isolation and characterization of tetranucleotide microsatellites from atlantic haddock...
TRANSCRIPT
��������� �� ���� ���������� �� ������� �������� ������������ ���� ������� ��� ������������ ���������
������� � �� ���������� ����� � ���� �������� ��� � � �����������
����� ����������� ���� � !�� ��� ��" ��#� $ ��% ���&
���������� � � ��������� �������� ���������� �������� ��� ����� ��� !�"#�������� ' � ��� ������ ������ $������� � � ��������� �������� ��� ����� �"% &"�'���� (�� )�*� +�*������ �������� ���������� �������� ��� ����� ��� !� '���� '�� ���� ���� ���� +�*������ � �� � &,���� �� #������ � �� ��� �������� -& ./�01� ��&
��������� (�) � ����#�� ���" *������� ���� ���� " ) ��+ " ,��* �������� ��""��� -'���������� �����2��.
�� +� � �� " /��� � � ������ " #���� � *�"�0 " *��� ��� 1 �"2��1��"�%����� � � ����� +��� "#� ����
����� " ,�� � ����#�� ���" *������� ���� � /��� � � +���*��+��� -�344 ��� � � + � ���#�5 * ��� ���. ��"
6��1�� " ���� � ) �� �, �1� �) " � � ��%������� -77837445 * ��� 78�. �� � ��*+� �, 87 ��""��� ���� �� "
,��* �� 9������ 9� �, �� �� :����� �� �������� � �� ���* � � �� ,�� ; � ����#�� ���" *������� ���� ��
���������� " ) ��+ " ,��* ��" -(��&.� � � ���� � �� " �� �������� ��""���5 �� +��� �� �" " � �"��� " 2
� ���1� +��"#�� ��" ��� )����1� �� �� +�+#������ ����� " -�4 ��� � �5 � � ��%�������� 74<. �� � ���� ��
�#���1� ,�� ������+ ������ � �� �=#��#��#� 2� ��� " �++���������� ��" �� +�� ������� #� ,#� ,�� � ���)���
+�+#������ ���#��#� �� �� ���"
� � ���� �������� ��""���� � ����#�� ���" *������� ���� � *��� ���21 �" �����* ��
������������
�������� ��""��� -'���������� �����2��. �� � " * ����
��"��" 0�� ���� �� ,�#�" ����� *#�� �, �� :���� ��������
������ ���� �� �,� �� ,�� ��#�� �� �� $�� �, $����� �� ��
��� ��" ���" >����" �� �� � �� ����"��� ��** �����
���"���� �, ��""��� ��) ������������ 1 � �� �� ��" � �,
�77�777 ���� � �� �� 9������ 9� �, -? +� �, (��� �� � ��"
� ���� ����"�� �777.� ��" ��""��� � *���� �� *���
����*������ �*+������ ��** ����� 0�20�� �� �� ��������
����"� @�� ) �� ���� �� *�" �� ��� �4A7�� ����� 1��2
*��� �� *��� � ����� ��� " ���� "� ���� �����*�����
����� � �� �� 2���#��#� � � "#������ �� ��% 2��2�� � ���"�2
����� ��" *��#���� ��� "#� � -? +� �, (��� �� � ��"
� ���� ����"�� �777. �� ���� �� 9������ 9� �, ��""���
0�� �� ��� 1 � ���� " ���� �44&
�� " ���� �� �� ���) �� 0�� �� ��� ���*#��� " " 2
) ��+* �� �, ��** ����� � ����� ��" �=#��#��#� �,
��""��� ,�� �#*�� ����#*+���� �� �� �,� � �� ��� ,��
*���� 0�� �+ �� � #�" ������ �=#��#��#� " ) ��+* ���
��""��� 1���" ����� �� ���� �� " ,��* �� ���" ��" *���2
���� " �� ��+��)��� #���� �+������ ��* (� =# ����� ���� �7
�� �7 *�� � ��" �7 �� �7 , *�� � �� +��� " ��� �� � �� �
� � �) " 9 +� *1 � �<� �77�5 ��� +� " ? � *1 � ��� �77�
3��������� �����4 ������� .0"5 "65 6 78 ��� .0"5 "656/� �5���� �9�����):
���;��5��;� ; �
��� $��� ����� &� &�A 3 &��� �77�?>B �7�778C��7��<277�277�72&
��**#��� �+������ ����� ��" ��� �� ���� �� " �) � ��
��#�� �, "��� �� � �� #���� �+������ �� ��*+� � -��"2
"��� �� � ���� �+��� ��. /���� �� ����� �1�#� +�� ����
-��. ������1#����� �� �� �#�)�)��� �,,�+���� -(�. �� *�� �
�� , *�� � *�� 1 �#++� ����� �+������ ��" , �����%�����
�#�� �� �, ��� � �� ��"�)�"#��� ����#�� ���� ����� ��
���*���� � �+��� � >, *��� �� ��"�)�"#��� "� +��"#�
��* � �� )�������� �� � +��"#���) �#�� �� - �� )�� ���2
� ����1� )�������� �� �� ���"����� �, +�� ���� �� "�,, �2
����� �#�)�)�� �*��� (� ���)� 5 � ?��� � ��� �44;. *��
1 �#,0�� ���� ���� ���� �����21�� " -�� ���"�*. � � �����
�, �7 �� &7 (� 0�� ,�� ,#�#� 1���"����� *�� � +� � �� ) ��
, � �, �� �������� ,�*��� ��� � ��#�� �� ��� �����" ,��
��1� " (� 0�� ��" ���� �, � � ��� )�������� *�� 1 ����� ��"
*�� 1 ��* *����0 " �� �#�� ���) � � ������� �� ��
+���� �� � �� �=#��#��#� �+ ������ ,����
@����� )����1� *�� �#��� � � ��� *��� �� 1�� " ��
+���* ��� ����� � ������ -���. � +� � �� �*+������
����� �� -�. )��#�� �� ��1� "��� +�� ����� �� + "���
�#���* �, ��""��� �=#��#��#� +�+#������� +��"#� "
,��* ��**#��� �+������ +��� "#� �5 -�. " ) ��+ � 2
����+ 21�� " * ���"� �� �)��" �� *���*�% ��1� "���5
-�. *������� � � ��� "�) ����� �� �=#��#��#� ��� �5 ��"
-&. ������ �� � ���)��� ����� ���#��#� �� ���" +�+#2
������� ���� *�� +��) �������� �� +��� ����� ������+ ��0�
"�) ����� @ � � � � +��� ; � � � ����#�� ���" *����2
��� ���� � ,��* ��""��� ���� � � ������ " #���� � *�"�2
0������ �, �� *��� ��� 1 �"2��1��"�%����� � � �����
+��� "#� �, @�*����� � �� -�44�. ���� �� �, ���� �����
��+������ 6��1�� *��� "�� � "#� " ��� ��#�� ���� � ����)
�� "��#�� ���" *������� ���� � -�� ���� ��" ������
�44;. ��" � � ����� 6��1�� &21+ "�,, � �� � 1 �� �
�"D�� �� ��� � � ���� � +��� � �#��� �, +��* � � ��� �,
� � ���� +#1���� " ��" -(���� �����. � ����#�� ���"
*������� ���� � -���� � � ��� �777. �� ����� �*+��,� ��
��""���
������ �� �� ���
�� ���� � ��� �������� � ���� ������� � ��
?:� �� 6����� " ,��* � ����� ��""��� �+ ��* � �12
���� " ,��* �� $�� �, (#�"� ��" ���� " �� 87E ������
������* �� +��� "#� �� ,�������� @�*����� � �� -�444.�
1#� *�"�0 " �� �� ���� ���� � �� -�77�.� � � #� " ��
������ ��" ���� � ����#�� ���" *������� ���� � $�� F��
� ��*�� ?:� ��� "�� �� " ���� �� � ��������� �%�*
9��> �,� � " +���+���������� #���� ���, ��� ������ +���2
+����� � � ��*�� ?:� ��� ����� " �� 9:G ���� ��
-@�*����� � ��� �444. �� �� +� � �� �, �� � ���������
�%�* <�>� ����� �#�� 9:G ���� � "�* ��� 1#� ���
9:G ���6 �3� ��*�� � ��*1����� *�� �#� � ���� +��2
� "#� �� �" " � ��*�� ?:� ���� 9:G ���� �� ������ "
�� 1��� �"� H���� 9:G +��* ��� �� � ��*1����� � 2
��*��29:G ?:� ��� ��� �*+��0 " ��" ��1��"�% " ��
-I���.& ��" -I���.& ������#�� ���" � 1�#�" ��
��� +��)�"��2���� " +���*��� ��� 1 �"� )�� � 1����� ���2
D#��� ������ " �� �� ;� �" �, �� ������#�� ���" �:������ � " ?:� ��� � *�) " ,��* �� �����21 �"
��*+� 6 #���� � + �� " ���� � 9:G2� ��*�� � ��*1�2
���� *�� �#� � � � � � �� " ,��* �� 1 �"� 1� " ��2
�#���� �� 4<�� >� � " )������ ,��* �� @�*����� � ��-�444. +��� "#� � �� � ��) � " 9:G2� ��*�� ?:� ���
"�� ���� ��� �*+��0 "� ����� " ���� � ���� � �) �2
���� +���*�"� ->�)����� �� �����1�"� ����,. ��" �����2
,��* " ���� >�)����� ��� :� 9��� ��*+ � �� � ���
,�������� �� *��#,���#� �� +�������5 @�*����� � ��
-�444. #� " � ��������� �%�* � �� "�� �� ���� � ?:�
,��* � ��*�� ?:� +���� �� �������� ���� +H��A ���2
�*�" ?:� ��� 6����� " #���� J��� � -K�� ����� ����,.
+���*�" ���#*��� �� �#���� " 1� �� *��#,���#� � >�� ��
?:� ��� ���� � =# �� " #���� ��� � ) �� +��* � -II�
��� �I� I�� ��� I. ��" �* ����*2����*���� -��� ���2
����� :!. �� �*�� =# ��� ?� � �*������ ���� � 2
=# ����� �� *����� �� +� � �� �, �� �" ������ ���� �
� =# �� �� ��� � ��" �, �� � ��*�� ��� �� � =#�� "
�� #� �, � *�"�0 " �� �*�� ������� � ��* � �� � 2
=# �� �� � ��*1����� ���� �B �; ���� � �, � *��#� ��
4<��� ,����� " 1� �7 � ���"� �� <7�� �� ���� �� "��� ����� � *+ ���#� +� ) �� " �� *���*�% " ��� ���2
���� -��1��"�%�����. 1 �� � �� 9:G � =# �� ��" ��
F������ ��� �� 9 =# ����� � �#��� #���� �� ��� �����
� *+ ���#� �, ;<�� -� ��** �" " 1� �* ����*. � � ������ )����1� 9 =# ����� � ������� � � �����% " #����
�� �$> �8� ��� ��� �#��*�� " � =# �� �
����� �������� �� ���� ���� �! ����� ���
"������#��� � � ���� ������� �����
?:� ,��* 87 ��""��� ���� �� " ,��* �� �� �� $���
� ���� �, �� 9������ 9� �, ��� 6����� " #���� J��� �
� ��*�� 6�������� ���#*�� �����"��� �� �� *��#,��2
�#� ��� +������� /��� � � �*+��0 " ��"�)�"#���� #���� �
� ��� I ��#� ��� *����� � ������� � � ����� " �#� ��
�72�� )��#* �� �� ;7 *� ���� �7 *� ����� +@ A&� 7�
*� ��� ":��� 7; �� �, #���1 � " +��* �� 7; �� �,
� ����#�� ���" �������� ���� ,�� @�""��� &�4
$���%&� + �������9 =# �� ����* �9 =# �� �I �$������ �����:#*1 ��/��#�������� ��������1� �) "@ � ��%�������-@�.��6+ �� "@ � ��%�������-@ .��)��# �,� ��
,��? )������,��*@��"� ��1 ���6+ ��������-@ �.��"��� ������ *+ ���#� �,(�) � ����#�� ���" �������� ���� /���>����� ",��*��������@�""������"� /��#�
>����� ",��*��"-���� � ����777.�� �� "��@�""�������*�� �� � 1�� "�����*+� �,87��""������� �� ",��*�� 9������9� �,
/��#�
� + �������
� =# ��
���* �� =# ��
��� �����
:�
9�% ����
-1+.
:#*1 �
�,��� � �
@�
@
@ �
��-��.
�� �
-�I��. �-�I��. �-�I��. &
(B�III�������������I
�(&�8<7�
<738�
�778�
7787
�7
;&
�B�I�������������I��
�� 8
-I��I. �-I���. ;
(B������I�I���������
�(&�8<7�
�4�3��7
47<;8
7<44
78�;7
;7
�B���I������I��������I
�� 4
-I���. ��
(BII��I����I����II��
�(&�8<7�
�;�3�7A
�8748�
74<4
7�;<8
;7
�B�II����III��I�I����
�� ��
-I���. �8-I���. �
(BI�����III��II����
�(&�8<7&
���3&A�
44�7
744&
�7
;&
-I���. ;
�BI��II�I���������I�
�� &<
-���I. �8
(B�������I��I������I
�(&�8<7;
��&3�4<
�A7A&�
74�;
7���;
;�
�B���������������������
I*��&�
-I���. �
(BII��II�������II�I��
�(>�;4��&
��73��<
�474A<
74;<
7A4�7
;7
�B������I��II��������
�(��*���� � �����777
&�7 ������� � �� ���� � ��
@ 6 �� (�* ��1 � " +��* � -��1� �.� 7A H =�, ?:�
+���* ��� �� �*�� ������� ���"������ � � �� ,������B �
���� �, 4&�� ,�� � *��#� �5 � ���� � �, 4&�� ,�� � *��#� �=��� ,�� �7 � ���"�5 8��� ,�� �7 � ���"�5 �; ���� � �, 47��,�� �7 � ���"�� =��� ,�� �7 � ���"�5 8��� ,�� �7 � ���"�-�� � =� �� ��) � �� ��1� �.5 ��" � ���� �, 8��� ,�� �;*��#� � (�) � ����#�� ���" *������� ���� ���� (���
(�A� (��4� (��&� ��" (��8. �, �� 8 " ) ��+ "
,��* ��" -���� � � ��� �777. � � � �� " #���� ���"������
�+ ��0 " 1� �� �#������ ��" �� ��� ����� � *+ ���#� � &��1 ��� �� � ��** �" " ��� ����� � *+ ���#� � (�����2
��� ���� �� =#�� )��#* �, " ����% " ,��*�*�" -���2
������� 77;E ��C)�� 1��*�+� ��� 1�# . ��� �"" " �� ���
��*+� � " ���#� " ,�� �7 *��#� � �� 4&��� ��" ��% ,���2������ " �� < �� <E +���������*�" � �� ,�� � �� � ��#��
-" + �"��� �� �� ��% �, �� 6+ �� " +��"#��5 ��1� �.
�������� ���� ��� � � �� 1��"� � � )��#���% " #���� ��
(�$> >> -@������� ������ !�+��.
� ������ � �������
1� �) " � � ��%������� -�. ��� ����#��� " �� ��
+��+������ �, ��"�)�"#��� 6��1����� � "�,, � �� ��� � � �62
+ �� " � � ��%������� -��. ��� ����#��� " #���� I�:���
K ����� ��" -���*��" ��" ��#�� �� �44;. �� �#*1 � �,
��� � � �1� �) " ��� 1�� " �� � ��*+� ��% �, 87 0��� ��"
���,��*����� �, � ����+�� +��+������� �� @��"�2 ��1 ��
6+ �������� ��� � �� " #���� I�:��� K ����� ��"
������
��� ���� A7E �, �� ���� � ������ " ������� " �� ��
*�� *������� ���� ������� ��+������ ���������� �, +��*�����
&21+ � + �� *���,� ���� *������� ���� 21 ����� ���� �
� � ��� � �" ������ �� ) �� ��*���� �� ��� �� ������ " � �
���* �� � � " ) ��+ " ,�� �� ���� ���� 6��1�� " #��=#
� =# �� �� ��� � �� 1��� �, �� ;� ��" �� � ����� F�������� �� � �+ ���) ������ (�) +��* � � �� �� �" " )����1�
+��0� � ���������� �, � �� � 1��"� -��1� �. ��� � �
+���*��+��� -�344 ��� � � + � ���#�5 * ��� ���. ��" 62
��1�� " ��� �� ) �� ���� �� -77837445 * ��� 78�. ��� �
�, < � ����#�� ���" *������� ���� � ���������� " ) ��+ " ,��
��"� (��&� ����� �*+��0 " ��" ��� ,�#�" �� 1 � #� ,#�
��"�*����� *��� � �� ��""��� -�4 ��� � �� �� L 74<5
��1� �. �� � *������ ��" ���� ��� � ,��� " �� �*+��,� ��
� � ��)������ :�� �, �� ���� ���� " )�" �� �, ���2
��0���� " +���#� ,��* @��"�2 ��1 �� 6+ ��������
-��1� �.
����������
�� � ; � � � ����#�� ���" *������� ���� � ,��* ��""���
+��)�" � �#�� �, ���� ���� 6��1�� *���*�� ��� ��#�� �
��"� ���� �� 6� +���� �, '����� ��� ��) ��� � � ����
+��*����� &21+ "�,, � �� � ��#�� �� )����#� ���� �� � ��2
��) �� ��� �� �" ���,� ��" ��% #���� *��#�� �� �#��*�� "
���� *� >� �""������ � ��) ����� ���� � �, �� ; ��"
� ����#�� ���" *������� ���� � � �� "� ����� �*+��0 � ��
��""��� (�) �, �� � < ���� �� ������ )����1� ��" �� ����
�#���1� ,�� #� �� �=#��#��#� " ) ��+* ��� ������+ ���2
��� �� ��" � ���)��� +�+#������ ���#��#� �� �� ���" ��
��6�� ���#� -'���. 6��1�� " ���� � ��� � � �*��� �� 87
��"�)�"#��� �#�) � "� ��" �� *�� 1 �#���1� ,�� +�+#������
������ �
�������������
����� / / ��� ��" �� �� � �, �� ����"��� �����
I#��" ) �� � &+#9>� �>>�+>9 ,�� ���� ����� ��*+� �
,��* I ��� � $���� � ��������"� � I��"��� / $ �� ���
��" / / ��� ,�� �� �� ��������� �� �� ��1������� ��
�+ ������ ���� ,#� �� � ! �� � ,�� � �+ ���� ?:� � 2
=# ����� ���� � � ���� ��� �#++��� " 1� � ����"���
$��� �������� 9���� �� � � ���� +���� ����+ ����� �� ��
��" �� ,�� �� " ) ��+* ��� ����� * ��� ��" �++����2
���� �, � � ��� 1��� �������� �� �������� 0�� �� � ��"
�=#��#��#�
������
? +���* �� �, (��� �� � ��" � ���� ����"� -�777. H+"�� �
�� � � �� " ������� 9� �, ���#�" ������ �� �777 >�B �� ?
������ 9���� &; ? +���* �� �, (��� �� � ��" � ���� ����"��
�3�;
?��� � � � @ �1��� �� �� �������� �� ��" /���*���� 9 -�44;.
H� �, ?:� *������� ���� +���*��+���* �� �����% � � ���
���� ������� 1 �� � ����� �� ��" ���#��� 0�� �� &� #��� �
���� �;B�7;3���
@�*������ �$� ����#�� �/� (��� � ?>� ��" (� ���� �� ��
-�444. H��) ���� ���� � ��" �������� +��� "#� � ,�� ������#�����
�, � ��*�� ?:� ��1���� � ����� " ,�� *������� ���� � ���� �5
�,��� �8B;773;78
� ����#�� ���" �������� ���� ,�� @�""��� &��
���� ����� � �� �� ����� ��� ��������"� �/� !�� �� � �
��" $ ��% �� � -�77�. >�������� �, ��� ��) � � ����#�� ���"
*������� ���� � �� �������� � ����� -������ �������. '� > �
���� �B��3��
���� �� ��� / � �?� ��" $ ����*� �? -�777. ? ) ��+* �� �,
���2 ��" � ����#�� ���" � + �� *������� ���� ���� �� �������� ��"
-(���� �����.; '� > � 4B��A3��4
�� ���� ��� ��" ������ !� -�44;. �� )��)��� � �������� �,
?:� 0�� �+������� ��" ��� �++�������� �� 0�� �� � ��" �=#��#�2
�#� ! #��� ��� &8B�43;;
���*��"� �� ��" ��#�� �� ( -�44;. I�:��� -K �����2��.
��+#������ � � ���� ��,���� ,�� 6��� � ��� ��" �#* �����* !
����� A7B�&A3�&4
&�� ������� � �� ���� � ��