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State of the art Guia prática Javier Rodriguez-Vera

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State of the artGuia prática

Javier Rodriguez-Vera

Quê é state of the art

• Informação actualizada

• Informação válida

Pesquisa bibliográfica

Fontes que podemos consultar:– Apontamentos– Opiniões

– Livros– Sites– Jornais

Apontamentos

Notas tomadas a mão habitualmente dum discurso oral:– Problemas de interpretação da escrita

– “Bias” de interpretação da mensagem– O orador estava a dar um state of the art?

Opiniões

Falar com alguém do nosso entorno que tem conhecimento adequado do tópico:– A linguagem verbal tem “perdas”

– A pessoa quem perguntamos está actualizada ou enganada?

– Útil: pode dar alguma referência bibliográfica

Livros

• Informação validada.

• Muito condensada. Sem pormenores.

• Não actualizados.• Úteis para ter uma visão global da

questão.

Internet

• “Toda a informação do mondo está na net”– Limitação 1: Alta sensibilidade baixa

especificidade:• Exemplo: “prostate cancer”: 9.660.000 entradas

– Limitação 2: Não temos garantia da qualidade da informação:The Prostate Cancer Charity - Front Page

- [ Traduzir esta página ] The Prostate Cancer Charity offers support and information to anyone

concerned with prostate cancer. The site has information on the prostate, ...www.prostate-cancer.org.uk/ - 30k - Em cache - Páginas semelhantes

Precisamos aumentar a especificidade e diminuir a sensibilidade: EFICIÊNCIA

• Jornais online/papel:– Informação validada.– Informação actualizada

– Informação acessível

• Quê tipos de jornais existem?– Indexados

– Não indexados: “Grey literature”

Jornais: introdução histórica

• Resposta a necessidade histórica:– Informação rápida, manuseável e barata.

• Primeiros Jornais 1665:– Philosophical Transactions– Jornal de Savants

• 2000: 1.000.000 jornais científicos no mondo

Por quê indexar um jornal?

• Número de jornais muito elevado: é preciso discriminar aqueles de maior qualidade.

• Indexados: revisão interpares, publicação periódica durante um tempo, cumprem norma Vancouver, ultrapassam audit…

• Indexado= Garantia de qualidade.

• Não indexado não quer dizer má qualidade

Problemas e soluções: os compiladores

• PubMed e Embase: recursos que agrupam jornais “de qualidade” e os ordenam segundo vários parâmetros.

EMBASE

• 19 milhões de artigos indexados de 7,000 jornais desde 1947.

• Preço elevado: eficaz, mas ineficiente– £4300 para 2008-2009

PubMed

• Serviço da National Library of Medicine

• Revisa milhares de Jornais:

• 5246 (Jan 2008) 70 países• Contém 10 milhões de referências

bibliográficas desde 1966

www.pubmed.org

Vantagens do PubMed

• Gratuito

• Instantâneo

• “Links” para artigos em fulltext

Inconvenientes do PubMed

• Precisa duma linguagem específica

• Há muitos artigos sem fulltext

Como Fazer uma pesquisa bibliográfica em PubMed

• 1. “Linguagem PubMed”

• 2. Restrictores

• 3. Selecção de artigos

Linguagem PubMed

• 10 milhões de referências bibliográficas: perante qualquer pergunta vamos a obter respostas.

• Respondem a nossa pergunta?• Exemplo: prostate cancer: 78336 entradas

• PRECISAMOS AUMENTAR A ESPECIFICIDADE

PESQUISA BIBLIOGRÁFICA COM PUBMED

• Quê queremos saber?. Definir antes da pesquisa.

• Primeira aproximação: termos livres (não boleanos). Da uma ideia da quantidade de informação disponível na base de dados

Disponível em fulltext gratuito:

Disponível em fulltext, mas é preciso pagar. Abstract

gratuito.

Nada gratuito

Formas de apresentação dos resultados

Podemos armazenar as pesquisas?Clipboard

Queremos eliminar um artigo do Clipboard

My NCBIpermite guardar critérios de búsqueda e

definir diversos filtros personalizados

• Pesquisa actualizada e enviada ao mail periodicamente

Os filtrosAumentam a especificidade da nossa pesquisa

Single Citation Matcher

• Para localizar artigos a partir de dados isolados (Autor, jornal, data de publicação)

• Útil para localizar os artigos sugeridos pelos peritos.

Os operadores booleanos

• Ferramenta lógica para relacionar diferentes términos nas pesquisas compostas.– AND: devem verificar-se cada uma das condições definidas

(aumenta especificidade)• Exemplo: Cancer AND 2000/3: artigos publicados em Março de

2003 em cujo título exista a palavra Cancer– OR: deverá verificar-se ao menos uma das condições definidas

(aumenta a sensibilidade)• Exemplo: cancer[ti] OR cancer[tw] OR tumor[ti] OR tumor[tw] :

Artigos que tenham a palavra cancer ou tumor no título ou texto – NOT: Deverá cumprir-se a condição da esquerda mas não a da

direita• Exemplo:Young[au] NOT Nature[ta] :Artigos que Young tenha

publicado em jornais não sendo Nature

Comodines

• Truncamento: Asterisco *– Implica escrever uma palavra incompleta, terminada

em asterisco• Exemplo: muta*[ti] Busca os registos que tenham no título

o término mutation, mutations, mutability ou, em general, qualquer término que começe pela raiz "muta".

• Termos com mais de duas palavras: Comas “”.– Escrever os registos entre comas “”.

• Exemplo: "lung disease"[ti] pesquisa os artigos em cujo título poda ler-se o conjunto "lung disease" tal e como está escrito.

Límites

• Filtros predefinidos que, unidos a cadeia de búsqueda especificada, aumenta a rentabilidade da pesquisa.

Preview• Para ver se o número de entradas tem atingido um nível

aceitável• Mostra os resultados das três últimas pesquisas

realizadas• Resulta possível combinar com operadores booleanos

Exemplo: #1 AND #3

MeSH (Medical Subject Headings)

• Termo com que está indexado um artigo em Medline.

• Ao introduzir o nosso termo de busqueda no MeSH Browser:– 1. Diz-nos se esse termo está indexado– 2. Se o estiver, nos apresenta uma lista

hierárquica de menos a mais concreto

Página de inicio PubMed

Identificación del MeSH

Otra forma de identificar el MeSH

Ingrese un término

Término solicitado

Términos controlados

Término controlado en el MeSH para Hepatic cirrhosis Definición del Término

Selección del término MeSH

Subencabezamientos para especificar una búsqueda

Sinónimos de entrada del término

Estructura jerárquica (árbol) MeHS para el término liver cirrhosis

Selección del término MeSH

Cuadro de dialogo para la búsqueda en PubMed

Envió de término MeSH para su búsqueda (operadores booleanos: And, OR, NOT)

Cuadro de dialogo de estrategia de búsqueda

Término MeSH dado por el sistema

Ejecutar búsqueda en PubMed

Resultado

Escolha de informação válida

1. Que venha do PubMed não quere dizer que seja fiável ou issenta de “bias”.

2. De esta informação, quê preferenciar:

1. Metanálises

2. Ensaios clínicos aleatorizados controlados

3. Ensaios controlados

4. Serie de casos

5. Casos clínicos

6. Editoriais

Neste momento, temos um

State of the art