esercitazione prosite & interpro. prosite elenco dei motivi in prosite

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ESERCITAZIONE PROSITE & INTERPRO

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Page 1: ESERCITAZIONE PROSITE & INTERPRO. Prosite Elenco dei motivi in PROSITE

ESERCITAZIONE

PROSITE&

INTERPRO

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Prosite

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Elenco dei motivi in PROSITE

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Funzioni coinvolgenti ZINCO

ZINC

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Motivo funzionale LIM

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Descrizione di LIM

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Descrizione con 2 tipi di motivi

Profilo

Espressione regolare

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Espressione regolare per LIM

SelettivitàSensitività

Espressione regolare

Elenco veri positivi

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Matrice di Profilo per LIMPossibili aminoacidi

61 Posizioni sulla sequenza

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Descrizione con 2 tipi di motivi

Allineamento multiplo

Organizzazionein domini

dei veri positivi

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Allineamento multiplo per LIM

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Architettura in domini

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ScanProsite

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2 tipi di ricerche

MKGLLWSKNRKSSTASASSSSTSTSHKTTTASTASSSSPSSSSQTIRNSTSGASPYMHSHHHHGQGHSHHRGEDNNRDKRKSSVFPPSKQYTSTSSSQVNLGMYHSDTNTRSSRSIASTLKDDSPSVCSEDEISNSSSQKSNAQDETPIAYKKSAHSKDSLLPSRSSSLSPPQSRCSTGT

C-X(2)-[CH]-[AIL]-T

Per sequenza

Per motivo funzionale

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Ricerca per sequenza

xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

incollare sequenzadiCSKP_HUMAN

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6 Motivi trovati

Motivo trovato

Posizioni/e

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Ricerca di un motivo

C-X(2)-[CH]-[AIL]-T-CEspressione regolare

Banchedatisolo SPsenzavariantidi splicing

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53 sequenze positive trovate

Proteina trovata

Posizione motivo

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INTERPRO SCAN

xxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxxx

incollare sequenzadiCSKP_HUMAN

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