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FishBase Offene Daten zur Meeresbiodiversität Rainer Froese IFM-GEOMAR, Kiel [email protected] Semantic Web Tag Leipzig, 6. Mai 2010

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Page 1: FishBase Offene Daten zur Meeresbiodiversität Rainer Froese IFM-GEOMAR, Kiel rfroese@ifm-geomar.de Semantic Web Tag Leipzig, 6. Mai 2010

FishBaseOffene Daten zur Meeresbiodiversität

Rainer FroeseIFM-GEOMAR, Kiel

[email protected]

Semantic Web TagLeipzig, 6. Mai 2010

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Inhalt

• FishBase: Alle Daten über alle Fische• AquaMaps: Standardisierte Verbreitungs-

karten für 1.8 Millionen Arten• Attribution, context, sustainability:

Herausforderungen für das semantic web

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FishBase

• Daten aus 45000 Veröffentlichungen standardisiert und intelligent verknüpft

• ‘Deep-links’ mit allen relevanten großen Datenbanken

• Frei zugänglich unter www.fishbase.org• Halbe Million Besucher pro Monat• Über 1000 Zitate in der Primärliteratur

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Wieviele Fischarten gibt es?

0

5000

10000

15000

20000

25000

30000

35000

1990 1995 2000 2005 2010

Year

Num

ber o

f Spe

cies

Based on FishBase 01/2009

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Was wissen wir über sie?

0

100

200

300

400

500

600

1 10 100 1000 10000 100000

Rank

Num

ber o

f pub

licat

ions

use

d in

FB

per s

peci

es

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Welche Informationen sind verfügbar?

0 5,000 10,000 15,000 20,000 25,000 30,000

Mortality

Longevity

Growth

LWR

Fecundity

Maturity (tm)

Maturity (Lm)

Spawning

Diet

Food / trophic level

Maps

Depth

Length

Photos

FB names

Common names

Species summary

Species / Records (n)

276,175

49,564

46,571

Based on FishBase 01/2009

31,300

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Welche Information wird genutzt?

0 5 10 15 20 25 30 35

Genetics

Diseases

Fish Quiz

Ecology

Tools

Physiology

Reproduction

Population dynamics

FishBase Book

Trophic ecology

Fish collections

Identification

Glossary

Eschmeyer

Info by Country

References

Scientific names

Common names

Photos

Percent of visitors accessing this topic Based on Kiel server, June – August 2009

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Wie oft wird FishBase zitiert?

0

50

100

150

200

250

300

350

1990 1995 2000 2005 2010

Year

Num

ber o

f Fis

hBas

e Ci

tatio

ns

1386 registered FishBase citations

Based on FishBase 01/2009

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Google Scholar, April 2006: 1610 citations, including 5 in Nature and 7

in Science

Fisheries

EcologyConservation

Aquaculture

Taxonomy

GeneticsParasitology

ITPalaeontology

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Who is Using it?Who is Using it?FishBase Web Users

Individuals

Private sector

Universities

Governments

NGOs

Museums

Int. Research Centres

Based on 2787 entries in the FishBase Guestbook, March 2007

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Wie finden uns die Nutzer?Wie finden uns die Nutzer?

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Woher kommen sie?Woher kommen sie?

FishBase Users by Continent

North America

Europe

Asia

South America

Africa

Australia

Oceania

Based on 2408 entries in the FishBase Guestbook , September 2005

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AquaMaps

Karten mit der Wahrscheinlichkeit des• natürlichen Vorkommens• möglichen Vorkommens• Vorkommen in 2015Karten mit• Artenreichtum• anderen Kombinationen

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www.aquamaps.org

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Keine Haie am Südpol

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Vorkommen des Walhais

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Wo machen Schutzgebiete Sinn?

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Gefährliche Rippenqualle Mnemiopsis leidyi

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Hier könnte sie leben:Mnemiopsis leidyi

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Herausforderungen

Attribution (Angabe und Würdigung der Quelle):

• Keine • Versteckt• Verkürzt• Ohne LinkRichtig wäre z.B.Source: Myers 1996, as shown in FishBase

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Herausforderungen

Context: Bedeutung kommt vom Zusammenhang; Einbindung in der Quell- Datenbank ist Metainformation

Realität: • ‘crawling’ verliert Zusammenhang• ‘crawling’ speichert falschen

Zusammenhang• Mashups mischen gute und falsche Inhalte

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Herausforderungen

Business model: Datenerhebung und Pflege kosten Geld. Mega-User müssen sich um die Nachhaltigkeit der Datenquellen kümmern.

Realität: Fortbestand vieler Datenquellen ist nicht gesichert. Mashups verweigern Verantwortung.

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Partners and SponsorsPartners and Sponsors

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The FishBase The FishBase TeamTeam