clase 13 mutación

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Mutación Clase 14

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Page 1: Clase 13 Mutación

Mutación

Clase 14

Page 2: Clase 13 Mutación

Mutación

• Fuente original de variación genética

• Jerárquica– Nucleótido– Secuencia– Gen– Cromosoma

Page 3: Clase 13 Mutación

Diversidad

Mutación+

Deriva-

Selección

+/-

Migración

+

Page 4: Clase 13 Mutación

Efecto de Mutación

• Neutro

• Substitución

• Indel– Efecto fuerte

• Mutación dirigida e inversa

Page 5: Clase 13 Mutación
Page 6: Clase 13 Mutación
Page 7: Clase 13 Mutación

Frecuencias

• Asumimos:– Alelo silvestre (A1)– Alelo mutado (A2)– Mutaciones reversibles de (A1 a A2)

• Frecuencia A1 a A2 ocurre u• Frecuencia A1 a A2 ocurre v• Frecuencia A2 es q

Page 8: Clase 13 Mutación

)(

)1(

vuqu

vququ

vqqu

qpq

Page 9: Clase 13 Mutación

Equilibrio

)(

)(0

vuu

q

vuqu

e

Page 10: Clase 13 Mutación

¿Qué tan efectivan son las mutaciones cambiando frecuencias?

0

0

001

)1(

)1(

pup

pu

uppp

tt

¿Si u=10-5 cuántas generaciones se ocupan para reducir p a la mitad?

Page 11: Clase 13 Mutación

Destino de las mutaciones

• Una mutación ocurre en forma heterocigota• Mutación puede desaparecer por

apareamiento• Hay 50% probabilidad de perder una

mutación en la siguiente generación

• Probabilidad de perder mutación en familia de tmaño k = (½)k

Page 12: Clase 13 Mutación

Mutaciones en poblaciones finitas

• Mutaciones se pueden perder al azar

• Teoría neutralista– Efecto de deriva y mutación sobre diversidad

• Mucha utilidad actual en estudio de evolución

Page 13: Clase 13 Mutación

• Probabilidad de una nueva mutación:

• Probabilidad de fijar la nueva mutación:

• Probabilidad de perder una nueva mutación

Np

21

0

Npu

2

1)(

Nqu

2

11)(

Page 14: Clase 13 Mutación

00.050.10.150.20.250.30.350.40.450.5

1 10 100 1000

N

u(p)

Page 15: Clase 13 Mutación

Fijación y Pérdida

• Fijación y pérdida de los alelos involucran escalas de tiempo muy distintas– t pérdida entre 0 y 1/2N– t fijación entre 1/2N y 1

– Usualmente frecuencia de mutación es pequeña

Page 16: Clase 13 Mutación

Tiempo para fijar y pérdida

Fijar

Pérdida

eNpT 4)(1

NNN

pT e 2ln2)(0

Page 17: Clase 13 Mutación
Page 18: Clase 13 Mutación

Modelo de Alelos Infinito (IAM)

• Cada mutación crea un alelo nuevo

• Alelos son creados por mutación y perdidos por deriva hasta alcanzar un equilibrio

• Produce un número alto de alelos y diversidad genética

Page 19: Clase 13 Mutación

Modelo de Alelos Infinito (IAM)

• Cada mutación crea un alelo nuevo

• Alelos son creados por mutación y perdidos por deriva hasta alcanzar un equilibrio

• Produce un número alto de alelos y diversidad genética

Page 20: Clase 13 Mutación

Diversidad Genética en IAM• Kimura define por endogamia

• Los dos alelos no deben mutar

• Dado que He = 1-f:

121

12

1

t

eet f

NNf

21 1

21

12

1uf

NNf t

eet

144

uNuN

He

ee

Page 21: Clase 13 Mutación
Page 22: Clase 13 Mutación
Page 23: Clase 13 Mutación

Modelo Mutaciones escalonadas (SMM)

• Mutaciones no ocurren en cualquier lugar

• Mutaciones son más probables en estados adyacentes

• Afecta heterocigosidad:– Usualmente menor

• Implicaciones para diferentes marcadores

21

)18(

11

uNH

e

e

Page 24: Clase 13 Mutación