I E F A T H E V V D E V F V N L P G E S Y D I G E I I S R F E T M G I D V T V N L K A F D K N L G R N K Q I Y E M V G L N V V T F S T N F Y K T S H V I S K R I L D I C G A T I G L I L F A I A S L V L V P L I R K D G G P A I F A Q T R I G K N G R H F T F Y K F R S M R S D A E A I K E Q L M D Q N T M Q G G M F K I D N D P R V T K I G R F I R K T S L D E L P Q F W N V F I G D M S L V G T R P P T V D E Y V Q Y T P E Q K R R L S F K P G I T G L W Q V S G R S K I T D F D D V V K L D V A Y I D N W T I W K D I E I L L K T V K V V F M R E G A K -

WchA wt

AP422 (deletion of A910)

AP426 (G1081T transvertion)

Sequencing of the capsular locus (cps)

7F cps in both strains, but distinct single point mutations in wchA, coding for a glucose phosphate transferase

MDEKGLKIFLAVLQSIIVILLVYFLSFVREAELERSSMVILYLLHFFVFYFSSYGNNFFK RGYLVEFNSTIRYIFFFAIAISVLNFFIAERFSISRRGMVYFLTLEGISLYLLNFLVKKY WKHVFFNLKNSKKILLLTVTKNMEKVLDKLLESDELSWKLVAVSVLDKSDFQHDKIPVIE KEKIIEFATHEVVDEVFVNLPGESYDIGEIISRFETMGIDVTVNLKAFDKNLGRNKQIYE MVGLNVVTFSTNFYKTSHVISKRILDICGATIGLILFAIASLVLVPLIRKDGGPAIFAQT RIGKMVDILPFINSVRCGAMLKLSKNS-

MDEKGLKIFLAVLQSIIVILLVYFLSFVREAELERSSMVILYLLHFFVFYFSSYGNNFFK RGYLVEFNSTIRYIFFFAIAISVLNFFIAERFSISRRGMVYFLTLEGISLYLLNFLVKKY WKHVFFNLKNSKKILLLTVTKNMEKVLDKLLESDELSWKLVAVSVLDKSDFQHDKIPVIE KEKIIEFATHEVVDEVFVNLPGESYDIGEIISRFETMGIDVTVNLKAFDKNLGRNKQIYE MVGLNVVTFSTNFYKTSHVISKRILDICGATIGLILFAIASLVLVPLIRKDGGPAIFAQT RIGKNGRHFTFYKFRSMRSDAEAIKEQLMDQNTMQGGMFKIDNDPRVTKIGRFIRKTSLD *LPQFWNVFIGDMSLVGTRPPTVDEYVQYTPEQKRRLSFKPGITGLWQVSGRSKITDFDD VVKLDVAYIDNWTIWKDIEILLKTVKVVFMREGAK-

Bentley et al. 2006 PLoS Genet

MIPI • Annalisa Pantosti • Maria Del Grosso • Fabio D’Ambrosio • Romina Camilli • Monica Monaco CNESP • Paolo D’Ancona • Maria Grazia Caporali

I laboratori ospedalieri e i laboratori regionali di riferimento

ISS

Univ. Campus Biomedico • Giovanni Gherardi • Daniela Visaggio

Diapositiva numero 1Diapositiva numero 2Diapositiva numero 3Pneumococcal conjugate vaccinesDiminuzione dell’ incidenza delle malattie invasive da pneumococco (USA- sierotipi vaccinali)�Diapositiva numero 6Casi annuali di meningite da �S. pneumoniae per classe di età Diapositiva numero 8Diapositiva numero 9Diapositiva numero 10Diapositiva numero 11Evoluzione dei sierotipi�confronto tra 3 periodiDiapositiva numero 13Diapositiva numero 14Diapositiva numero 15Diapositiva numero 16Diapositiva numero 17Diapositiva numero 18Diapositiva numero 19Diapositiva numero 20Diapositiva numero 21Diapositiva numero 22Diapositiva numero 23Diapositiva numero 24Diapositiva numero 25Fallimenti vaccinaliDiapositiva numero 27Diapositiva numero 28Diapositiva numero 29NON-TYPEABLE PNEUMOCOCCI Diapositiva numero 31Diapositiva numero 32Diapositiva numero 33