rendemen maserasi

Untuk DipelajariBIOKIMIA I

ENZIM SEBAGAI BIOKATALISATOR

ENZIMEnzim adalah katalisator biologis (biokatalisator) : mempercepat reaksi kimia dalam sel hidup tanpa ikut bereaksiEnzim = Protein– Enzim adalah protein aktif. – Terdiri atas 100 – 2500 asam amino.– Sifat-sifat enzim = sifat-sifat protein

Enzim merupakan holoenzim, terdiri atas :– Apoenzim : bagian protein dari enzim yang

tidak aktif– Kofaktor : komponen non-protein untuk

aktivitas enzim. Macam :1. Koenzim : molekul organik2. Ion logam

Komponen Enzim

Enzim adalah Protein Polipetida-polipeptida saja : Chymotrypsin,

Pankreatik ribonuklease Protein + non Protein : Sebagia besar enzim

Molekul organik (Koenzim) Protein inaktif + Kofaktor (Apoenzim)

Ion logam

ENZIM Protein aktif (Holoenzim)

MORFOLOGI PROTEIN

Morfologi Enzim

apoenzim

SIFAT ENZIM SAMA DG PROTEIN

NATIVE ENZIM DENATURATED ENZIM

Mudah mengalami denaturasi

CONTOH Zn SEBAGAI ION LOGAM

Zn

Sisi aktif enzim

Sisi aktif mengandung ion logam seperti Zn, Fe, dan Cu, serta koenzim

STRUKTUR 3-DIMENSI ENZIM

E.C. Nymber: 3.2.1.21

Oligomerik Unit Octamer

No of residues 448

Contoh Lysozyme

Senyawa yang dapat mempercepat reaksi kimia Biokatalisator

ENZIM : E + S ES E + P

Tetap tidak berubah diakhir reaksi Sangat efektif dalam jumlah sedikit Tidak dapat merubah produk akhir Tidak merubah posisi kesetimbangan Dipengaruhi pH, inhibitor, aktivator Mengalami denaturasi pada suhu tinggi Sangat Spesifik

Sifat Reaksi Enzim:

The Rate of Catalyzed Enzyme Reaction

SPESIFISITAS ENZIM

Enzim bekerja secara spesifik

Substrat dan Enzim harus cocok

HIPOTESIS “LOCK and KEY”

RG: Reacting group; BG: Binding group; BS: Binding site; CS: Catalytic site

Substrat Enzim Kompleks ES

SPESIFISITAS ENZIM

HIPOTESIS “INDUCED-FIT”


Substrat Enzim Kompleks ES

SPESIFISITAS ENZIM

HIPOTESIS “INDUCED-FIT”


Mirip substrat

Non-productive interaction

Sequence of Binding

Mekanisme Reaksi

Substrate Inhibitor

Imobilisasi Enzim

Penamaan (Nomenclature)

Cara lama (nama trivial) :• Akhiran “in”

substrat atau asal enzim diberi akhiran in misal : pepsin, papain, tripsin, dll

• Akhiran “ase”substrat atau macam reaksi diberi akhiran asemisal :– laktase (mengkatalisa laktosa menjadi glukosa dan

galaktosa); – fumarase (mengkatalisa fumarat dan air menjadi

malat)– laktat dehidrogenase (mengkatalisa dehidrogenasi

laktat menjadi piruvat)

Cara Baru (nama sistimatik) :• Tahun 1955 dalam International Union of

Biochemistry, komosi enzim menyusun penamaan enzim, setiap enzim diberi nomer E.C. (Enzyme Commission)

• Misal laktat dehidrogenase (nama trivial)atau L-laktat:NAD+ oksidoreduktase EC. 1.1.1.27– Nomor I : Kelompok enzim/ tipe reaksi– Nomor II : Sub- kelompok enzim, substrat atau

ikatan yang dipotong, misal donor elektron (u/ enzim oksidoreduktase)

– Nomor III : Sub-sub-kelompok enzim, jenis reaksi yang lebih detil, koenzim yang diperlukan, substrat, misal aseptor elektron (u/ enzim oksidoreduktase)

– Nomor IV : nomor seri dalam sub-kelompok enzim

Kelompok enzim: 6 kelompok besar :1. Oksido-reduktase : mengkatalisa reaksi oksido-

reduktasi 2. Transferase : mengkatalisa reaksi transfer

gugus3. Hidolase : mengkatalisa reaksi hidrolitik4. Liase : mengkatalisa reaksi penghilangan gugus

sehingga terbentuk ikatan rangkap5. Isomerase, mengkatalisa reaksi isomerasi6. Ligase (sintetase), mengkatalisa reaksi

penggabungan 2 molekul dengan melibatkan sumber energi (biasanya ATP)

• Kelompok I : OKSIDOREDUKTASEmisal : laktat dehidrogenase (E.C 1.1.1.27)nama lengkap : L-laktat-NAD oksidoreduktase– Laktat berfungsi sebagai donor elektron– NAD berfungsi sebagai aseptor elektron– Reaksi : laktat + NAD piruvat + NADH

• Kelompok II : TRANSFERASEmisal : heksokinase (E.C 2.7.1.1)nama lengkap : D-heksosa 6-phosphat transferase– ATP sebagai donor phosphat– D-heksosa sebagai aseptor phosphat dan

ditransfer ke atom C no-6 dari heksosa– Reaksi : ATP + D-heksosa ADP + D-heksosa 6-P

• Kelompok III : HIDROLASEmisal : adenosin triphosphatase (E.C 3.6.1.3)nama lengkap : ATP phospho-hidrolase– ATP sebagai substrat, dihidrolisa sehingga

melepaskan ortho-phosphate– Reaksi : ATP + H2O ADP + orhtophosphat

• Kelompok IV : LIASEmisal : fruktosa-biphosphat aldolase (E.C 4.1.2.13)nama lengkap : D-fruktosa 1,6 biphosphat D-gliseraldehid 3-phosphat liase– D-fruktosa 1,6 biphosphat sebagai substrat– D-gliseraldehid 3-P sebagai produk– Reaksi : D-Fruktosa 1,6 di-P

D-gliseraldehid 3-P + dihidroksiaseton-P

• Kelompok V : ISOMERASEmisal : triose-phosphat isomerase (E.C 5.3.1.1)nama lengkap : D-gliseraldehid 3-phospho ketol-isomerase– D-gliseraldehid 3-P (aldosa) diisomerasi menjadi

ketosa (dihidroksiaseton-phosphat)– Reaksi : D-gliseraldehid 3-P dihidroksiaseton-P

• Kelompok VI : LIGASEmisal : isoleusil-t-RNA-seintetase (E.C 6.1.1.5)nama lengkap : L-isoleusin : t-RNA ligase– L-isoleusin berikatan dengan aseptor spesifik t-

RNA, pada proses ini ATP terurai menjadi AMP dan piro-phosphat

– Reaksi : ATP + L-isoleusin + t-RNA AMP + pirophosphat + L-isoleusil-t-RNA

rendemen maserasi

Documents