Poligalacturonasa I (Pectinasa)

1. Introducción. Importancia, aplicación, beneficios etc. de la enzima. ( Justificar su elección).

Trabajaremos con la enzima poligalacturonasa (también conocida como pectinasa) que se extrae del Aspergillus niger esto debido a su gran importancia, principalmente en el sector alimenticio, pero también en otros sectores de la industria.

En la industria alimenticia es utilizada para la clarificación de jugos, ya que se ha demostrado que es más eficiente que la utilización de la pectin liasa. Además, utilizando esta pectinasa se puede reducir la viscosidad intrínseca del jugo de manzana en un 4.5% y aumentar la transmitancia de luz en un 71.8%.En otros sectores de la industria es utilizada gracias a su naturaleza termoestable y por tener actividad en un amplio rango de pH; una posible aplicación de la pectinasa, relacionada con sus características termoestables, es la de su utilización en el procesamiento y desencolado de fibras textiles, además del lavado y la decoloración biológica, para lo cual se utilizan altas temperaturas para reducir la presencia de contaminantes mesófilos (cuya temperatura óptima de crecimiento está en un rango de entre 25 y 40°C).

También son utilizadas para la degradación de la pectina presente en los residuos industriales de procesamiento de material vegetal, reduciendo de esta manera la demanda química y bioquímica de oxígeno.

Otra aplicación en el sector alimenticio, y relacionada también con su naturaleza termoestable, es en la extracción del azúcar de la remolacha azucarera, de dónde se obtiene un 29% de la producción mundial de azúcar; eso de debe a que la remolacha contiene una gran cantidad de pectina (más del 30% en peso). La despectinización en el proceso de extracción de azúcar de la remolacha utilizando la poligalacturonasa resulta muy práctico debido a que dicho proceso se realiza a temperaturas que rondan los 70°C.

2. No. de clasificación  y Propiedades Fisicoquímicas (PM, PI, pH óptimo, T óptima, % de hidrofobicidad, % de cada tipo de aminoácidos, coeficiente de extinción, carga en función del pH etc.)Posteriormente deberán correlacionar estas características con su proceso de purificación

Endopolygalacturonase I - Propiedades Fisicoquímicas

Enzyme Comission

Number

EC 3.2.1.15

Sequence ID PGLR1_ASPNG

PM 38108.4 Da

PI 4.25

pH óptimo 4.5

Temperatura óptima

40°C

Porcentaje de hidrofobicidad (GRAVY)

-0.261

Composición aminoacídica

Coeficiente de extinción

Índice de Inestabilidad

28.07 (es estable)

Índice alifático 71.49

Composición atómica

Número total de residuos cargados

positivamente (Asp + Glu)

50

Número total de residuos cargados

negativamente (Arg + Lys)

22

Carga en función del pH

pH=10 >> ( )pH= >> neutrapH= 5 >> ( )

3. Características estructurales: Secuencia primaria, secundaria (% de alfas, % betas), terciaria y/o cuaternaria (modelo 3D y descripción del mismo). Posteriormente deberán correlacionar esta descripción estructural con su

mecanismo catalítico. Esta sección deberá incluir figuras que permitan

apreciar las características estructurales de las enzimas.

Front

Left

Back

Right

Asymmetric unit

4. Métodos de purificación. (Detalle de la metodología empleada incluyendo en que sistema de expresión se ha recuperado, de que organismo viene ya sea nativa o recombinante, rendimientos, % de pureza, % recuperación, contraste en caso de que haya más de una metodología para su purificación). Esta sección debe incluir tanto una descripción como un diagrama de flujo.http://www.brenda-enzymes.info/literature/lit.php4?e=3.2.1.15&r=114100

Fuentes:

http://web.expasy.org/cgi-bin/protparam/protparam

http://www.brenda-enzymes.info/php/result_flat.php4?ecno=3.2.1.15&Suchword=&organism%5B%5D=Aspergillus+niger&show_tm=0

http://www.brenda-enzymes.info/literature/lit.php4?e=3.2.1.15&r=713703

http://www.rcsb.org/pdb/explore/images.do?structureId=1NHC

http://www.rcsb.org/pdb/protein/P26213

http://www.uniprot.org/uniprot/P26213

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/protein/P26213

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Structure/mmdb/mmdbsrv.cgi?Dopt=s&uid=25251